Acid ceramidase (aCDase, ASAH1) hydrolyzes lysosomal membrane ceramide into sphingosine, the backbone of all sphingolipids, to regulate many cellular processes. Abnormal function of aCDase leads to Farber disease, spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy, and is associated with Alzheimer's, diabetes, and cancer. Here, we present crystal structures of mammalian aCDases in both proenzyme and autocleaved forms. In the proenzyme, the catalytic center is buried and protected from solvent. Autocleavage triggers a conformational change exposing a hydrophobic channel leading to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, Qula casein derived from yak milk casein was hydrolyzed using a two-enzyme combination approach, and high angiotensin I-converting enzyme (ACE) inhibitory activity peptides were screened by quantitative structure-activity relationship (QSAR) modeling integrated with molecular docking analysis. Hydrolysates (<3 kDa) derived from combinations of thermolysin + alcalase and thermolysin + proteinase K demonstrated high ACE inhibitory activities. Peptide sequences in hydrolysates derived from these two combinations were identified by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: High level of Low Density Lipoprotein-Cholesterol (LDL-C) in circulation in the blood is associated with an elevated risk of cardiovascular disease (CVD) and stroke. Currently the statin drugs which inhibit the enzyme HMG-CoA reductase responsible for cholesterol synthesis in the liver are very effective in lowering LDL-cholesterol. However these drugs are often associated with serious side effects particularly for ∼10-12% of cases. Therefore there is a need to develop non-statin based cholesterol reducing agents. Recently it was revealed that the secreted Proprotein Convertase Sub
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbonic anhydrases (CAs, EC 4.2.1.1) belonging to the γ-class are present in archaea, bacteria and plants but, except the Methanosarcina thermophila enzymes CAM and CAMH, they were poorly characterized so far. Here we report a new such enzyme (PgiCA), the γ-CA from the oral cavity pathogenic bacterium Porphyromonas gingivalis, the main causative agent of periodontitis. PgiCA showed a good catalytic activity for the CO2 hydration reaction, comparable to that of the human (h) isoform hCA I. Inorganic anions such as thiocyanate, cyanide, azide, hydrogen sulfide, sulfamate and trithiocarbonate we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enzymatic synthesis and hydrolysis of nucleoside phosphate compounds play a key role in various biological pathways, like signal transduction, DNA synthesis and metabolism. Although these processes have been studied extensively, numerous key issues regarding the chemical pathway and atomic movements remain open for many enzymatic reactions. Here, using the Mason-Pfizer monkey retrovirus dUTPase, we study the dUTPase-catalyzed hydrolysis of dUTP, an incorrect DNA building block, to elaborate the mechanistic details at high resolution. Combining mass spectrometry analysis of the dUTPase-catalyze
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a common and devastating type of childhood-onset muscular dystrophy, attributed to an X-linked defect in the gene that encodes dystrophin. Myopathy with DMD is most pronounced in the diaphragm muscle and fast-twitch limb muscles and is dependent upon susceptibility to damage, inflammatory cell infiltration, and proinflammatory signaling (nuclear factor-κB; NF-κB). Although recent papers have reawakened the notion that oxidative stress links inflammatory signaling with pathology in DMD in limb muscle, the importance of redox mechanisms had been clouded by in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The class A carbapenemase KPC-6 produces resistance to a broad range of β-lactam antibiotics. This enzyme hydrolyzes penicillins, the monobactam aztreonam, and carbapenems with similar catalytic efficiencies, ranging from 10(5) to 10(6) M(-1) s(-1). The catalytic efficiencies of KPC-6 against cephems vary to a greater extent, ranging from 10(3) M(-1) s(-1) for the cephamycin cefoxitin and the extended-spectrum cephalosporin ceftazidime to 10(5) to 10(6) M(-1) s(-1) for the narrow-spectrum and some of the extended-spectrum cephalosporins.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxidoreductase enzymes encapsulated in metal-organic frameworks (MOFs) offer an effective approach for water decontamination, yet activity loss during slow coprecipitation severely limits their application. Here, we develop a polyvinylpyrrolidone (PVP)-accelerated strategy that encapsulates horseradish peroxidase (HRP) into a zeolitic imidazolate framework (ZIF-L) within minutes. Time-resolved synchrotron X-ray scattering directly visualizes the nucleation and growth kinetics, revealing that PVP promotes rapid crystallization and drastically shortens enzyme exposure to denaturing conditions. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global crisis of antimicrobial resistance demands solutions that transcend conventional antibiotic paradigms. Here, we present an atomically engineered VS4-based nanomaterial (TFB-Fe@VS4) featuring dendritic architectures with single-iron catalytic sites, designed as a multimodal reactive oxygen species (ROS) generator against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and its recalcitrant biofilms. This biocatalytic system leverages three synergistic mechanisms: nanodendrite-mediated bacterial capture, microenvironment-responsive ROS generation, and ultrasound-amplified oxidative
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aimed to evaluate the effect of the immobilization method of trypsin on biochar on the hydrolysis of casein from different sources, when compared to the process using trypsin in native form, to obtain bioactive peptides. The modification of the surface of biochar with glutaraldehyde was effective, as shown by the results of FTIR assay and the texture profile of the materials. Both activated and functionalized biochar showed high immobilization efficiency (greater than 87%) and high binding capacity (greater than 91 mg/g). During hydrolysis, the biocatalyst obtained by enzyme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As the most popularly abused one of opioids, heroin is actually a prodrug. In the body, heroin is hydrolyzed/activated to 6-monoacetylmorphine (6-MAM) first and then to morphine to produce its toxic and physiological effects. It has been known that heroin hydrolysis to 6-MAM and morphine is accelerated by cholinesterases, including acetylcholinesterase (AChE) and/or butyrylcholinesterase (BChE). However, there has been controversy over the specific catalytic activities and functional significance of the cholinesterases, which requires for the more careful kinetic characterization under the sam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In animal models, estrogens are complete carcinogens in certain target sites. 4-Hydroxyestradiol (4-OH-E2), an endogenous metabolite of 17β-estradiol (E2), is known to have prominent estrogenic activity plus potential genotoxicity and mutagenicity. We report here our finding that 4-OH-E2 does not induce pituitary tumors in ACI female rats, whereas E2 produces 100% pituitary tumor incidence. To probe the mechanism, we conducted a short-term animal experiment to compare the proliferative effect of 4-OH-E2 in several organs. We found that, whereas 4-OH-E2 had little ability to stimulate pituitary
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The six-iron cofactor of [FeFe]-hydrogenases (H-cluster) is the most efficient H2-forming catalyst in nature. It comprises a diiron active site with three carbon monoxide (CO) and two cyanide (CN(-)) ligands in the active oxidized state (Hox) and one additional CO ligand in the inhibited state (Hox-CO). The diatomic ligands are sensitive reporter groups for structural changes of the cofactor. Their vibrational dynamics were monitored by real-time attenuated total reflection Fourier-transform infrared spectroscopy. Combination of (13)CO gas exposure, blue or red light irradiation, and controlle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Product isolation from aqueous-organic reaction mixtures that contain high concentrations of whole cells constitutes a challenging task in bioprocessing. Stirring of the biphasic reaction media leads to the formation of solvent droplets coated by cells and other surface active components and an emulsion forms. We used an early focus on phase separation to simplify a whole-cell bioreduction. Octanol, heptanol, hexanol, hexane and dipropylether were tested as co-solvents in the E. coli catalyzed reduction of o-chloroacetophenone. All solvents showed very similar performance in bioreductions and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The final step in the biosynthesis of the phthalideisoquinoline alkaloid noscapine involves a purported dehydrogenation of the narcotinehemiacetal keto moiety. A short-chain dehydrogenase/reductase (SDR), designated noscapine synthase (NOS), that catalyzes dehydrogenation of narcotinehemiacetal to noscapine was identified in opium poppy and functionally characterized. The NOS gene was isolated using an integrated transcript and metabolite profiling strategy and subsequently expressed in Escherichia coli. Noscapine synthase is highly divergent from other characterized members of the NADPH-depen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake venom serine proteinases (SVSPs) are hemostatically active toxins that perturb the maintenance and regulation of both the blood coagulation cascade and fibrinolytic feedback system at specific points, and hence, are widely used as tools in pharmacological and clinical diagnosis. The crystal structure of a thrombin-like enzyme (TLE) from Bothrops jararacussu venom (Jararacussin-I) was determined at 2.48 Å resolution. This is the first crystal structure of a TLE and allows structural comparisons with both the Agkistrodon contortrix contortrix Protein C Activator and the Trimeresurus stejne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The bacterium Acetobacter sp. CCTCC M209061 is a promising whole-cell biocatalyst with exclusive anti-Prelog stereoselectivity for the reduction of prochiral ketones that can be used to make valuable chiral alcohols such as (R)-4-(trimethylsilyl)-3-butyn-2-ol. Although it has promising catalytic properties, its stability and reusability are relatively poor compared to other biocatalysts. Hence, we explored various materials for immobilizing the active cells, in order to improve the operational stability of biocatalyst.
RESULTS: It was found that Ca-alginate give the best immobiliz
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein we demonstrate the protocol of a biocatalytic precipitation (BCP)-based sandwich photoelectrochemical (PEC) horseradish peroxidase (HRP)-linked immunoassay on the basis of their synergy effect for the ultrasensitive detection of mouse IgG (antigen, Ag) as a model protein. The hybrid film consisting of oppositely charged polyelectrolytes and CdS quantum dots (QDs) is developed by the classic layer by layer (LbL) method and then employed as the photoactive antibody (Ab) immobilization matrix for the subsequent sandwich-type Ab-Ag affinity interactions. Improved sensitivity is achieved thr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymer-drug and polymer-protein conjugates are promising candidates for the delivery of therapeutic agents. PEGylation, using poly(ethylene glycol) for the conjugation, is now the gold standard in this field, and some PEGylated proteins have successfully reached the market. Hydroxyethyl starch (HES) is a water-soluble, biodegradable derivative of starch that is currently being investigated as a substitute for PEG. So far, only chemical methods have been suggested for HES conjugation; however, these may have detrimental effects on proteins. Here, we report an enzymatic method for HES conjugati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The design, synthesis, and evaluation of a series of novel inhibitors of aspartate transcarbamoylase (ATCase) are reported. Several submicromolar phosphorus-containing inhibitors are described, but all-carboxylate compounds are inactive. Compounds were synthesized to probe the postulated cyclic transition-state of the enzyme-catalyzed reaction. In addition, the associated role of the protonation state at the phosphorus acid moiety was evaluated using phosphinic and carboxylic acids. Although none of the synthesized inhibitors is more potent than N-phosphonacetyl-l-aspartate (PALA), the compoun
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.