Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder whose genetic architecture and underlying molecular mechanisms remain incompletely understood, particularly in sporadic disease. To investigate whether genetically regulated DNA methylation may help interpret ALS susceptibility, we conducted a methylome-wide association study (MWAS) of genetically predicted blood DNA methylation using the PrediXcan framework. CpG-specific prediction models developed in the ARIES and Understanding Society cohorts were applied to ALS genome-wide association study (GWAS) summary statistics …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Aberrant DNA methylation of imprinted genes and increased sperm DNA fragmentation (SDF) have been implicated in male infertility. However, their impact on assisted reproductive technology (ART) outcomes remains unclear. This pilot study aimed to investigate SDF and methylation status of H19, IGF2, and PEG1/MEST in relation to fertilisation and embryo development following intracytoplasmic sperm injection (ICSI).
METHODS: Twenty male partners of women undergoing ICSI were recruited and classified according to ART outcome into viable embryos (VEs, n = 7), non-viable embry…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neonatal hypoxic ischemic encephalopathy (HIE) is a common birth complication that can cause death or lifelong disabling conditions like cerebral palsy, epilepsy, and autism. It is well established that maternal infection and inflammation are significant risk factors for HIE but reasons for this increase in neurological risk to the offspring remain unknown. Inflammation or infection are associated with epigenetic changes and may contribute to the increased risk of neurodevelopmental disability in exposed offspring. Here, we analyzed and compared DNA methylation patterns in brain monocytes isol…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in NLRP7, implicated in 55% of recurrent hydatidiform mole characterized by hypomethylation at maternally methylated imprinted regions, are proposed to disrupt de novo DNA methylation in human oocytes. However, the precise mechanism remains unclear. Here, we identify TCL1A, a DNMT3A inhibitor, as an endogenous NLRP7-interacting partner. The cryo-EM structure of the NLRP7-TCL1A complex reveals its fundamental architecture. Comprehensive analysis demonstrates that the majority of recurrent hydatidiform mole-causing NLRP7 variants impair its interaction with TCL1A. Mechanistic…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Region-based epigenome-wide association studies have demonstrated improved statistical power and biological interpretability compared with probe-wise analyses of DNA methylation data. However, most existing region-based methods characterize methylation dysregulation primarily through changes in mean methylation levels associated with a phenotype of interest. Substantial evidence indicates that phenotype-associated methylation alterations may also manifest through changes in methylation variability or through joint shifts in mean and variability. Despite this, no existing statistical framework …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obesity represents a major global healthcare crisis, with childhood obesity rising at an alarming rate. Children with obesity are highly likely to carry it into adulthood, bringing numerous associated health risks. Even more troubling is the emerging understanding of "obesity memory", which contributes to the frequent issue of weight regain. Here, we show that obesity imprints CD4 T cells through DNA methylation, leading to a long-time lag, spanning years, before adaptive immune homeostasis is restored after weight loss. Differential DNA methylation analysis highlights autophagy and immune sen…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The claudin-5 ( CLDN5) gene is critical for blood-brain barrier integrity and may link traumatic stress, accelerated aging, and neurological disease. Building on prior research showing associations between trauma exposure and PTSD with CLDN5 DNA methylation (DNAm), we tested whether candidate CLDN5 DNAm loci were associated with advanced epigenetic aging in blood and brain tissue and with hippocampal volume.
METHODS: A total of 1302 trauma-exposed individuals (M age = 44.23, SD = 13.71; 76% males) underwent psychiatric diagnostic interviews and blood draws for obtaining epi/genetic…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: The purpose is to explore the mechanism and new therapeutic strategy of lethal 3 malignant brain tumor like 4 (L3MBTL4) gene in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC).
METHODS: Immunoprecipitation, siRNA knockdown, immunohistochemistry, homologous recombination (HR) and non-homologous end joining (NHEJ) reporter assays, comet assays, and a xenograft mouse model were employed.
RESULTS: L3MBTL4 was methylated in 16.3% (7/43) of intraductal papillary mucinous neoplasms, 19.0% (4/21) of mucinous cystic neoplasm, and 28.2% (84/298) of PDAC, and its expression was regulated by promoter regio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aging is the strongest risk factor for Alzheimer's disease (AD), but the molecular connections between aging and AD remain unclear. DNA methylation (DNAm) is implicated in both processes.
METHODS: We conducted a meta-analysis of DNAm in prefrontal cortex from two independent postmortem cohorts: the Religious Orders Study and Memory and Aging Project (ROSMAP) and Brains for Dementia Research (BDR). Age-associated CpG sites were identified using cohort-specific linear models adjusted for neuronal proportion, sex, and batch, followed by meta-analysis. We computed epigenetic age accel…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sinonasal tumours are rare entities presenting with non-specific symptoms, therefore being often misinterpreted. The present study aimed to evaluate if the 13-gene DNA Methylation assay for early cancer detection already assessed in the oral cavity, was also useful in nasal cavity tumours. The case series consisted of 93 patients (63 males/30 females), 49 with malignant tumours, 14 with benign/borderline tumours, 34 as control series with 33 inflammatory polyps and one fungus ball. We collected one flocked swab from the lesion and one from the contralateral nasal cavity. All sinonasal cancer c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Huntington's disease is caused by a trinucleotide CAG repeat expansion in the HTT gene. Despite displaying autosomal dominance, phenotypic variation exists amongst mutation carriers, in particular relating to the age that symptoms first occur. This variation is primarily driven by an inverse relationship between CAG expansion size and age of symptom onset. However, the majority of variation in age of onset that is independent of CAG repeat length is thought to be driven by environmental influences. Since DNA methylation can be altered by environmental factors, and as methylomic var…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A number of mechanisms that control Yersinia pestis behavior during its complex life cycle in both mammalian hosts and arthropod vectors are known to be thermally regulated. In bacteria, the response to temperature shifts often involves epigenetic factors, particularly changes in DNA methylation. In this study, we aimed to fully characterize the methylome of eleven Y. pestis strains from different subspecies. We described its temperature-dependent features by comparing cultures grown at 22 °C (typical flea environment) and 37 °C (mammalian host temperature). Only two methylation motifs were de…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global cancer incidence continues to rise, emphasizing the urgent need for improved diagnostics and management strategies. DNA methylation biomarkers in liquid biopsies offer a promising, minimally invasive solution. Despite their potential, only a few tests have successfully transitioned from research to clinical practice. This review addresses key aspects influencing successful biomarker development and clinical implementation-including liquid biopsy source selection, biomarker discovery workflow and targeted validation in clinical sample series-and provide strategies to improve accuracy, re…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most malignant solid tumors worldwide. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are the key factor in the … the effects of FTX knockdown and promoted the survival of HCC cells. In conclusion, DNMT1-dependent DNA methylation of FTX promotes the development of HCC through regulating miR-374b-3p/TFRC axis. Therefore, DNMT1/FTX/miR-374b-3p/TFRC axis may be a potential target for HCC.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is clinically divided into IGHV mutated (M-CLL) and IGHV unmutated (U-CLL) subtypes, which are thought to arise from distinct cells of origin along the B-cell differentiation pathway. We measured genome-scale DNA methylation in purified CLL samples ( n = 89) and utilized reference-based cell deconvolution techniques to develop a continuous metric of epigenetic similarity across a B-naive-like to B-memory-like scale (B-Index). B-Index accurately classifies CLL into clinical subtypes (98.8%), has a stronger epigenetic signal than IGHV gene percent identity, and…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with stage II-III colorectal cancer (CRC) often receive fluoropyrimidine-based chemotherapy, usually combined with other regimens, of which ∼50% experience severe chemotherapy-induced toxicities. The B-vitamin folate has been associated with toxicity risk, possibly through effects on DNA methylation. Here, we examined the potential role of folate-associated DNA methylation in the context of chemotherapy-induced toxicities. Systematic literature searches were conducted to identify studies investigating either DNA methylation profiles associated with folate status/intake or with toxicit…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-at-death estimation is critical in forensic investigations, particularly for skeletal and dental remains. Accurate age estimation is essential for constructing biological profiles in forensic investigations. DNA methylation, particularly in age-related genes such as FHL2, has emerged as a promising epigenetic marker for this purpose. While previous studies have applied methylation assays to the entire tooth, these methods often result in the destruction of the dental structures. In this study, we assessed whether FHL2 methylation levels measured using methylation-sensitive high-resolution …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural genomic variants leading to anaplastic lymphoma kinase (ALK) gene fusions and aberrant expression of the ALK tyrosine kinase are the hallmark of subtypes of T- and B-lineage neoplasms, namely ALK-positive anaplastic large lymphoma (ALCL) and ALK-positive large B-cell lymphoma (LBCL). The latter is a rare aggressive lymphoma, which has been initially identified as a variant of diffuse LBCL (DLBCL) with plasmablastic features. Here, we performed comparative DNA methylation profiling of human and murine ALK-positive B-cell neoplasms. Array-based DNA methylation data from ALK-positive L…
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is the strongest risk factor for Alzheimer's disease (AD), yet the molecular mechanisms linking aging to AD remain poorly understood. DNA methylation (DNAm) is an epigenetic modification that plays a critical role in gene regulation and has been implicated in both aging and AD. In this study, we performed a meta-analysis of DNAm profiles in the prefrontal cortex using two large, independent postmortem brain cohorts, the Religious Orders Study and Memory and Aging Project (ROSMAP) and Brains for Dementia Research (BDR), to identify DNAm differences associated with aging in late life. We i…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While DNA methylation (DNAm)-based algorithms of aging show promise for predicting age-related diseases, their comparative utility for incident cardiovascular disease (CVD) remains underexplored. We aimed to systematically compare 13 DNAm algorithms in relation to CVD risk in older adults.
METHODS: This prospective cohort study included 2112 participants from the US HRS (Health and Retirement Study) with baseline DNAm data (2016) and 6-year follow-up. DNAm profiling was performed using the Infinium MethylationEPIC BeadChip kit (EPIC, Illumina, San Diego, CA). Thirteen widely used …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования