BACKGROUND: Endometriosis-associated ovarian cancers (EAOCs), encompassing clear cell (CC) and endometrioid carcinomas (EC), constitute distinct biological entities yet lack robust biomarkers for precise classification, prognostication, and therapeutic decision-making in women. Therefore, we aimed to describe novel biomarkers.
METHODS: In this study, we conducted an integrated transcriptomic analysis, powered by machine learning, to discover novel consensus biomarkers and delineate cancer hallmark signatures specific to EC and CC. Drawing on gene expression profiles from EAOC specimens, we me
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stillbirth (SB) in dairy cattle is both an animal welfare and an economic issue. The reasons for SB and how traits such as gestation length (GL) influence it are part of ongoing research. Utilizing imputed high-density (HD) and whole-genome sequencing (WGS) genotypes from 34,497 German Holstein cows, this study aimed to identify local genetic correlation in trait-associated genomic regions for SB and GL. For this, regional heritability mapping (RHM) was conducted, alongside analyses of global and local genetic correlation. In the downstream analysis, regions showing significant local genetic c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The CCL5/CCR5 axis plays a pivotal role in tumor progression and metastasis. We previously reported CCR5 promoted melanoma EMT and metastasis by upregulating TGFβ1 expression via the PI3K/AKT/GSK3β pathway. However, the full spectrum of downstream events triggered by CCR5 activation remains poorly understood.
METHODS: Here we employed quantitative phosphoproteomics to profile dynamic phosphorylation events in B16/F10 cells following CCL5 stimulation at three time points (5, 10 and 30 min). Moreover, to specifically dissect CCR5-mediated phosphorylation events distinct from other C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African American men experience markedly higher prostate cancer incidence and mortality yet remain underrepresented in genomic studies aimed at identifying ancestry-associated molecular drivers of disease progression. Circulating cell-free DNA (cfDNA) provides a minimally invasive means of capturing tumor-derived genomic alterations and enables broad characterization of molecular heterogeneity. In this study, we performed comprehensive plasma cfDNA profiling in 22 African American and 66 Caucasian men with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) to define ancestry-related diffe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myostatin (MSTN), encoded by the MSTN gene, is a critical negative regulator of skeletal muscle mass. This study aims to identify and characterize the miRNAs involved in the development of the double-muscling phenotype in MSTN-deficient rabbits. We performed high-throughput sequencing to analyze the miRNA expression profiles in gluteus maximus tissue from wild type (MSTN+/+) and MSTN-KO (MSTN+/- and MSTN-/- inclusive) rabbits. Differentially expressed miRNAs (DEmiRNAs) were identified, and their potential target genes were predicted. Functional enrichment analysis of these target mRNAs was con
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While apigenin shows therapeutic potential for bone-related disorders like osteoporosis and osteoarthritis, its mechanisms in regulating ligamentum flavum ossification (OLF) are unclear. An integrated computational strategy combining network pharmacology, machine learning, and molecular docking was used to study apigenin's therapeutic potential for OLF. First, differential gene expression profiling was done using the GSE113212 dataset to find OLF-related differentially expressed genes. At the same time, apigenin's putative targets and bioactive components were collected from pharmacological da
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Obstructive sleep apnea (OSA) affects nearly 1 billion adults worldwide, and it is relatively common in patients with lung adenocarcinoma (LUAD). This study aimed to identify potential shared transcriptomic signatures and explore pathways linking OSA and LUAD.
METHODS: Transcriptomic data were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Gene Expression Omnibus (GEO). Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and protein-protein interaction (PPI) network analysis were used to identify hub genes. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEG
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a complex process in which spermatogonia differentiate into haploid sperm cells. Genes guiding this process are subject to an evolutionary trade-off between purifying selection preserving basic functions and positive selection favoring fast gamete production and innovative sperm traits. The outcome of this trade-off varies across the spermatogenesis stages in mammals but remains unexplored for species with ZW sex chromosomes, such as birds. Here, we identify 20 cell clusters comprising somatic and germline cells across stages of spermatogenesis by using single-cell RNA seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNMT1 variants are linked to complex neurodegenerative syndromes, yet their variant-specific functional and epigenomic consequences remain poorly defined. DNMT1 variants were identified in eight patients using gene-panel or whole-exome sequencing. Functional effects were assessed by site-directed mutagenesis and transient expression in HEK293T cells. Genome-wide methylation profiling of peripheral blood leukocyte DNA was performed using Nanopore sequencing, enabling direct quantification of 5-methylcytosine (5mC). CpG island-level differential methylation and gene set enrichment analysis (GSEA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to identify differentially expressed proteins (DEPs) in the gastric mucosa of patients with gastric precancerous lesions, establish a differential protein expression profile, and investigate the associated biological processes.
METHODS: Quantitative proteomic analysis of gastric mucosal tissues from 60 patients-including 20 each diagnosed with chronic atrophic gastritis (CAG), intestinal metaplasia (IM), and low-grade intraepithelial neoplasia (LGIN)-was performed using data-independent acquisition liquid chromatography-tandem mass spectrometry (DIA LC-MS/MS). DEP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to determine the prevalence of infection by larvae from the Anisakidae family in fish commonly consumed in the north of Chile. Then, 2968 specimens belonging to 22 different fish genera were studied. Anisakis spp. third-stage larvae were collected and used for PCR and proteomics studies. Trachurus murphyi was the most parasitized species (51.6%), whereas Scomber japonicus (21.3%) and Isacia conceptions (9.5%) were also found parasitized. PCR studies showed that the only species detected was Anisakis simplex. By LC-MS/MS, we identified a total of 8119 peptide precursors, which c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present a reproducible Seurat-based protocol to analyze PBMC CD4⁺ T-cell single-cell RNA sequencing data across malaria reinfection timepoints. This protocol demonstrates a reproducible Seurat-based workflow for analyzing PBMC CD4⁺ T-cell scRNA-seq data across malaria reinfection timepoints, using representative publicly available datasets to demonstrate its application: a Plasmodium-specific TCR-transgenic CD4⁺ T-cell dataset (GSE233703) and a polyclonal CD4⁺ T-cell dataset comparing reinfection-associated timepoints (GSE233713; D27₍₃₎ versus D30). The workflow includes standardized
СтатьяVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrosis is a chronic degenerative condition of the endometrium in the mare, with fibrosis being the most prevalent. In the current study, the transcriptome signature of in vitro cultured fibroblasts derived from endometria with or without endometrosis was compared by RNA sequencing to elucidate alterations in gene expression that lead to dysregulated cellular function and the underlying molecular mechanisms driving fibrosis. A total of 191 genes were identified as altered, including 43 up-regulated and 148 down-regulated. In addition, the differentially expressed genes (DEGs) were annotat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Richmond is an emerging pathogen from contaminated animal food, posing a risk of global foodborne outbreaks. Few reports have documented this species in live aquatic organisms. In this study, Salmonella Richmond COFI-RLBCAU-I was isolated from live Pangasianodon hypophthalmus, and its pathogenicity was tested on the three most culturable fish species, P. hypophthalmus, Labeo rohita, and Oreochromis niloticus. The results showed that the bacteria are non-pathogenic to these three species. Techniques, including β-hemolytic activity, Gram staining, biochemical tests su
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Prostate cancer (PCa) is a leading malignancy in men, and understanding its molecular mechanisms is crucial for advancing therapeutic strategies. Ubiquitination, a key post-translational modification, regulates protein degradation and signaling, playing a vital role in cancer progression. This study focuses on HECTD4, a HECT-type E3 ubiquitin ligase, to identify its ubiquitination targets and understand its role in PCa.
MATERIALS AND METHODS: HECTD4 knockdown was performed in LNCaP, PC-3, and DU145 PCa cell lines. A combination of semi-quantitative PCR and liquid chromatograph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study explores the genetic basis of membranous nephropathy (MN) in gastric adenocarcinoma (GC) through bioinformatics and machine learning analyses.
METHODS: Gene expression profiles from MN (GSE108109) and GC (GSE54129) datasets were obtained from the Gene Expression Omnibus. Common differentially expressed genes (DEGs) were identified using the limma R package. Biological functions were analyzed via Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathways with the Cluster Profiler package. LASSO regression and Random Forest algorithms were used to iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, the role of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in neurodegenerative activities has garnered significant attention, yet the role in Alzheimer's disease (AD) remains unclear. Based on our previous single-cell RNA sequencing data sets of PBMCs from healthy controls and AD patients, we identified differentially expressed genes (DEGs) between healthy individuals and AD patients. These DEGs are involved in pathways related to apoptosis regulation, cognition, synaptic organization, and other AD pathology-associated biological processes using Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of G
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid cancer, the most common endocrine malignancy, has seen a significant rise in incidence, necessitating improved diagnostic and prognostic methods. Despite advancements in fine-needle aspiration biopsy (FNAB) and molecular mutation detection, these techniques have limitations, particularly in large nodules. This study aims to identify molecular markers and construct a comprehensive ceRNA regulatory network to enhance thyroid cancer diagnosis and prognosis. Using transcriptomic data from TCGA, GTEx, and GEO datasets, we performed differential expression analysis and WGCNA to identify key
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Tec family of proteins has been identified as a key player in numerous diseases. However, no studies on the associations of Tec family proteins with overall survival (OS) in differentiated thyroid cancer (DTC) patients have been conducted.
METHODS: RNA sequencing (RNA-Seq) and clinical data were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. LASSO-Cox, random forest, and eXtreme Gradient Boosting (XGBoost) analysis methods were used to screen for the genes encoding Tec family proteins that were most closely associated with DTC. A predictive model was developed to est
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ulcerative colitis (UC) is a chronic inflammatory disorder primarily affecting the colonic mucosa and submucosa. Butea monosperma stem bark is traditionally used in Ayurveda for diarrhea, inflammatory diseases, and Grahani Roga, which shares similarities with UC. However, the molecular mechanisms of B. monosperma in UC are unexplored. This study aimed to predict the molecular mechanisms of B. monosperma in UC by integrating network pharmacology, molecular docking, and dynamics-the first systematic effort to decode its phytochemical-target-pathway interactions, bridging traditional knowledge wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования