BACKGROUND: Gallbladder cancer (GBC), an aggressive disease with limited treatment options, occurs mainly in low-income and middle-income regions of Asia and Latin America. We analysed whole-exome sequencing data from 262 GBC tumour-normal sample pairs from Chilean, Chinese, Indian, Japanese and South Korean patients to investigate differences in GBC mutation profiles according to geographic location and genetic ancestry.
METHODS: We used a unified analysis pipeline to ascertain gene mutations and mutational signatures, estimated the individual proportions of major ancestry subtypes in the in…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prenatal detection of fetal structural anomalies often prompts chromosomal analysis; however, chromosomal microarray analysis (CMA) has limited diagnostic yield for monogenic disorders. Whole-exome sequencing (WES) has emerged as a powerful tool for identifying single-gene etiologies, particularly in cases with complex neurodevelopmental phenotypes.
CASE PRESENTATION: We report a female infant presenting with prenatally detected ventriculomegaly and inconclusive chromosomal testing. Prenatal investigations, including karyotyping and genome-wide chromosomal sequencing, identified s…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) is a rare and very aggressive pediatric myelodysplastic/myeloproliferative neoplasm with molecular heterogeneity and constitutive activation of the RAS signaling pathway. The aim of this study was to identify the mutational landscape, driver genes, mutational signatures, functional pathways, and therapeutic targets of mutations that affect receptor tyrosine kinases (RTKs) and RAS pathways in JMML.
METHODS: We collected tumor and matched buccal swab samples from 35 patients with JMML and performed whole-exome sequencing. Variants w…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hidradenitis suppurativa (HS)-related autoinflammatory syndromes, simply termed as syndromic HS (sHS), represent a group of ra … y to determine inheritance patterns.
METHODS: To address these gaps, we performed trio-based whole-exome sequencing (WES) on five individuals diagnosed with sHS and their unaffected parents.
RESULTS: The pathway related to epidermal adhesion and desmosome organization was the most represented across our cohort, encompassing seven genes: DSC3, DSG1, FA …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study investigates the genetic basis of congenital tooth agenesis (CTA) using an omics approach. Whole exome sequencing (WES) identified novel variants, which were further analyzed in combination with RNA expression data to uncover genes associated with CTA, molecular mechanisms, and systemic disease links.
METHODS: WES was performed on 11 samples (6 CTA patients and 5 controls) to identify pathogenic variants. Integrative approaches, including gene expression profiling, protein interaction mapping, pathway enrichment, in silico functional assessments and molecular dynamics (MD)…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 71-year-old Caucasian female with a history of a right conjunctival intraepithelial neoplasia (CIN) presented with an expanding right lacrimal sac mass. Pathology from the lacrimal sac biopsy revealed invasive, moderately differentiated, non-keratinizing squamous cell carcinoma (SCC) that stained positive for p63 and p40 and negatively for CEA. The conjunctival and lacrimal sac masses were noncontiguous and found to be HPV-positive SCCs after definitive surgery. Whole exome sequencing demonstrated distinct, shared deletions and gains in both tumors, with the lacrimal sac SCC having more gene…
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Hemiplegic migraine (HM) is a rare and severe subtype of migraine with a complex genetic basis. Although pathogenic variants in … raine (FHM) pathogenic variants. Methods: We conducted a case-control association analysis of whole exome sequencing (WES) data from 184 unrelated HM patients. A targeted panel of 34 SVD-related genes was assessed. Variants were prioritised based on rarity (MAF ≤ 0.05), location (exonic/splice site), and predicted pathogenicity using in silico tools. St …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole Exome Sequencing (WES) was performed on 265 Pakistani individuals with suspected neurodevelopmental disorders, revealing that seven of them carried homozygous mutations in the PLA2G6 gene, which is linked to neurodegenerative diseases such as Infantile Neuroaxonal Dystrophy (INAD) and Parkinson's disease 14 (PD14). These patients presented with a typical cluster of symptoms, including ataxia, gait instability, cognitive decline, motor regression, and psychiatric manifestations like autistic features, impulsive behaviour, and emotional lability. However, the clinical presentation varied a…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Prior studies investigating the genetic architecture of pediatric motor speech disorders (MSDs) have been limited by small sample sizes and an exclusive focus on apraxia. We aimed to identify pathogenic genomic variants associated with MSDs in a large pediatric population referred for exome sequencing (ES).
METHODS: We identified pediatric patients with MSDs who had clinical ES between 2012 and 2022. The rate of pathogenic/likely pathogenic (P/LP) findings considered causative of the MSD phenotype was determined and delineated by sex and neurodevelopmental comorbidity. Gene-based bur…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hyperammonemia, not a disorder, but an outcome of a disorder marked by elevated ammonia levels in the blood, is a serious medical condition that makes accurate diagnosis based on clinical and laboratory findings challenging. In this scenario, employing advanced genetic tests like whole exome sequencing can provide crucial insights that help clinicians better manage the disease. Also, identifying disease-causing variants provides conditions for genetic counseling and subsequent preventive measures, including prenatal diagnosis. METHODS: This study was conducted at the Comprehensive …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome (MRKHS), characterized by congenital uterine and vaginal aplasia, lacks definitive etiology. Discordant monozygotic (MZ) twins provide a unique model to dissect postzygotic drivers of phenotypic divergence. This study aimed to identify postzygotic mutations (SNVs, Indels, CNVs, SVs) underlying MRKHS discordance and redefine its molecular etiology.
METHODS: Whole-genome and exome sequencing (WGS/WES) were performed on blood-derived DNA from MRKHS discordant MZ twins. Variant detection utilized VarScan2, GATK, BreakDancer, and CNVnator, with stri…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (ns-CL/P) is one of the most common craniofacial anomalies with a multifactorial etiology. To investigate the contribution of rare variants to disease risk, we performed whole-exome sequencing (WES) in 58 patients with ns-CL/P from a homogeneous Polish population, excluding from analysis 423 previously investigated cleft candidate genes. After stringent filtering, prioritization, and segregation analysis, we identified 31 likely pathogenic (LP) variants across 30 genes, significantly enriched in categories related to developmental processes.…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anomalies of the corpus callosum (AnCC) are congenital malformations associated with highly variable neurodevelopmental outcomes. We performed prenatal exome sequencing (pES) on a cohort of 352 fetuses diagnosed with AnCC, analysing the diagnostic yield, the implicated genes based on the type of anomaly (partial or complete agenesis, short corpus callosum, or callosal dysgenesis) and assessing the impact on pregnancy outcomes. The overall diagnostic yield of pES was 23%, with pathogenic or likely pathogenic variants identified in 49 different genes, most of which linked to intellectual develop…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recurrent pregnancy loss or RPL is a controversial subject in reproductive medicine. Although we perform clinical tests and cytogenetic analyses, we are often left puzzled. Whole-exome sequencing (WES) is changing this trend, whose usage has helped discover inherited and new genetic changes related to miscarriage.
OBJECTIVE: This review summarizes international experience of using WES in RPL diagnostics and genetics, particularly from Saudi Arabia and other consanguineous populations.
METHODS: Based on PRISMA protocols, database searches were performed in PubMed, Scopus, Embase, …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Fetal skeletal dysplasia (SD) is a complex group of bone and cartilage with high genetic heterogeneity and phenotypic diversity. Our study aimed to identify the genetic causes of fetal SD, provide an accurate prenatal diagnosis for those families investigate non-invasive prenatal detection strategy, and facilitate clinical diagnosis of fetal SD.
MATERIALS AND METHODS: A Total 34 fetuses with SD were recruited and analyzed using chromosomal microarray analysis (CMA) and whole exome sequencing (WES). Moreover, a non-invasive prenatal diagnosis (NIPD) based on next-generation sequenci…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyoderma gangrenosum (PG) is an inflammatory skin disorder that belongs to the group of neutrophilic dermatoses. Clinically, it is typified … ed with PG susceptibility and severity (arbitrarily defined as unilesional or multilesional), whole-exome sequencing was performed on 11 unrelated patients with PG. Eight carried at least 1 variant of the keratin-encoding genes, including keratin (K)18 gene K18, K20, K23, K32, and K33B. Strikingly, a recurrent variant (rs77999286) of the K18 gene was id …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Severe combined immunodeficiency (SCID) is the most fatal form of inherited primary immunodeficiency disease. Known molecular defect mutations occur in most children with SCID.
METHODS: Herein, we report Adenosine Deaminase-SCID (ADA-SCID) using whole-exome sequencing (WES), explore exome mutational landscape and significance for 17 SCID samples, and verify the mutated exon genes using the Gene Expression Omnibus (GEO) datasets. A total of 250 patients, who were hospitalized at the Neonatal Intensive Care Unit (NICU) of The Seventh Medical Center of the PLA General Hospital for 3 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KEY POINTS: MUC1 is associated with autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease, a genetic disorder progressing to kidney failure. Variations in this gene are not easily diagnosed by conventional methods due to the MUC1 architecture, which contains a variable number of tandem repeats. Using dedicated bioinformatics tools, we systematically detected the presence of 27dupC most common MUC1 pathogenic variant from exome sequencing data.
BACKGROUND: The MUC1 gene is associated with autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease (ADTKD), leading to CKD. Current methods of sequencing…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: The pathogenetic role of 15q11.2 Copy Number Variations (CNVs) remains contentious in the scientific community, as microdeletions and microduplications in this region are linked to neurodevelopmental disorders with variable expressivity. This study aims to explore the diagnostic utility of Exome Sequencing (ES) in a cohort of pediatric patients with 15q11.2 CNVs. Methods: We enrolled 35 probands with 15q11.2 microdeletions or microduplications from two genetic centers between January 2021 and January 2023. Chromosomal Microarray Analysis (CMA) and ES were performed with …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования