Multinuclear ((31)P and (79/81)Br), multifield (9.4, 11.75, and 21.1 T) solid-state nuclear magnetic resonance experiments are performed for … Br-P distance in the crystal structure, a finding that has possible application in the field of NMR crystallography. This trend is explained in terms of Ramsey's theory on paramagnetic shielding. Overall, this work demonstrates how careful NMR studies of underexploited exotic nuclides, such as (79/81)Br, can afford insights into structure and bonding environments …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NEMO is an integral part of the IkappaB kinase complex and serves as a molecular switch by which the NF-kappaB signaling pathway can be regulated. Oligomerization and polyubiquitin (poly-Ub) binding, mediated through the regulatory CC2-LZ domain, were shown to be key features governing NEMO function, but the relationship between these two activities remains unclear. In this study, we solved the structure of this domain in complex with a designed ankyrin repeat protein, which helps its crystallization. We generated several NEMO mutants in this domain, including those associated with human disea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid evolution of macromolecular crystallography towards high-frame-rate detectors and complex serial data collection strategies requires better integration of traditional software tools and the development of new solutions. Managing data flow, assessing quality in real time and merging results from thousands of crystals - as required by synchrotron serial crystallography - present significant challenges for beamline operations. Existing solutions often fragment the workflow into disconnected steps: visualization, processing and experiment data management. We present QuickProcess2 (QP2), …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Co-crystal structures of a base-excision DNA-repair enzyme (human 8-oxoguanine DNA glycosylase; hOgg1) in complex with a photocaged 8-oxoguanine DNA lesion were determined before and after uncaging via illumination at 2.81 and 2.48 Å resolution, respectively. The structures were carefully reassessed to rapidly expand the target repertoire of light-triggered time-resolved macromolecular crystallography. Late-intermediate cryo-trapping after uncaging revealed the partial accommodation of 8-oxoguanine in the active site with 68% occupancy, which did not induce full active-site adaptation to the c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two-dimensional (2D) crystals of integral membrane proteins, comprising ordered protein reconstituted into a synthetic lipid bilayer, can be induced to form from detergent solubilized and purified membrane protein sources via the addition of exogenous lipid and the subsequent removal of the solubilizing detergent. This is most commonly accomplished by dialysis of a small volume of ternary protein-detergent-lipid mixture against a large volume of buffer, and can be carried out using common, easily available materials. Following successful crystallization, electron crystallographic data obtained
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfonamides are a fundamental class of compounds with diverse pharmacological applications. Here, two benzene-1,3-disulfonamide-containing cycloalkyne compounds were designed to demonstrate the strained conformations due to the 11-membered ring. Their structures were experimentally analyzed using single-crystal X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. The molecules exhibit flexible sulfonamide conformations together with characteristic distortions of the benzene and alkyne moieties. Comparing the compound data obtained, the proton NMR chemical shift of hydrogen…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to discover new effective anti-cancer drugs, fifteen derivatives of chrysin-1,3,5-triazine were designed and synthesized as potential novel anti-cancer agents. The structure of the target compounds were characterized by 1H NMR, 13C NMR, IR, and HR-MS. The purity of all compounds were detected by HPLC. The structure of compound 4a was subjected to further investigation through single crystal X-ray diffraction, and elaborate discussions were conducted on the Hirshfeld surface and two-dimensional fingerprint diagram to explore the molecular conformation, crystal packing mode and molecula
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is caused by parasites of the genus Schistosoma, which infect more than 200 million people. Praziquantel (PZQ) has been the … -throughput fragment screening campaign of 768 compounds against S. mansoni TGR (SmTGR) using X-ray crystallography. We observed 49 binding events involving 35 distinct molecular fragments which were found to be distributed across 16 binding sites. Most sites are described for the first time within SmTGR, a noteworthy exception being the "doorstop pocket" near th …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragment-based drug discovery (FBDD) is contingent on the development of analytical methods to identify weak protein-fragment noncovalent interactions. Herein we have combined an underutilized fragment screening method, native state mass spectrometry, together with two proven and popular fragment screening methods, surface plasmon resonance and X-ray crystallography, in a fragment screening campaign against human carbonic anhydrase II (CA II). In an initial fragment screen against a 720-member fragment library (the "CSIRO Fragment Library") seven CA II binding fragments, including a selection …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Additivity of functional group contributions to protein-ligand binding is a very popular concept in medicinal chemistry as the basis of rational design and optimized lead structures. Most of the currently applied scoring functions for docking build on such additivity models. Even though the limitation of this concept is well known, case studies examining in detail why additivity fails at the molecular level are still very scarce. The present study shows, by use of crystal structure analysis and isothermal titration calorimetry for a congeneric series of thrombin inhibitors, that extensive coop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 50-residue snake venom protein L-omwaprin and its enantiomer D-omwaprin were prepared by total chemical synthesis. Radial diffusion assa … on the strong scattering from the sulfur atoms in the eight cysteine residues per protein. Racemic crystallography once again proved to be a valuable method for obtaining crystals of recalcitrant proteins and for determining high-resolution X-ray structures by direct methods.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Botulism food poisoning is caused primarily by ingestion of the Clostridium botulinum neurotoxin (BoNT). The 1300 amino acid BoNT forms a progenitor toxin (PTX) that, when associated with a number of other proteins, increases its oral toxicity by protecting it from the low pH of the stomach and from intestinal proteases. One of these associated proteins, HA1, has also been suggested to be involved with internalization of the toxin into the bloodstream by binding to oligosaccharides lining the intestine. Here is reported the crystal structure of HA1 from type C Clostridium botulinum at a resolu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histidine is a key amino-acid residues in proteins that can exist in three different protonation states: two different neutral tautomeric forms and a protonated, positively charged one. It can act as both donor and acceptor of hydrogen bonds, coordinate metal ions, and engage in acid/base catalysis. Human Carbonic Anhydrase II (HCA II) is a pivotal enzyme catalyzing the reversible hydration of carbon dioxide. It contains 12 histidine residues: six are surface exposed, two buried, three are active site zinc ion ligands, and one is a proton shuttle. Comparing results from NMR spectroscopy with p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The symptomatic and disease-modifying effects of butyrylcholinesterase (BuChE) inhibitors provide an encouraging premise for researching effective treatments for Alzheimer's disease. Here, we examined a series of compounds with a new chemical scaffold based on 3-(cyclohexylmethyl)amino-2-hydroxypropyl, and we identified a highly selective hBuChE inhibitor (29). Based on extensive in vitro and in vivo evaluations of the compound and its enantiomers, (R)-29 was identified as a promising candidate for further development. Compound (R)-29 is a potent hBuChE inhibitor (IC50 = 40 nM) with selectivit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide (NO) reductase from the fungus Fusarium oxysporum is a P450-type enzyme (P450nor) that catalyzes the reduction of NO to nitrous … results for the characterization of the coordination and electronic structures of I TR freeze-trap crystallography using an X-ray free electron laser (XFEL) reveals highly bent Fe-NO coordination in I , with an elongated Fe-NO bond length (Fe-NO = 1.91 Å, Fe-N-O = 138°) in the absence of NAD+ TR-infrared (IR) spectroscopy detects the formation of I with an N-O s …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The seven antigenically distinct serotypes (A-G) of botulinum neurotoxin (BoNT) are responsible for the deadly disease botulism. BoNT serotype A (BoNT/A) exerts its lethal action by cleaving the SNARE protein SNAP-25, leading to inhibition of neurotransmitter release, flaccid paralysis and autonomic dysfunction. BoNTs are dichain proteins consisting of a ∼ 100 kDa heavy chain and a ∼ 50 kDa light chain; the former is responsible for neurospecific binding, internalization and translocation, and the latter for cleavage of neuronal SNARE proteins. Because of their extreme toxicity and history of
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermidine synthase (SPDS) is an important enzyme in the pathway for the biosynthesis of polyamines, and it synthesizes the polyamine spermi … peratures. Here, we report a new SPDS structure in complex with PUT (SPDS-PUT) and multitemperature crystallography of SPDS complexed with PUT and 5-deoxy-5-methylthioadenosine (MTA) at 100, 273, and 293 K to study its structure and dynamics. The results revealed that the occupancy of the active site is important for the extent of stabilization in the gatekeeping …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the molecular-level-induced-fit adsorption of acetylene (C2H2) and carbon dioxide (CO2) in sql-SIFSIX-bpe-Zn, a flexible, anion-pillared ultramicroporous metal-organic framework (MOF). Sql-SIFSIX-bpe-Zn undergoes distinct pressure-dependent phase transitions, enabling a high selectivity for C2H2 over CO2 and ethylene (C2H4). However, the unclear thermodynamic and kinetic mechanisms underlying this behavior, as well as limitations in models derived from single-crystal X-ray diffraction (SCXRD), necessitate further investigation. Using in situ multinuclear solid-state NMR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragment-based drug discovery (FBDD) is an effective approach for exploring chemical space using small, low-affinity fragments as starting p … novel Mac1 binders. Selected compounds were synthesized and validated by NMR spectroscopy and X-ray crystallography, demonstrating improved binding relative to the original fragment hits with KD values in the range of 299-990 µM. This study demonstrates the advantages of integrating AI with FBDD to streamline molecular design, providing a data-driven framework fo …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования