Borrelia burgdorferi, a causative agent of Lyme disease, has a highly unusual segmented genome composed of both circular molecules and linear DNA replicons terminated by covalently closed hairpin ends or telomeres. Replication intermediates of the linear molecules are processed into hairpin telomeres via the activity of ResT, a telomere resolvase. We report here the results of limited proteolysis and mass spectroscopy to identify two main structural domains in ResT, separated by a chymotrypsin cleavage site between residues 163 and 164 of the 449 amino acid protein. The two domains have been o…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the SARS-CoV-2 pandemic, the so far two most effective approved antivirals are the protease inhibitors nirmatrelvir, in combination with … hen confirmed several ensitrelvir-specific mutants in gold standard enzymatic assays and SARS-CoV-2 replicons. These findings indicate that the two inhibitors can have distinct viral resistance profiles, which could determine treatment decisions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) is responsible for the spread and persistence of bacterial infections. Surveillance of AMR in healthy individ … , and ybtP&Q, and plasmids in the isolates sequenced. All isolates harbored more than three plasmid replicons of either the Col and/or Inc type. Plasmid reconstruction revealed an integrated tetA gene, a toxin production caa gene in two E. coli isolates, and a cusC gene in K. quasivariicola ST3879, which induces neonatal meningitis. The global spread of AM …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic has emphasized the urgency for effective antiviral therapies against SARS-CoV-2. Targeting the main protease (3CLpro) … and 72-fold increases in nirmatrelvir IC50 values. Additionally, we constructed SARS-CoV-2 omicron replicons containing these mutations, and one of the mutants (S144A/E166A) displayed a 20-fold increase in EC50, confirming the role of FEP in identifying drug-resistance mutations. Our findings suggest that FEP can be a valuable tool in proactively monitori …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmids are the main driving forces for the rapid dissemination of blaNDM-1. In recent years, blaNDM-1-carrying fusion plasmids have been frequently reported. However, the evolutionary patterns of blaNDM-1-carrying fusion plasmids remain largely unknown. Herein, we reported a blaNDM-1-bearing fusion plasmid pZX35-269k possessing IncFII and IncA/C2 replicons from clinical ST349 E. coli 13ZX35. The backbone of pZX35-269k was structurally unstable, which was manifested in different types of structural dissociation during conjugation and passage, thereby forming various daughter plasmids. Moreove…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virulence plasmids of hypervirulent Klebsiella pneumoniae (hvKp) have the potential to transfer to drug-resistant strains or integrate with … ence and resistance plasmids may be the major cause. Virulence plasmids commonly possessed multiple replicons, of which IncFIBK was the most prevalent (84.6%). We identified 49 IncFIBK alleles among 583 IncFIBK plasmids, and they could be divided into Clades I, II, and III. We further observed that conjugative and non-conjugative virulence plasmids could b …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficacy of RNA-based vaccines has been recently demonstrated, leading to the use of mRNA-based COVID-19 vaccines. The application of self-amplifying mRNA within these formulations may offer further enhancement to these vaccines, as self-amplifying mRNA replicons enable longer expression kinetics and more potent immune responses compared to non-amplifying mRNAs. To investigate the impact of administration route on RNA-vaccine potency, we investigated the immunogenicity of a self-amplifying mRNA encoding the rabies virus glycoprotein encapsulated in different nanoparticle platforms (solid l…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
serogroup Canicola is one of the most important pathogens causing leptospirosis and is used as a vaccine strain of the current Chinese human … and circulating isolate LJ178; both had two circular chromosomes and two circular extrachromosomal replicons. Compared with the strain 611 genome, 132 single nucleotide polymorphisms and 92 indels were found in strain LJ178. The larger lipopolysaccharide biosynthesis locus of serogroup Canicola was identified in both genomes. The phylogenetic analysis bas …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The underlying resistance mechanism and phylogenetic relationship of a colistin-resistant Salmonella enterica serovar Enteritidis strain EC20120916 that resulted in fatal meningitis in an immunocompromised patient was investigated by whole-genome sequencing (WGS) analysis.
METHODS: WGS of strain EC20120916 was performed on an Illumina MiSeq platform and annotation of the sequence was performed using the Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Antimicrobial resistance genes, plasmid replicons and pathogenicity islands were identified. A phylogenetic tree was constructed usin…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus cereus is a close relative of B. anthracis, the causative agent of anthrax whose pathogenic determinants are located on pXO1 and pX … land. The plasmids were found in about 17% of the isolates, but their frequencies and expression of replicons differed within and between populations. In the multi-locus sequence typing, the bacteria exhibited high genetic polymorphism reflected by 116 sequencing types, including 84 singletons and 10 clonal complexes, which mainly consisted of isolates of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) infection is a major worldwide problem causes acute and chronic HCV infection. Current treatment of HCV includes peg … been acquired by executing combinational therapy of compounds with standard regime in different HCV replicons. Even though, diverse groups of compounds have been described as antiviral targets against HCV via Specifically Targeted Antiviral Therapy for hepatitis C (STAT-C) approach (in which compounds are designed to directly block HCV or host proteins con …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) is the primary cause of urinary tract infections (UTIs) in adult women, which are increasingly refractory to antimicrobial treatment. UPEC colonizes the vagina prior to causing a UTI. Our hypothesis was that the vaginal flora would be enriched in UPEC and therefore have a greater prevalence of non-susceptibility relative to the rectal flora. We used disk diffusion to determine the antimicrobial susceptibilities of 100 cervico-vaginal E. coli (CVEC) and 100 rectal E. coli (REC) isolates from 200 different patients. Phylogeny, plasmid replicons, and antimicr…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 33 clinical isolates encoding TEM-3 (CTX-1) from four French hospitals were studied. The strains belonged to seven species, Klebs … -3, was widespread and appeared, by Southern hybridization, as the progenitor of the other types of replicons. The plasmid epidemic responsible for dissemination of TEM-3 in clinical isolates of members of the family Enterobacteriaceae may have originated in S. marcescens since pCFF04 was first detected in this species.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Archaea possess a remarkably diverse mobilome, but for many archaeal viruses and plasmids, even the basic processes, such as genome replicat … replication mechanism in archaea, highlight deep evolutionary links between archaeal and bacterial replicons, and provide a versatile genetic platform for studying virus-host interactions in hypersaline environments.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterococcus spp. are opportunistic bacteria capable of acquiring antimicrobial resistance and virulence traits, facilitating their adaptati … e sequencing revealed a genetically diverse population, comprising multiple sequence types, plasmid replicons, and virulence gene profiles, including determinants for adhesion, biofilm formation, capsule synthesis, and extracellular proteases. Ionophore resistance genes (narA, narB) were also detected in several lineages. The coexistence of antimicrobial r …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extended-spectrum β-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae (ESBL-K. pneumoniae) is a priority antimicrobial-resistant pathogen with the c … s identified diverse antimicrobial resistance determinants, virulence-associated genes, and plasmid replicons, with IncFIB(K) being the predominant plasmid type. Phylogenetic analysis demonstrated close genetic relatedness between wastewater and farm environment isolates, with some differing by only 0-6 single-nucleotide polymorphisms, suggesting possible …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic led to a dramatic increase in healthcare-associated infections and antimicrobial resistance, particularly in intensive … phylogenetic reconstruction, and in silico detection of resistance and virulence genes and plasmid replicons. High-risk multidrug-resistant (MDR) clones were identified among Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, and Staphylococcus aureus. Core genome SNP analysis confirmed direct transmission of K. pneumoniae between patients …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Klebsiella pneumoniae ST307 is emerging as a significant global high-risk antimicrobial-resistant (AMR) clone with a … rulence factors such as iutA, clpK1, fyuA, fimH, mrkA, Irp2, and TraT and an IncFiB(pQil)/IncFII(K) replicon, which harbors the blaKPC-2 gene. Additionally, the transposable element Tn4401 was identified as a key vehicle for the mobilization of the blaKPC-2 resistance gene. Finally, this is the report of a high-risk CRKP ST307 clone expressing KPC-2, SHV-1 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Segmental duplications play an important role in genome evolution via their contribution to copy-number variation, gene-family diversificati … demonstrate the applicability of SegMantX for the identification of diverged gene transfers between replicons and plasmid hybridization events. Our findings highlight MGEs as drivers of segmental duplications in plasmid evolution, leading to the amplification of their cargo genes, including antibiotic resistance genes. SegMantX provides a powerful framewor …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enterococcus thailandicus was initially isolated from food in Thailand, and a single clinical case involving an intra-abdominal … nfirmed using whole-genome analysis. No antimicrobial resistance genes, virulence genes, or plasmid replicons were identified in these isolates. Phylogenetic analysis of the clinical isolates and 21 E. thailandicus isolates in public databases indicated a relatively close lineage to that obtained from pig stool samples in Japan. No antimicrobial resistance …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования