OBJECTIVE: To analyze a fetus with abnormal cardiac ultrasound by using various techniques and explore its genotype-phenotype correlation.
METHODS: Lymphocytes derived from umbilical cord blood sample were subjected to G-banding analysis. Short tandem repeats quantitative fluorescence PCR (STR-QF-PCR) was used for analysis of fetal DNA as an auxiliary test. Low-coverage whole genome sequencing (WGS) was used to detect chromosomal deletion/duplication which exceeded 100 kb in size.
RESULTS: The karyotype of the fetus was 47,XN,+mar. As detected by STR-QF-PCR, the copy number of GATA178F11 loc
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TANGO2 deficiency disorder (TDD) is a rare autosomal recessive condition characterized by recurrent metabolic crises, rhabdomyolysis, encephalopathy, seizures, intellectual disability, and life-threatening cardiac arrhythmias.
METHODS: Here, we describe 16 affected individuals from 10 consanguineous Palestinian families harboring a shared homozygous missense variant in TANGO2 (NM_152906.7:c.443T > G; NP_690870.3:p.(Leu148Trp)). Exome sequencing identified the variant in three probands and targeted Sanger sequencing confirmed segregation in all remaining families. The variant is ab
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The poxtA gene is a transferable linezolid-resistance gene that encodes an ATP-binding cassette F protein that prevents linezolid from inhibiting protein synthesis. In enterococci, the presence of the poxtA gene does not consistently imply resistance to linezolid. The objective of this work was to analyze the role of the poxtA gene in linezolid susceptibility in a cohort of five poxtA+ clinical isolates of Enterococcus faecium.
METHODS: Three of the isolates were linezolid-resistant and two were linezolid-susceptible. The genomes of all five isolates were sequenced using short and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic myopathies are caused by pathogenic variants in >300 genes across the nuclear and mitochondrial genomes. Although short-read next-generation sequencing (NGS) has revolutionised the diagnosis of genetic disorders, large and/or complex genetic variants, which are over-represented in the genetic myopathies, are not well characterised using this approach. Long-read sequencing (LRS) is a newer genetic testing technology that overcomes many of the limitations of NGS. In particular, LRS provides improved detection of challenging variant types, including short tandem repeat (STR) expansions, c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
APOEε4 is the strongest genetic risk factor for Alzheimer's disease (AD) with approximately 50% of AD patients carrying at least one APOEε4 allele. Our group identified a protective interaction between APOEε4 with the African-specific A allele of rs10423769, which reduces the AD risk effect of APOEε4 homozygotes by approximately 75%. The protective variant lies 2Mb from APOE in a region of segmental duplications (SD) of chromosome 19 containing a cluster of pregnancy specific beta-1 glycoprotein genes (PSGs) and a long non-coding RNA. Using both short and long read sequencing, we demonstrate t
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis type 1 (NF1) presents an autosomal dominant, haploinsufficient, and multisystemic disorder with patches of skin café-au-lait spots, lisch nodules in the iris, even tumors in the peripheral nervous system or fibromatous skin. In this study, a Chinese young woman who suffered from NF1 disease with first-trimester spontaneous abortion was recruited. Analysis for whole exome sequencing (WES), Sanger sequencing, short tandem repeat (STR), and co-segregation was carried out. As results, a novel, heterozygous, de novo pathogenic variant (c.4963delA:p.Thr1656Glnfs*42) of the NF1 gene
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Usher syndrome encompasses a group of genetically and clinically heterogeneous autosomal recessive disorders with hearing deficiencies and retinitis pigmentosa. The mechanisms underlying the Usher syndrome are highly variable. In the present study, a Chinese family with Usher syndrome was recruited. Whole exome sequencing (WES), Sanger sequencing, homozygosity mapping, short tandem repeat (STR) analysis and segregation analysis were performed. Functional domains of the pathogenic variant for USH2A were analysed. We identified a homozygous frameshift variant c.99_100insT (p.Arg34Serfs*41) in th
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The unknown origin of DNA samples derived from crime scenes generates a considerable amount of uncertainty, as do unexpected short tandem repeat (STR) results caused by sample mix-ups, contamination, medical interventions, and transgender individuals (broad meaning). Genetic abnormalities such as somatic/germline mutations, mosaicism or chimerism, sex reversal cases, aneuploidies, and chromosomal structural rearrangements are also possible causes of such results. The evidence offered by the present study suggested that additional DYS385 alleles, as seen in mixed stain samples and in the potent
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax is common as a zoonotic disease in the southern Caucasus area including parts of Turkey and Georgia. In this region, population genetics of the etiological agent Bacillus anthracis comprises, where known, the major canonical single nucleotide polymorphism (canSNP) groups A.Br.Aust94 and A.Br.008/009 of the pathogen's global phylogeny, respectively. Previously, isolates of B. anthracis from Turkey have been genotyped predominantly by multi locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) or canSNP typing. While whole genome sequencing is the future gold standard, it is currently s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional PCR methods combined with linkage analysis based on short tandem repeats (STRs) or Karyomapping with single nucleotide polymorphism (SNP) arrays, have been applied to preimplantation genetic diagnosis (PGD) for spinal muscular atrophy (SMA), an autosome recessive disorder. However, it has limitations in SMA diagnosis by Karyomapping, and these methods are unable to distinguish wild-type embryos with carriers effectively. Mutated allele revealed by sequencing with aneuploidy and linkage analyses (MARSALA) is a new method allowing embryo selection by a one-step next-generation seque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) has many strains; however, it remains unclear whether a causal relationship exists between different regions and viral genetic variants in healthy persons. This study was designed to examine the relationship between EBV strains in tonsils and adenoids and peripheral blood lymphocytes of the same individuals using different measurements of EBV strain polymorphism. This study examined whether EBV contains two or three copies of a tandem repeat sequence in the first intron of the BZLF-1 gene. The genotype of the virus from P3HR-1, designated Z*, yielded a 415-bp product,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is an emerging infectious disease that has been identified as both a human and animal health problem worldwide. Regular outbreaks associated with specific risk factors have been reported in Argentina. However, there are no available data concerning the genetic population level for this pathogen. Therefore, the aim of this work was to describe the genetic diversity of Leptospira interrogans through the application of two molecular typing strategies: variable number of tandem repeats (VNTR) and multilocus sequence typing (MLST). For this purpose, seven reference strains and 18 non-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chimerism in humans is a rare phenomenon often initially identified in the resolution of an ABO blood type discrepancy. We report a dispermic chimera who presented with mixed field in his B antigen typing that might have been mistaken for the B3 subtype. The propositus is a healthy Korean male blood donor. Neither his clinical history nor initial molecular investigation of his ABO gene explained his mixed field agglutination with murine anti-B. Chimerism was suspected, and 9 short tandem repeat (STR) loci were analyzed on DNA extracted from blood, buccal swabs, and hair from this donor and on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repetitive DNA motifs with potential variable-number tandem repeats (VNTR) were identified in the genome of Neisseria meningitidis and used to develop a typing method. A total of 146 meningococcal isolates recovered from carriers and patients were studied. These included 82 of the 107 N. meningitidis isolates previously used in the development of multilocus sequence typing (MLST), 45 isolates recovered from different counties in Norway in connection with local outbreaks, and 19 serogroup W135 isolates of sequence type 11 (ST-11), which were recovered in several parts of the world. The latter g
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify the genetic defect leading to the congenital nuclear cataract affecting a large five-generation Swiss family.
METHODS: Family history and clinical data were recorded. The phenotype was documented by both slit lamp and Scheimpflug photography. One cortical lens was evaluated by electron microscopy after cataract extraction. Lenticular phenotyping and genotyping were performed independently with short tandem repeat polymorphism. Linkage analysis was performed, and candidate genes were PCR amplified and screened for mutations on both strands using direct sequencing.
RESULTS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three mutant alleles (i1, i4, and i5) of the tyrosinase gene in the i locus of the medaka fish Oryzias latipes have hitherto been described, all being associated with transposable element insertion. We have recently identified another allele causing a complete albino phenotype in homozygous carriers and named it i6. Sequence comparison between the tyrosinase gene for the i6 allele (Tyr-i6) and the wild-type gene previously obtained (Tyr-i+) revealed three deletions of 8, 44, and 245 bp. The first two deletions reside in an intron and are differences in the number of tandem tetranucleotide repe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Added by telomerase, arrays of TTAGGG repeats specify the ends of human chromosomes. A complex formed by six telomere-specific proteins associates with this sequence and protects chromosome ends. By analogy to other chromosomal protein complexes such as condensin and cohesin, I will refer to this complex as shelterin. Three shelterin subunits, TRF1, TRF2, and POT1 directly recognize TTAGGG repeats. They are interconnected by three additional shelterin proteins, TIN2, TPP1, and Rap1, forming a complex that allows cells to distinguish telomeres from sites of DNA damage. Without the protective ac
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type I interferons (IFNs) are key innate immune cytokines and have undergone extensive lineage-specific gene expansion during vertebrate evolution. Although IFN gene expansion has traditionally been attributed to local tandem duplication, whether alternative genomic mechanisms contribute to the diversification of type I IFN genes remains largely unexplored. Here, we identified an unusual expansion pattern of the type I subgroup d IFN gene (IFNd) in the large yellow croaker (Larimichthys crocea, Lc), revealing a potential transposition-associated mechanism underlying the duplication and relocat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Telomeres, are composed of tandem repeat sequences located at the ends of chromosomes and are required to maintain genomic stability. Telomeres can become shorter due to cell division and specific lifestyle factors. Critically shortened telomeres are linked to cellular dysfunction, senescence and aging. A number of studies have used low resolution techniques to assess telomere length in the placenta. In this study, we applied Single Telomere Length Analysis (STELA) which provides high-resolution chromosome specific telomere length profiles to ask whether we could obtain more deta…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant adeno-associated virus (rAAV) vectors have been shown to permit very efficient widespread transgene expression in skeletal muscle after systemic delivery, making these increasingly attractive as vectors for Duchenne muscular dystrophy (DMD) gene therapy. DMD is a severe muscle-wasting disorder caused by DMD gene mutations leading to complete loss of dystrophin protein. One of the major issues associated with delivery of the DMD gene, as a therapeutic approach for DMD, is its large open reading frame (ORF; 11.1 kb). A series of truncated microdystrophin cDNAs (delivered via a single
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования