Fifty years ago, David Baltimore published a brief conceptual paper delineating the classification of viruses by the routes of genome expression. The six "Baltimore classes" of viruses, with a subsequently added 7th class, became the conceptual framework for the development of virology during the next five decades. During this time, it became clear that the Baltimore classes, with relatively minor additions, indeed cover the diversity of virus genome expression schemes that also define the replication cycles. Here, we examine the status of the Baltimore classes 50 years after their advent and
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mesothelioma is a rare and aggressive cancer linked to asbestos exposure and characterized by rapid metastasis and poor prognosis. Inhibition of adenosine deaminase acting on dsRNA 2 (ADAR2) RNA binding but not ADAR2 editing has shown antitumor effects in mesothelioma. Natural compounds from the Traditional Chinese Medicine (TCM) database were docked to the RNA-binding interface of ADAR2's second dsRNA binding domain (dsRBD2), and their drug-likeness and predicted safety were assessed. Eight ligands (ZINC000085597263, ZINC000085633079, ZINC000014649947, ZINC000034512861, ZINC000070454124, ZINC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ixodes scapularis is the main vector of Lyme disease in the eastern and central United States. Tick salivary secretion has been shown as important for both blood-meal completion and pathogen transmission. Here we report a duplication event of cystatin genes in its genome that results in a transcription-regulated boost of saliva inhibitory activity against a conserved and relatively limited number of vertebrate papain-like cysteine proteases during blood feeding. We further show that the polypeptide products of the two genes differ in their binding affinity for some enzyme targets, and they dis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA damage response (DDR) is an extensive signaling network that is robustly mobilized by DNA double-strand breaks (DSBs). The primary transducer of the DSB response is the protein kinase, ataxia-telangiectasia, mutated (ATM). Here, we establish nuclear poly(A)-binding protein 1 (PABPN1) as a novel target of ATM and a crucial player in the DSB response. PABPN1 usually functions in regulation of RNA processing and stability. We establish that PABPN1 is recruited to the DDR as a critical regulator of DSB repair. A portion of PABPN1 relocalizes to DSB sites and is phosphorylated on Ser95 in a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut virome is a complex community that exists in equilibrium with the host. Disruptions of this balance could drive the development of inflammatory diseases, such as inflammatory bowel disease (IBD). RNA editing, particularly A-to-I editing by ADAR1, prevents the excessive immune response to viral double strand (ds) RNA. Failure of RNA editing may sustain inflammation and this study explore the role of ADAR1 in IBD. ADAR1 was analyzed in IBD patients and healthy controls (CTR) using western blotting and qPCR. Colonic epithelial cells (HCEC-1CT), ex vivo organ cultures, and colonic organoid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All positive-strand RNA viruses of eukaryotes studied assemble RNA replication complexes on the surfaces of cytoplasmic membranes. Infection of mammalian cells with poliovirus and other picornaviruses results in the accumulation of dramatically rearranged and vesiculated membranes. Poliovirus-induced membranes did not cofractionate with endoplasmic reticulum (ER), lysosomes, mitochondria, or the majority of Golgi-derived or endosomal membranes in buoyant density gradients, although changes in ionic strength affected ER and virus-induced vesicles, but not other cellular organelles, similarly. W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral diseases remain among the most difficult constraints in horticultural crops because they reduce yield, impair market quality, persist in vegetatively propagated material and are intensified by mixed infections, insect vectors and climate-driven shifts in disease epidemiology. Conventional measures, including resistant cultivars, sanitation, vector management, pesticide use and virus-free planting material, remain essential but often lack the precision and flexibility required for rapidly evolving plant-virus pathosystems. RNA interference (RNAi) provides a sequence-specific antiviral str
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nuclear factor 90 (NF90) is a double-stranded RNA-binding protein involved in a multitude of different cellular mechanisms such as transcription, translation, viral infection, and mRNA stability. Recent data suggest that NF90 might influence the abundance of target mRNAs in the cytoplasm through miRNA- and Argonaute 2 (Ago2)-dependent activity.
RESULTS: Here, we identified the interactome of NF90 in the cytoplasm, which revealed several components of the RNA-induced silencing complex (RISC) and associated factors. Co-immunoprecipitation analysis confirmed the interaction of NF90 w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronavirus replication is understood to occur within double membrane vesicles (DMVs) that arise during viral infection. Prior work has determined that these DMVs have characteristic pores formed from the non-structural viral proteins nsp3 and nsp4, which facilitate export of newly synthesized viral RNA. Yet how the replication machinery, which is comprised of the non-structural proteins nsp7 to nsp16, is recruited to the DMV remains a mystery. Working from AlphaFold and previously determined structures, we constructed a series of models that link formation of the DMV pore to nsp5 protease pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Immunotherapies such as immune checkpoint blockade have achieved remarkable success in treating cancer. Unfortunately, response rates have been limited in multiple cancers including hepatocellular carcinoma (HCC). The critical function of epigenetics in tumor immune evasion and antitumor immunity supports harnessing epigenetic regulators as a potential strategy to enhance the efficacy of immunotherapy. Here, we discovered a tumor-promoting function of FTSJ3, an RNA 2'-O-methyltransferase, in HCC by suppressing antitumor immune responses. FTSJ3 was upregulated in hepatocellular carc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus, Picobirnavirus (PBV), Spanish 'pico'='small', birna for 'bipartite RNA' genome, belongs to the family Picobirnaviridae under the proposed order Diplornavirales. PBV infections have been reported from diarrhoeic animal species and humans as well as from asymptomatic cases. The detection of Picobirnaviruses (PBVs) in diarrhoeic faecal specimens from children aged <5 years, suggestive of zoonotic transmission is being reported. 23 Picobirnavirus positive faecal specimens were detected by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and silver staining from a set of 1112 faecal specimens c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) is a double-stranded DNA virus, but its life cycle involves an intermediate stage, during which pregenomic RNA (pgRNA) is encapsulated in the capsid and then reverse-transcribed into the minus DNA strand. These immature HBV virions are the key target for antiviral drug discovery. In this study, we investigate the flexibility and mechanical stability of the HBV capsid containing pgRNA by employing residue-resolved coarse-grained molecular dynamics simulations. The results showed that the presence of pgRNA tends to decrease the overall flexibility of the capsid. In additi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Hepatitis E virus (HEV) causes both the endemic and epidemic spread of acute hepatitis in many parts of the world. HEV open reading frame 3 (ORF3) encodes a 13-kDa multifunctional protein (vp13) that is essential for HEV infection of animals. The exact role of vp13 in HEV infection remains unclear. In this study, vp13 was found to enhance interferon (IFN) production induced by poly(I · C), a synthetic analog of double-stranded RNA. Poly(I · C) treatment induced a higher level of IFN-β mRNA in HeLa cells stably expressing vp13 than in control cells. Using a luciferase reporter const
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Internal ribosome entry sites (IRESs) are RNA sequences that facilitate cap- and end-independent translation initiation in eukaryotes. Type IV IRESs, which include the hepatitis C virus IRES, directly bind the 40S ribosomal subunit and require only a subset of canonical initiation factors to function. As the full extent of diversity and species distribution of type IV IRESs was unknown, we sought to identify and classify the architectural variation of all members. Using a secondary structure homology-based search method, we identified 163 putative type IV IRESs from viruses with diverse hosts
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcriptional dynamic of mammalian cells when these transit from the ubiquitous mitotic to a meiotic-specific program is key to understand this switch central to sexual reproduction. By quantifying active RNA polymerase II and nascent transcripts using single cell dataset and ethynyl-uridine pool-down with sorted cells from synchronized testes, we detailed the transcriptional activity of murine male germ cells. When spermatogonia differentiate, transcription slows down, reaching minimal activity at meiotic entry and resumes during pachytene stage. This event, we termed EMLT (for early me
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Embryonic stem cells (ESCs) display a distinctive resistance against various viruses, irrespective of any interferon response. Nevertheless, the underlying mechanism of this resistance remains unclear. In this study, we identify vesicle-associated membrane protein 5 (VAMP5) as a potent cell-autonomous defense factor against coronaviruses, including SARS-CoV-2, with high expression levels observed in ESCs and mesoderm. VAMP5 not only exhibits functional conservation in restricting the replication of SARS-CoV-2 and its variants, as well as other highly pathogenic coronaviruses, but also shows ef
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Positive-strand RNA viruses replicate in close association with rearranged intracellular membranes. For hepatitis C virus (HCV) and severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), these rearrangements comprise endoplasmic reticulum (ER)-derived double membrane vesicles (DMVs) serving as RNA replication sites. Cellular factors involved in DMV biogenesis are poorly defined. Here, we show that despite structural similarity of viral DMVs with autophagosomes, conventional macroautophagy is dispensable for HCV and SARS-CoV-2 replication. However, both viruses exploit factors involved i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Epstein-Barr virus (EBV) EBER transcripts are small, highly structured RNAs able to bind to and inhibit activation of the double-stranded RNA-dependent protein kinase PKR in cell-free systems, and within latently infected B-cell lines they inhibit alpha interferon-induced apoptosis that is believed to be mediated through PKR. Here, we address the consequences of EBER expression for PKR activation in vivo in response to alpha interferon. In agreement with published findings, either EBV infection or the EBERs alone protected Burkitt lymphoma cells from alpha-interferon-induced apoptosis. How
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
microRNAs are 22-nucleotide-long double-strand small RNAs, able to modulate gene expression at posttranscriptional level, degrading mRNA and/or impairing translation. They have been shown to regulate mRNA and protein abundance and to participate in many regulatory circuits controlling developmental timing, cell proliferation and differentiation, apoptosis and stress response. Notably, microRNA activity has been correlated to the pathogenesis of cancer; they are aberrantly expressed in solid and hematological tumors, suggesting that they could function as oncogenes or tumor suppressors. The eme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vimentin (VIM), an indispensable protein, is responsible for the formation of intermediate filament structures within cells and plays a crucial role in viral infections. However, the precise role of VIM in classical swine fever virus (CSFV) infection remains unclear. Herein, we systematically investigated the function of VIM in CSFV replication. We demonstrated that both knockdown and overexpression of VIM affected CSFV replication. Furthermore, we observed by confocal microscopy the rearrangement of cellular VIM into a cage-like structure during CSFV infection. Three-dimensional (3D) imaging
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования