Escherichia coli and Shigella species are closely related and genetically constitute the same species. Differentiating between these two pathogens and accurately identifying the four species of Shigella are therefore challenging. The organism-specific bioinformatics whole-genome sequencing (WGS) typing pipelines at Public Health England are dependent on the initial identification of the bacterial species by use of a kmer-based approach. Of the 1,982 Escherichia coli and Shigella sp. isolates analyzed in this study, 1,957 (98.4%) had concordant results by both traditional biochemistry and serol…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Shigella, a major diarrheal disease pathogen worldwide, is the target of vaccine development. The Global Enteric Multicenter Study (GEMS) investigated burden and etiology of moderate-to-severe diarrheal disease in children aged <60 months and matched controls without diarrhea during 3 years at 4 sites in Africa and 3 in Asia. Shigella was 1 of the 4 most common pathogens across sites and age strata. GEMS Shigella serotypes are reviewed to guide vaccine development.
METHODS: Subjects' stool specimens/rectal swabs were transported to site laboratories in transport media and plated o…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) is an important genetic tool that provides molecular markers for rapid differentiation of closely related strains. We have applied SNP discovery and analysis for distinguishing each of the four Shigella serogroups (Boydii, Dysenteriae, Flexneri, and Sonnei) and for discriminating individual strains within the same serogroup by using 24 SNPs selected from nine genes. Five SNPs were identified from sequence analysis of two housekeeping genes (gapA and thrB) used previously in our lab to differentiate Shigella isolates into distinct lineages. The…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella is the cause of shigellosis or bacillary dysentery, the occurrence of which is estimated to be 165 million cases per year worldwide, resulting in 1.1 million deaths. Rapid and reliable assays for detecting and identifying Shigella in food, environmental and clinical samples are therefore necessary. Shigella species are traditionally identified by their O antigens. This study developed a DNA microarray targeting O-serotype-specific genes to detect all 34 distinct O-antigen forms of Shigella, including Shigella boydii types 1-18, Shigella dysenteriae types 1-13, Shigella flexneri types …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
From May 2004 to October 2006, a prospective study was carried out in Dakar, Senegal, to update information about the antimicrobial susceptibility of Shigella spp. isolated from stool specimens. Among the 165 non-duplicate strains collected, 81 (49%) were identified as Shigella flexneri, 75 (45%) as Shigella sonnei, 5 (3%) as Shigella boydii, and 4 (2%) as Shigella dysenteriae. Disk diffusion testing revealed that the majority of isolates were resistant to sulphonamides, trimethoprim-sulfamethoxazole, streptomycin, and tetracycline (respective overall resistance rates: 90, 90, 96, and 94%). Mo…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования