Protein-inclusive single-cell multimodal profiling has emerged as a transformative strategy for resolving cellular heterogeneity by jointly measuring proteins and complementary molecular features in the same cells. The resulting protein-inclusive datasets are increasingly used to characterize cellular states, construct multimodal cell atlases, and decode disease mechanisms. However, such data are rarely included in existing databases. In this study, SingPro was updated from a single-cell proteomics database into a proteomics-centric knowledge base for single-cell multimodal profiling. Distinct…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oncoprotein β-catenin has critical roles in cell adhesion and cell signalling. β-catenin affects human physiology and pathology through numerous interaction partners, of which many have been discovered by standard affinity purification-based proteomics. However, the interaction landscape of β-catenin remains incompletely understood, highlighting a need for new experimental approaches for the exploration of β-catenin biology. Proximity proteomics, which facilitate the discovery of molecules vicinal to proteins-of-interest by mass spectrometry, have recently emerged as a powerful complementa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), has led to significant global health burden, including both acute infections and persistent post-acute sequelae, also known as Long COVID (LC) in survivors. While clinical management has reduced case-fatality rates, a substantial proportion of patients develop LC, a heterogeneous syndrome with long-term symptoms. This complex continuum requires therapeutic strategies for both the acute and chronic phases. Plasma proteomics has emerged as a powerful tool in precision medicin…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellulosomes are large, surface-displayed enzyme complexes that enable anaerobic bacteria to degrade recalcitrant plant polysaccharides, yet … far more prevalent and diverse than previously appreciated and demonstrate the power of structural proteomics to uncover deeply divergent functional systems in the gut microbiome.IMPORTANCEPlant cell wall polysaccharides are a major dietary carbon source, yet their degradation relies on rare, highly specialized microbial enzyme assemblies known as celluloso …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyrroloquinoline quinone (PQQ) is a bacterial redox cofactor enabling enzyme catalysis in various sugar and alcohol dehydrogenases. However, its proposed additional role as a "longevity vitamin" lacks a clear molecular basis and is thus highly debated. Here, we applied chemical proteomics to identify previously unknown classes of PQQ-binding proteins. We designed and synthesized a structurally diverse suite of five PQQ probes equipped with a diazirine photo-cross-linker and an alkyne handle for target identification. The fidelity of the probes was first evaluated for two well-characterized bac…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasma proteomics is a rapid, noninvasive, and highly informative approach for identifying disease biomarkers. However, the wide dynamic range of protein concentration limits the depth of liquid chromatography-tandem mass spectrometry proteomics. To address this challenge, we evaluated, with an Orbitrap Astral instrument using DIA, the performance of several protein depleting and enriching technologies on platelet-free plasma. Specifically, we assessed: perchloric acid depletion, immunodepletion, ProteoMiner, MagNet-SAX, ENRICHplus, Proteonano and the combination of ProteoMiner and immunodeple…
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell omics tools provide unique insights into heterogeneous cell populations and their responses to stimuli. For example, single-cell … ted isolation, cryopreservation, and nanodroplet-based processing for single-cell mass spectrometry proteomics analysis of the postmortem human brain cortex-derived microglia. From a single microglial cell, 1039 proteins could be identified on average. As a proof-of-principle, we applied single-cell proteomics for exploring the heterogeneity of brain microgl …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and comprehensive analysis of complex proteomes across large sample sets is vital for unlocking the potential of systems biology. We present a high-throughput mass spectrometry (MS) proteomics method that integrates narrow-window data-independent acquisition (nDIA) with short-gradient micro-flow chromatography, enabling profiling of >240 samples per day. This optimized MS approach identifies 6,201 and 7,466 human proteins with 1- and 2-min gradients, respectively. As a practical application, we analyzed 507 samples composed of 13 different tissues from mice treated with the enzyme-drug L…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large-scale plasma proteomics studies advance the human proteome atlas mapping and precision medicine, but face inefficiencies in sample processing. Here, we developed a fully automated, room-temperature All-in-Tip platform, enabling deep proteome profiling (>3000 protein groups per batch), high throughput (>4600 samples per day for sample preparation), and low cost (<$1 per sample). The All-in-Tip utilized functional macroporous nanoparticles (NPs) as tip fillings, forming protein corona to narrow the dynamic range of plasma proteomics within 5 min. Additionally, the spatial confinement of NP…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic flatworms, including cestodes and trematodes, are covered by a specialized syncytial tegument that mediates nutrient uptake and host-parasite interactions. While the tegument of trematodes has been extensively characterized, its molecular composition in cestodes remains largely unknown. In this work, we performed a comparative proteomic analysis of the tegument of three cestode species, including larval and adult stages: Hymenolepis microstoma, Mesocestoides corti (syn. M. vogae) and the human pathogen Echinococcus multilocularis. Using stringent enrichment criteria relative to whole
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Despite the growing use of proximity labeling tools, there are limited techniques available to identify subcellularly localized … efrontal cortex (mPFC) cell bodies and corresponding axons in a downstream projection. We performed proteomics to identify proteins enriched in mPFC cell bodies and terminals, and upregulated in mPFC cell bodies following an acute cocaine injection. These advancements enable the detection of proteins at the subcellular level within short labeling windows, al …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogenesis of systemic lupus erythematosus (SLE) is closely associated with abnormal activation of B lymphocytes. Telitacicept simultaneously blocks B-cell stimulating factors and proliferation-inducing ligands, thereby inhibiting B-cell proliferation and differentiation, demonstrating favorable therapeutic efficacy in the majority of SLE patients. However, there is a lack of reliable biomarkers of efficacy and systematic elucidation of its mechanism of action.
METHODS: The study employed proteomics and metabolomics analysis to explore biomarkers and mechanisms underlying th…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune disease characterized by systemic inflammation and multi-organ involvement, yet its molecular mechanisms remain incompletely understood. While plasma proteomics provides valuable insights into disease-associated alterations, most studies focus on high-abundance proteins. Low-abundance plasma proteins, which often serve as critical regulators of immune signaling and inflammatory pathways, remain insufficiently characterized in RA.
METHODS: Plasma samples from 27 RA patients and 10 healthy controls (HCs) were analyzed using the SomaS…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep Visual Proteomics (DVP) combines high-resolution microscopy, computational instance segmentation, laser capture microdissection (LMD), and ultrasensitive mass spectrometry to enable spatially resolved molecular analysis of defined cellular populations. Within this workflow, LMD plays a central role by physically isolating microscopy-defined regions of interest for downstream proteomic profiling. However, accurate image-to-stage transfer remains challenging due to limitations in imaging resolution, tissue preparation variability, laser cutting parameters, and partially manual alignment pro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bottom-up proteomic workflows rely on sequential preprocessing steps, commonly including peptide-to-protein aggregation ("roll-up"), to enha … es. We found that the median and mean roll-up methods outperform the sum method in both PTM and LiP proteomics, and site-level quantification in LiP outperforms peptide-level quantification. Our findings offer the first systematic, data-driven guidance for selecting roll-up techniques in site-level proteomic analyses, with implications for both PTM-focused a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Epstein-Barr virus (EBV) is a human gamma-herpesvirus which infects over 90% of the global population and is associated with lymphoid an … in insight into the factors restricting BZLF1 expression, we used the PICh method of locus-specific proteomics (proteomics of isolated chromatin segments) to identify proteins which occupy BZLF1 promoter DNA. We identified more than 30 proteins associated with the BZLF1 promoter, including the nucleosome remodeler CHD4 and components of the Polycomb PRC1 com …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atherosclerotic plaque rupture is a major cause of cerebrovascular events, yet the molecular determinants underlying vulnerability-related plaque morphology, including fibrous-cap thickness, remain incompletely defined. Using histomorphology-guided spatial proteomics, here we delineate molecular programs associated with plaque cap phenotype across discrete plaque subregions. In 112 carotid endarterectomy specimens, differences between thin-cap and thick-cap plaques were predominantly localized to the necrotic core and fibrous cap. These differences were enriched for processes related to inflam…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The absence of robust biomarkers for early detection of severe liver disease (SLD) highlights the critical need for high-throughput proteomics-driven discovery. In this prospective cohort study, we aimed to identify plasma protein signatures associated with incident SLD and assess their clinical utility. Using the large-scale Olink Explore 1536 platform, we quantified 1461 plasma proteins in 46951 participants from the UK Biobank community-based cohort without baseline liver disease. Over a median follow-up of 14.1 years, we identified 490 proteins significantly associated with incident SLD ri…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics, the study of the structure and function of proteins, has been used to investigate candidate biomarkers and study the pathophysiology of various diseases. Biomarkers may be useful in diagnosing, monitoring and assessing treatment responses. This review provides an overview of proteomic techniques, describes the workflow and pipeline for biomarker discovery, and evaluates the current literature on proteomic studies in veterinary gastroenterology in dogs and cats. Current studies in this field are advancing our understanding of disease pathophysiology in conditions such as chronic ent…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования