Chlamydia trachomatis causes both trachoma and sexually transmitted infections. These diseases have similar pathology and potentially similar genetic predisposing factors. We aimed to identify polymorphisms and pathways associated with pathological sequelae of ocular Chlamydia trachomatis infections in The Gambia. We report a discovery phase genome-wide association study (GWAS) of scarring trachoma (1090 cases, 1531 controls) that identified 27 SNPs with strong, but not genome-wide significant, association with disease (5 × 10(-6) > P > 5 × 10(-8)). The most strongly associated SNP (rs11151339
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Interstitial cystitis, or bladder pain syndrome (IC/BPS), is a chronic bladder disorder characterized by lower abdominal pain associated with the urinary bladder and accompanied by urinary frequency and urgency in the absence of identifiable causes. IC/PBS can be separated into the classic Hunner's ulcerative type and the more prevalent non-ulcerative disease. Our aim was to unravel the biological processes and dysregulated cell signaling pathways leading to the bladder remodeling in non-ulcerative bladder pain syndrome (BPS) by studying the gene expression changes in the patients'
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The epigenetic effects of individual environmental toxicants in tobacco remain largely unexplored. Cadmium (Cd) has been associated with smoking-related health effects, and its concentration in tobacco smoke is higher in comparison with other metals.
OBJECTIVES: We studied the association of Cd and smoking exposures with human blood DNA methylation (DNAm) profiles. We also evaluated the implication of findings to relevant methylation pathways and the potential contribution of Cd exposure from smoking to explain the association between smoking and site-specific DNAm.
METHODS: We c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genetic cause of most congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT) cases remains unknown, therefore the novel approaches in searching for the common disease denominators are required. miRs regulate gene expression in humans and therefore have potentially therapeutic and biomarker properties. No studies thus far have attempted to explore the miRs in human CAKUT. We applied a new strategy to identify most specific miRs associated with CAKUT, in pediatric patients.
METHODS: Data from the whole genome expression, gathered from ureter tissue samples of 19 patients a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovine milk is a rich source of bioactive proteins that supports the early growth and development of the newborn lambs. A large number of researches had targeted to the identification of ovine milk fat globule membrane proteins (MFGMPs), caseins (CNs), mastitis milk proteins in past years, but the dynamic change tendency of milk whey proteins during postnatal development has received limited attention. This research aimed to investigate the dynamic changes of ovine milk whey proteins after delivery, and explore the functions of whey proteins on early development of the newborns.
ME
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pure invasive micropapillary carcinoma (IMPC) is a special type of breast carcinoma characterised by clusters of cells presenting polarity abnormalities. The biological alterations underlying this pattern remain unknown.
METHODS: Pangenomic analysis (n=39), TP53 (n=43) and PIK3CA (n=41) sequencing in a series of IMPCs were performed. A subset of cases was also analysed with whole-exome sequencing (n=4) and RNA sequencing (n=6). Copy number variation profiles were compared with those of oestrogen receptors and grade-matched invasive ductal carcinomas (IDCs) of no special type.
R
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord stimulation has become an important modality in pain treatment especially for neuropathic pain conditions refractory to pharmacotherapy. However, the molecular control of inhibitory and excitatory mechanisms observed after spinal cord stimulation are poorly understood. Here, we used RNA-seq to identify differences in the expression of genes and gene networks in spinal cord tissue from nerve-injured rats with and without repetitive conventional spinal cord stimulation treatment. Five weeks after chronic constrictive injury to the left sciatic nerve, male and female rats were randomi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotes have evolved complex defense pathways to combat invading pathogens. Here, we investigated the role of the Arabidopsis thaliana heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP-Q) LIF2 in the plant innate immune response. We show that LIF2 loss-of-function in A. thaliana leads to changes in the basal expression of the salicylic acid (SA)- and jasmonic acid (JA)- dependent defense marker genes PR1 and PDF1.2, respectively. Whereas the expression of genes involved in SA and JA biosynthesis and signaling was also affected in the lif2-1 mutant, no change in SA and JA hormonal contents was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver is a unique organ that has a phenomenal capacity to regenerate after injury. Different surgical procedures, including partial hepatectomy (PH), intraoperative portal vein ligation (PVL), and associated liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy (ALPPS) show clinically distinct recovery patterns and regeneration. The observable clinical differences likely mirror some underlying variations in the patterns of gene activation and regeneration pathways. In this study, we provided a comprehensive comparative transcriptomic analysis of gene regulation in regenerating ra
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcosis is a fungal disease caused by C. neoformans. To adapt and survive in diverse ecological niches, including the animal host, this opportunistic pathogen relies on its ability to uptake nutrients, such as carbon, nitrogen, iron, phosphate, sulfur, and amino acids. Genetic circuits play a role in the response to environmental changes, modulating gene expression and adjusting the microbial metabolism to the nutrients available for the best energy usage and survival. We studied the sulfur amino acid biosynthesis and its implications on C. neoformans biology and virulence. CNAG_04798 e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drought stress is a global problem, and the lack of water is a key factor that leads to agricultural shortages. MicroRNAs play a crucial role in the plant drought stress response; however, the microRNAs and their targets involved in drought response have not been well elucidated. In the present study, we used Illumina platform (https://www.illumina.com/) and combined data from miRNA, RNA, and degradome sequencing to explore the drought- and organ-specific miRNAs in orchardgrass (Dactylis glomerata L.) leaf and root. We aimed to find potential miRNA⁻mRNA regulation patterns responding to drough
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The treatment of microbial infections is becoming increasingly challenging because of limited therapeutic options and the growing number of pathogenic strains that are resistant to current antibiotics. There is an urgent need to identify molecules with novel modes of action to facilitate the development of new and more effective therapeutic agents. The anti-mycobacterial activity of the C17 diyne natural products falcarinol and panaxydol has been described previously; however, their mode of action remains largely undetermined in microbes. Gene expression profiling was therefore use
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feature reduction of genetic markers and its impact on genomic selection has been studied extensively. Prior information borrowed from genome-wide association studies (GWAS) can improve genomic selection accuracy. However, the effect of integration of posterior inclusion probability (PIP) information from fine mapping algorithm and linkage disequilibrium (LD) on genomic selection remains less studied. Here, three marker prioritization strategies-genome-wide fine-mapping (GWFM), LD pruning (LDFM), and GWAS-informed LD pruning ((GWAS + LD)FM)-were evaluated, using Bayesian fine-mapping integrate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we describe the rational design, synthesis, and biological evaluation of a novel series of salicylaldehyde-derived sulfonamide Schiff base hybrids. Eight compounds (C3-C10) were synthesized via condensation of 3-formyl-4-hydroxybenzenesulfonyl chloride with diverse primary amines and extensively characterized using IR, NMR, and MS/MS. Synthesized compounds were evaluated for their cytotoxicity in a variety of pancreatic, breast, colorectal, hepatic and ovarian cancer cell lines, and compound C5 was identified as the lead candidate, with an IC₅₀ ranging 4.1-75 μM across the compl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The milk fat-to-protein ratio (FPR) is an important indicator of milk quality and a useful biomarker of metabolic status in dairy cows. This study used functional single-step genome-wide association analysis (ssGWAS) incorporating performance records from 502,781 first-parity Iranian Holstein cows and SNP genotypes from 2,187 Holstein bulls to investigate the genomic architecture underlying FPR variation in this population. The heritability of FPR was estimated at 0.24. Genome-wide scanning identified 18 significant SNPs on BTA14 and 121 positional candidate genes located within ± 100 kb of th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of engineered Chinese Hamster Ovary (CHO) cell lines capable of long-term, stable, and efficient recombinant protein expression is essential for industrial biologics manufacturing. Traditional random integration is hindered by epigenetic silencing and position effects, while current site-specific strategies are restricted by a limited stable library. To address this, we established a screening strategy based on two core criteria for ideal loci: 1) the capacity for sustained exogenous protein expression and 2) minimal impact on host cell physiology. By analyzing chromosomal loca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke induces rapid changes in transcriptional regulatory mechanisms across diverse genomic regions of the brain. These alterations fine-tune gene expression patterns to orchestrate post-stroke pathological responses. Precise control of these processes is critical for limiting brain damage and facilitating long-term neurological recovery. During transcription, RNA can hybridize with the DNA template to form three-stranded RNA:DNA hybrids, termed R-loops. Accumulation of R-loops leads to altered transcriptional fidelity, DNA damage, and genomic instability in several pathological cond
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A COVID-19 booster dose has been found to be effective in our fight against SARS-CoV-2 infection. However, their long-term beneficial or adverse effects among healthy individuals are not fully understood. We investigated the impact of the Pfizer-BioNTech-(BNT162b2) booster dose on plasma proteome profiles of fully vaccinated healthy individuals in a mimic of reinfection to understand the disease mechanisms and to identify novel diagnostic and prognostic biomarkers. In contrast to prebooster, postbooster recipients exhibited a distinct proteomic signature following SARS-CoV-2 spike (S) protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This exploratory study aimed to characterize plasma proteome profiles across different risk groups and investigate underlying molecular mechanisms using bioinformatics approaches.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: This is a case-control study. Plasma samples from 15 children per group- standard-risk B-ALL (B-ALL SR), high-risk B-ALL (B-ALL HR), high-risk T-ALL (T-ALL HR) and controls were pooled. LC-MS/MS was used for proteome analysis. Dynein axonemal heavy chain 5 (DYH5) was selected for preliminary validation using ELISA in individual samples. Pearson correlation was applied descrip
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bisphenol F (BPF), a primary substitute for bisphenol A (BPA), is widely utilized in industrial production and daily life. However, its widespread environmental presence has raised concerns regarding potential health risks. This study aims to investigate the potential toxic targets of BPF in the pathogenesis of non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). Initially, potential target genes of BPF were identified using the ChEMBL, STITCH, and SWISS databases. NAFLD-related genes were obtained from the OMIM and GeneCards databases, yielding a preliminary set of 28 overlapping candidate targets. Gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.