Externally imposed perturbations can subtly reshape protein structure and mechanics prior to the emergence of global unfolding signatures. Delineating locally sensitive zones, however, can pose immense challenges. Subjecting a small folded protein to isotropic pressure spanning 0.001-10 kbar, we develop a simplified and interpretable computational framework to characterize local responses embedded within its conformational ensemble. Pairwise mechanical stiffness descriptors are treated as high-dimensional mechanical fingerprints and projected using linear discriminant analysis (LDA) to identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thermophilic proteins are known for their stability and activity at elevated temperatures and hence serve as useful models for engineering enzymes with enhanced stability. The stability of these proteins is governed by both thermodynamic and kinetic factors that affect the folding-unfolding equilibrium and the rate of irreversible denaturation. Structural studies have shown that enhanced thermostability often results from multiple cooperative interactions, including improved hydrophobic packing, strengthened electrostatic interactions, and optimized hydrogen-bonding networks. Comparative studi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As genome and gene sequencing rapidly expand, data increasingly outpace studies linking genetic variants to specific diseases, making comput … ld facilitate early diagnosis of myopathies and other hereditary protein storage diseases, in which protein unfolding precedes pathological aggregation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In humans, Salmonella enterica infections are responsible for a plethora of medical conditions. These include intestinal inflammation and typhoid fever. The initial contact between Salmonella and polarized epithelial cells is established by the SPI4-encoded type I secretion system (T1SS), which secretes SiiE, a giant non-fimbrial adhesin. We have recombinantly produced various domains of this T1SS from Salmonella enterica serovar Typhimurium in Escherichia coli for further experimental characterization. We purified three variants of SiiD, the periplasmic adapter protein spanning the space betw
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The NIH assay is used to assess the potency of rabies vaccine and is currently a key measure required for vaccine release. As this test invo … apacity of both tests to detect the corresponding consequences. Excessive BPL inactivation causes G-protein unfolding, altering in turn viral morphology and the continuity of the G-protein layer in the viral particle. Both the NIH and the ELISA tests were able to monitor the consequences of excessive inactivation in a similar manner. Of note, the experimental error …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutron reflectometry has been successfully used to study adsorption on a stainless steel surface by means of depositing a thin steel film o … nd the high water retention predicted by the QCM data suggest that there is a significant extent of protein unfolding upon adsorption. A lower extent of adsorption was seen on the chromium surfaces, although the adsorbed layer structures were similar, suggesting comparable adsorption mechanisms.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery that a protein could mimic viral and bacterial pathogens around 1980 by Stanley Prusiner was unexpected. Evidence shows now that Creutzfeldt-Jakob disease and related disorders are caused by prions. Prions and, for example neurodegeneratives diseases, arise from the same general disease mechanism. In each, there is abnormal unfolding and then aggregation of proteins. The protein conformational changes associated with the pathogenesis of protein misfolding disorders produce β sheet rich oligomers that are partially resistant to proteolysis and have a high tendency to form amyloid-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein S-nitrosation is a post-translational modification that regulates the function of more than 500 human proteins. Despite its apparent physiological significance, S-nitrosation is poorly understood at a molecular level. Here, we investigated the effect of S-nitrosation on the activity, structure, stability, and dynamics of human glutathione transferase P1-1 (GSTP1-1), an important detoxification enzyme ubiquitous in aerobes. S-Nitrosation at Cys47 and Cys101 reduces the activity of the enzyme by 94%. Circular dichroism spectroscopy, acrylamide quenching, and amide hydrogen-deuterium exch
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Starvation, like many other catabolic conditions, induces loss of skeletal muscle mass by promoting fiber atrophy. In addition to the canonical processes, the starvation-induced response employs many distinct pathways that make it a unique atrophic program. However, in the multiplex of the underlying mechanisms, several components of starvation-induced atrophy have yet to be fully understood and their roles and interplay remain to be elucidated. Here we unveiled the role of tumor necrosis factor receptor-associated factor 6 (TRAF6), a unique E3 ubiquitin ligase and adaptor protein, in starvati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcription factor THAP1 (THanatos Associated Protein 1) has emerged recently as the cause of DYT6 primary dystonia, a type of rare, familial and mostly early-onset syndrome that leads to involuntary muscle contractions. Many of the mutations described in the DYT6 patients fall within the sequence-specific DNA-binding domain (THAP domain) of THAP1 and are believed to negatively affect DNA binding. Here, we have used an integrated approach combining spectroscopic (NMR, fluorescence, DSF) and calorimetric (ITC) methods to evaluate the effect of missense mutations, within the THAP domain, o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The promyelocytic leukemia protein (PML) forms nuclear bodies (NB) that can be redistributed by virus infection. In particular, lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) influences disruption of PML NB through the interaction of PML with the arenaviral Z protein. In a previous report, we have shown that the disulfide compound NSC20625 has antiviral and virucidal properties against arenaviruses, inducing unfolding and oligomerization of Z without affecting cellular RING-containing proteins such as the PML. Here, we further studied the effect of the zinc-finger-reactive disulfide NSC20625 on PML
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collagen XVII is a hemidesmosomal transmembrane molecule important for epithelial adhesion in the skin. It exists in two forms, as a full-length protein and as a soluble ectodomain that is shed from the keratinocyte surface by furin-mediated proteolysis. To obtain information on the conformation and the functions of this unusual collagen, its largest collagenous domain, Col15, was expressed in a eukaryotic episomal expression system and purified by DEAE and fast protein liquid- Mono S chromatography. The protein was triple-helical (T(m) of 26.5 degrees C) when produced in cultures containing a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated germination as a pre-isolation modification method to enhance the techno-functional and nutritional properties of common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench) protein. Germination was conducted at two different temperatures (20 and 30 °C) for 24, 48, and 72 h, and isolated proteins were analyzed for their chemical, structural, and functional properties. Results showed that the highest protein yield was achieved at 30 °C for 24 h, though durations exceeding 48 h reduced purity. SDS-PAGE and FTIR analyses confirmed that endogenous protease activity degraded high-molecul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The myriad applications of protein-surfactant interactions have generated ongoing interest among researchers in understanding the organization of protein-surfactant mixed assemblies. The present study investigated the solution behavior of a protein-surfactant mixture involving a native protein, Bovine serum albumin (BSA), and a series of nonionic surfactants, polyoxyethylene cetyl ethers (BC-X) with varying oxyethylene units (15, 20, 30) in the phosphate-buffered medium. UV-visible and fluorescence data confirmed the interactions between BSA functional groups and BC-X oxyethylene unit via pola
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated how plant protein type and heat treatment influence the structure and functionality of hybrid Cheddar-type cheese gels … duced conformational changes, with decreased α-helix and increased β-sheet content, consistent with protein unfolding and subsequent re-aggregation. Whey composition analysis and SDS-PAGE confirmed higher protein retention in soy and pea-based systems than in faba-based systems following heating in the presence of mTGase. Microstructural analysis revealed that soy- …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A complex 3D structure and the surrounding environment determine the function and stability of a protein. Various osmolytes can be added to a protein drug formulation to stabilize the native protein structure by preventing unfolding and aggregation. In this context, the concept of transfer free energy, which represents the change in chemical potential of a protein being transferred from water to an osmolyte solution, has emerged as a powerful tool to elucidate the energetics involved in the protein-osmolyte interaction. In the present work, we experimentally determine the transfer free energie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many human diseases, particularly neurodegenerative diseases, are associated with protein misfolding. Cellular protein quality control includes all processes that ensure proper protein folding and thus prevent the toxic consequences of protein misfolding. The heat shock response (HSR) and the unfolded protein response (UPR) are major stress response pathways within protein quality control that antagonize protein misfolding in the cytosol and the endoplasmic reticulum, respectively. Huntington's disease is an inherited neurodegenerative disease caused by the misfolding of an abnormally expanded
ОбзорСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated the effects of ultrasound-assisted enzymatic hydrolysis on the structural and flavor properties of porcine plasma prote … ectron microscopy indicated that the combined effect of ultrasound and enzymatic hydrolysis induced protein unfolding, exposed hydrophobic regions, and enhanced enzyme accessibility. These changes included increased α-helix and random coil contents, reduced β-turn content, enhanced surface hydrophobicity, reduced particle size, and a more fragmented and porous micr …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sustainable isolation of nonamphiphilic phytochemicals remains a formidable challenge in biochemical engineering. In this study, a highly efficient and solvent free foam fractionation process was developed for recovering rosmarinic acid from botanical extracts. By systematically screening diverse biological surfactants, whey soy protein emerged as an exceptionally robust dual functional frother and nanoscale collector. Response surface methodology optimized the operational parameters to 850 mg/L protein concentration, pH 2.5, and a gas flow rate of 470 mL/min, yielding an outstanding targe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-solvent precipitation using formic acid (FA, 0-98%, v/v) was developed to fabricate hemp protein nanoparticles (HPNs) for Pickering emulsion stabilization. FA ≥10% (v/v) increased hemp protein solubility from 38.0% to 86.9% by solubilizing storage globulins, yielding HPNs with tunable sizes (100-780 nm), high ζ-potentials (>30 mV), and adjustable contact angles (57.7°-126.6°). HPNs prepared at 40% FA exhibited optimal interfacial properties, including the lowest interfacial tension and highest emulsifying activity index (∼1800 m2/g), forming Pickering emulsions with 3-week stability and s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования