Cartilage Acidic Protein 2 (CRTAC2) is a novel protein present from prokaryotes to vertebrates with abundant expression in the teleost fish pituitary gland and an isoform of CRTAC1, a chondrocyte marker in humans. The two proteins are non-integrins containing N-terminal integrin-like Ca(2+)-binding motifs and their structure and function remain to be assigned. Structural studies of recombinant sea bream (sb)CRTAC2 revealed it is composed of 8.8% α-helix, 33.4% β-sheet and 57.8% unordered protein. sbCRTAC2 bound Ca(2+) with high affinity (K(d)=1.46nM) and favourable Gibbs free energy (∆G=-12.4k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combinatorial libraries and protein engineering represent two new powerful tools in drug discovery and development. The application of a combinatorial ssDNA library to thrombin led to the discovery of a sequence-specific nucleotide-based thrombin inhibitor (thrombin aptamer). The thrombin aptamer has a novel tertiary structure revealed by NMR and shows potent rapid anticoagulation with a short half-life in vivo. It has been used successfully to replace heparin in a canine cardiopulmonary bypass model. Functional mapping of the surface residues of thrombin led to the generation of a modified th
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
β-Lactamases are bacterial enzymes that hydrolyze β-lactam antibiotics. TEM-1 is a prevalent plasmid-encoded β-lactamase in Gram-negative bacteria that efficiently catalyzes the hydrolysis of penicillins and early cephalosporins but not oxyimino-cephalosporins. A previous random mutagenesis study identified a W165Y/E166Y/P167G triple mutant that displays greatly altered substrate specificity with increased activity for the oxyimino-cephalosporin, ceftazidime, and decreased activity toward all other β-lactams tested. Surprisingly, this mutant lacks the conserved Glu-166 residue critical for enz
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a continuing study for discovering urease inhibitors based on flavonoids, nineteen reductive derivatives of flavonoids were synthesized and evaluated against Helicobacter pylori urease. Analysis of structure-activity relationship disclosed that 4-deoxy analogues are more potent than other reductive products. Out of them, 4',7,8-trihydroxyl-2-isoflavene (13) was found to be the most active with IC50 of 0.85 μM, being over 20-fold more potent than the commercial available urease inhibitor, acetohydroxamic acid (AHA). Kinetics study revealed that 13 is a competitive inhibitor of H. pylori urea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Q cycle mechanism of the bc1 complex requires two quinone reaction centers, the hydroquinone oxidation (QP) and the quinone reduction (QN) center. These sites can be distinguished by the specific binding of inhibitors to either of them. A substantial body of information about the hydroquinone oxidation site has been provided by the analysis of the binding of QP site inhibitors to the bc1 complex in different redox states and to preparations depleted of lipid or protein components as well as by functional studies with mutant bc1 complexes selected for resistance toward the inhibitors. The r
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cataract, a major cause of visual impairment worldwide, is the opacification of the eye's crystalline lens due to aggregation of the crystallin proteins. The research reported here is aimed at investigating the aggregating behavior of γ-crystallin proteins in various incubation conditions. Thioflavin T binding assay, circular dichroism spectroscopy, 1-anilinonaphthalene-8-sulfonic acid fluorescence spectroscopy, intrinsic (tryptophan) fluorescence spectroscopy, light scattering, and electron microscopy were used for structural characterization. Molecular dynamics simulations and bioinformatics
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Domain 2 of the anthrax protective antigen (PA) prepore heptamer unfolds and refolds during endosome acidification to generate an extended 100 Å β barrel pore that inserts into the endosomal membrane. The PA pore facilitates the pH-dependent unfolding and translocation of bound toxin enzymic components, lethal factor (LF) and/or edema factor, from the endosome to the cytoplasm. We constructed immobilized complexes of the prepore with the PA-binding domain of LF (LFN) to monitor the real-time prepore to pore kinetic transition using surface plasmon resonance and biolayer interferometry (BLI). T
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The MLL (Mixed Lineage Leukemia) gene is a common target for chromosomal translocations associated with human acute leukemias. These translocations result in a gain of MLL function by generating novel chimeric proteins containing the amino-terminus of MLL fused in-frame with one of 30 distinct partner proteins. Structure/function studies using an in vitro myeloid progenitor immortalization assay have revealed that at least four nuclear partner proteins contribute transcriptional effector properties to MLL to produce a range of chimeric transcription factors with leukemogenic potential. Mouse m
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor (SNARE) proteins are required for intracellular membrane fusion, and are differentially localized throughout the cell. SNAREs on vesicle and target membranes contain "SNARE motifs" which interact to form a four-helix bundle that contributes to the fusion of two membranes. SNARE motif sequences fall into four classes, homologous to the neuronal proteins syntaxin 1a, VAMP 2, and the N- and C-terminal SNARE motifs of SNAP-25 (S25N and S25C), and it is thought that one member from each class interacts to form a SNARE complex. Ma
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Granulins (GRNs) are a family of small (∼6 kDa) proteins generated by the proteolytic processing of their precursor, progranulin (PGRN), in many cell types. Both PGRN and GRNs are implicated in a plethora of biological functions, often in opposing roles to each other. Lately, GRNs have generated significant attention due to their implicated roles in neurodegenerative disorders. Despite their physiological and pathological significance, the structure-function relationships of GRNs are poorly defined. GRNs contain 12 conserved cysteines forming six intramolecular disulfide bonds, making them rat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bidirectional membrane trafficking along microtubules is mediated by kinesin-1, kinesin-3, and dynein. Several organelle-bound adapters for kinesin-1 and dynein have been reported that orchestrate their opposing activity. However, the coordination of kinesin-3/dynein-mediated transport is not understood. In this paper, we report that a Hook protein, Hok1, is essential for kinesin-3- and dynein-dependent early endosome (EE) motility in the fungus Ustilago maydis. Hok1 binds to EEs via its C-terminal region, where it forms a complex with homologues of human fused toes (FTS) and its interactor FT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PUR domain is a nucleic acid-binding motif found in critical regulatory proteins of higher eukaryotes and in certain species of bacteria. During investigations into mechanisms by which the Lyme disease spirochete controls synthesis of its Erp surface proteins, it was discovered that the borrelial PUR domain protein, Bpur, binds with high affinity to double-stranded DNA adjacent to the erp transcriptional promoter. Bpur was found to enhance the effects of the erp repressor protein, BpaB. Bpur also bound single-stranded DNA and RNA, with relative affinities RNA > double-stranded DNA > single
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae cytolysin (VCC) is a potent cytolytic toxin that induces colloid osmotic lysis of its target eukaryotic cells by forming transmembrane oligomeric β-barrel channels. VCC is secreted by the bacteria as an inactive precursor (Pro-VCC) and is subsequently activated by proteolytic removal of an N-terminal "Pro-domain", thus generating the active form of the toxin (Mature-VCC). Earlier studies have indicated an intramolecular chaperone-like role of the Pro-domain favoring efficient secretion of the toxin from the periplasm into the extracellular space. However, the exact role of the
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
gamma-Secretase is critically involved in the Notch pathway and in Alzheimer's disease. The four subunits of gamma-secretase assemble in the endoplasmic reticulum (ER) and unassembled subunits are retained/retrieved to the ER by specific signals. We here describe a novel ER-retention/retrieval signal in the transmembrane domain (TMD) 4 of presenilin 1, a subunit of gamma-secretase. TMD4 also is essential for complex formation, conferring a dual role for this domain. Likewise, TMD1 of Pen2 is bifunctional as well. It carries an ER-retention/retrieval signal and is important for complex assembly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most proteasome substrates are marked for degradation by ubiquitin conjugation, but some are targeted by other means. The properties of these exceptional cases provide insights into the general requirements for proteasomal degradation. Here the focus is on three ubiquitin-independent substrates that have been the subject of detailed study. These are Rpn4, a transcriptional regulator of proteasome homeostasis, thymidylate synthase, an enzyme required for production of DNA precursors and ornithine decarboxylase, the initial enzyme committed to polyamine biosynthesis. It can be inferred from thes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activation of LysR-type transcription factors (LTTRs) is thought to result from conformational changes that occur when inducer molecules bind to their Inducer Binding Domains (IBDs). However, the exact nature of these changes remains to be fully elucidated. We present the crystal structures of two truncated constructs of the LTTR DntR in their apo- forms and in complex with its natural inducer molecule, salicylate. These provide a fuller picture of the conformational changes that can occur in LTTR IBDs and offer insights that may be relevant when considering the mechanism of activation of LTTR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acetylcholinesterases (AChEs) and their genes from susceptible and resistant insects have been extensively studied to understand the molecular basis of target site insensitivity. Due to the existence of other resistance mechanisms, however, it can be problematic to correlate directly a mutation with the resistant phenotype. An alternative approach involves recombinant expression and characterization of highly purified wild-type and mutant AChEs, which serves as a reliable platform for studying structure-function relationships. We expressed the catalytic domain of Anopheles gambiae AChE1 (r-AgA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint inhibitor (ICI) myocarditis is a rare but frequently fatal immune-related adverse event of cancer immunotherapy. Understanding the mechanisms of this toxicity is critical to balancing treatment with maintenance of antitumor immunity. Using integrated spatial and single-cell analyses in a pharmacological murine model, we identified regional infiltration of Ly6C+ monocytes and PD-1+ CD8+ T cells in the heart that organize into fibroblast-rich immune structures, which we term tertiary T cell niches (TTCNs). TTCNs serve as hubs for T cell activation, sharing features of tertiary
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein aggregation is facilitated by the generation of partially folded intermediates that lack most of the tertiary interactions, but retain the complete secondary structure. These partially folded states cross-link each other to form protein aggregates. Protein aggregates in an advanced stage result in the formation of amyloid fibrils, which have high tensile strength. These amyloid fibrils are associated with a number of pathologies, especially Alzheimer's disease, which involves the aggregation of the Aβ peptide. In recent years, much attention has been paid to the generation of potent th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования