We identified in a large Tunisian pedigree a novel UBE3A frameshift mutation in exon 16 coding region, and we expect that the resulting UBE3A truncated protein in our patients is non-functional since the mutation implies the catalytic region of the enzyme. The family includes 14 affected patients born from four sisters. This mutation was found in all surviving affected individuals and their mothers pointing out the importance of genetic counseling possibility in Angelman syndrome (AS). All patients had severe mental retardation with epilepsy and microcephaly. Minor clinical expression variatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prolyl 4-hydroxylases (P4H) catalyze the post-translational hydroxylation of proline residues and play a role in collagen production, hypoxia response, and cell wall development. P4Hs belong to the group of Fe(II)/alphaKG oxygenases and require Fe(II), alpha-ketoglutarate (alphaKG), and O(2) for activity. We report the 1.40 A structure of a P4H from Bacillus anthracis, the causative agent of anthrax, whose immunodominant exosporium protein BclA contains collagen-like repeat sequences. The structure reveals the double-stranded beta-helix core fold characteristic of Fe(II)/alphaKG oxygenases. Th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rate constants of the hydride-transfer reactions from isopropyl alcohol (i-PrOH) to an NAD(+) model, 9-phenylxanthylium ion (PhXn(+)), in acetonitrile (AN) and in water containing AN (80% H(2)O/20% AN) were determined over a temperature range from 36 to 67 degrees C. The reactions follow second-order rate laws. In the latter solution, formation of the water adduct of PhXn(+) was observed as a side-equilibrium (K). The observed inverse solvent kinetic isotope effect (k(H(2)O)(obs)/k(D(2)O)(obs) = 0.54), the larger than unity equilibrium isotope effect (K(H(2)O)/K(D(2)O) = 2.69), and the res
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Based on their ability to chelate metals, hydroxamate molecules and siderophores have been successfully used as metalloenzyme inhibitors. As the anthrax toxin lethal factor (LF) is a zinc (Zn)-metallopeptidase, an investigation of the ability of some small non-siderophore hydroxamate compounds, 5 hydroxamate-containing siderophores, and 1 catecholate siderophore was undertaken to determine whether these compounds would inhibit LF. In addition, salmon sperm protamine and ethylenediaminetetraacetic acid were investigated.
METHODS: A spectrophotometric assay of LF activit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a computational and structural study, we investigated a series of 4-substituted lin-benzoguanines that are potent inhibitors of tRNA-guanine transglycosylase (TGT), a putative target for the treatment of shigellosis. At first glance, it appears self-evident that the placement of a positively charged ligand functional group between the carboxylate groups of two adjacent aspartate residues in the glycosylase catalytic center leads to enhanced ligand binding. The concomitant displacement of water molecules that partially solvate the aspartates prior to ligand binding appears to result as a con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human butyrylcholinesterase (hBChE) hydrolyzes or scavenges a wide range of toxic esters, including heroin, cocaine, carbamate pesticides, organophosphorus pesticides, and nerve agents. Organophosphates (OPs) exert their acute toxicity through inhibition of acetylcholinesterase (AChE) by phosphorylation of the catalytic serine. Phosphylated cholinesterase (ChE) can undergo a spontaneous, time-dependent process called "aging", during which the OP-ChE conjugate is dealkylated. This leads to irreversible inhibition of the enzyme. The inhibition of ChEs by tabun and the subsequent aging reaction a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cysteine-rich secretory proteins (CRISPs) are widely distributed in mammals, reptiles, amphibians and secernenteas, and are involved in a variety of biological reactions. Here we report the crystal structure of triflin, a snake venom derived blocker of high K(+)-induced artery contraction, at 2.4A resolution. Triflin consists of two domains. The first 163 residues form a large globular body with an alpha-beta-alpha sandwich core, which resembles pathogenesis-related proteins of group-1 (PR-1). Two glutamic acid-associated histidine residues are located in an elongated cleft. A Cd(2+) resid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the mechanisms by which cytochrome(s) P450 (CYP) discriminate good from poor substrates, and orient them for highly regio- and stereoselective oxidation, has considerable intrinsic and practical importance. Here we present results of a study of fatty acid hydroxylation by CYP2B1 in a reconstituted system and in microsomes from phenobarbital-pretreated rats. The results indicate that 2B1 prefers decanoic acid as the optimum fatty acid substrate (among C(8)-C(16)) and that it hydroxylates all positions five or more methylene groups distant from the carboxylate carbon. That hydroxyl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multicomponent synthesis of a mini-library of histone deacetylase inhibitors with imidazo[1,2- a]pyridine-based cap groups is presented. The biological evaluation led to the discovery of the hit compound MAIP-032 as a selective HDAC6 inhibitor with promising anticancer activity. The X-ray structure of catalytic domain 2 from Danio rerio HDAC6 complexed with MAIP-032 revealed a monodentate zinc-binding mode.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 5,5-disubstitutedpyrimidine-2,4,6-triones represent a new class of MMP inhibitors showing selectivity for the gelatinases A and B, collagenase-3, and human neutrophil collagenase. The SAR presented here is in good agreement with an X-ray structure of compound 5 bound to the catalytic domain of stromelysin-1. While of the barbiturate structural class, compound 5 did not show any toxic or sedative effects.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Francisella tularensis is a highly infectious facultative intracellular bacterium and aetiological agent of tularaemia. The conserved hypothetical lipoprotein with homology to thiol/disulphide oxidoreductase proteins (FtDsbA) is an essential virulence factor in F. tularensis. Its protein sequence has two different domains: the DsbA_Com1_like domain (DSBA), with the highly conserved catalytically active site CXXC and cis-proline residue; and the domain amino-terminal to FKBP-type peptidyl-prolyl isomerases (FKBP_N). To establish the role of both domains in tularaemia infection models, site-dire
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The value of reducing the activity of ornithine decarboxylase (ODC), a key enzyme in the biosynthesis of polyamines, is well-appreciated. Polyamines are necessary components for cell growth, and manipulation of polyamine homeostasis may be an effective strategy for the treatment of a number of disorders, including neoplastic diseases. An approach to develop an effective DNAzyme, using the 10-23 model, against ODC is described in these studies. DNAzymes able to cleave the target ODC RNA were identified in vitro and further characterized by the effect each had on ODC protein and activity levels
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclic nucleotide phosphodiesterases (PDEs) are a superfamily of enzymes controlling cellular concentrations of the second messengers cAMP and cGMP. Crystal structures of the catalytic domains of cGMP-specific PDE5A1 and cAMP-specific PDE4D2 in complex with the nonselective inhibitor 3-isobutyl-1-methylxanthine have been determined at medium resolution. The catalytic domain of PDE5A1 has the same topological folding as that of PDE4D2, but three regions show different tertiary structures, including residues 79-113, 208-224 (H-loop), and 341-364 (M-loop) in PDE4D2 or 535-566, 661-676, and 787-81…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribonucleotide reductase (RNR) is an essential enzyme that converts ribonucleotides to deoxyribonucleotides, utilizing a ∼32 Å chain of proton-coupled electron transfer (PCET) reactions spanning two protein subunits to generate a catalytic cysteine radical. Two cryogenic electron microscopy structures of the active complex of E. coli RNR are currently available. One structure was trapped in the preturnover state, prior to radical translocation, and the other structure was trapped in the midturnover state, with the radical in the active site. Herein, we use molecular dynamics simulations to inv
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All protein kinases contain conserved amino acid residues that bind the ATP substrate molecule and promote catalysis. As an intensely pursued drug target class, kinase inhibitor development is often streamlined by the utilization of three-dimensional structural data and binding modes to achieve a robust understanding of the molecular basis of kinase inhibition and inform structure-guided drug design. We analyze X-ray cocrystal structures of 300+ diverse kinase-inhibitor complexes and offer an assessment with respect to the targeting of conserved polar amino acid residues, which we term the "Ca
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An artificial phosphatase, GoldAP, is rationally designed by installation of a metal-binding site onto a natural protein fragment to form a well-defined active centre on gold nanoparticles. GoldAP efficiently catalyses the hydrolysis of p-nitrophenyl phosphate in seconds with a kcat that is higher than that of Escherichia coli alkaline phosphatase.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dinucleotide molecule, 5'-phospho-2'-deoxyuridine-3'-pyrophosphate adenosine-3'-phosphate (pdUppA-3'-p) (PUA), is known to act as a highly potent inhibitor of bovine pancreatic ribonuclease A (RNase A) with Ki = 27 nM (D. D. Leonidas et al., Biochemistry, 1999, 38, 10287-10297). In the present work, PUA is investigated to study the effect of different conformations on its residence time and dynamical interactions at the active site of RNase A. Two conformers of PUA, designated as closed and open in terms of their end-to-end distances, have been screened in different environments based on a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ELOVL6 is a key enzyme in long-chain fatty acid elongation, catalyzing the conversion of C16 fatty acids into C18 fatty acids. While its role in lipid metabolism is well established, recent studies have linked ELOVL6 to metabolic and neurodegenerative diseases, making it an attractive therapeutic target. However, the absence of a resolved crystal structure and limited mechanistic understanding of its inhibition pose significant challenges for drug discovery. In this study, we employ a multitiered computational approach, including structure prediction, molecular dynamics (MD) simulations, and f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nearly half of the global population is infected with Helicobacter pylori. Antibiotic use has led to substantial antimicrobial resistance and unintended gut microbiota depletion, creating an urgent need for alternative therapeutic strategies. Here, we demonstrate that urease, a key enzyme that enables H. pylori survival by hydrolysing urea to neutralize stomach acid, is a conserved antibacterial target with low risk of resistance development. Using comprehensive deep mutational scanning coupled with phage-based functional screening, we systematically evaluated how mutations in core residues af
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ergosteryl-3β-O-L-aspartate synthase (ErdS) catalyzes tRNA-dependent aspartylation of ergosterol, a lipid essential for fungal cell membrane integrity. However, the functional significance of ergosteryl-aspartate and the molecular mechanisms underlying its synthesis remain unclear. Here, we show that ErdS localization is highly dynamic and that Erg-Asp is required for proper hyphal growth, sporulation, and spore germination, and likely influences stress tolerance. The cryo-electron microscopy structure of ErdS revealed an unprecedented sterol-binding pocket. In addition, the structures in comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.