OBJECTIVES: To explore the association between PRIM2 expression and prognosis of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) from multiclinic centers.
MATERIALS AND METHODS: Samples from PDAC patients were collected and processed to tissue microarray (TMA). PRIM2 expression was detected by immunohistochemistry (IHC) of in 127 enrolled PDAC patients who underwent surgical resection from January 2012 to December 2018, were with complete follow-up, and were enrolled and grouped by PRIM2 stain level into 2 groups. The expression differences, the association to clinicopathologic features
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite efforts to elucidate Zika virus (ZIKV) teratogenesis, still several issues remain unresolved, particularly on the molecular mechanisms behind the pathogenesis of Congenital Zika Syndrome (CZS). To answer this question, we used bioinformatics tools, animal experiments and human gene expression analysis to investigate genes related to brain development potentially involved in CZS. Searches in databases for genes related to brain development and CZS were performed, and a protein interaction network was created. The expression of these genes was analyzed in a CZS animal model and secondary
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Branched-chain amino acids (BCAAs) are oxidized in the muscle and result in stimulating anabolic signals-which in return may optimize performance, body composition and recovery. Meanwhile, among athletes, the evidence about BCAA supplementation is not clear. The aim of this study was to review the effects of BCAAs in athletic populations. The research was conducted in three databases: Web of Science (all databases), PubMed and Scopus. The inclusion criteria involved participants classified both as athletes and people who train regularly, and who were orally supplemented with BCAAs. The risk of
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rare diseases represent a challenge for physicians because patients are rarely seen, and they can manifest with symptoms similar to those of common diseases. In this work, genetic confirmation of diagnosis is derived from DNA sequencing. We present a tutorial for the molecular analysis of a rare disease using Fabry disease as an example.
METHODS: An exonic sequence derived from a hypothetical male patient was matched against human reference data using a genome browser. The missense mutation was identified by running BlastX, and information on the affected protein was retrieved fro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In the present study, we aimed to explore whether common genetic targets or signaling pathways existed in chemical cystitis.
METHODS: Gene Expression Omnibus (GEO) database was used to search the related gene expression profiles. The differentially expressed genes (DEGs) were identified by using GEO2R. The DAVID 6.8 Beta and R software were used to perform Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway analysis and Gene Ontology function analysis of DEGs. The protein-protein interaction network was constructed by STRING 11.0 to reveal the potential gene interactions. The expressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We explore the underlying molecular mechanisms and to identify key molecules in Huntington's disease by utilizing bioinformatics methods. The gene expression profile of GSE3621 was extracted from the gene expression omnibus. Differentially expressed genes between the R6/1 transgenic mouse model of Huntington's disease and controls at different time points were screened by limma package in R. Kyoto encyclopedia of genes and genomes database. It was used to analyze the pathways of differentially expressed genes. A searching tool of the protein-protein interaction network was constructed and visu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human infection with avian influenza H5N1 is an emerging infectious disease characterized by respiratory symptoms and a high fatality rate. Hemagglutinin and neuraminidase are the two surface proteins responsible for infection by influenza virus. Till date, neuraminidase has been the major target for antiviral drugs. In the present study we chose hemagglutinin protein as it mediates the binding of the virus to target cells through sialic acid residues on the host cell-surface. Hemagglutinin of H5 avian influenza (PDB ID: 1JSN) was used as the receptor protein. Ligands were generated by structu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The existence of XAGE genes was first reported after database homology searches for PAGE-like sequences identified 3 XAGE EST clusters. One of these clusters, XAGE-1, has in later studies been identified as a cancer/testis-associated gene. Here, we report the expression profiles of all 3 reported XAGE genes, as well as several splice variants of XAGE-1, in normal human tissues, Ewing's sarcoma and melanocytic tumors. We also provide the genetic structure of the corresponding genes. Moreover, by searching the databases for XAGE homologues, we identified 3 additional GAGE-like genes. RT-PCR stud
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to screen out differentially expressed genes (DEGs) and explore small molecule drugs for Tetralogy of Fallot (TOF). The gene expression profile of TOF GSE26125 was downloaded from the Gene Expression Omnibus database, including 16 idiopathic TOF samples and five healthy controls. The DEGs were identified by the Limma package in R language and underwent functional enrichment analysis via Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery tools. A protein-protein interaction (PPI) network of DEGs was then constructed and the significant clusters were selected for fu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study explored the prognostic role of GPR27 and its predictive value to platinum-based therapy in ovarian cancer.
MATERIAL AND METHODS: A survival analysis of GPR27, and the therapeutic response to platinum in ovarian cancer was investigated using data from the cancer genome atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) databases. GPR27 expression was assessed using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and immunohistochemistry.
RESULTS: Database analysis and RT-PCR revealed over-expression of GPR27 mRNA in ovarian cancer tissues compared to normal ovaria
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the possible mechanism by which Cassiae Semen treats DR via network pharmacology and to validate this mechanism via in vitro experiments. The active ingredients and potential DR-related targets of Cassia Semen were screened using the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology (TCMSP) platform and other disease-related databases. A protein‒protein interaction network for these common targets was subsequently established via the STRING database. Key active ingredients and core targets were selected through network topology analysis using Cytoscape
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moslosooflavone, which is a natural flavonoid, demonstrates significant protective effects against hypobaric hypoxia-induced brain injury (HHBI). Nevertheless, its underlying mechanisms are still poorly understood. The present study aimed to elucidate the neuroprotective mechanisms of moslosooflavone against HHBI by integrating network pharmacology with in vivo experimental validation. Potential targets of moslosooflavone and HHBI-related genes were retrieved from public databases. The STRING database in conjunction with Cytoscape 3.9.1 software was used to construct a comprehensive protein-pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accidents with the caterpillar Lonomia obliqua are often associated with a coagulation disorder and hemorrhagic syndrome in humans. In the present study, we have constructed cDNA libraries from two venomous structures of the caterpillar, namely the tegument and the bristle. High-throughput sequencing and bioinformatics analyses were performed in parallel. Over one thousand cDNAs were obtained and clustered to produce a database of 538 contigs and singletons (clusters) for the tegument library and 368 for the bristle library. We have thus identified dozens of full-length cDNAs coding for protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is an aggressive kidney malignancy with limited prognostic biomarkers. CRKL has been implicated in cancer progression, but its prognostic value and immune associations in ccRCC remain unclear. Using TCGA, GEO, and UALCAN databases, we analyzed CRKL expression. Kaplan-Meier and multivariate Cox regression assessed survival; TIMER and TISIDB evaluated immune infiltration; LinkedOmics databases and GSEA identified enriched pathways. CRKL was significantly overexpressed in ccRCC tissues at both mRNA and protein levels. Surprisingly, high CRKL expression was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Ralstonia mannitolilytica is an global opportunistic pathogen responsible for various diseases. In this study, we reported the genome of a R. mannitolilytica isolate responsible for bacteremia in an acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD).
METHODS: Bacterial identification was performed with a Vitek2™ Automated System and 16S rRNA sequencing with BLASTn against the Non-Redundant Protein Sequence (Nr) database. Genome sequencing and analysis were performed using PacBio RS II sequencer, Hierarchical Genome Assembly Process assembly, as well as multiple
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pituitary stalk interruption syndrome (PSIS) and holoprosencephaly (HPE) are congenital midline defects. Rare mutations in the sonic hedgehog (SHH) signaling gene CDON have recently been reported in patients with HPE.
OBJECTIVE: To report a unique case of PSIS with a maternally inherited nonsense mutation in the SHH signaling protein CDON.
METHOD: We performed exome sequencing on a case of PSIS. Control databases (1000 Genomes, dbSNP, Exome Variant Server, ExAC Browser) and an ancestry-matched control panel were screened upon identification of CDON mutation.
RESULTS: We identifi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Shen-Qi-Jiang-Tang granule (SQJTG), a classic traditional Chinese medicine (TCM) prescription, has been widely used in clinical for diabetes, especially type Ⅱ diabetes. Previous anti-diabetic studies stumbled across that SQJTG has a potential kidney protective effect on diabetic nephropathy (DN). However, the protective mechanism of SQJTG on DN still needs to be explored.
AIM OF THE STUDY: The purpose of the present study was to explore the therapeutic effect of SQJTG on DN through both bioinformatics analysis and in vivo experiments.
METHODS AND MATERIALS: T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Macrophage apoptosis is a key contributor to the elimination of immune cells and increased susceptibility during sepsis. CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4 (CMTM4) is a membrane protein with four transmembrane domains. It has recently been implicated in the regulation of immune cell biological functions. However, its role in regulating macrophage apoptosis during sepsis has not been extensively studied.
METHODS: Clinical samples were analyzed to determine CMTM4 expression levels and their correlation with clinical examination results. An in vitro model was develope
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Although the association between dietary protein intake and inflammatory bowel disease (IBD) risk has been investigated, the results are inconsistent. Therefore, we conducted a meta-analysis to reassess the relationship between dietary protein intake and IBD risk.
METHODS AND STUDY DESIGN: The PubMed, Web of Knowledge, and Wanfang databases were searched for pertinent studies through January 31, 2020. Relative risks (RRs) with 95% confidence intervals (CIs) were derived using a random-effect model. Subgroup analyses according to disease type, geographic location, an
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Xuebijing (XBJ) injection, a Traditional Chinese medicine (TCM) widely used in China for treating sepsis and multiple organ dysfunction, has shown neuroprotective effects in traumatic brain injury (TBI). However, the mechanisms underlying these effects remain unclear. This study aims to elucidate the neuroprotective and pharmacological molecular mechanisms of XBJ and its active monomer, Hydroxy-safflor yellow A (HSYA), in treating TBI through network pharmacology and experimental validation.
METHODS: Potential therapeutic targets for TBI were collected from TCMSP, TTD, OMIM, and Ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования