Bacterial Sec7-domain-containing proteins (RalF) are known only from species of Legionella and Rickettsia, which have facultative and obligate intracellular lifestyles, respectively. L. pneumophila RalF, a type IV secretion system (T4SS) effector, is a guanine nucleotide exchange factor (GEF) of ADP-ribosylation factors (Arfs), activating and recruiting host Arf1 to the Legionella-containing vacuole. In contrast, previous in vitro studies showed R. prowazekii (Typhus Group) RalF is a functional Arf-GEF that localizes to the host plasma membrane and interacts with the actin cytoskeleton via a u
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Secretoglobin 1A1 (SCGB 1A1), also called Clara cell secretory protein, is the most abundantly secreted protein of the airway. The SCGB1A1 gene has been characterized in mammals as a single copy in the genome. However, analysis of the equine genome suggested that horses might have multiple SCGB1A1 gene copies. Non-ciliated lung epithelial cells produce SCGB 1A1 during inhalation of noxious substances to counter airway inflammation. Airway fluid and lung tissue of horses with recurrent airway obstruction (RAO), a chronic inflammatory lung disease affecting mature horses similar to e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beta-thalassemia is caused by the reduced (beta) or absent (beta) synthesis of the beta globin chains of the hemoglobin tetramer. Three clinical and hematological conditions of increasing severity are recognized, i.e., the beta-thalassemia carrier state, thalassemia intermedia, and thalassemia major. The beta-thalassemia carrier state, which results from heterozygosity for beta-thalassemia, is clinically asymptomatic and is defined by specific hematological features. Thalassemia major is a severe transfusion-dependent anemia. Thalassemia intermedia comprehend a clinically and genotypically ver
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid hormone (T3) regulates the expression of rat TSH beta-subunit (TSH beta) mRNA, in part, at the posttranscriptional level, by reducing the half-life of TSH beta mRNA. The mechanism(s) mediating this alteration in mRNA stability are unknown, but previous work indicates that labile protein(s) are involved. The majority of cis-acting elements identified to date that have been implicated in the regulated destabilization of mRNAs have been located in the 3'-untranslated region (3'-UTR) of the mRNA. The 3'-UTR of rat, murine, and human TSH beta mRNA is highly conserved, and within this region
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis is a vector-borne pathogen that evolved from the enteric pathogen Yersinia pseudotuberculosis. Despite different routes of infection, both pathogens need to overcome host-mediated zinc limitation. Y. pestis relies on the transporter ZnuABC and the metallophore yersiniabactin, but surprisingly, disruption of these systems in Y. pseudotuberculosis did not limit growth during zinc limitation, suggesting the presence of additional mechanisms. Here, we identify the opine-type metallophore yersinopine, encoded by the cnt operon, as a primary zinc uptake system in Y. pseudotuberculosi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Angiogenesis is essential for recovery following ischemic stroke, as brain microvascular endothelial cells (BMVECs) drive vascular repair. 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) is a major regulator of endothelial function in some vascular contexts, but it is unknown whether 15-PGDH plays a significant role in angiogenesis following stroke. Notably, based on preliminary bioinformatics prediction of their 3'UTR interaction, we hypothesize that Gpr137b-ps-a pseudogene-derived lncRNA originating from Gpr137b-forms a regulatory link with 15-PGDH to modulate this process (i.e.,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neisseria gonorrhoeae is a global public health threat, exacerbated by the rapid dissemination of ceftriaxone-resistant strains harboring penA allele 60.001. Current diagnostics are limited by long turnaround times, reliance on thermal cycling equipment, and poor suitability for resource-limited settings.
METHODS: We developed an isothermal recombinase polymerase amplification assay coupled with a lateral flow strip (RPA-LFS) for separate identification of N. gonorrhoeae and the ceftriaxone resistance-associated SNP C932T (A311V) in penA 60.001 and limited closely related alleles.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytochromes P450 (CYPs) represent a large gene superfamily that plays an important role in the metabolism of both exogenous and endogenous compounds. We have reported that the testis-specific Y-encoded-like proteins (TSPYLs) are novel CYP gene transcriptional regulators. However, little is known of mechanism(s) by which TSPYLs regulate CYP expression or the functional consequences of that regulation. The TSPYL gene family includes six members, TSPYL1 to TSPYL6. However, TSPYL3 is a pseudogene, TSPYL5 is only known to regulates the expression of CYP19A1, and TSPYL6 is expressed exclusively
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematopoiesis, a process that results in the differentiation of all blood lineages, is essential throughout life. The production of 1x1012 blood cells per day, including 200x109 erythrocytes, is highly dependent on nutrient consumption. Notably though, the relative requirements for micronutrients during the perinatal period, a critical developmental window for immune cell and erythrocyte differentiation, have not been extensively studied. More specifically, the impact of the vitamin C/ascorbate micronutrient on perinatal as compared to adult hematopoiesis has been difficult to assess in animal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detailed analyses of 20 patients with sporadic neurofibromatosis type 1 (NF1) microdeletions revealed an unexpected high frequency of somatic mosaicism (8/20 [40%]). This proportion of mosaic deletions is much higher than previously anticipated. Of these deletions, 16 were identified by a screen of unselected patients with NF1. None of the eight patients with mosaic deletions exhibited the mental retardation and facial dysmorphism usually associated with NF1 microdeletions. Our study demonstrates the importance of a general screening for NF1 deletions, regardless of a special phenotype, becaus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ATM is an important cancer susceptibility gene that encodes a critical apical kinase of the DNA damage response (DDR) pathway. We show that a key nonsense-mediated RNA decay switch exon (NSE) in ATM is repressed by U2AF, PUF60 and hnRNPA1. The NSE activation was haplotype-specific and was most promoted by cytosine at rs609621 in the NSE 3' splice-site (3'ss), which is predominant in high cancer risk populations. NSE levels were deregulated in leukemias and were influenced by the identity of U2AF35 residue 34. We also identify splice-switching oligonucleotides (SSOs) that exploit competition of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The existence of cell free fetal DNA, derived from apoptotic syncytiotrophoblast, in the maternal circulation has opened new possibilities of non-invasive prenatal diagnosis. Although still some technical problems exists, especially the lack of a generic positive control on the presence of fetal DNA and the aspecific amplification of background maternal DNA, non-invasive prenatal RHD typing has been successfully introduced in several laboratories, especially in Europe. The diagnostic accuracy reaches>99%. In the Netherlands PCR guided administration of antenatal anti-D prophylaxis is cost-effe
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonclassic steroid 21-hydroxylase deficiency is a frequent, relatively mild disorder of cortisol biosynthesis, characterized by variable signs of postnatal androgen excess. It is inherited as an allelic variant of the gene designated CYP21B, which encodes 21-hydroxylase. CYP21B is located in the HLA histocompatibility complex, and a "nonclassic" allelic variant is often associated with characteristic HLA antigens--B14,DR1. We cloned and analyzed the CYP21B gene from a patient homozygous for HLA-B14,DR1 who had nonclassic 21-hydroxylase deficiency. Five deviations from the normal genetic sequen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida parapsilosis is an opportunistic yeast pathogen that can cause life-threatening infections in immunocompromised humans. Whole-genome sequencing studies of the species have demonstrated remarkably low diversity, with strains typically differing by about 1.5 single nucleotide polymorphisms (SNPs) per 10 kb. However, SNP calling alone does not capture the full extent of genetic variation. Here, we define the pangenome of 372 C. parapsilosis isolates to determine variation in gene content. The pangenome consists of 5,859 genes, of which 48 are not found in the genome of the reference strai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and primary mediastinal B-cell lymphoma (PMBCL) are aggressive histological subtypes of non-Hodgkin's lymphoma. Improved understanding of the underlying molecular pathogenesis has led to new classification and risk stratification tools, including the development of cell-free biomarkers through liquid biopsies. The goal of this study was to investigate cell-free RNA (cfRNA) biomarkers in DLBCL and PMBCL patients.
MATERIALS AND METHODS: Blood plasma samples (n=168) and matched diagnostic formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples (
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica subspecies enterica serovar Gallinarum biovar Pullorum (S Pullorum) is the etiological agent of pullorum disease, causing white diarrhea with high mortality in chickens. There are many unsolved issues surrounding the epidemiology of S Pullorum, including its origin and transmission history as well as the discordance between its phenotypic heterogeneity and genetic monomorphism. In this paper, we report the results of whole-genome sequencing of a panel of 97 S Pullorum strains isolated between 1962 and 2014 from four countries across three continents. We utilized 6,795 core
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The CEL gene encodes the pancreatic enzyme carboxyl ester lipase. The human CEL-HYB1 allele, a hybrid variant of CEL and its adjacent pseudogene CELP, is associated with a five-fold increased risk for chronic pancreatitis in European cohorts. Humanized Cel-HYB1 mice develop chronic pancreatitis spontaneously albeit with a relatively mild presentation. The aim of this study was to further characterize the pancreatic phenotype in Cel-HYB1 mice.
METHODS: We investigated Cel-HYB1 animals by two complementary approaches. First, we analyzed compound heterozygous Cel-16R/HYB1 mice wher
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current therapies cannot completely reverse advanced atherosclerosis. High levels of amino acids, induced by Western diet, stimulate mTORC1 (mammalian target of rapamycin complex 1)-autophagy defects in macrophages, accelerating atherosclerotic plaque progression. In addition, autophagy-lysosomal dysfunction contributes to plaque necrotic core enlargement and lipid accumulation. Therefore, it is essential to investigate the novel mechanism and molecules to reverse amino acid-mTORC1-autophagy signaling dysfunction in macrophages of patients with advanced atherosclerosis.
METHODS: W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydia pecorum is a globally recognised pathogen of livestock and koalas. To date, comparative genomics of C. pecorum strains from sheep, cattle and koalas has revealed that only single nucleotide polymorphisms (SNPs) and a limited number of pseudogenes appear to contribute to the genetic diversity of this pathogen. No chlamydial plasmid has been detected in these strains despite its ubiquitous presence in almost all other chlamydial species. Genomic analyses have not previously included C. pecorum from porcine hosts. We sequenced the genome of three C. pecorum isolates from pig…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retropseudogenes are intronless DNA sequences sharing a high degree of homology with the cDNA of their corresponding active genes. They are thought to have originated by reverse transcription of messenger RNA and reintegration of the cDNA into the genome. Usually considered a type of evolutionary waste, they melt into the background of their surrounding DNA by the loss of similarity to the active gene or disappear from the genome by the accumulation of deletions. On the other hand, in this paper we describe the evolutionary recycling of this genomic waste. Recently, a splice variant of the gen…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.