BACKGROUND: Although mRNA dysregulation can induce changes in mesenchymal stem cell (MSC) homeostasis, the mechanisms by which post-transcriptional regulation influences MSC differentiation potential remain understudied. PUMILIO2 (PUM2) represses translation by binding target mRNAs in a sequence-specific manner.
METHODS: In vitro osteogenic differentiation assays were conducted using human bone marrow-derived MSCs. Alkaline phosphatase and alizarin red S staining were used to evaluate the osteogenic potential of MSCs. A rat xenograft model featuring a calvarial defect to examine effects of MS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nuclear-factor-E2-related factor 2 (Nrf2) cascade activation can ameliorate dexamethasone (DEX)-induced oxidative injury and death in human osteoblasts. Phosphoglycerate kinase 1 (PGK1) depletion is shown to efficiently activate Nrf2 signaling by inducing methylglyoxal modification of Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1). We here identified a novel PGK1-targeting microRNA: microRNA-4523 (miR-4523). RNA fluorescent in situ hybridization, RNA pull-down, and Argonaute-2 RNA immunoprecipitation results confirmed a direct binding between miR-4523 and PGK1 mRNA in primary human osteoblasts an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies indicate that PIWI (P-element-induced WImpy testis) like proteins and their cognate PIWI-interacting RNAs (piRNAs), initially identified in germline cells for protecting genomic stability by transposon silencing, also exert multiple regulatory functions in somatic and immune systems. Additionally, PIWIL/piRNA pathways are linked to innate antiviral defense and immune signaling pathway regulation. This review systematically compiles the reports on the immunological functions of noncoding RNAs (ncRNAs) and delineates the potential molecular processes and functional characteristics
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Beyond regulation of mRNAs by individual ncRNA types, like miRNAs, circRNAs or lncRNAs, their interplay as competitive endogenous RNAs (ceRNAs) appears pivotal in diseases. ceRNAs are promising biomarkers in diagnosing diseases as well as in understanding off-target drug mechanisms or developing specific therapeutics. Many diseases are influenced at different molecular levels and across multiple organs, making cross-organ multi-omics interaction studies necessary to holistically understand diseases and their regulation. In our study we applied this approach to the cognitive dysfunc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BrCa) is a predominant type of cancer with high mortality rates. The deregulation of cell signaling pathways is a hallmark of BrCa pathogenesis and disease progression. Aiming to explore novel post-transcriptional regulatory mechanisms influencing BrCa cell signaling, a combinational sequencing approach was employed by integrating small RNA sequencing with poly(A)-RNA sequencing, following the alteration of cell signaling using proteasome inhibitors. Pursuing a broad analysis of BrCa gene expression, cell lines deriving from the major molecular subtypes were incorporated. Gene e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: tRNA-derived small RNAs (tsRNAs) represent a novel class of highly conserved non-coding RNAs that play crucial roles in various cellular processes, including cell proliferation and the initiation of viral reverse transcription. Despite their significant biological functions, studies exploring the role of tsRNAs in infectious diseases remain limited. Severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) is an emerging tick-borne hemorrhagic fever caused by SFTS virus (SFTSV), which is associated with a high fatality rate. This study investigates the potential diagnostic value of serum
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Cervical cancer is mainly driven by persistent infection with high-risk human papillomaviruses (HPV), particularly HPV16 and HPV18. Despite advances in cytology, HPV-DNA testing and vaccination, challenges remain in the triage of HPV-positive individuals, prognostic stratification and prediction of treatment response. Non-coding RNAs (ncRNAs), including microRNAs, long non-coding RNAs and circular RNAs, together with host genetic factors influencing ncRNA expression and emerging lncRNA-encoded peptides, are increasingly recognized as regulators of HPV-associated carcinog
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small RNAs (sRNAs), broadly defined as RNA molecules shorter than ~200 nucleotides in size, include miscellaneous products of transcription and post-transcriptional processing that are variably abundant in cancer cells. While some types of sRNAs, such as microRNA (miRNA), are relatively well-characterized, the biological roles of many others remain unknown. Regardless of functionality, sRNA transcriptomes may reflect the identity of cell types, tissues, and cancers. While deep sequencing remains the best approach for sRNA profiling, there are distinct technical challenges for sRNA extraction,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) modification is deemed to be co-transcriptionally installed on pre-mRNAs, thereby influencing various downstream RNA metabolism events. However, the causal relationship between m6A modification and RNA processing is often unclear, resulting in premature or even misleading generalizations on the function of m6A modification. Here, we develop 4sU-coupled m6A-level and isoform-characterization sequencing (4sU-m6A-LAIC-seq) and 4sU-GLORI to quantify the m6A levels for both newly synthesized and steady-state RNAs at transcript and single-base-resolution levels, respectively
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) has a unique ability among flaviviruses to cross the placental barrier and infect the fetal brain causing severe abnormalities of neurodevelopment known collectively as congenital Zika syndrome. In our recent study, we demonstrated that the viral noncoding RNA (subgenomic flaviviral RNA, sfRNA) of the Zika virus induces apoptosis of neural progenitors and is required for ZIKV pathogenesis in the developing brain. Herein, we expanded on our initial findings and identified biological processes and signaling pathways affected by the production of ZIKV sfRNA in the developing bra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-Methyladenosine (m6A) RNA modification has emerged in recent years as a new layer of regulatory mechanism controlling gene expression in eukaryotes. As a reversible epigenetic modification found not only in messenger RNAs but also in non-coding RNAs, m6A affects the fate of the modified RNA molecules and plays important roles in almost all vital bioprocesses, including cancer development. Here we review the up-to-date knowledge of the pathological roles and underlying molecular mechanism of m6A modifications (in both coding and non-coding RNAs) in cancer pathogenesis and drug response/resis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infections are responsible for numerous deaths worldwide. Flaviviruses, which contain RNA as their genetic material, are one of the most pathogenic families of viruses. There is an increasing amount of evidence suggesting that their 5' and 3' non-coding terminal regions are critical for their survival. Information on their structural features is essential to gain detailed insights into their functions and interactions with host proteins. In this study, the 5' and 3' terminal regions of Murray Valley encephalitis virus and Powassan virus were examined using biophysical and computational m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs (circRNAs) are a novel class of non-coding RNA molecules in eukaryotic organisms that have potentially important roles in gene regulation. Nevertheless, whether viruses can encode circRNA is still uncertain. To examine whether large genome DNA viruses can generate circRNA during the infection of human cells, we performed RNA sequencing of ribosomal RNA-depleted total RNA from Epstein-Barr virus (EBV)-infected cell lines, including SNU-719, AGS-EBV, C666-1 and Akata. We identified an EBV-encoded circRNA, ebv_circ_RPMS1, that consists of the head-to-tail splicing of exons 2-4 from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is an inherited neurodegenerative disorder caused by a mutation that expands the polyglutamine (CAG) repeat in exon 1 of the huntingtin (HTT) gene. Wild-type HTT protein interacts with other proteins to protect cells against toxic stimuli, mediate vesicle transport and endocytosis, and modulate synaptic activity. Mutant HTT protein disrupts autophagy, vesicle transport, neurotransmitter signaling, and mitochondrial function. Although many of the activities of wild-type HTT protein and the toxicities of mutant HTT protein are characterized, less is known about the acti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The function of RNA from the non-coding (the so called "dark matter") regions of the genome has been a subject of considerable recent debate. Perhaps the most controversy is regarding the function of RNAs found in introns of annotated transcripts, where most of the reads that map outside of exons are usually found. However, it has been reported that the levels of RNA in introns are minor relative to those of the corresponding exons, and that changes in the levels of intronic RNAs correlate tightly with that of adjacent exons. This would suggest that RNAs produced from the vast expa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Previously, we determined that heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E1 (hnRNP-E1) functions as an intracellular physiologic sensor of folate deficiency. In this model, l-homocysteine, which accumulates intracellularly in proportion to the extent of folate deficiency, covalently binds to and thereby activates homocysteinylated hnRNP-E1 to interact with folate receptor-α mRNA; this high-affinity interaction triggers the translational upregulation of cell surface folate receptors, which enables cells to optimize folate uptake from the external milieu. However, integral to this mode
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, the incidence of gestational diabetes mellitus (GDM) has been steadily increasing, posing risks to the long-term health of both mother and child. We aim to characterize blood glucose levels of pregnant women and predict the risk of GDM during early pregnancy through plasma cell-free mRNA and non-coding RNA (cfRNA). Here, we collected plasma samples from 108 pregnant women (54 with GDM and 54 controls) at around 16 weeks of gestation. Following high-throughput sequencing, we performed differentially abundant genes analysis and evaluated correlations between cfRNA profiles and b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effective T cell responses against pathogens require a rapid yet tightly controlled remodeling of the proteome, and RNA binding proteins (RBPs) are key in this process. For instance, the RBP ZFP36L1 prevents excessive protein production and thereby limits immunopathology. ZFP36L1 is primarily known to mediate mRNA decay, but it can also regulate other processes. How its mode of action relates to its interaction partners is, however, not well-understood. Here, we mapped the ZFP36L1 interactome in primary human T cells. Using proximity labeling, we identified known and new interactors that regul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial small non-coding RNA (sRNAs), together with the RNA chaperone Hfq, post-transcriptionally regulate gene expression by affecting ribosome binding or mRNA stability. In the human pathogen Bordetella pertussis, the causative agent of whooping cough, hundreds of sRNAs have been identified, but their roles in B. pertussis biology are mostly unknown. Here we characterize the Hfq-dependent sRNABpsA, whose level is dramatically higher in the virulence (Bvg+) mode. We show that transcription from a σA-dependent promoter yields a long form of 190 nucleotides (nt) that is processed by RNase E t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Small RNAs have been found to control a broad range of bacterial phenotypes including tolerance to antibiotics. Vancomycin tolerance in multidrug resistance Staphylococcus aureus is correlated with dysregulation of small RNAs although their contribution to antibiotic tolerance is poorly understood. RNA-RNA interactome profiling techniques are expanding our understanding of sRNA-mRNA interactions in bacteria; however, determining the function of these interactions for hundreds of sRNA-mRNA pairs is a major challenge. At steady-state, protein and mRNA abundances are often highly corr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования