BACKGROUND: Tumor necrosis factor (TNFA) is the canonical member of the TNF superfamily, which plays a major role in both inflammation and apoptosis. To evaluate the role of TNFs in otitis media (OM), the most common disease of childhood, we evaluated middle ear (ME) expression of genes encoding the TNF and TNF receptor superfamilies during bacterial OM in the mouse, characterized OM in TNFA-deficient mice, and assessed apoptosis during OM in normal versus TNF-deficient MEs.
RESULTS: TNFs and TNF receptors were broadly regulated during OM, with TNFA showing the highest level of up-regulation.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella are able to modulate host cell functions facilitating both uptake and resistance to cellular host defence mechanisms. While interactions between bacterial modulators and cellular proteins have been the main focus of Salmonella research, relatively little is known about mammalian gene regulation in response to Salmonella infection. A major class of mammalian gene modulators consists of microRNAs. For our study we examined interactions of microRNAs and regulated mRNAs in mammalian intestinal Salmonella infections using a piglet model.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: After
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All living cells possess adaptive responses to environmental stress that are essential to ensuring cell survival. For motile organisms, this can culminate in avoidance or attractile behavior, but for sessile organisms such as plants, stress adaptation is a process of success or failure within the confines of a given environment. Nearly all bacterial species possess a highly evolved system for stress adaptation, known as the "stringent response." This ancient and ubiquitous regulatory response is mediated by production of a second messenger of general stress, the nucleotide guanosine-3',5'-(bis
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrative and conjugative elements (ICEs) are widespread autonomous mobile DNA within bacterial chromosomes. ICEs contain the genes necessary for excision from the chromosome, conjugative transfer to a new recipient cell, and chromosomal reintegration. They can also carry accessory genes that, while not essential for transfer, confer adaptive phenotypes to the host, contributing to host survival under stressful or changing conditions. Genome studies have indicated that Pseudomonas aeruginosa clinical isolates carry a wide range of related ICEs with adaptive genes enriched for heavy metal res
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heteroresistance and persistence are examples of mechanisms that can allow otherwise drug-susceptible bacteria to survive and resume growth after antibiotic exposure. These temporary forms of antibiotic tolerance can be caused by the upregulation of stress response genes or a decrease in cell growth rate. However, it is not clear how the expression of multiple genes contributes to tolerance phenotypes. Using fluorescent reporters for stress-related genes, we conducted real-time measurements of expression prior to, during, and after antibiotic exposure. We first identified relationships between
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-transcriptional regulation via small regulatory RNAs (sRNAs) has been implicated in diverse regulatory processes in bacteria, including virulence. One class of sRNAs, termed trans-acting sRNAs, can affect the stability and/or the translational efficiency of regulated transcripts. In this study, we utilized a collaborative approach that employed data from infection with the Borrelia burgdorferi Tn library, coupled with Tn-seq, together with borrelial sRNA and total RNA transcriptomes, to identify an intergenic trans-acting sRNA, which we designate here as ittA for infectivity-associated an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteroides fragilis is the strict anaerobic bacteria most commonly found in human infections, and has a high mortality rate. Among other virulence factors, the remarkable ability to acquire resistance to a variety of antimicrobial agents and to tolerate nanomolar concentrations of oxygen explains in part their success in causing infection and colonizing the mucosa. Much attention has been given to genes related to multiple drug resistance derived from plasmids, integrons or transposon, but such genes are also detected in chromosomal systems, like the mar (multiple antibiotic resistance) locus
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The widespread and inappropriate use of antibiotics, for therapeutic and prophylactic purposes, has contributed to a global crisis of rapidly increasing antimicrobial resistance of microorganisms. This resistance is often associated with elevated mutagenesis induced by the presence of antibiotics. Additionally, subinhibitory concentrations of antibiotics can trigger stress responses in bacteria, further exacerbating this problem. In the present study, we investigated the effect of low doses of ciprofloxacin on the induction of the SOS response and the subsequent development of antibiotic resis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Centella asiatica (L.) Urb or Indian pennywort is a plant of ethnopharmacological relevance, commonly called as Brahmi in South India known for its antimicrobial property in gut and for the treatment of other gut ailments. Natural anti-virulence drugs that disarm pathogens by directly targeting virulence factors or the cell viability and are thus preferred over antibiotics as these drugs impose limited selection pressure for resistance development. In this regard, an in-vitro experimental study was conducted to know the effect of extract of Centella asiatica(L.)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A luciferase-based reporter system for the expression of the toxic shock syndrome toxin-1 gene (tst) of Staphylococcus aureus FRI 1187 was used in continuous culture to determine whether high cell density on transient shift-down or shift-up of specific growth rate (mu) induced expression of tst. Little expression occurred at steady state at a low dilution rate (D) and in a transient period of increasing mu. However, a rapid and approximately 130-fold increase in expression occurred during a transient shift-down of mu. These findings suggest reduction of mu is a key element in the control of ts
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Production of a heat-stable, extracellular esterase by Streptomyces scabies is regulated by zinc ions. The esterase-encoding gene (est) from S. scabies was cloned and expressed in Streptomyces lividans. In S. lividans, expression of the est gene is also regulated by Zn2+, and the esterase is efficiently secreted in this organism. The sequence of the est gene suggests that a 39-amino acid signal peptide is removed during secretion of this protein. Deletion analysis has indicated that the hydrophobic domain of the signal peptide is required for secretion. Gel retardation assays and DNaseI footpr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Corynebacterium diphtheriae is the causative agent of diphtheria, a severe respiratory disease in humans. Diphtheria toxin, encoded by the tox gene, is a potent exotoxin secreted by C. diphtheriae that is responsible for much of the morbidity and mortality of diphtheria. Expression of the tox gene is regulated by iron and the diphtheria toxin repressor (DtxR). In addition to controlling toxin expression, DtxR functions as a global iron-dependent regulatory factor that mediates iron homeostasis in C. diphtheriae. While numerous genes regulated by DtxR and iron are known, a genome-wide study of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Production of flagella is costly and subject to global multilayered regulation, which is reflected in the hierarchical control of flagellar production in many bacterial species. For Salmonella enterica serovar Typhimurium and its relatives, global regulation of flagellar production primarily occurs through the control of flhDC transcription and mRNA translation. In this study, the roles of the homologous multidrug resistance regulators MarA, SoxS, Rob, and RamA (constituting the mar-sox-rob regulon in S Typhimurium) in regulating flagellar gene expression were explored. Each of these regulator
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcription activator-like effector Tal12a is widely conserved among Xanthomonas campestris pv. campestris strains that cause black rot in Brassica crops. However, its role in disease remains unclear. To investigate how Tal12a contributes to pathogenesis, we combined transcriptomic profiling of cauliflower leaves infected with Tal12a-expressing strains, prediction of TALE-binding elements, and heterologous expression assays in Nicotiana benthamiana. The aim of this approach was to identify candidate susceptibility genes. Artificial TALEs were further employed to validate the contribution
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is the causative agent of a spectrum of human and animal diseases ranging from gastroenteritis to typhoid fever. It is a food--and water--borne pathogen and infects via ingestion followed by invasion of intestinal epithelial cells and phagocytic cells. In this study we employed a mutational approach to define the nutrients and metabolic pathways required by Salmonella enterica serovar Typhimurium during infection of a human epithelial cell line (HeLa). We deleted the key glycolytic genes, pfkA and pfkB to show that S. Typhimurium utilizes glycolysis for replication within HeLa cells
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia burgdorferi, an agent of Lyme disease, establishes persistent infection in immunocompetent animals and humans. Although the infection in humans can be cleared by antibiotic therapy, persistence in reservoir animals is necessary for the maintenance of the bacterium in the natural reservoir host⇔tick vector infectious cycle. B. burgdorferi binds to β(1)- and β(3)-chain integrins, and the P66 outer membrane protein is responsible for at least some of the integrin binding activity of the spirochete. Because integrins are transmembrane, bidirectional signaling molecules, integrin binding m
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of multidrug-resistant Pseudomonas strains poses a serious threat to public health. Essential oil components, such as thymol (TH), exhibit potent antibacterial activity. However, the effects of continuous sublethal TH exposure and resulting changes to antibiotic susceptibility remain poorly understood. Here, we investigated a multi-resistant Pseudomonas psychrophila strain after TH adaptation using an integrated transcriptomic and metabolomic approach. Treatment with TH caused a significant decrease in MIC values for aminoglycosides (streptomycin, gentamicin, kanamycin) and tetra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As Bacillus cereus endospores exist in various vegetables grown in soil, the possibility of contamination in food products with high salt concentrations cannot be ignored. Recent studies revealed that harsh conditions affect the resistance of bacteria; thus, we investigated the developmental aspect of heat resistance of B. cereus after sporulation with high NaCl concentration. RNA sequencing was conducted for transcriptomic changes when B. cereus endospores formed at high salinity, and membrane fluidity and hydrophobicity were measured to verify the transcriptomic analysis. Our data showed tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Toxin complex (Tc) family proteins were first identified as insecticidal toxins in Photorhabdus luminescens and have since been found in a wide range of bacteria. The genome of Yersinia pestis, the causative agent of bubonic plague, contains a locus that encodes the Tc protein homologues YitA, YitB, YitC, and YipA and YipB. Previous microarray data indicate that the Tc genes are highly upregulated by Y. pestis while in the flea vector; however, their role in the infection of fleas and pathogenesis in the mammalian host is unclear.
RESULTS: We show that the Tc proteins YitA and Yip
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio alginolyticus is a widespread marine pathogen responsible for major disease outbreaks in aquaculture and zoonotic infections in humans. Its pathogenicity is tightly regulated by quorum sensing and driven by biofilm formation, motility, and multiple virulence factors. The organism's high adaptability and virulence complicate traditional antibiotic treatments, especially amid rising antibiotic resistance. Although thymol, a natural monoterpenoid, is known for its broad-spectrum bactericidal activity, its effects on the survival and virulence of V. alginolyticus have not been previously in
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.