MOTIVATION: Many approaches in systems biology have been applied in drug repositioning due to the increased availability of the omics data and computational biology tools. Using a multi-omics integrated network, which contains information of various biological interactions, could offer a more comprehensive inspective and interpretation for the drug mechanism of action (MoA).
RESULTS: We developed a computational pipeline for dissecting the hidden MoAs of drugs (Open MoA). Our pipeline computes confidence scores to edges that represent connections between genes/proteins in the integrated netwo…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Astrocytes are important for normal brain functioning. Astrocytes are metabolic regulators of the brain that exert many functions such as th … th factors, steroid derivatives, mesenchymal stem cell paracrine factors, nicotine derivatives, and computational biology tools. Moreover, the combined use of experimental approaches with bioinformatics tools such as the ones obtained through system biology has allowed a broader knowledge in astrocytic protection both in normal and pathological conditions. In the prese …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Antibody-drug conjugates (ADCs) have evolved from early heterogeneous constructs into a mature therapeutic platform with exponential clinical relevance. This review highlights recent advances in ADC design and development, with emphasis on antigen selection, antibody engineering, linker and payload innovation, site-specific conjugation, clinical translation, toxicity, resistance, and emerging data-driven approaches. Methods: The review draws on the literature published from 2019 to the recent clinical and regulatory developments relevant to approved and late-stage ADCs, emphasizing
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gingival keratinization is a critical physiological process that protects against mechanical stress and microbial invasion. Disr … ds:Gingival keratinization, Periodontal diseases, Gene regulatory networks, Differential equations, Computational biology, Systems biology.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent decades, the development of new drugs has become increasingly expensive and inefficient, and the molecular mechanisms of most pharmaceuticals remain poorly understood. In response, computational systems and network medicine tools have emerged to identify potential drug repurposing candidates. However, these tools often require complex installation and lack intuitive visual network mining capabilities. To tackle these challenges, we introduce Drugst.One, a platform that assists specialized computational medicine tools in becoming user-friendly, web-based utilities for drug repurposing
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The question of how the physical dimensions of animal organs are specified has long fascinated both experimentalists and computational scientists working in the field of developmental biology. Research over the last few decades has identified many of the genes and signaling pathways involved in organizing the emergent multi-scale features of growth and homeostasis. However, an integrated model of organ growth regulation is still unrealized due to the numerous feedback control loops found within and between intercellular signaling pathways as well as a lack of understanding of the exact role of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Modern medication discovery is undergoing a paradigm change at the junction of herbal pharmacology with computational modeling informed by quantum theory. Herbal compounds, which have often been considered as complex and poorly understood entities, have historically been investigated using linear screening approaches and reductionist bioactivity models. A novel paradigm being presented in this work is herbal holography. Herbal molecules are seen by it as multi-dimensional systems best understood using holographic and quantum theories. As the pharmacological potential of plant-based co
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioinformatics has revolutionized biology and medicine by using computational methods to analyze and interpret biological data. Quantum mechanics has recently emerged as a promising tool for the analysis of biological systems, leading to the development of quantum bioinformatics. This new field employs the principles of quantum mechanics, quantum algorithms, and quantum computing to solve complex problems in molecular biology, drug design, and protein folding. However, the intersection of bioinformatics, biology, and quantum mechanics presents unique challenges. One significant challenge is th
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The U.S. Department of Energy's Systems Biology Knowledgebase (KBase; www.kbase.us) is an open, collaborative platform that integrates data, models, and analysis tools to accelerate discovery in microbiology, plant biology, and environmental systems. Recently, KBase expanded as a comprehensive, multi-omics ecosystem. KBase enables representation of scientific samples, long-read sequence analysis, protein structure integration, and scalable modeling of microbial communities across diverse environments. KBase also generates digital notebooks as citable, executable research objects that link data
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present an approach integrating structural and computational biology with immunological tests to identify epitopes in the OppA antigen from the Gram-negative pathogen Burkholderia pseudomallei, the etiological agent of melioidosis. The crystal structure of OppA(Bp), reported here at 2.1 Å resolution, was the basis for a computational analysis that identified three potential epitopes. In parallel, antigen proteolysis and immunocapturing allowed us to identify three additional peptides. All six potential epitopes were synthesized as free peptides and tested for their immunoreactivity against …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aneurysm vasculopathies represents a group of vascular disorders that share a common morphological diagnosis: a vascular dilation, the aneurysm. They can have a same etiology and a different clinical presentation or morphology, or have different etiology and very similar anatomical geometry. The biology of the aneurysm formation is a complex process that will be a result of an endogenous predisposition and epigenetic factors later on including the intracranial hemodynamics. We describe the biology of saccular aneurysms, its growth and rupture, as well as, current concepts of hemodynamics deriv
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing demand for sustainable food systems has accelerated research into alternative proteins derived from plant sources, microorganisms, insects, and cultured animal cells. These protein systems offer promising solutions to environmental, ethical, and nutritional challenges associated with conventional livestock production. However, designing and optimizing alternative proteins requires deep understanding of molecular structures, biochemical properties, and production processes. Computational biology has emerged as a powerful approach to address these challenges by enabling predictive mo…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrinsically Disordered Regions (IDRs) play essential roles in cellular processes through interactions with proteins, nucleic acids, lipids … encoding methods determining performance gains. These findings establish that quantum advantage in computational biology emerges from architectural design principles rather than computational scale, providing a framework for overcoming performance limitations in bioinformatics applications where dataset expansion is constrained.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single cell biology has the potential to elucidate many critical biological processes and diseases, from development and regeneration to cancer. Single cell analyses are uncovering the molecular diversity of cells, revealing a clearer picture of the variation among and between different cell types. New techniques are beginning to unravel how differences in cell state-transcriptional, epigenetic, and other characteristics-can lead to different cell fates among genetically identical cells, which underlies complex processes such as embryonic development, drug resistance, response to injury, and c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Technological revolutions in several fields have pushed the boundaries of vaccine design and provided new avenues for vaccine development. Next-generation vaccine platforms have shown promise in targeting challenging antigens, for which traditional approaches have been ineffective. With advances in protein engineering, structural biology, computational biology and immunology, the structural vaccinology approach, which uses protein structure information to develop immunogens, holds promise for future vaccine design. In this review, we highlight various vaccine development strategies, along with…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In silico techniques have become essential in contemporary parasitology, offering swift, cost-effective, and scalable methods for exploring parasite biology, host-parasite interactions, drug resistance, the discovery of diagnostic markers, vaccine development, and the prioritization of therapeutic targets. Computational frameworks that encompass genomics, pangenomics, phylogenetics, transcriptomics, proteomics, structural biology, molecular docking, molecular dynamics simulations, artificial intelligence (AI), and immunoinformatics have collectively revolutionized parasite research. They enabl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since its inception, synthetic biology has relied on linear genetic modifications to treat living cells as biological counterparts to silicon microchips and computer-aided manufacturing. This paradigm is deeply rooted in the historical frameworks of Turing, Boole, and von Neumann, whose theoretical models remarkably anticipated the computational nature of the central dogma and native genetic operons. However, forcing living cells to strictly conform to the rigid, deterministic constraints of human software ignores a fundamental architectural disconnect: the dynamic, stochastic reality of the c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The newly emerging field of systems biology involves a judicious interplay between high-throughput 'wet' experimentation, computational modelling and technology development, coupled to the world of ideas and theory. This interplay involves iterative cycles, such that systems biology is not at all confined to hypothesis-dependent studies, with intelligent, principled, hypothesis-generating studies being of high importance and consequently very far from aimless fishing expeditions. I seek to illustrate each of these facets. Novel technology development in metabolomics can increase substantially
LectureПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approaches are needed to reduce the impact of climate change and provide freshwater. Synthetic biology, and plant synthetic biology specifically, is in an exceptional position to address these needs. Plants are powerful synthetic biology platforms as they derive their energy from the sun (photosynthesis) while capturing the potent greenhouse gas, carbon dioxide. Historically, plants were used in specialized circumstances to provide and store freshwater. Even today many mangrove species can filter seawater while some plants can store massive amounts of water. I propose that starting from nature
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in 3D and 4D bioprinting have enabled the development of physiologically relevant cancer models that better mimic the spatial and temporal complexity of tumor biology. 4D bioprinting integrates intelligent biomaterials, stimuli-responsive bioinks, and computational design to produce constructs capable of planned, time-dependent modifications in structure or function after printing. Such dynamic features could be useful for modeling tumor microenvironment (TME) evolution, cancer progression, therapeutic responses, and spatio-temporally controlled drug delivery. Prior reviews pre
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования