Botulinum toxin (BoNT) from Clostridium botulinum OFD05, isolated from bovine botulism, is a D/C mosaic-type BoNT. BoNTs possess binding, translocation and catalytic domains. The BoNT/OFD05 binding domain exhibits significant sequence identity to BoNT/C, which requires a single ganglioside as a binding receptor on neuronal cells, while BoNT/A and BoNT/B require two receptors for specific binding. To determine the binding mechanism of BoNT/OFD05 and its ganglioside receptors on neuronal cells, recombinant BoNT/OFD05 receptor-binding domain has been expressed, purified and crystallized. Native a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Janus family of tyrosine kinases (JAK) plays an essential role in development and in coupling cytokine receptors to downstream intracellular signaling events. A t(9;12)(p24;p13) chromosomal translocation in a T cell childhood acute lymphoblastic leukemia patient was characterized and shown to fuse the 3' portion of JAK2 to the 5' region of TEL, a gene encoding a member of the ETS transcription factor family. The TEL-JAK2 fusion protein includes the catalytic domain of JAK2 and the TEL-specific oligomerization domain. TEL-induced oligomerization of TEL-JAK2 resulted in the constitutive acti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An increasing number of analgesic peptides have been found in the tail toxicyst, but there has been little research into their analgesic domains. Where are the analgesic domains in a conservative betaalphabetabeta topology conformation of the analgesic peptides? We have carried out research to address this question. On account of the importance of disulfide bonds in the study of protein structure, the conformational stability, catalytic activity and folding, and site-directed mutagenesis in disulfide bridges have been used to look for the analgesic domain in a mature antitumor-analgesic peptid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how phosphoenolpyruvate (PEP) binding induces the large open-to-closed conformational transition of bacterial Enzyme I (EI) has remained a long-standing problem in structural biology. In EI, PEP binds the C-terminal EIC domain, yet catalysis requires docking of the distant N-terminal EIN domain, which carries the active-site H189 residue, onto EIC. How this local binding event is coupled to global domain rearrangement has been unclear. Here, we combine experimental Chemical Shift Covariance Analysis (CHESCA) with computational Chemically Accurate Contact Response Analysis (ChACRA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pdr5, a member of the extensive ABC transporter superfamily, is representative of a clinically relevant subgroup involved in pleiotropic drug resistance. Pdr5 and its homologues drive drug efflux through uncoupled hydrolysis of nucleotides, enabling organisms such as baker's yeast and pathogenic fungi to survive in the presence of chemically diverse antifungal agents. Here, we present the molecular structure of Pdr5 solved with single particle cryo-EM, revealing details of an ATP-driven conformational cycle, which mechanically drives drug translocation through an amphipathic channel, and a cla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The final steps of cell-wall biosynthesis in bacteria are carried out by penicillin-binding proteins (PBPs), whose transpeptidase domains form the cross-links in peptidoglycan chains that define the bacterial cell wall. These enzymes are the targets of β-lactam antibiotics, as their inhibition reduces the structural integrity of the cell wall. Bacterial resistance to antibiotics is a rapidly growing concern; however, the structural underpinnings of PBP-derived antibiotic resistance are poorly understood. PBP4 and PBP5 are low-affinity, class B transpeptidases that confer antibiotic resistance
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Down syndrome is one of the major causes of mental retardation and congenital heart malformations. Other common clinical features of Down sy … The DSCR1 binding region in calcineurin A is located in the linker region between the calcineurin A catalytic domain and the calcineurin B binding domain, outside of other functional domains previously defined in calcineurin A. DSCR1 belongs to a family of evolutionarily conserved proteins with three members in humans: DSCR1, ZAKI-4 and DSCR1L2. We further demonst …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The receptors for colony stimulating factor-1 (CSF-1), platelet derived growth factor and the c-kit protein tyrosine kinase (PTK) contain within their catalytic domains a stretch of 60-100 residues, largely unrelated in sequence, with no counterpart in other PTKs. Of the 64 amino acids within this kinase insert, 58 were deleted from the mouse CSF-1 receptor by oligonucleotide-directed mutagenesis. The mutant CSF-1 receptor was not markedly affected in its kinase activity, post-translational processing or its ability to induce autocrine transformation of NIH 3T3 mouse fibroblasts. Similarly, re…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thioredoxins are ubiquitous thiol-disulfide oxidoreductases that maintain intracellular redox homeostasis. In addition to its conserved catalytic domain, Escherichia coli thioredoxin 2 (EcTrx2) possesses a unique N-terminal zinc-binding domain whose physiological function remains largely unknown. Here, we identify a previously unrecognized DNA-binding activity of EcTrx2 and demonstrate its role in protecting DNA during oxidative stress. Electrophoretic mobility shift assays showed that EcTrx2 bound plasmid DNA in a concentration-dependent and GST-tag-independent manner, whereas EcTrx1 exhibite…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence information obtained by NH2-terminal sequence analysis of two molecular weight forms (45 and 48 kDa) of the porcine Gal beta 1,3GalNAc alpha 2,3-sialyltransferase was used to clone a full-length cDNA of the enzyme. The cDNA sequence revealed an open reading frame coding for 343 amino acids and a putative domain structure consisting of a short NH2-terminal cytoplasmic domain, a signal-anchor sequence, and a large COOH-terminal catalytic domain. This domain structure was confirmed by construction of a recombinant sialyltransferase in which the cytoplasmic domain and signal-anchor sequen…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia telangiectasia and Rad3-related (ATR) initiates cell cycle checkpoints to maintain genome integrity in the presence of replication stress or various forms of DNA damage. However, how ATR is activated for checkpoint initiation remains incompletely understood. The canonical model suggests that binding of an ATR-activator protein relieves the autoinhibitory PIKK regulatory domain (PRD) within the kinase domain, thereby activating ATR by granting substrate access to the catalytic centre. To better understand the checkpoint initiation mechanism, we conducted a genetic screen in fission yeast
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phage-derived lysins represent a novel, non-traditional therapeutic agent against multidrug-resistant bacteria. However, engineering lysins with broad host range remain poorly addressed. Previously, we reported that the chimeric lysin ClyR, which harbors the CHAP catalytic domain of PlyC lysin (PlyCAC) and the SH3b cell-wall binding domain of PlySs2 lysin (PlySb), exhibits an expanded host range. However, the mechanism by which ClyR exhibits expanded bactericidal activity is still not fully understood. Since the structure of PlyCAC is publicly available (PDB code: 4F88), here, we first solve t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
: Neuropathy target esterase (NTE) is an endoplasmic reticulum (ER)-localized phospholipase that deacylates phosphatidylcholine (PC) and lysophosphatidylcholine (LPC). Loss-of-function mutations in the human NTE gene have been associated with a spectrum of neurodegenerative disorders such as hereditary spastic paraplegia, ataxia and chorioretinal dystrophy. Despite this, little is known about structure-function relationships between NTE protein domains, enzymatic activity and the interaction with cellular organelles. In the current study we show that the C-terminal region of NTE forms a cataly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfite oxidase (SO) is a molybdoheme enzyme that is important in sulfur catabolism, and mutations in the active site region are known to cause SO deficiency disorder in humans. This investigation probes the effects that mutating aromatic residues (Y273, W338, and H337) in the molybdenum-containing domain of human SO have on both the intramolecular electron transfer (IET) rate between the molybdenum and iron centers using laser flash photolysis and on catalytic turnover via steady-state kinetic analysis. The W338 and H337 mutants show large decreases in their IET rate constants (k (ET)) relati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review describes the structure and function of prolyl endopeptidase (PEP) enzymes and how they are being evaluated as drug targets and therapeutic agents. The most well studied PEP family has a two-domain structure whose unique seven-blade beta-propeller domain works with the catalytic domain to hydrolyze the peptide bond on the carboxyl side of internal proline residues of an oligopeptide substrate. Structural and functional studies on this protease family have elucidated the mechanism for peptide entry between the two domains. Other structurally unrelated PEPs have been identified, but …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-domain auxiliary activity family 12 (AA12) pyrroloquinoline quinone-dependent dehydrogenases and free AA8 modules are prevalent in cellulolytic fungi; however, their function in polysaccharide biodegradation remains unclear. Here, we characterized three single-domain AA12 dehydrogenases (TthAA12, TthAA12B, and TteAA12A) and one free AA8 module (TthAA8A) from Thermothelomyces thermophilus and Thermothielavioides terrestris. All three single-domain AA12 dehydrogenases primarily function as dehydrogenases but also exhibit a measurable intrinsic oxidase activity, as evidenced by the concomi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known about the biochemical properties of the non-catalytic domains of snake venom metalloproteinases (SVMPs). The ECD sequence of the disintegrin-like domain (D-domain) has been assigned as the disintegrin motif and, recently, the hyper-variable region (HVR) of the cysteine-rich domain (C-domain) was suggested to constitute a potential protein-protein adhesive interface. Here we show that the recombinant C-domain of HF3, a hemorrhagic SVMP from Bothrops jararaca, as well as three peptides resembling its HVR, inhibit collagen-induced platelet aggregation, which indicates a role for t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis is a fatal childhood neurological disorder caused by a deficiency in the lysosomal protease tr … large 151-residue C-shaped prodomain makes extensive contacts as it wraps around the surface of the catalytic domain with the two domains connected by a 24-residue flexible linker that passes through the substrate-binding groove. The proenzyme structure reveals suboptimal catalytic triad geometry with its propiece linker partially blocking the substrate-binding si …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix metalloproteinases (MMPs) and their inhibitors are important in connective tissue re-modelling in diseases of the cardiovascular syst … athogenesis of heart failure. We have determined the crystal structure, at 2.3 A resolution, of the catalytic domain of human MMP9 bound to a peptidic reverse hydroxamate inhibitor as well as the complex of the same inhibitor bound to an active-site mutant (E402Q) at 2.1 A resolution. MMP9 adopts the typical MMP fold. The catalytic centre is composed of the active …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria identifies as a tropical hallmark, conforming to the burgeoning notion of escalating drug resistance among virulent strains, with the burdensome Plasmodium falciparum under its wing. The cysteine protease Falcipain-2 (FP2) is released in the parasite's food vacuole in the trophozoite stage and contributes to disease progression through its hemoglobinase activity. In the present study, we have determined the crystal structure of FP2 from a drug resistant P. falciparum 3D7 strain. FP2-3D7 sequence has detected four amino acid variants, R12K, E14 N, P100T and G102D, in the mature domain o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования