In this pilot study, structural properties and 1H NMR chemical shifts of an Ala-Glu-Pro-Phe peptide dissolved in an aqueous solution and an aqueous mixture of the 1-ethyl-3-methylimidazolium trifluoroacetate ionic liquid (IL) have been scrutinized using an integrated computational protocol based on classical molecular dynamics (MD) simulations and combined quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) approaches for NMR shielding constants. Two long-lived trans and cis Pro isomers of the tetrapeptide have been considered. MD simulations as long as 400 ns were found to be too short to ensure co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Dates (Phoenix dactylifera), often questioned for their high sugar content, may provide anti-diabetic benefits through their phytochemicals. Date vinegar offers a potentially effective alternative with reduced sugar content and enhanced bioactivity. This study evaluated the effects of date vinegar on glycemic control and lipid profiles in adults with type 2 diabetes mellitus (T2DM) and dyslipidemia while exploring the molecular mechanisms of its bioactive compounds in managing cardiovascular diseases (CVDs) and T2DM.
METHODS: A 10-week randomized controlled trial assessed the cl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
From Alzheimer's disease to amyotrophic lateral sclerosis, the molecular cascades underlying neurodegenerative disorders remain poorly understood. The clinical view of neurodegeneration is confounded by symptomatic heterogeneity and mixed pathology in almost every patient. While the underlying physiological alterations originate, proliferate, and propagate potentially decades before symptomatic onset, the complexity and inaccessibility of the living brain limit direct observation over a patient's lifespan. Consequently, there is a critical need for robust computational methods to support the s
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing widespread use of lithium, which is preferred as an energy source in batteries produced for electric vehicles and in many electronic vehicles such as computers and mobile phones, has made it an important environmental pollutant. In this study, the toxicity profile of lithium carbonate (Li2CO3) was investigated with the Allium test, which is a bio-indicator test. Dose-related toxic effects were investigated using Li2CO3 at doses of 25 mg/L, 50 mg/L, and 100 mg/L. The toxicity profile was determined by examining physiological, cytotoxic, genotoxic, biochemical and anatomical effec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Of all the branches of modern medicine, vaccinology can claim to be the one that has contributed most to the relief of human misery and the spectacular increase in life expectancy in the last two centuries. It is the only science that has eradicated an infectious disease-smallpox-responsible for 8-20% of all deaths in several European countries in the 18th century. Other disabling and lethal diseases, like poliomyelitis and measles, are targeted for eradication. Currently, it is estimated that immunization saves the lives of 3 million children a year but 2 million more lives could be saved by
Историческая статьяСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION/OBJECTIVE: Janus kinase 1 (JAK1) is a key controller and regulator of cytokinemediated immune responses and an effective therapeutic target in autoimmune and inflammatory diseases. In the present study, an in silico workflow was implemented to identify secondary metabolites of mushrooms as prospective JAK1-binding compounds. This integrated computational-aided drug discovery (CADD) approach was used to evaluate their binding affinity scores, interactions, pharmacokinetic properties, structural stability, toxicity, and electronic characteristics.
METHODS: An in-silico workflow was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This research delved into the molecular mechanism underlying dioctyl terephthalate (DOTP)-related periodontitis (PD) through the application of network toxicology, molecular docking, and molecular dynamics simulations. By leveraging data from SwissTargetPrediction, SuperPred, and GeneCards databases, targets associated with DOTP toxicity and PD were pinpointed, leading to the identification of 37 shared targets through a comprehensive analysis. Enrichment analysis unveiled significant implications in inflammatory responses (e.g., the AGE-RAGE signaling pathway) and immune regulatory pathways (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A disease phenotype generally reflects various pathobiological processes that interact in a complex network. The highly interconnected nature of the human protein interaction network (interactome) indicates that, at the molecular level, it is difficult to consider diseases as being independent of one another. Recently, genome-wide molecular measurements, data mining and bioinformatics approaches have provided the means to explore human diseases from a molecular basis. The exploration of diseases and a system of disease relationships based on the integration of genome-wide molecular data with t
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dengue virus has developed an effective replication mechanism that enables rapid viral replication in human hosts. The use of a molecular bottleneck offers an ideal approach for antiviral intervention, especially when no clinically authorized antivirals are available against dengue. The replication process is challenging due to functional redundancy. One of the core antiviral targets is the viral RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), a conserved and essential component of the DENV replication machinery with no mammalian homolog, which represents a promising target for antiviral intervention
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The roles of physicists in medical imaging have expanded over the years, from the study of imaging systems (sources and detectors) and dose to the assessment of image quality and perception, the development of image processing techniques, and the development of image analysis methods to assist in detection and diagnosis. The latter is a natural extension of medical physicists' goals in developing imaging techniques to help physicians acquire diagnostic information and improve clinical decisions. Studies indicate that radiologists do not detect all abnormalities on images that are visible on re
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physical virology investigates viral particles by focusing on their assembly, stability, mechanics, and interactions with host cells, neutralizing antibodies, and surfaces. Within this field, computational virology is becoming an indispensable pillar, serving as a "computational microscope" that bridges the spatio-temporal scales of viral processes, from individual protein dynamics to capsid assembly and cellular entry. This perspective article offers a critical overview of the current state, challenges, and future directions of computational approaches in physical virology. Our vision is anch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The exact two-component (X2C) relativistic quantum chemistry calculations can be used to describe scalar relativistic effects and spin-orbit couplings at reasonable computational cost. However, they have limited applicability to wave function-based quantum chemistry methods, particularly geometric optimizations and dynamics simulations, owing to the high computational demands of these methods in sizable molecular systems. In this work, we report our implementation of an analytical gradient algorithm with a density-fitting approximation for Hartree-Fock, state-specific complete active space sel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid identification of effective SARS-CoV-2 inhibitors is essential for managing the ongoing pandemic and preparing for future outbreaks. This study aims to develop an efficient computational framework to accelerate pre-screening and optimization of inhibitors through functional group modifications of FDA-approved drugs, Adrafinil and Baicalein, targeting the SARS-CoV-2 main protease (MPro). We introduce MDBinding, a computational drug optimization program designed to enhance the inhibitor screening process by integrating molecular dynamics (MD) simulations. MDBinding systematically identifie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The random phase approximation of time-dependent auxiliary density functional theory (TDADFT) is rederived from auxiliary density perturbation theory. Our exhaustive validation of TDADFT reveals an upshift of the excitation energies by ∼0.1 eV with respect to standard time-dependent density functional theory. For the computationally efficient implementation of TDADFT, floating point operation optimized three-center electron repulsion integral recurrence relations and their double asymptotic expansions are implemented into the Davidson solver. The computational efficiency of TDADFT is benchmark
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cerebellar network is renowned for its regular architecture that has inspired foundational computational theories. However, the relationship between circuit structure, function and dynamics remains elusive. To tackle the issue, we developed an advanced computational modeling framework that allows us to reconstruct and simulate the structure and function of the mouse cerebellar cortex using morphologically realistic multi-compartmental neuron models. The cerebellar connectome is generated through appropriate connection rules, unifying a collection of scattered experimental data into a coher
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the last decade, computational methods have been intensively applied to a variety of scientific researches and engineering designs. Although the computational fluid dynamics (CFD) method has played a dominant role in studying and simulating transport phenomena involving fluid flow and heat and mass transfers, in recent years, other numerical methods for the simulations at meso- and micro-scales have also been actively applied to solve the physics of complex flow and fluid-interface interactions. This paper presents a review of recent advances in multi-scale computational simulation of bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The integration of molecular features into histopathological diagnoses has become central to the World Health Organization (WHO) classification of central nervous system (CNS) tumors, improving prognostic accuracy and supporting precision medicine. However, unequal access to molecular testing limits the universal application of integrated diagnosis. To address this, artificial intelligence (AI) models are being developed to predict molecular alterations directly from histological data. In gliomas, deep learning applied to whole-slide images (WSIs) of permanent sections achieves neuropathologis
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological systems often exhibit intermediate molecular states under perturbation, showing changes that align with baseline condition or perturbed state. Capturing these complex patterns is critical for understanding molecular resilience and maladaptive persistence. We introduce SwitchClass, a label-switch classification framework that distinguishes features whose intermediate-state profiles align with baseline or perturbed condition. By training a dual classifier with inverted labels, SwitchClass computes a directional importance score (δ), which quantifies each feature's alignment across bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Survivin, a multifunctional regulator of mitosis and apoptosis, plays a central role in cancer progression and therapy resistance, making it an attractive target for anticancer drug development. In this study, a series of 4,6-diphenyl-3-cyanopyridine derivatives were designed and synthesized as potential survivin inhibitors through an integrated strategy combining 3D-QSAR modeling, molecular docking, molecular dynamics simulations, and biological evaluation. The CoMFA and CoMSIA models established reliable structure-activity relationships and provided contour-map-based guidance for rational mo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of novel benzisothiazole-based hydrazide derivatives was rationally designed, synthesized, and evaluated for their antitubercular activity. Among the synthesized compounds, derivative 8k emerged as the most potent candidate, exhibiting a minimum inhibitory concentration (MIC) of 0.25 μg/mL, along with a high selectivity index (SI) of 42 and confirmed bactericidal activity. To gain preliminary insights into its possible mechanism of action, compound 8k was subjected to molecular docking and 100 ns molecular dynamics simulations, using enoyl-acyl carrier protein reductase (InhA) as the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования