BACKGROUND: Pathological amyloid-β and α-synuclein are associated with a spectrum of related dementias, ranging from Alzheimer's disease (AD) and dementia with Lewy bodies (DLB) to Parkinson disease dementia (PDD). While these diseases share clinical and pathological features, they also have unique patterns of pathology. However, epigenetic factors that contribute to these pathological differences remain unknown.
OBJECTIVE: In this preliminary study, we explore differences in DNA methylation and transcription in five neuropathologically defined groups: cognitively unimpaired controls, AD, pur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogen-induced epigenetic modifications can reshape anti-infection immune processes and control the magnitude of host responses. DNA methylation profiling has identified crucial aberrant methylation changes associated with diseases, thus providing biological insights into the roles of epigenetic factors in mycobacterial infection. In this study, we performed a genome-wide methylation analysis of skin biopsies from patients with leprosy and healthy controls. T helper 17 differentiation pathway was found to be significantly associated with leprosy through functional enrichment analysis. As a k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Air pollution exposure is now considered a growing concern for global public health. RNA or DNA methylation changes caused by air pollution may be related to the development of cardiovascular disease. To investigate the early biomarkers of air pollution exposure, a panel study of eight college students recorded after a business trip from Qingdao to Shijiazhuang and back to Qingdao was performed in this work. The concentration of PM2.5, PM10, SO2, NO2, and CO in Shijiazhuang was higher than that in Qingdao during the study period. The platelet count was positively correlated with air pollutants
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical cancer (CC) is the second leading cause of cancer death among women worldwide. Epigenetic regulation of gene expression through DNA methylation and hydroxymethylation plays a pivotal role during tumorigenesis. In this study, to analyze the epigenomic landscape and identify potential biomarkers for CCs, we selected a series of samples from normal to cervical intra-epithelial neoplasia (CINs) to CCs and performed an integrative analysis of whole-genome bisulfite sequencing (WGBS-seq), oxidative WGBS, RNA-seq, and external histone modifications profiling data.
RESULTS: In th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Human chronic myelogenous leukemia (CML) is a hematopoietic stem cell disorder with high malignant and invasive activity. lncRNA SNHG5 has been reported to be upregulated in CML. However, whether it affects the proliferation, differentiation, and apoptosis in CML cells is still unknown. This study investigated the role of SNHG5 in CML and revealed the potential mechanism. MATERIAL AND METHODS K562 cells were transfected with shRNA, and the expression level of SNHG5 was assessd by quantitative RT-PCR. The proliferation ability was determined by CCK-8 assay. Western blot analysis was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyperhomocysteinemia (HHcy) is a risk factor for vascular disease but its underlying molecular pathology is not understood. Homocysteine is metabolically linked to the epigenetic process of DNA methylation. Tissue-specific changes in DNA methylation have been observed in HHcy but little is known about vascular tissue. The objective of this study was to determine if changes in the epigenetic regulation of glucocorticoid receptor (GR) expression (encoded by Nr3c1) in aorta are associated with HHcy. C57BL/6 mice heterozygous for disruption of the cystathionine-β-synthase gene (Cbs+/-) and control
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium (Cd) and its compounds are well-known human carcinogens, but the mechanisms underlying the carcinogenesis are not entirely understood yet. Aberrant methylation was investigated in order to obtain insight into the DNA repair-related epigenetic mechanisms underlying CdCl(2)-induced malignant transformation of human bronchial epithelial cells (16HBE). Gene expression and DNA methylation were assessed in untreated control cells; 5th, 15th, and 35th passage of CdCl2-treated cells and tumorigenic cells (TCs) from nude mice by using high-performance liquid chromatography, real-time PCR, Weste
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: The goal of this investigation was to determine whether epigenetic modifications in the IFNG promoter are associated with an increase of IFNG transcription in different stages of periodontal diseases.
MATERIALS AND METHODS: DNA was extracted from gingival biopsy samples collected from 47 total sites from 47 different subjects: 23 periodontally healthy sites, 12 experimentally induced gingivitis sites and 12 chronic periodontitis sites. Levels of DNA methylation within the IFNG promoter containing six CpG dinucleotides were determined using pyrosequencing technology. Interferon gamma mRNA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) modification is the most widespread RNA internal modification involved in RNA metabolism. M6A regulators consist of writers, erasers and readers. They exert their function by methylation, demethylation and recognization respectively, participating in cell biology and immune responses. Previously, the focus of m6A modification is its effect on tumor progress. Currently, extensive m6A-related studies have been performed in autoimmune diseases, such as RA, IBD and SLE, revealing that the unique influence of m6A modification in autoimmunity is undeniable. In this review, w
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA m6A methylation is a post-transcriptional modification that occurs at the nitrogen-6 position of adenine. This dynamically reversible modification is installed, removed and recognized by methyltransferases, demethylases and readers, respectively. This modification has been found in most eukaryotic mRNA, tRNA, rRNA and other non-coding RNA. Recent studies have revealed important regulatory functions of the m6A including effects on gene expression regulation, organism development and cancer development. In this review, we summarize the discovery and features of m6A, and briefly introduce the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crosstalk among tRNA modification proteins have been implicated in important functional roles in biology. We previously reported that Physcomitrium tRNA (cytosine38-C5)-methyltransferase, TRDMT1/DNMT2 catalyses C38, C48 and C49 methylation in tRNAAsp(GUC) and plays a crucial role in regulating transcription/stability of tRNAAsp(GUC) under oxidative stress. To gain insight into its precise mode of regulation, in the present study we show that moss TRDMT1/DNMT2 participates in broader networks of tRNA modification pathways. Using in silico methods we first identified that the yeast homologs of m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac hypertrophy represents a complex remodeling process involving extensive reprogramming of gene expression. While transcriptional regulation has been well characterized, post-transcriptional RNA processing has recently emerged as a crucial determinant of cardiac homeostasis. This review summarizes current knowledge of RNA modifications, alternative splicing, mRNA stability, and RNA editing in physiological and pathological hypertrophy. We highlight key epitranscriptomic marks such as N6-methyladenosine (m6A), 5-methylcytosine (m5C), and 7-methylguanosine (m7G), as well as the functions o
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV; family Flaviviridae; genus Flavivirus) is a pathogenic mosquito-borne RNA virus that currently threatens human health in the Americas, large parts of Asia and occasionally elsewhere in the world. ZIKV infection is often asymptomatic but can cause severe symptoms including congenital microcephaly and Guillain-Barré syndrome. The positive single-stranded RNA genome of the mosquito-borne ZIKV requires effective replication in two evolutionary distinct hosts - mosquitoes and primates. In addition to some of the viral proteins, the ZIKV genomic RNA and functional RNAs produced the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gene expression and regulation are central to the survival and adaptation of Plasmodium falciparum. However, the interplay between transcriptional activity, Natural Antisense Transcripts (NATs), and DNA methylation in clinical isolates associated with different malaria manifestations remains poorly understood.
METHODS: Here, we present an integrated, strand-specific transcriptome and methylome analysis of P. falciparum derived from patients with uncomplicated malaria (UNC), hepatic dysfunction (HD), and cerebral malaria (CM), using custom, strand-aware microarrays, and direction
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic modifications such as DNA methylation play a critical role in hypoxic cell programs. However, no previous studies have investigated the epigenetic regulation of gene expression in peripheral artery disease (PAD), a condition characterized by intermittent ischemia. Our study aims to examine how PAD affects the DNA methylome in skeletal muscle of patients with PAD with intermittent claudication or critical limb ischemia compared with non-PAD controls.
METHODS: This was a cross-sectional study evaluating differences in the DNA methylome and transcriptome using reduced repr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Nongenetic factors influence systemic sclerosis (SSc) pathogenesis, underscoring epigenetics as a relevant contributor to the disease. We aimed to unravel DNA methylation abnormalities associated with SSc through an epigenome-wide association study.
METHODS: We analyzed DNA methylation data from whole-blood samples in 179 patients with SSc and 241 unaffected individuals to identify differentially methylated positions (DMPs) with a false discovery rate (FDR) <0.05. These results were further integrated with RNA sequencing data from the same patients to assess their functional conseq
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The downregulation of the Spastic Paraplegia-20 (SPG20) gene is correlated with a rare autosomal recessive disorder called Troyer Syndrome. Only in recent years has SPG20 been studied and partially characterized in cancer. SPG20 has been shown to be hypermethylated in colorectal cancer, gastric cancer, non-Hodgkin's lymphoma and hepatocellular carcinoma. In this study, we analyze the methylation status and the gene expression of SPG20 in different tumors of various histological origins.
METHODS: We analyzed the data generated through Infinium Human Methylation 450 BeadChip array
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously described a hominid-specific long non-coding RNA, MORT (also known as ZNF667-AS1, Gene ID: 100128252), which is expressed in all normal cell types, but epigenetically silenced during cancer-associated immortalization of human mammary epithelial cells. Initial analysis of The Cancer Genome Atlas (TCGA) showed that 15 of 17 cancer types, which represent the 10 most common cancers in women and men, display DNA methylation associated MORT silencing in a large fraction of their tumors. In this study we analyzed MORT expression and DNA methylation state in the remaining 16 TCGA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is one of the most common causes of cancer-related death in the world, with multiple genetic and epigenetic alterations involved in disease development. CYLD tumor suppressor gene encodes a multifunctional deubiquitinase which negatively regulates various signaling pathways. Deregulation of this gene has been found in different types of cancer. This study aimed to evaluate for the first time the CpG island methylation pattern of CYLD gene promoter, and its expression level in gastric adenocarcinoma. CYLD messenger RNA expression and promoter methylation in 53 tumoral and th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the male mouse germ line, PIWI-interacting RNAs (piRNAs), bound by the PIWI protein MIWI2 (PIWIL4), guide DNA methylation of young active transposons through SPOCD1. However, the underlying mechanisms of SPOCD1-mediated piRNA-directed transposon methylation and whether this pathway functions to protect the human germ line remain unknown. We identified loss-of-function variants in human SPOCD1 that cause defective transposon silencing and male infertility. Through the analysis of these pathogenic alleles, we discovered that the uncharacterized protein C19ORF84 interacts with SPOCD1. DNMT3C,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования