The diagnosis of bacterial infections remains slow because many existing methods rely on enrichment steps such as nucleic acid amplification or growth culture. RNA-cleaving DNAzymes offer a promising route to accelerate bacterial diagnosis because they can be selected and programmed to specifically recognize disease-causing bacteria and generate reporter DNA strands for signal readout. However, integrating DNAzymes into biosensors capable of analyzing complex biological matrices remains challenging, as matrix-associated interferents can destabilize DNAzymes, suppress catalytic activity, and co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The accumulation of α-synuclein (SNCA) in the central nervous system is a hallmark of Parkinson's disease (PD) and multiple system atrophy (MSA). SNCA intron 1 methylation is implicated in SNCA transcriptional regulation and may serve as a peripheral epigenetic signal in synucleinopathies. However, studies of SNCA methylation in leukocyte-derived DNA have yielded inconsistent results. We aimed to evaluate whether cell-free DNA (cfDNA)-based SNCA intron 1 methylation differs in PD or MSA compared with normal controls (NC).
METHODS: Plasma cfDNA was collected from 105 patients with
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveSepsis remains associated with substantial short-term mortality, and conventional severity indicators may not fully capture biological heterogeneity related to tissue injury, inflammation, and immune suppression. This study evaluated whether early plasma cell-free DNA and monocyte human leukocyte antigen-DR (mHLA-DR) expression could improve the prediction of 28-day mortality in adult intensive care unit patients with sepsis.MethodsThis single-center prospective observational cohort study enrolled consecutive adult intensive care unit patients meeting Sepsis-3 criteria. Plasma cell-fr
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Liquid biopsy monitoring in pediatric solid tumors is limited by low mutational burden and lack of trackable genomic drivers. We sought to develop a mutation-agnostic, methylation-based liquid biopsy framework enabling universal molecular surveillance of high-risk neuroblastoma.
EXPERIMENTAL DESIGN: Using whole-genome Oxford Nanopore Technologies sequencing of high-risk neuroblastoma tumors, we compared tumor-derived methylation profiles with a comprehensive atlas of normal human cell types and identified 72 neuroblastoma-specific differentially methylated regions (meNBL) that were r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Colorectal cancer (CRC) screening reduces cancer incidence and mortality, but participation rates are suboptimal in the USA and associated with inequities in CRC outcomes for lower income and many racial/ethnic minoritised groups. A novel, US Food and Drug Administration-approved cell-free tumour DNA (cfDNA) blood test has the potential to improve screening rates, but the impact of offering this test on participation, including among populations at disproportionately increased risk for inequities in CRC outcomes, has not been studied. We designed a small effectiveness randomised
СтатьяПротокол клинического исследованияПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In HER2-positive advanced or recurrent gastric cancer, tissue-based HER2 assessment has been established; however, the clinical relevance of ERBB2 copy number (CN) measured from plasma cell-free DNA (cfDNA), particularly its longitudinal change during treatment, remains unclear.
METHODS: This was a prespecified ancillary correlative analysis of the phase II KSCC-TROX trial (jRCTs071190007; UMIN000036867), evaluating whether changes in cfDNA ERBB2 CN (ΔCN) reflect clinical outcomes. Of the 66 patients included in the TROX trial analysis set, 55 with baseline blood samples comprised
СтатьяКлиническое исследование II фазыПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Echinococcosis poses a significant public health threat, and its diagnosis relies on imaging. Non-invasive plasma detection of Echinococcus cell-free DNA (cfDNA) offers a promising diagnostic approach. We developed a low-cost multiplex PCR panel with 230 primer pairs targeting Echinococcus mitochondrial genomes and nuclear DNA repeat regions. We validated the panel using gradient dilutions of two pathogen species' DNA and 81 plasma samples (53 patients and 28 controls), differentiating species through sequencing analysis. Our method detected Echinococcus genomic DNA at an input as low as 1 fg
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Effective postoperative monitoring remains an important area of investigation for early-stage lung cancer patients after curative resection. This exploratory technical feasibility study evaluated a methylation-based fragmentomics approach by analyzing paired pre- and post-operative plasma cfDNA from 10 patients.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: Paired pre- and post-operative blood samples were collected from 10 patients with early-stage lung cancer who underwent curative-intent surgical resection. cfDNA was extracted, enriched for methylated fragments, and subjected to deep sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) testing offers a non-invasive approach for monitoring allograft health in transplant recipients. However, its diagnostic performance and clinical utility remain insufficiently characterized across diverse populations. Objectives: This study assesses concordance between dd-cfDNA, donor-specific antibody (DSA) testing, and biopsy, while also comparing two commercial assays (AlloSure and Prospera) in kidney and pancreas transplant recipients. Methods: We retrospectively analyzed 271 transplant patient records from 2019 to 2024 at our institution,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myocarditis is inflammatory injury of the myocardium and causes approximately 30,000 deaths globally each year. Fulminant myocarditis is an extremely severe form of myocarditis. Currently, the clinical evaluation of myocarditis and fulminant myocarditis is primarily based on symptoms, ECG findings, and biochemical markers. Cardiac magnetic resonance and endomyocardial biopsy can provide further support for the diagnosis, but both have limitations in routine practice. Recent studies have shown that cell-free DNA (cfDNA) has distinct methylation patterns depending on the organ of origin, suggest
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-invasive fetal HPA typing is a valuable tool to identify the pregnancies at risk of fetal and neonatal alloimmune thrombocytopenia (FNAIT). Different approaches have been developed, mainly based on real-time PCR and droplet digital-PCR. Those methods have a limited ability to multiplex and require replicates due to the contamination risk. Moreover, in order to exclude false-negative results caused by insufficient cell-free fetal DNA, the presence of fetal DNA is usually assessed with a single epigenetic marker whereas large single-nucleotide variant (SNV) panels are now availab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The role of neutrophil extracellular traps (NETs) in IgA vasculitis (IgAV) pathogenesis is emerging, with NETosis-associated markers potentially linked to disease activity. This study aimed to explore the relationship between NETosis biomarkers and IgAV disease phases.
METHODS: A longitudinal study involving 33 paediatric IgAV patients and 26 healthy controls was conducted. Blood and urine samples were collected from healthy controls and patients during active and inactive disease phases. NETosis markers, including cell-free DNA (cf-DNA), neutrophil elastase, MPO and citrullinated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-free circulating tumor DNA (ctDNA) has emerged as a promising biomarker for response evaluation in metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). The current study evaluated the modified fast aneuploidy screening test-sequencing system (mFast-SeqS), a quick, tumor-agnostic and affordable ctDNA assay that requires a small input of DNA, to generate a genome-wide aneuploidy (GWA) score in mCRPC patients, and correlated this to matched metastatic tumor biopsies. In this prospective multicenter study, GWA scores were evaluated from blood samples of 196 mCRPC patients prior to treatme
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutrophil extracellular traps (NETs) and circulating cell-free DNA (cfDNA) are pivotal in driving excessive inflammation and organ damage during sepsis, with their levels correlating positively with sepsis severity in both patients and murine models. Despite the ability of deoxyribonuclease I (DNase I) to degrade NETs and cfDNA, its short half-life and rapid degradation limit its therapeutic effectiveness. To address this challenge, we developed a methyl-branched liposome fused with a red blood cell membrane for the systemic delivery of DNase I (DNase I/Rm-Lipo). The efficacy of DNase I/Rm-Li
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Plasma cell-free DNA (cfDNA) testing is increasingly used for disease diagnosis and monitoring in retinoblastoma, with RB1 allele fraction in cfDNA actively corresponding to disease status and treatment response. However, while RB1 mosaicism has been reported in retinoblastoma, its clinical implications and potential impact on cfDNA testing remain unclear.
OBJECTIVES: To identify RB1 mosaicism using paired plasma and buffy coat (containing lymphocytes, monocytes, granulocytes, and platelets) DNA testing, and to characterize the implications of RB1 mosaicism on cfDNA testing outcom
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Circulating cell-free DNA (cfDNA) is recognized as a relevant biomarker for monitoring the effects of various physiological and pathophysiological factors. To identify the effect of body temperature, we investigated the kinetics of cfDNA in response to two forms of heating.
METHODS: In a randomized crossover design, twelve healthy young males cycled at 60% of their maximum oxygen uptake (VO2max) (exertional heating) and conducted lower-body immersion in hot water (43-44°C) (exogenous heating) until their rectal temperature (Tre) reached 39°C. EDTA blood samples were collected at each
СтатьяРандомизированное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In France, legislation concerning pregnancy monitoring only considers screening for Down syndrome (T21), while the contingent introduction of the circulating cell free DNA test (DPNI) also allows screening for trisomies 13 and 18 with similar performances.
METHODS: We retrospectively studied more than 800,000 patients among whom 7971 presented serum markers suggestive of T18 (but without increased risk of T21), of which 438 benefited from NIPT and of a complete pregnancy follow-up.
RESULTS: We show that the use of a specific risk calculation for T18 would have improve the relevan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The introduction of donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) and the Molecular Microscope Diagnostic System (MMDx) is changing how we diagnose rejection following heart transplantation (HT). This study aims to assess the accuracy of dd-cfDNA in detecting rejection as identified by MMDx and histology, with a focus on determining an optimal dd-cfDNA threshold to improve diagnostic performance.
METHODS: Single-center prospective study of HT recipients undergoing for-cause biopsies with paired MMDx results and dd-cfDNA levels. We employed a receiver operator curve to evaluate the perfor
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purpose of the current study was to investigate the clinical implications of elevated donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) levels in heart transplantation recipients without evidence of rejection observed on endomyocardial biopsy.
METHODS: We retrospectively analyzed dd-cfDNA samples from all consecutive heart transplantation recipients between 2019 and 2023, excluding those with multiorgan transplants. Each sample was paired with an endomyocardial biopsy (<30 days). A positive biopsy was defined based on International Society for Heart and Lung Transplantation criteria of ≥
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Placental-originated cell-free DNA (cfDNA) provides unique opportunities to study (epi)genetic placental programming remotely, but studies investigating the cfDNA methylome are scarce and usually technologically challenging. Methylated DNA sequencing (MeD-seq) is well compatible with low cfDNA concentrations and has a high genome-wide coverage. We therefore aim to investigate the feasibility of genome-wide methylation profiling of first trimester maternal cfDNA using MeD-seq, by identifying placental-specific methylation marks in cfDNA.
METHODS: We collected cfDNA from nonpregnant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования