The persistence of latent HIV-1 reservoirs remains a critical barrier to functional curing AIDS, as current latency-reversing agents (LRAs) exhibit limited clinical efficacy. While RNA modifications like N⁶-methyladenosine (m⁶A) regulate viral replication, their role in maintaining HIV-1 latency is poorly defined. Here, we identify the RNA-binding protein RBM39 as a scaffold organizing an m⁶A-dependent silencing complex that enforces viral latency. Through proteomic and functional analyses, we demonstrate that RBM39 recruits the m⁶A reader YTHDC1 and the RNA helicase DDX5, forming a tripartite
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drought stress is a global problem, and the lack of water is a key factor that leads to agricultural shortages. MicroRNAs play a crucial role in the plant drought stress response; however, the microRNAs and their targets involved in drought response have not been well elucidated. In the present study, we used Illumina platform (https://www.illumina.com/) and combined data from miRNA, RNA, and degradome sequencing to explore the drought- and organ-specific miRNAs in orchardgrass (Dactylis glomerata L.) leaf and root. We aimed to find potential miRNA⁻mRNA regulation patterns responding to drough
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) modification, primarily regulated by methyltransferase-like protein 3 (METTL3), plays a pivotal role in RNA metabolism and leukemogenesis. However, the post-translational mechanisms governing METTL3 stability and function remain incompletely understood. Given the widespread occurrence of O-GlcNAcylation on nuclear and cytosolic proteins, we hypothesized that METTL3 might undergo O-GlcNAcylation, thereby influencing its stability and oncogenic function in myeloid malignancies. In this study, we found that METTL3 is O-GlcNAcylated in both myelodysplastic syndrome (MDS) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore melanocortin-4 receptor (MC4R) and uncoupling protein 1 (UCP1) expression and function in autoimmune uveitis (AU) and … n (Co-IP), actinomycin D assays verified the interaction between MC4R and UCP1 and their effect on mRNA stability; small interfering RNA (siRNA) rescue experiments in vivo, in vitro confirmed that UCP1 mediates AU pathology via MC4R.
RESULTS: A total of 161 DEGs were identified, with MC4R and UCP1 hub genes aberrantly expressed in EAU tissues and LPS-treated c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: The selection and validation of species-specific housekeeping genes (HKGs) have become increasingly common in functional genomics, with application of quantitative Polymerase Chain Reaction (qPCR) or cDNA-based qPCR (RT-qPCR). Despite the Macrobrachium amazonicum having RNA-seq studies available, there are still no data on the most stable and consistent HKGs for use in relative gene expression analyses. Therefore, the present study aimed to identify and validate seven HKGs in M. amazonicum: Eukaryotic Translation Initiation Factor (EIF), 18S ribosomal RNA (18S), Ribosoma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: CYP1B1, a crucial drug-metabolizing enzyme, metabolizes both endogenous compounds and clinical drugs. The present study investigated the effects of CYP1B1 on the proliferation, migration, apoptosis, and ferroptosis of HCC cells. It further elucidated the regulatory role of m⁶A modification particularly via the methyltransferase METTL14 in regulating CYP1B1 mRNA stability and translation efficiency.
METHODS: CCK-8, colony formation, wound healing, and transwell assays were employed to assess the role of CYP1B1 in HCC cell proliferation and migration. Ferroptosis-related assays, W…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) modifications play a vital role in hepatocellular carcinoma (HCC) progression. However, the function of m6A reader proteins in HCC remains poorly understood. Here, we elucidate the role and mechanism of insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 2 (IGF2BP2) in HCC. In here, we analyzed IGF2BP2 expression in HCC using bioinformatics and clinical samples. The functional role of the IGF2BP2-RELB regulatory axis in HCC progression was assessed through cytological assays and a xenograft HCC mouse model. RNA sequencing, Western blotting, Actinomycin-D assays, and RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dysregulated expression of circular RNAs (circRNAs), newly recognized RNA molecules that are widely found across different species, has been implicated in the progression of several cancers, including breast cancer. Our previous research identified a novel circRNA, hsa_circ_0136682, whose expression pattern and potential function in breast cancer remain to be clarified. This study focuses on uncovering the regulatory impact and specific mechanisms of hsa_circ_0136682 in breast cancer progression. Functionally, we observed a significant upregulation of hsa_circ_0136682 in breast cancer cell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung squamous cell carcinoma (LUSC) is a highly aggressive malignancy with a dismal prognosis and limited targeted therapies. While post-translational and RNA modifications are implicated in tumor progression, their precise roles in LUSC remain elusive. Here, we identify the RNA methyltransferase FTSJ3 as a critical oncogenic driver. FTSJ3 is markedly upregulated in LUSC tissues, and its high expression correlates with poor patient survival. Mechanistically, FTSJ3 catalyzes 2'-O-methylation of HSPA5 mRNA, leading to transcript stabilization and increased protein abundance of the molecular chap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The viral genome of SARS-CoV-2 is packaged by the nucleocapsid (N-)protein into ribonucleoprotein particles (RNPs), 38 ± 10 of which are contained in each virion. Their architecture has remained unclear due to the pleomorphism of RNPs, the high flexibility of N-protein intrinsically disordered regions, and highly multivalent interactions between viral RNA and N-protein binding sites in both N-terminal (NTD) and C-terminal domain (CTD). Here we explore critical interaction motifs of RNPs by applying a combination of biophysical techniques to ancestral and mutant proteins binding different nucle
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetes is a metabolic disease characterized by hyperglycemia, which induces the production of AGEs, ROS, inflammatory cytokines, and growth factors, leading to the formation of vascular dysfunction and target organ damage, promoting the development of diabetic complications. Diabetic nephropathy, retinopathy, and cardiomyopathy are common complications of diabetes, which are major contributors to disability and death in people with diabetes. Long non-coding RNAs affect gene transcription, mRNA stability, and translation efficiency to influence gene expression for a variety of biological func…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the development of Tether-seq, a transcriptome-wide screen to probe RNA-small molecule interactions using disulfide tethering. This technique uses s4U metabolic labeling to provide sites for reversible and covalent attachment of small molecule disulfides to the transcriptome. By screening under reducing conditions, we identify interactions that are stabilized by binding over those driven by the reactivity of the RNA sites. When applied to cellular RNA, Tether-seq with a disulfide analogue of risdiplam, an FDA-approved drug that targets RNA to treat spinal muscular atrophy (SMA), reve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The resistance of tumor cells to therapy severely impairs the efficacy of treatment, leading to recurrence and metastasis of various cancers. Clarifying the underlying mechanisms of therapeutic resistance may provide new strategies for overcoming cancer resistance. N6-methyladenosine (m6A) is the most prevalent RNA modification in eukaryotes, and is involved in the regulation of RNA splicing, translation, transport, degradation, stability and processing, thus affecting several physiological processes and cancer progression. As a novel type of multifunctional non-coding RNAs (ncRNAs), circular
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 (EV71) poses serious threats to human health, particularly in Southeast Asia, and no drugs or vaccines are available. Previous work identified the stem loop II structure of the EV71 internal ribosomal entry site as vital to viral translation and a potential target. After screening an RNA-biased library using a peptide-displacement assay, we identify DMA-135 as a dose-dependent inhibitor of viral translation and replication with no significant toxicity in cell-based studies. Structural, biophysical, and biochemical characterization support an allosteric mechanism in which DMA-135
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The poorly studied picornavirus, human parechovirus 3 (HPeV3) causes neonatal sepsis with no therapies available. Our 4.3-Å resolution structure of HPeV3 on its own and at 15 Å resolution in complex with human monoclonal antibody Fabs demonstrates the expected picornavirus capsid structure with three distinct features. First, 25% of the HPeV3 RNA genome in 60 sites is highly ordered as confirmed by asymmetric reconstruction, and interacts with conserved regions of the capsid proteins VP1 and VP3. Second, the VP0 N terminus stabilizes the capsid inner surface, in contrast to other picornaviruse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Ulcerative colitis (UC), an idiopathic and chronic inflammatory disease, primarily targets the mucosal lining of the colon. … n YAMC cells was tested by RNA immunoprecipitation and m6A RNA immunoprecipitation assays, and the mRNA stability of NCOA3 was determined after actinomycin D treatment.
RESULTS: miR-222-3p was increased while IGF2BP2 and NCOA3 were decreased in the colon tissues of UC mice. IGF2BP2 overexpression effectively alleviated intestinal injury and reinstated the func …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated the mechanism of methyltransferase-like 14 (METTL14)-mediated epigenetic transcriptome modification of RA … CR was adopted to detect the RAD21 m6A modification level. RT-qPCR was applied for detecting RAD21 mRNA stability in actinomycin D-treated cells. RIP was implemented to detect METTL14-RAD21 interaction. Tumor formation assay was performed in nude mice. Tumor weight and volume were recorded. The collected tumor tissues were measured for Ki67-positive cell levels …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The topology of RNA therapeutics is emerging as a critical design dimension in precision oncology. Unlike linear mRNA, circular RNA (circRNA) lacks free ends, conferring exceptional resistance to exonuclease degradation and enabling sustained protein expression for days to weeks. Beyond their use as engineered therapeutics, endogenous circRNAs exhibit cancer-associated expression patterns and persistence in biofluids, supporting complementary roles in tumor biology and as candidate biomarkers for diagnosis and longitudinal disease monitoring. This review argues that circular topology should be
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Utilizing publicly available RNA-seq data to screen for ideal reference genes is more efficient and accurate than traditional methods. Previous studies have identified optimal reference genes in various chicken tissues, but none have specifically focused on the oviduct (including the infundibulum, magnum, isthmus, uterus, and vagina), which is crucial for egg production. Identifying stable reference genes in the oviduct is essential for improving research on gene expression levels. This study investigated genes with consistent expression patterns in the chicken oviduct, encompassing both indiv
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This article aims to elucidate the role of Long non-coding RNA SLC7A11 antisense RNA1 (SLC7A11-AS1) in oral squamous cell carcinoma, which are expected to be useful for the oral squamous cell carcinoma diagnosis and treatment.
DESIGN: SLC7A11-AS1 expression was detected by quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) in oral squamous cell carcinoma cell lines. Cellular localization of SLC7A11-AS1C was detected by fluorescence in situ hybridization (FISH) assays and subcellular fractionation assay. Biological functions of SLC7A11-AS1 were explore
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования