Sky island mountain ranges of the American Southwest represent isolated habitat fragments surrounded by arid lowland barriers, making them powerful natural experiments for studying population divergence, demographic history and local adaptation. Here, we use whole-genome resequencing of the Western Hercules beetle (Dynastes grantii Horn, 1870) across four primary lineages to characterize the genomic consequences of habitat fragmentation and climate-driven isolation. Population structure analyses revealed strong hierarchical genetic differentiation consistent with isolation-by-distance, while A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomes of prokaryotes differ significantly in size and DNA composition. Escherichia coli is considered a model organism to analyze the processes involved in bacterial genome evolution, as the species comprises numerous pathogenic and commensal variants. Pathogenic and nonpathogenic E. coli strains differ in the presence and absence of additional DNA elements contributing to specific virulence traits and also in the presence and absence of additional genetic information. To analyze the genetic diversity of pathogenic and commensal E. coli isolates, a whole-genome approach was applied. Using DN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent reports of Dirofilaria immitis causing canine heartworm disease (HWD) in highly endemic foci of Italy suggested the increasing risk for dogs and humans. In southernmost areas, such as Linosa island (Sicily), previous studies showed D. immitis infection in 58.9 % of dogs and a parasitic exposure in 7.9 % of islanders. These findings prompted a targeted elimination program, which led to HWD elimination by 2022. Hence, the present study aimed to assessantibody response and kinetics among Linosa residents one year after the implementation of canine HWD elimination program. In 2023, bloo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) has been used therapeutically for over a century, the determinants of its probiotic properties r … play between colibactin, salmochelin, and siderophore-Mcc biosynthetic pathways suggests that these genomic islands were co-selected and played a role in the evolution of E. coli from phylogroup B2. This co-evolution observed in EcN illustrates the fine margin between pathogenicity and probiotic activity, and the need to address both the effectiveness and safety …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: High-grade serous ovarian cancer (HGSC) is the most common and lethal form of epithelial ovarian cancer (EOC). Two distinct tissues have been suggested as the tissue of origin: ovarian surface epithelia (OSE) and fallopian tube epithelia (FTE). We hypothesized that the DNA methylome of HGSC should more closely resemble the methylome of its tissue of origin. To this end, we profiled HGSC (n = 10), and patient-matched OSE and FTE (n = 5) primary fresh-frozen tissues, and analyzed the DNA methylome using Illumina 450K arrays (n = 20) and Agilent Sure Select methyl-seq (n = 7). Methylo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human genetic diversity in the Pacific has not been adequately sampled, particularly in Melanesia. As a result, population relationships there have been open to debate. A genome scan of autosomal markers (687 microsatellites and 203 insertions/deletions) on 952 individuals from 41 Pacific populations now provides the basis for understanding the remarkable nature of Melanesian variation, and for a more accurate comparison of these Pacific populations with previously studied groups from other regions. It also shows how textured human population variation can be in particular circumstances. Genet
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterohaemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O26:H11 have emerged as the most important non-O157:H7 EHEC, with respect to their ability to cause diarrhoea and the haemolytic uraemic syndrome (HUS). HUS is a leading cause of acute renal failure in children, and is mainly caused by EHEC expressing Shiga toxins (Stx) 1 and/or 2. Since 1996, EHEC O26, which produce Stx2 only and appear to have enhanced virulence, have been increasingly isolated from HUS patients in Germany. In contrast, EHEC O26 found in cattle predominantly produce Stx1 as the sole Stx. Additional potential virulence factors of EHE
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome 12q24.1 is a recurrent breakpoint in high-grade B-cell non-Hodgkin lymphoma (B-NHL). To identify the genes involved at 12q24.1, molecular cloning of a three-way translocation t(8;14;12)(q24.1;q32.3;q24.1) in a Burkitt lymphoma cell line (Wien 133) was performed; all four translocation breakpoints were cloned and sequenced. Analysis of clones encompassing the der(12)(12;14)(q24.1;q32.3) breakpoint showed a CpG island from chromosome 12q24.1 juxtaposed in a tail-to-tail configuration with a productively rearranged Ig VH4-DH-JH5 gene. A total of 4.5 kb of genomic DNA including the CpG
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The uropathogenic Escherichia coli strain 536 (O6:K15:H31) carries two unstable DNA regions on its chromosome which were termed pathogenicity islands (Pais). Both pathogenicity islands, Pai I and Pai II, are incorporated into tRNA specific loci: Pai I is located in the tRNA gene for selenocysteine (selC), and Pai II is integrated in the leucine-specific tRNA locus leuX. Mutant strain 536-21 has lost the two pathogenicity islands together with the intact tRNA genes. While 536 is a virulent strain, 536-21 has lost a number of properties, including in vivo virulence. In previous publications we r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The scavenging of atmospheric trace gases has been recognized as one of the lifestyle-defining capabilities of microorganisms in terrestrial polar ecosystems. Several metagenome-assembled genomes of as-yet-uncultivated methanotrophic bacteria, which consume atmospheric CH4 in these ecosystems, have been retrieved in cultivation-independent studies. In this study, we isolated and characterized a representative of these methanotrophs, strain D3K7, from a subarctic soil of northern Russia. Strain D3K7 grows on methane and methanol in a wide range of temperatures, between 5 and 30 °C. Weak growth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is an environmental bacterium and a nosocomial pathogen with clone C one of the most prevalent clonal groups. The P. aeruginosa clone C specific genomic island PACGI-1 harbors a xenolog of ftsH encoding a functionally diverse membrane-spanning ATP-dependent metalloprotease on the core genome. In the aquatic isolate P. aeruginosa SG17M, the core genome copy ftsH1 significantly affects growth and dominantly mediates a broad range of phenotypes, such as secretion of secondary metabolites, swimming and twitching motility and resistance to aminoglycosides, while the PACGI-1 x
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Denmark is a low prevalence country with regard to methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA). In 2008 and 2014, two neonatal wards in the Copenhagen area experienced outbreaks with a typical community acquired MRSA belonging to the same spa type and sequence type (t015:ST45) and both were PVL and ACME negative. In outbreak 1, the isolates harbored SCCmec IVa and in outbreak 2 SCCmec V. The clinical presentation differed between the two outbreaks, as none of five MRSA positive mothers in outbreak 1 had mastitis vs. five of six MRSA positive mothers in outbreak 2 (p < 0.02). To investig
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete genome sequence of a relatively weak virulent tobacco pathogen, Pseudomonas syringae pv. tabaci 8018 (Pta8018) was determined to elucidate key genetic elements that cause disease. Genome comparison of Pta8018 to the previously available P. syringae pv. tabaci strains revealed that Pta8018 and Pta11528 had high genome synteny, with an approximately 5 Mb chromosome inversion in Pta6605. Furthermore, Pta8018 had lost the pathogenicity island GI-1 including a tabtoxin biosynthesis gene cluster and showed weak virulence on Nicotiana tabacum 'Xanthi NC' (Xanthi). When inoculated into se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen that causes listeriosis in humans with severe symptoms. In South Korea, listeriosis had only been reported sporadically among hospitalized patients until the first foodborne outbreak occurred in 2018. In this study, a L. monocytogenes strain responsible for this outbreak (FSCNU0110) was characterized via whole genome sequencing and compared with publicly available L. monocytogenes genomes of the same clonal complex (CC). Strain FSCNU0110 belonged to multilocus sequence typing (MLST)-based sequence type 224 and CC224, and core genome MLST-based sub
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica is a ubiquitous and clinically-important bacterial pathogen, able to infect and cause different diseases in a wide range of hosts. Here, we report the isolation and characterization of a new S. enterica serovar (13,23:i:-; S. Tirat-Zvi), belonging to the Havana supper-lineage that was isolated from a wild house sparrow (Passer domesticus) in Israel. Whole genome sequencing and complete assembly of its genome indicated a plasmid-free, 4.7 Mb genome that carries the Salmonella pathogenicity islands 1-6, 9, 19 and an integrative and conjugative element (ICE), encoding arsenic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes (Lm) is a foodborne pathogen causing listeriosis. Invasive forms of the disease mainly manifest as septicaemia, meningitis and maternal-neonatal infections. Lm-associated respiratory infections are very rare and little known. We reported two Lm respiratory infection cases occurred in Central Italy during the summer of 2020, in the midst of the SARS-CoV2 pandemic. In addition to collect the epidemiological and clinical characteristics of the patients, we used Whole Genome Sequencing to study the genomes of the Lm isolates investigating their virulence and antimicrobial pr
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The underlying resistance mechanism and phylogenetic relationship of a colistin-resistant Salmonella enterica serovar Enteritidis strain EC20120916 that resulted in fatal meningitis in an immunocompromised patient was investigated by whole-genome sequencing (WGS) analysis.
METHODS: WGS of strain EC20120916 was performed on an Illumina MiSeq platform and annotation of the sequence was performed using the Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Antimicrobial resistance genes, plasmid replicons and pathogenicity islands were identified. A phylogenetic tree was constructed usin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In addition to harmless commensal species, Neisseria genus encompasses two pathogenic species, N. meningitidis (the meningococcus) and N. gonorrhoeae (the gonococcus), which are responsible for meningitis and genital tract infections, respectively. Since the publication of the first Neisseria genome in 2000, the presence of several genomic islands (GI) comprising maf genes has been intriguing. These GIs account for approximately 2% of the genome of the pathogenic Neisseria species and the function of the proteins encoded by maf genes remained unknown. We showed that maf genes encode a function…
СтатьяКомментарийПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxigenic Klebsiella oxytoca strains produce the pyrrolobenzodiazepine enterotoxins tilimycin (TM) and tilivalline (TV), which contribute to the development of antibiotic-associated hemorrhagic colitis. The biosynthesis of these toxins depends on the nonribosomal peptide synthetase (NRPS) operon located within the til pathogenicity island. Although several global and signal-responsive regulators of NRPS operon expression have been identified, the regulatory network governing enterotoxin biosynthesis remains incompletely characterized. In this study, we identified a previously unrecognized tran
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serotype Typhimurium, a nontyphoidal Salmonella (NTS), results in a range of enteric diseases, representing a major disease burden worldwide. There is still a significant portion of Salmonella genes whose mechanistic basis to overcome host innate defense mechanisms largely remains unknown. Here, we have applied transposon insertion sequencing (Tn-seq) method to unveil the genetic factors required for the growth or survival of S. Typhimurium under various host stressors simulated in vitro. A highly saturating Tn5 library of S. Typhimurium 14028s was subjected to selection du
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования