Aging can induce age-related bone diseases such as osteoporosis. DNA methylation, a core epigenetic regulatory mechanism, participate in the pathological process of aging-induced bone metabolism imbalance by modulating gene expression at the epigenetic level. Using S-adenosylmethionine as a methyl donor, it exhibits characteristics of hypomethylation in genomic repetitive regions and abnormal methylation in CpG islands of promoters of key bone metabolism genes with advancing age. The "epigenetic clock" constructed based on these features can accurately predict an individual's biological age. I
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatoblastoma is the most common pediatric liver cancer, with the fastest rising incidence among childhood malignancies. Early genomic studies revealed that hepatoblastoma has the lowest mutational burden of any human cancer, however, recent advances in single-cell RNA-seq, multiomics, spatial transcriptomics, and functional genomics screenings have revealed substantial complexity. Diverse cellular subpopulations, divergent WNT signaling, key developmental pathways, and intricate interactions between the tumor cells and tumor immune microenvironment (TME) collectively shape tumor heterogeneit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterogeneity in virulence potential of L. monocytogenes subgroups have been associated with genetic elements that could provide advantages in certain environments to invade, multiply, and survive within a host. The presence of gene mutations has been found to be related to attenuated phenotypes, while the presence of groups of genes, such as pathogenicity islands (PI), has been associated with hypervirulent or stress-resistant clones. We evaluated 232 whole genome sequences from invasive listeriosis cases in human and ruminants from the US and Europe to identify genomic elements associated wi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise deposition of CpG methylation is critical for mammalian development and tissue homeostasis and is often dysregulated in human diseases. The localization of de novo DNA methyltransferase DNMT3A is facilitated by its PWWP domain recognizing histone H3 lysine 36 (H3K36) methylation1,2 and is normally depleted at CpG islands (CGIs)3. However, methylation of CGIs regulated by Polycomb repressive complexes (PRCs) has also been observed4-8. Here, we report that DNMT3A PWWP domain mutations identified in paragangliomas9 and microcephalic dwarfism10 promote aberrant localization of DNMT3A to CG
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance in campylobacters has been described worldwide. The emergence of multiresistant isolates, particularly among Campyl … and a novel methyltransferase, named Erm(N) here. The erm(B) gene was found in multidrug-resistant genomic islands, whereas erm(N) was inserted within CRISPR arrays of the CRISPR-cas9 operon. Moreover, using PCR screening in erythromycin-resistant strains from our collection, we show that erm(N) was already present in 3 French clinical strains 2 years before its …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: S. enterica subsp. houtenae has been rarely documented, and very limited genomic information is available. This report describes a rare case of primary extraintestinal salmonellosis in a young roe deer, associated with Salmonella enterica subsp. houtenae. Methods: A traditional cultural-based analysis was carried out from the contents of a neck abscess; biochemical identification and PCR assay were performed to isolate and identify the pathogen. Through whole-genome sequencing (WGS), multilocus sequence typing (MLST), core genome MLST (cgMLST), and the Salmonella pathogenicity
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ten-eleven translocation 2 gene (TET2) encodes a member of the TET family of DNA methylcytosine oxidases that converts 5-methylcytosine (5mC) to 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) to initiate the demethylation of DNA within genomic CpG islands. Somatic loss-of-function mutations of TET2 are frequently observed in human myelodysplastic syndrome (MDS), which is a clonal malignancy characterized by dysplastic changes of developing blood cell progenitors, leading to ineffective hematopoiesis. We used genome-editing technology to disrupt the zebrafish Tet2 catalytic domain. tet2(m/m) (homozygous fo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zinc-binding protein-89 regulates Bak to facilitate apoptosis in cancer cells. This study examined if zinc-binding protein-89 regulates Bak through an epigenetic mechanism in hepatocellular carcinoma. We first demonstrated that the expression of Bak was reduced but the levels of deoxyribonucleic acid methyltransferase 1 and histone deacetylase 3 were increased in hepatocellular carcinoma cancer tissues compared to the corresponding non-cancer tissues. Moreover, there was a negative correlation between Bak expression and deoxyribonucleic acid methyltransferase 1 levels in hepatocellular carcino
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have constructed two YAC contigs in the Xp11.23-p11.22 interval of the human X chromosome, a region that was previously poorly characterized. One contig, of at least 1.4 Mb, links the pseudogene OATL1 to the genes GATA1, TFE3, and SYP and also contains loci implicated in Wiskott-Aldrich syndrome and synovial sarcoma. A second contig, mapping proximal to the first, is estimated to be over 2.1 Mb and links the hypervariable locus DXS255 to DXS146, and also contains a chloride channel gene that is responsible for hereditary nephrolithiasis. We have used plasmid rescue, inverse PCR, and Alu-PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics2016eng
The demographic history of the isolated population of the Faroe Islands may have induced enrichment of variants rarely seen in outbred European populations, including enrichment of risk variants for panic disorder (PD). PD is a common mental disorder, characterized by recurring and unprovoked panic attacks, and genetic factors have been estimated to explain around 40% of the risk. In this study the potential enrichment of PD risk variants was explored based on whole-exome sequencing of 54 patients with PD and 211 control individuals from the Faroese population. No genome-wide significant assoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The survival and microevolution of Helicobacter pylori strains in the niches of the stomach after eradication therapy have largely been unexplored. We analyzed genomic signatures for two successive isolates obtained 9 years apart from a duodenal ulcer patient who underwent eradication therapy for H. pylori. These isolates were genotyped based on 50 different parameters involving three different fingerprinting approaches and several evolutionarily significant and virulence-associated landmarks in the genome, including nine informative gene loci, the cag pathogenicity island and its right juncti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current understanding of genomic diversity within the halophilic genus Salinivibrio relies predominantly on draft genomes, with only seven complete genomes among the 62 publicly available. Previous pangenome analysis suggested a closed genomic structure while concluding that Salinivibrio lacks polyhydroxyalkanoate (PHA) degradation capacity despite possessing biosynthesis genes. Here, we present eight complete Salinivibrio genomes from Pearse Lakes (Rottnest Island, Western Australia) generated using Oxford Nanopore long-read sequencing, alongside re-analysis of 38 high-quality public genomes
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have sequenced the genome of Shigella flexneri serotype 2a, the most prevalent species and serotype that causes bacillary dysentery or shigellosis in man. The whole genome is composed of a 4 607 203 bp chromosome and a 221 618 bp virulence plasmid, designated pCP301. While the plasmid shows minor divergence from that sequenced in serotype 5a, striking characteristics of the chromosome have been revealed. The S.flexneri chromosome has, astonishingly, 314 IS elements, more than 7-fold over those possessed by its close relatives, the non-pathogenic K12 strain and enterohemorrhagic O157:H7 stra
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The characterization of pathogens affecting Antarctic wildlife has been historically limited and sporadic. With the introduction of H5N1 high pathogenicity avian influenza virus (HPAIV) in Antarctica in the austral summer 2023/2024, concerns about the health of Antarctic seabirds and mammals prompted immediate surveillance efforts. In March 2024, we visited the Danger Islands archipelago, that hosts two mega-colonies of Adélie penguins, and observed an unusual mortality estimated in thousands of Adélie penguins and other species. Swabs and tissues were collected for molecular detection of infe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bats are reservoir hosts for numerous well-known zoonotic viruses, but their broader virus-hosting capacities remain understudied. Picornavirales are an order of enteric viruses that cause disease across a wide range of mammalian hosts, including Hepatitis A in humans and foot-and-mouth disease in ungulates. Host-switching and recombination drive the diversification of Picornavirales worldwide. Picornaviridae and Caliciviridae (families within Picornavirales) have been described in bats across mainland Africa, but surveillance for these viruses has been rare in the Southwest Indian Ocean Islan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli O157:H7, historically associated with undercooked beef, has increasingly been linked to leafy green associated outbreaks in … ed elevated tolerance to starvation, arsenic, gastric acid, and antibiotics, traits consistent with genomic islands encoding multiple resistance determinants. REPEXH02 strains showed increased tolerance to UV-C irradiation, potentially linked to mutations in DNA repair genes. Both REP groups showed significantly higher survival than EDL933 under desiccation and b …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine tuberculosis (bTB) is a respiratory disease caused by Mycobacterium bovis, posing a significant threat to animal health and the lives … d 12 unique genes specific to M. bovis SP38. Further integrated bioinformatic analysis revealed 224 genomic islands associated with virulence and pathogenesis. Among these, a highly antigenic protein, termed HP28, was selected for in vivo testing. The recombinant HP28 protein (rHP28) was expressed in E. coli and assessed for its ability to induce intradermal skin …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated the diffusion of Listeria monocytogenes (LM) in a beef steak tartare production chain, aiming to (1) evaluate Listeria spp. diffusion in finishing farms supplying beef cattle, (2) evaluate LM prevalence in carcasses, and (3) map LM diffusion in the production plant. A detection rate of 6/76 was observed in the farm, while carcasses after skinning and before refrigeration tested positive in 19/30 and 11/30, respectively. During tartare production, 57/154 meat and 35/191 environmental samples tested positive. A total of 114 LM isolates were characterized via a whole-genome s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple lines of evidence indicate Multiple Sclerosis (MS) is affected by vitamin D. This effect may be mediated by methylation in immune cell progenitors. We aimed to determine (1) if haematopoietic stem cell methylation constrains methylation in daughter cells and is variable between individuals, and (2) the interaction of methylation with the vitamin D receptor binding sites. We interrogated genomic methylation levels from matching purified CD34+ haematopoietic stem cells and progeny CD14+ monocytes and CD56+ NK cells from 11 individuals using modified reduced representation bisulfite sequ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the ecology, epidemiology and plasmid characteristics of extended-spectrum cephalosporin (ESC)-resistant E. coli in healthy pigs over a period of 4 years (2013-2016) following the withdrawal of ESCs. High carriage rates of ESC-resistant E. coli were demonstrated in 2013 (86.6%) and 2014 (83.3%), compared to 2015 (22%) and 2016 (8.5%). ESC resistance identified among E. coli isolates was attributed to the carriage of an IncI1 ST-3 plasmid (pCTXM1-MU2) encoding blaCTXM-1. Genomic characterisation of selected E. coli isolates (n = 61) identified plasmid movement into multi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования