BACKGROUND: Dengue virus (DENV), comprising four antigenically distinct serotypes (DENV1-4), continues to pose a major global health burden. The lack of a universally protective vaccine capable of inducing balanced immunity against all serotypes remains a critical challenge, largely due to antigenic diversity and the risk of antibody-dependent enhancement (ADE). Conserved capsid proteins represent promising targets for epitope-based vaccine development because of their structural stability and immunogenic potential.
METHODS: An integrated reverse vaccinology and immunoinformatics strategy was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Borna disease virus 1 (BoDV-1) is an emerging zoonotic RNA virus that can cause severe acute encephalitis with high mortality. Currently, there are no effective countermeasures, and the potential risk of a future outbreak requires urgent attention. To address this challenge, the complete genome sequence of BoDV-1 was utilized, and immunoinformatics was applied to identify antigenic peptides suitable for vaccine development.
METHODS: Immunoinformatics and antigenicity-focused protein screening were employed to predict B-cell linear epitopes, B-cell conformational epitopes, and cy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying epitopes and their corresponding T-cell receptor (TCR) sequences is crucial in the face of rapidly mutating viruses. Peptide synthesis is often required to confirm the exact epitope sequences, which is time-consuming and expensive. In this study, we introduce a scalable workflow to identify the exact sequences of virus epitopes and reactive TCRs targeting the epitopes from memory T cells. Following the narrowing down of epitopes to specific regions via the tandem minigene (TMG) system, our workflow incorporates the utilization of peptide-major histocompatibility complex-displaying
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease (CD) is a common CD4(+) T cell mediated enteropathy driven by gluten in wheat, rye, and barley. Whilst clinical feeding studies generally support the safety of oats ingestion in CD, the avenin protein from oats can stimulate intestinal gluten-reactive T cells isolated from some CD patients in vitro. Our objective was to establish whether ingestion of oats or other grains toxic in CD stimulate an avenin-specific T cell response in vivo. We fed participants a meal of oats (100 g/day over 3 days) to measure the in vivo polyclonal avenin-specific T cell responses to peptides contain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytotoxic T lymphocytes (CTL) with the CD4+ phenotype that recognize major histocompatibility complex (MHC) class II antigens are detectable very frequently in cultures of human alloreactive or virus-specific T cells. The significance of these CD4+ CTL for an immune reaction in vivo is not clear. Since Epstein-Barr virus (EBV) transformed B cells express HLA-class I and class II antigens equally well both CD8+ and CD4+ CTL should be stimulated during an acute EBV infection. We analysed the MHC specificity and the phenotype of EBV-specific CTL from patients with infectious mononucleosis (IM). W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wilms' tumor gene 1 (WT1) has been proposed as an attractive target for cancer immunotherapy. A natural 9-mer peptide (CYTWNQMNL), which bound to human leukocyte antigen (HLA)-A*24:02, was identified from among WT1-specific cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitopes. This natural WT1 CTL epitope peptide was further modified (CMTWNQMNL) to enhance its binding affinity to HLA-A*24:02. This modified WT1 CTL epitope peptide was superior to the natural peptide for inducing HLA-A*24:02-restricted WT1-specific CTLs. Here we induced several WT1 CTLs that reacted with both modified and natural WT1 tetramers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV)-specific cytotoxic T lymphocytes (CTL) are thought to be effective in limiting viral spread and in clearing virus during infection. Therefore, we attempted to establish HCV-specific CTL and identify novel HCV-specific CTL epitopes in a patient with acute hepatitis C by a novel screening method using recombinant vaccinia viruses (rVV) and synthetic peptides. CD8(+)CD45RA(-) T cells (memory T cells) were isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of a patient with acute hepatitis C. HCV-specific CTL were cloned at limited dilutions and tested for HCV-specific
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates potential epitopes in the glycoprotein and RNA of Chandipura vesiculovirus (CHPV) using MHC Class I (HLA-A0201) and MHC Class II (DRB1_0101) molecules with 3D structures derived from x-ray crystallography. Computationally derived peptides were mapped and subjected to in silico docking, revealing promising targets for CD8+ cytotoxic and CD4+ helper T cells. Key factors analysed include solvent accessible surface area (SASA), Debye-Waller factor (B-factor), and polar bond interactions. Post-docking, removal of N-acetylglucosamine (NAG) increased peptide stability and redu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytotoxic immune response in the peripheral blood lymphocytes (PBL) against an autologous malignant melanoma cell line, PJ-M, was found to be down-regulated in in vitro co-culture (IVC) selectively by unfractionated resident lymph node lymphocytes (derived from a lymph node infiltrated with the PJ-M melanoma cells) and T4+ as well as T8+ fractions of the resident lymph node-derived lymphocytes. In this study, the mechanism involved in, and the specificities of, cytotoxic immune response in this autologous system were examined at population and clonal levels. Resident lymph node lymphocytes
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zaire ebolavirus (EBOV) is a highly pathogenic filovirus which can result in Ebola virus disease (EVD); a serious medical condition that presents as flu like symptoms but then often leads to more serious or fatal outcomes. The 2013-16 West Africa epidemic saw an unparalleled number of cases. Here we show characterisation and identification of T cell epitopes in surviving patients from Guinea to the EBOV glycoprotein. We perform interferon gamma (IFNγ) ELISpot using a glycoprotein peptide library to identify T cell epitopes and determine the CD4+ or CD8+ T cell component response. Additionally,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigate here whether P1A, which was the first CTL-recognized and unmutated tumor antigen to be identified, is a tumor rejection antigen for J558 plasmacytoma in mice with an unperturbed T-cell repertoire. We show that although transgenic mice expressing P1A in the thymus have almost complete deletion of P1A-reactive T cells, they reject the B7-1-transfected J558 at a rate comparable with wild-type mice. Thus, P1A is not a necessary tumor rejection antigen for the J558 tumor cells. On the other hand, if anti-P1A CTL response is sufficient for tumor rejection, tumor cells must lose the an
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent evidence suggests that the four electrophoretically defined gliadin subfractions (alpha, beta, gamma and omega) of wheat can induce the typical pathological finding of coeliac disease. We have prepared long-term murine T cell lines to gliadin and its four major subfractions. The cell lines were tested in proliferative assays with each homologous gliadin subfraction, and to the other gliadin subfractions. There was some cross-reactivity, with unfractionated gliadin and its alpha-subfraction being the most antigenic, while omega-gliadin was the least. These data demonstrate that gliadin c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whereas by indirect immunofluorescence approximately 80% of freshly isolated human peripheral blood lymphocytes bound T3 (Leu 4)-specific and T11-specific monoclonal antibodies, by a more sensitive technique--the indirect antiglobulin rosetting reaction--more than 90% of these lymphocytes were T3+ (Leu 4+) and T11+; this finding suggested that some non-T cells may also express T3 and T11 determinants. In double labelling experiments most normal surface membrane immunoglobulin (smIg)-bearing lymphocytes, ie, B cells, were shown to express T3 and T11 determinants at low density. The determinants
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Entamoeba histolytica is an enteric protozoan that causes amoebic colitis and liver abscess. Human immunity to E. histolytica is apparently mediated by a serum antibody response and amoebicidal cellular mechanisms. The galactose-specific adherence protein of E. histolytica is a 260 kDa glycoprotein which mediates amoebic in vitro adherence to human colonic mucins, epithelium, and inflammatory cells. Amoebic lysis of cells is dependent upon binding by this adherence protein. Serum IgG and salivary IgA antibodies from greater than 90% of subjects with invasive amoebiasis recognize the adherence
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The functional relevance of HLA-C mismatches in an alloresponse is still much debated, putting into doubt the relevance of matching for this antigen in selection of an allogeneic bone marrow donor. In addition to presenting peptides to T cells, HLA-C also functions as a ligand for killing inhibitory receptors (KIRs) on natural killer (NK) cells. In the current study we provide an in vitro basis to address the question of whether mismatches for this antigen are a risk factor for acute graft-versus-host disease (GVHD).
METHODS AND RESULTS: By analysis of cytotoxic and helper T-lymph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marburg virus disease (MVD), a deadly zoonotic illness in humans, is caused by the Marburg virus (MARV), a single-stranded RNA virus belonging to the Orthomarburgvirus genus of the Filoviridae family. There are currently no approved vaccines or efficient antiviral therapies for MARV, despite high morbidity and fatality rates of the virus, particularly in Africa. Recognizing its epidemic potential and its inclusion on the WHO list of blueprint priority pathogens, an immunoinformatics approach was used to design novel multi-epitope saRNA vaccine candidates (MB-saVaxI and MB-saVaxII) targeting th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria, a vector-borne disease caused by Plasmodium and transmitted by Anopheles mosquitoes, remains a major health burden in tropical regions. During blood feeding, the mosquito midgut plays a key role in blood digestion and parasite development, where immune responses against the parasite occur. This study employed a stepwise immunoinformatics approach to design a conserved multiepitope vaccine based on the midgut-specific SGU protein of Anopheles. B and T-cell epitopes were selected based on antigenicity and non-allergenicity, linked using AAY and GPGPG linkers, and combined with β-defensi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is the pathogen that causes tuberculosis (TB). This disease affects one-third of the world's population, mainly in its latent form. The use of reverse vaccinology and immunoinformatics stands out for the production of vaccines based on peptides or proteins, since they are more specific, safe, effective and economical. The present study evaluated the immunological potential of the proteins MPT83 and MPT51 for vaccine production, comparing them with MPT64. To do this, the sequences of these proteins from MTB H37Rv were downloaded and analyzed. The prediction of T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) is an emerging tick-borne viral disease caused by the SFTS virus (Dabie bandavirus), which has become a substantial risk to public health. No specific treatment is available now, that calls for an effective vaccine. Given this, we aimed to develop a multi-epitope DNA vaccine through the help of bioinformatics. The final DNA vaccine was inserted into a special plasmid vector pVAX1, consisting of CD8+ T cell epitopes, CD4+ T cell epitopes and B cell epitopes (six epitopes each) screened from four genome-encoded proteins--nuclear protein (NP), gl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans is the highest-ranked fungal pathogen in the Fungal Priority Pathogens List (FPPL) released by the World Health Organization (WHO). In this study, through in silico simulations, a multi-epitope vaccine against Cryptococcus neoformans was developed using the mannoprotein antigen (MP88) as a vaccine candidate. Following the retrieval of the MP88 protein sequences, these were used to predict antigenic B-cell and T-cell epitopes via the bepipred tool and the artificial neural network, respectively. Conserved B-cell epitopes AYSTPA, AYSTPAS, PASSNCK, and DSAYPP were identifi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования