In comparison to normal tissue, solid tumors show an acidic extracellular pH, which results from hypoxia-induced glycolytic metabolism and the Warburg effect. Since acidosis modulates the expression of different microRNAs (e.g., miR-7, miR-183, miR-203, miR-215), microRNAs and their targets might be mediators between tumor acidosis and malignant behavior. The aim of this study was to investigate how modulation of these microRNAs affects the expression of their targets (Crem, cAMP-responsive element modulator; Gls2, glutaminase 2; Txnip, thioredoxin-interacting protein) in experimental tumors i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circadian clock is a highly conserved 24 h biological oscillation mechanism and is affected by environmental stimuli such as light, food and temperature. Disruption of the circadian clock results in disorders of diverse biological processes, including the sleep-wake cycle and metabolism. Although we previously identified several components of the circadian clock in zebrafish, our understanding of the relationship between light-inducible clock genes and metabolism remains incomplete. To investigate how light-inducible clock genes regulate metabolism, we performed transcriptomic and metabolo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 24-h circadian rhythm handles a wide variety of physiological needs. Clock genes, in coordination with other tissue-specific factors regulate various processes and often turns responsible for the pathological conditions when altered. Cancer is one such disease where the clock genes have been shown to contribute at multiple levels modulating key hallmarks of cancer. Most importantly, adding to this complication, noncoding RNAs (ncRNAs) have emerged as one of the major post-transcriptional regulators of gene expression and many recent studies have indicated about involvement of microRNAs or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circadian clock system plays an important role in regulating testosterone synthesis in mammals. Male Bmal1-/- mice are infertile with low serum testosterone levels and decreased expression of testicular steroidogenic genes, suggesting that circadian clock genes regulate testosterone biosynthesis by activating steroidogenic gene transcription. However, whether the circadian clock regulates testosterone production via other genes remains unknown. Using Bmal1-/- mice and their wild-type (WT) siblings, we aimed to identify additional genes by which the circadian clock regulates testosterone sy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: Were Neanderthals and Denisovans (referred here also as extinct hominidae) carrying deleterious variants in genes regulating reproduction?
SUMMARY ANSWER: The majority of extinct hominidae analyzed here, presented a considerable number of deleterious variants per individual in proteins regulating different aspects of reproduction, including gonad and uterine function, and gametogenesis.
WHAT IS KNOWN ALREADY: Neanderthals, Denisovans and extant humans were interfertile and hybridized while occupying geographically overlapping areas in Europe and Asia. This is evidenced by the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a chronic immune-mediated disease characterized by excessive proliferation of epidermal keratinocytes and increased immune cell infiltration to the skin. Although it is well-known that psoriasis pathogenesis is driven by aberrant production of proinflammatory cytokines, the mechanisms underlying the imbalance between proinflammatory and anti-inflammatory cytokine expression are incompletely understood. In this study, we report that the transcriptional coregulators CtBP1 and 2 can transactivate a common set of proinflammatory genes both in the skin of imiquimod-induced mouse psoria
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously used the genetic diversity available in common inbred mouse strains to identify quantitative trait loci (QTLs) responsible for the differences in angiogenic response using the corneal micropocket neovascularization (CoNV) assay. Employing a mouse genome-wide association study (GWAS) approach, the region on chromosome 15 containing Basp1 was identified as being significantly associated with angiogenesis in inbred strains. Here, we developed a unique strategy to determine and verify the role of BASP1 in angiogenic pathways. Basp1 expression in cornea had a strong correlation w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Skin cutaneous melanoma (SKCM) is the most common subtype of skin malignancy, with ever-increasing incidence, mortality, and disease burden. Dysregulation of JAK-STATs signaling pathway is involved in the pathogenesis and progression of cancers, thus affecting the prognosis of cancer patients. The function of JAKs in SKCM is still not clarified.
METHODS: A total of five online portal (GEPIA, TIMER, GeneMANIA, LinkedOmics, and GSCALite) is used to mine the expression and gene regulation network JAK2 in SKCM.
RESULTS: JAK2 expression was downregulated in SKCM and significantly asso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Duchenne muscular dystrophy (DMD) gene has a complex expression pattern regulated by multiple tissue-specific promoters and by alternative splicing (AS) of the resulting transcripts. Here, we used an RNAi-based approach coupled with DMD-targeted RNA-seq to identify RNA-binding proteins (RBPs) that regulate splicing of its skeletal muscle isoform (Dp427m) in a human muscular cell line. A total of 16 RBPs comprising the major regulators of muscle-specific splicing events were tested. We show that distinct combinations of RBPs maintain the correct inclusion in the Dp427m of exons that undergo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Western diet (WD) and hyperlipidemia are risk factors for vascular disease, dementia, and cognitive impairment. However, the molecular mechanisms are poorly understood. This pilot study investigated the genomic pathways by which the WD and hyperlipidemia regulate gene expression in brain microvessels. Five-week-old C57BL/6J wild type (WT) control and low-density lipoprotein receptor deficient (LDL-R-/-) male mice were fed the WD for eight weeks. Differential gene expression, gene networks and pathways, transcription factors, and non-protein coding RNAs were evaluated by a genome-wide micro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is a common cause in pathophysiology of different neurodegenerative diseases. Elimination of dysfunctional and damaged mitochondria is a key requirement for maintaining homeostasis and bioenergetics of degenerating neurons. Using global microRNA (miRNA) profiling in a systemic rotenone model of Parkinson's disease, we have identified miR-146a as upmost-regulated miRNA, which is known as inflammation regulatory miRNA. Here, we report the role of activated nuclear factor kappa beta (NF-kβ) in miR-146a-mediated downregulation of Parkin protein, which inhibits clearance o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parathyroid hormone (PTH) regulates serum calcium levels and bone strength. Secondary hyperparathyroidism (SHP) is a common complication of chronic kidney disease (CKD) that correlates with morbidity and mortality. In experimental SHP, the increased PTH gene expression is due to increased PTH mRNA stability and is mediated by protein-PTH mRNA interactions. Adenosine-uridine-rich binding factor 1 (AUF1) stabilizes and K-homology splicing regulatory protein (KSRP) destabilizes PTH mRNA. The peptidyl-prolyl cis/trans isomerase Pin1 acts on target proteins, including mRNA-binding proteins. Pin1 le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objetive: To investigate whether the methylation patterns of the interleukin-4 (IL-4) gene promoter changed and whether environmental factors affected the methylation level of IL-4 gene in the peripheral blood of patients with recurrent aphthous ulcer (RAU). Methods: Totally 20 patients, who were diagnosed with RAU, were recruited from May 2018 to May 2019 in the Department of Stomatology， First Hospital of Shanxi Medical University in the study (RAU group), including 12 females and 8 males, with mean age of 16-35 years. During the same period, 20 healthy volunteers matching the age and gender
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estrogen sulfotransferase (SULT1E1) inactivates estrogen and regulates its metabolic homeostats. Whereas SULT1E1 is expressed low in the liver of adult mice, it is induced by phenobarbital (PB) treatment or spontaneously in diabetic livers via nuclear receptors. Utilizing constitutive active/androstane receptor (CAR) KO, estrogen receptor α (ERα KO, phosphorylation-blocked ERα S216A KI mice, it is now demonstrated that, after being activated by PB, CAR binds and recruits ERα onto the Sulte1 promoter for subsequent phosphorylation at Ser216. This phosphorylation tightens CAR interacting with ER
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drugs of abuse elevate dopamine levels in the nucleus accumbens (NAc) and alter transcriptional programs believed to promote long-lasting synaptic and behavioral adaptations. Here, we leveraged single-nucleus RNA-sequencing to generate a comprehensive molecular atlas of cell subtypes in the NAc, defining both sex-specific and cell type-specific responses to acute cocaine experience in a rat model system. Using this transcriptional map, we identified an immediate early gene expression program that is up-regulated following cocaine experience in vivo and dopamine receptor activation in vitro. Mu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Juvenile dermatomyositis (JDM) is a systemic autoimmune disease with a prominent interferon (IFN) signature, but the pathogenesis of JDM and the etiology of its IFN signature remain unknown. The Mendelian autoinflammatory interferonopathies, Chronic Atypical Neutrophilic Dermatosis with Lipodystrophy and Elevated temperature (CANDLE) and STING-Associated Vasculopathy with onset in Infancy (SAVI), are caused by genetic mutations and have extremely elevated IFN signatures thought to drive pathology. The phenotypic overlap of some clinical features of CANDLE and SAVI with JDM led to t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parathyroid adenoma (PA) is marked by a certain benign outgrowth in the surface of parathyroid glands. The transcriptome analysis of parathyroid adenomas can provide a deep insight into actively expressed genes and transcripts. Hence, we analyzed and compared the gene expression profiles of parathyroid adenomas and healthy parathyroid gland tissues from Gene Expression Omnibus (GEO) database. We identified a total of 280 differentially expressed genes (196 up-regulated, 84 down-regulated), which are involved in a wide array of biological processes. We further constructed a gene interaction net
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insect courtship and mating depend on integration of olfactory, visual, and tactile cues. Compared to other insects, Bombyx mori, the domesticated silkworm, has relatively simple sexual behaviors as it cannot fly. Here by using CRISPR/Cas9 and electrophysiological techniques we found that courtship and mating behaviors are regulated in male silk moths by mutating genes in the sex determination cascade belonging to two conserved pathways. Loss of Bmdsx gene expression significantly reduced the peripheral perception of the major pheromone component bombykol by reducing expression of the product
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Striated myocytes compose about half of the cells of the heart, while contributing the majority of the heart's mass and volume. In response to increased demands for pumping power, including in diseases of pressure and volume overload, the contractile myocytes undergo non-mitotic growth, resulting in increased heart mass, i.e. cardiac hypertrophy. Myocyte hypertrophy is induced by a change in the gene expression program driven by the altered activity of transcription factors and co-repressor and co-activator chromatin-associated proteins. These gene regulatory proteins are subject to diverse po
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pineal gland is a neuroendocrine organ responsible for production of the nocturnal hormone melatonin. A specific set of homeobox gene-encoded transcription factors govern pineal development, and some are expressed in adulthood. The brain-specific homeobox gene (Bsx) falls into both categories. We here examined regulation and function of Bsx in the mature pineal gland of the rat. We report that Bsx is expressed from prenatal stages into adulthood, where Bsx transcripts are localized in the melatonin-synthesizing pinealocytes, as revealed by RNAscope in situ hybridization. Bsx transcripts we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования