BACKGROUND: Fecal microbiota transplantation (FMT) and the colonization of delivered donor microbes has been reported to improve the negativ … , Bacteroides, Lachnoclostridium, Escherichia-Shigella, unclassified Lachnospiraceae sequences, and archaea Methanobrevibacter) in the recipient prior to FMT (background community) was the most important feature in predicting colonization for all routes of fecal microbiota transplant. CONCLUSION: FMT administered as a lyophilized feed additive shows promi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A laboratory-evolved strain of Thermococcus kodakarensis was found to grow in a nutrient-rich medium without elemental sulfur (S0) or pyruva … lts also indicated that NupDABC, containing NupD with a unique primary structural property, was the archaeal nucleoside-specific transporter. These findings demonstrated that the PBP pathway is not only a nucleoside salvage module but also potentially acts as a central metabolic module supporting cell growth when nucleosides are available. This expands ou …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aimed to determine whether dietary supplementation with methanogen inhibitors during early life may lead to an imprint on … sed in treated compared to control calves during the first 14 weeks; however, at week 24 and 49 the archaea community was similar between groups. Bacterial proportions at the phylum level and the abundant bacterial genera were similar between treatment groups. In summary, methane inhibition increased hydrogen emissions, altered the methanogen community an …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylmercury (MeHg) is a potent bioaccumulative neurotoxin that is produced by certain anaerobic bacteria and archaea. Mercury (Hg) methylation has been linked to the gene pair hgcAB, which encodes a membrane-associated corrinoid protein and a ferredoxin. Although microbial Hg methylation has been characterized in vivo, the cellular biochemistry and the specific roles of the gene products HgcA and HgcB in Hg methylation are not well understood. Here, we report the kinetics of Hg methylation in cell lysates of Desulfovibrio desulfuricans ND132 at nanomolar Hg concentrations. The enzymatic Hg m…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Sequence comparisons showed that the sulfur oxygenase reductase (SOR) of the haloalkaliphilic bacterium Thioalkalivibrio paradox … des to sulfite, thiosulfate, and hydrogen sulfide. SORs are known from mesophilic and extremophilic archaea and bacteria. All SORs seem to form highly thermostable 24-subunit hollow spheres. They carry a low-potential mononuclear nonheme iron in the active site and an indispensable cysteine; however, their exact reaction mechanisms are unknown. Typically, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hyperthermostable beta-glycosidases from the Archaea Sulfolobus solfataricus (SsbetaGly) and Pyrococcus furiosus (CelB) hydrolyse beta-glycosides of D-glucose or D-galactose with relaxed specificities pertaining to the nature of the leaving group and the glycosidic linkage. To determine how specificity is manifested under conditions of kinetically controlled transgalactosylation, the major transfer products formed during the hydrolysis of lactose by these enzymes have been identified, and their appearance and degradation have been determined in dependence of the degree of substrate convers…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis (CF) is a genetic disease with mutational changes leading to profound dysbiosis, both pulmonary and intestinal, from a very young age. This dysbiosis plays an important role in clinical manifestations, particularly in the lungs, affected by chronic infection. The range of microbiological tools has recently been enriched by metagenomics based on next-generation sequencing (NGS). Currently applied essentially in a gene-targeted manner, metagenomics has enabled very exhaustive description of bacterial communities in the CF lung niche and, to a lesser extent, the fungi. Aided by pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caulobacter species are Alphaproteobacteria that commonly inhabit plant-associated and aquatic microbial communities. Although Caulobacter i … lysaccharides in bacterial infection by N4-family phages.IMPORTANCEViruses that infect bacteria and archaea, known as phages, shape microbial communities through their effects on host survival and gene flow. Yet for many microbes, the phages that infect them and the host structures required for infection remain poorly characterized. Caulobacter species ar …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxin-antitoxin (TA) systems are ubiquitously distributed in bacteria and archaea and have been implicated in various functions such as plasmid maintenance, phage defense, biofilm formation, stress response, and persistence, but their regulatory mechanisms and roles in haloarchaea are largely unknown. In this study, we found that four of the eight putative VapBC TA systems of Natrinema gari J7-2 are functional in strain J7-2 and Haloferax volcanii. Among them, the NgVapBC1 system is composed of the antitoxin NgVapB1 and the toxin NgVapC1, and the two proteins could form a NgVapBC1 complex. The…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The microbial ecosystem of women undergoes enormous changes during pregnancy and the perinatal period. Little is known about the … y, apart from lactose and oxaloacetic acid, which were elevated during active lactation. Fungal and archaeal profiles were indicative of pregnancy status. Methanobacterium signatures were found mainly in np women, and Methanobrevibacter showed an opposite behavior in the oral cavity (increased) and vagina (decreased) during pregnancy. Our findings suggest …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to engineer and optimise a dysbiotic biofilm model to develop in vitro root caries for investigating microbial … nd post-treatment strategies, including reads mapped to microorganisms other than bacteria, such as archaea and viruses. Carbohydrate esterases had increased expression in the post-treated biofilms and in samples without sugar cycles, while glucosyltransferases were highly expressed in the presence of sucrose cycles. Enrichment for functions related to ni …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gastrointestinal tract, skin and mucosal surfaces are inhabited by a complex system of bacteria, viruses, fungi, archaea, protists, and eukaryotic parasites with predominance of bacteria and bacterial viruses (bacteriophages). Collectively these microbes form the microbiota of the microecosystem of humans. Recent advancement in technologies for nucleic acid isolation from various environmental samples, feces and body secretions and advancements in shotgun throughput massive parallel DNA and RNA sequencing along with 16S ribosomal gene sequencing have unraveled the identity of otherwi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The human sweat is a mixture of secretions from three types of glands: eccrine, apocrine, and sebaceous. Eccrine glands open dir … mples. Approximately 5 % of the reads were found to map to other genomes: including bacteria (83%), archaea (3%), and virus (13%), identified bacteria species were consistent with those commonly colonizing the human upper body and arm skin. Small RNA-seq from EV-enriched pooled sweat RNA resulted in 74% of the trimmed reads mapped to the human genome, wit …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Zur regulon is central to zinc homeostasis in the zinc-resistant bacterium Cupriavidus metallidurans It comprises the transcription regu … heir zinc homeostasis. Members of the COG0523 family of metal-chaperoning GE3-type GTPases exist in archaea, bacteria, and eucaryotes, including humans, and they may be involved in delivery of zinc to thousands of different proteins. We used a combination of molecular, physiological, and biochemical methods to demonstrate the important but diverse functio …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mineral salt bricks are often used in cow raising as compensation for mineral losses to improve milk yield, growth, and metabolic activity. … 0.05). Based on these results, we performed high-throughput sequencing to explore the bacterial and archaeal communities of the rumen samples. Succiniclasticum and Prevotella, two propionate-producing bacteria, were predominant in samples of both adults and heifers. At the phylotype level, mineral salt intake led to a significant shift from Succiniclastic …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preterm delivery causes substantial neonatal mortality and morbidity. Unrecognized intra-amniotic infections caused by cultivati … real-time PCR assays to amplify, identify and quantify ribosomal DNA (rDNA) of bacteria, fungi and archaea from amniotic fluid of 166 women in preterm labor with intact membranes. We sequenced up to 24 rRNA clones per positive specimen and assigned taxonomic designations to approximately the species level. Microbial prevalence, diversity and abundance we …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Overactive bladder syndrome (OAB) is a poorly understood symptom complex that affects 40% of females over the age of 40, with clinical features including urinary urgency and incontinence. In addition to inflammation, oxidative stress, nerve damage and reduced blood flow, alterations in the urinary microbiome (urobiome), specifically in bladder bacterial diversity, have been reported to be associated with OAB. Bladder bacteria are members of the urobiome along with viruses, archaea, fungi, and protozoans. The urobiome metabolism, particularly in relationship to host complex sugars (glycans), ha…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To evaluate the association of gut microbiome signature and disease progression in locally advanced non-small cell lung cancer (LA- … dividual groups (p=0.009). Meanwhile, long-PFS group had significantly higher diversities in Fungi, Archaea, and Viruses than short-PFS group. The KEGG pathways overrepresented in short-PFS group included fructose and mannose metabolism (p=0.028), streptomycin biosynthesis (p=0.028), acarbose and validamycin biosynthesis (p=0.013), ribosome biogenesis in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) is an emerging tool for routine identification of bacteria, archaea and fungi. It has also been recently applied as an accurate approach for arthropod identification. Preliminary studies have shown that the MALDI-TOF MS was able to differentiate whether ticks and mosquitoes were infected or not with some bacteria and Plasmodium parasites, respectively. The aim of the present study was to test the efficiency of MALDI-TOF MS tool in distinguishing protein profiles between uninfected mosquitoes from specim…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbonic anhydrases (CAs, EC 4.2.1.1) are zinc enzymes acting as efficient catalysts for the reversible hydration of carbon dioxide to bicar … Representatives of the beta-delta-CA family are highly abundant in plants, diatoms, eubacteria and archaea. The catalytic mechanism of the alpha-CAs is understood in detail: the active site consists of a Zn(II) ion co-ordinated by three histidine residues and a water molecule/hydroxide ion. The latter is the active species, acting as a potent nucleophile …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования