The multiprotein factor composed of XPA and replication protein A (RPA) is an essential subunit of the mammalian nucleotide excision repair system. Although XPA-RPA has been implicated in damage recognition, its activity in the DNA repair pathway remains controversial. By replacing DNA adducts with mispaired bases or non-hybridizing analogues, we found that the weak preference of XPA and RPA for damaged substrates is entirely mediated by indirect readout of DNA helix conformations. Further screening with artificially distorted substrates revealed that XPA binds most efficiently to rigidly bent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Self-assembly based on nucleic acid systems has become highly attractive for bottom-up fabrication of programmable matter due to the highly selective molecular recognition property of biomolecules. In this context, Y-shaped DNA (Y-DNA) provides an effective building block for forming unique self-assembled large-scale architectures. The dimension and growth of the nano- and microstructures depend significantly on the configurational stability of Y-DNA as a building block. Here we present structural studies of Y-DNA systems using a time-resolved FRET (Förster resonance energy transfer) technique
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A plasmid DNA containing the inserted Babesia bovis cDNA clone designated c51A was used to prepare a DNA probe for B. bovis. The purified 0.6 kb specific DNA fragment was labeled by DIG DNA labeling. After denaturation, the probe was hybridised with the blotted target DNA extracted from bovine red blood cells infected with B. bovis or other protozoa or bovine red blood cells plus extra white blood cells. It was found that the probe produced from purified 0.6 kb DNA fragment could detect sample of B. bovis DNA equivalent to 0.015 microliter of 10% whole infected blood. Compared to the same DNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of a repetitive DNA probe for Babesia bigemina was reviewed. The original plasmid (p(Bbi)16) contained an insert of B. bigemina DNA of approximately 6.3 kb. This probe has been evaluated for specificity and analytical sensitivity by dot blot hybridization with isolates from Mexico, the Caribbean region and Kenya. A partial restriction map has been constructed and insert fragments have been subcloned and utilized as specific DNA probes. A comparison of 32P labelled and non-radioactive DNA probes was presented. Non-radioactive detection systems that have been used include digoxig…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new DNA probe assay (PACE 2, Gen-probe) was compared with cell culture for the detection of Chlamydia trachomatis in 909 women attending the Royal Women's Hospital, Melbourne, Victoria. The DNA probe assay had a sensitivity of 86.2%, a specificity of 99.9% and a positive predictive value of 96.2% in a population with 3.2% prevalence, indicating that it may be a suitable alternative to culture for the detection of C. trachomatis in specimens from the genital tract.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genomic library of Onchocerca gibsoni has been prepared in the vector lambda-gt10 and has been screened for specific DNA sequences by hybridization with radiolabelled total genomic DNA from a number of Onchocerca species. A clone--fOGI--has been isolated which does not interact with DNA prepared from O. gutturosa, O. lienalis, O. ochengi, O. cervicalis or O. volvulus (both Liberian and Mexican isolates). In addition, no hybridization is observed with host (cattle) DNA. fOGI can detect as little as 100-200 pg of O. gibsoni DNA. It is thus concluded that fOGI has the sensitivity to detect micr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the epidemiology of meningococcal disease, a specific DNA probe pUS210 (carrying insert DNA which is repeated in the meningococcal genome) was isolated. The ability of this probe to hydridise with multiple polymorphic fragments in Southern blots was exploited to examine genetic relations within strains. Two geographically distinct foci of prolonged meningococcal disease (Gloucester and Plymouth, UK) are due to a clonal population of virulent strains that are distinct from those found elsewhere in the UK.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated the potential value of a cloned sequence of genomic DNA of Brugia malayi as a species-specific probe. Clone pBm 15 reacted with all stages of 8 different geographic isolates of B. malayi and cross-hybridized with microfilariae of B. timori. It did not hybridize with Wuchereria bancrofti or with B. pahangi, W. kalimantani, Dirofilaria repens, Breinlia booliati or Cardiofilaria species, animal filariids that can be sympatric with B. malayi. P32-labeled clone pBm 15 correctly identified mosquitoes infected even with 1 infective larva of B. malayi. This specific DNA probe should be an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accurate detection of double-stranded DNA (dsDNA) cancer biomarkers remains a critical challenge in biosensing technologies, as native strand pairing hampers probe hybridization. While photoelectrochemical (PEC) biosensors hold promise for rapid and cost-effective nucleic acid diagnostics, their application has largely been confined to synthetic single-stranded DNA (ssDNA), limiting their clinical applicability. Here, we introduce an enzyme-free PEC biosensing strategy that directly detects DNA targets within their native double-stranded form by integrating locked nucleic acid (LNA) probes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorescence in situ hybridisation (FISH) is a suitable technique for the rapid, reliable and cultivation-independent identification of microbial pathogens. This study describes the development of fluorescently labelled rRNA-targeted oligonucleotides and a FISH assay to detect and identify Cryptococcus neoformans in culture and biological samples. All C. neoformans reference and clinical isolates gave positive signals with the specific oligonucleotide probes, whereas all non-target yeast species gave negative reactions with the same probes. The assay was also successfully applied to the detect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports on the evaluation of two L. infantum specific DNA probes for the diagnosis of canine leishmaniasis. The probes presented very satisfying performances in terms of specificity (100%) and predictive value of the positive result (100%). However, their sensitivity (35.3%) and the clinical complexity of canine infections render their use difficult in epidemiological surveys of visceral leishmaniasis aiming at measuring the prevalence of the dog infection by L. infantum. The sensitivity of these tools has improved (66.7%) when dogs presenting patent leishmaniasis were considered. S…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously described a system for characterising the relationships between trypanosome stocks of the T.brucei group based on Southern blotting with repetitive DNA probes followed by cluster analysis of resultant banding patterns (G. Hide et al. Molec. Bioch. Parasitol. 39, 213-226, 1990). In this study, we extend this analysis to examine the relationships between trypanosome stocks isolated from major sleeping sickness foci in Zambia, Kenya, and Uganda. We show that the trypanosome strains responsible for disease in Zambia are quite distinct from those sampled from the Kenya/Uganda foc…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA probes to both the joining region (JH) of the immunoglobulin heavy chain gene (IgH) and to the beta chain of the T-cell antigen receptor complex (TCR) have been used as tumour-specific markers to monitor the rearrangements of the IgH chain gene and the TCR beta gene in the blast cells of children presenting with acute lymphoblastic leukaemia (ALL) of B or T cell origin. Blast cells from 68 children with early B cell ALL and eight with T-ALL were examined at presentation, at day 28 after commencement of therapy and at varying times thereafter. An additional 43 patients (42 with B cell ALL, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A feasibility study in two Mediterranean populations showed that prenatal diagnosis of beta-thalassaemia with a limited number of synthetic oligonucleotide probes would have been possible in about 70% of cases. To provide a comprehensive programme of prenatal diagnosis for the thalassaemias it would be necessary, in most populations, to combine fetal DNA analysis with fetal blood sampling and globin-chain synthesis studies.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a series of uracil-triazole-pyrene peptidomimetics (2-4) designed to achieve modular geometric control through peptide linkers of varying length and flexibility. All three compounds exhibited submicromolar affinity for ds-DNA, while compound 4 also showed strong binding to ds-RNA, demonstrating the advantage of combining a uracil recognition unit with an extended pyrene aromatic surface compared to the Pyr-Trp reference ligand and the phenanthridine analog 4'. Structural variations strongly affected Cu(II) coordination. Although Pyr-Trp bound Cu(II) approximately 1000-fold more stron
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic inflammation is associated with a variety of human diseases, including cancer, with one possible mechanistic link involving over-production of nitric oxide (NO*) by activated macrophages. Subsequent reaction of NO* with superoxide in the presence of carbon dioxide yields nitrosoperoxycarbonate (ONOOCO2-), a strong oxidant that reacts with guanine in DNA to form a variety of oxidation and nitration products, such 2'-deoxy-8-oxoguanosine. Alternatively, the reaction of NO and O2 leads to the formation of N2O3, a nitrosating agent that causes nucleobase deamination to form 2'-deoxyxanthos
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
V. cholerae strains of different origin have been studied for the presence of cholera toxin genes (vct), the proximal part of the virulence cassette including genes zot, ace and orfU, as well as neuraminidase genes (neu), in their genomes with the use of molecular DNA probes. The possibility, in principle, for some strains to lose only a part of their virulence cassette (gene vct), while retaining its proximal part has been shown. In most cases such strains are isolated from patients with diarrhea of different severity and may probably play some etiological role, provided that the expression o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the isolation of middle-repetitive DNA sequences from Cryptococcus neoformans that are species and variety specific. These probes were used for assessing strain relatedness among cryptococcal isolates from patients with and without AIDS who were from Zaire and the United States. Five distinct hybridization patterns were observed for the 60 isolates examined, regardless of the restriction enzyme used for digestion. The most common pattern among the isolates from the patients without AIDS was also the most common among the isolates from the patients with AIDS who were from the United S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To identify by reverse genetics genes on the short arm of human chromosome 7 expected to be involved in the regulation of human craniofacial … s. We used Southern blots of this panel to assign to 7q or subregions of 7p more than 300 arbitrary DNA probes or genes that provide reference points for physical mapping of 7p. Three reciprocal translocations with one of the breakpoints in 7p13 mark the location of a gene involved in Greig cephalopolysyndactyly syndrome. To define an area in which we could …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A diagnostic hybridization assay for detecting herpes simplex virus type 1 (HSV-1) in ocular specimens was developed using cloned viral DNA as a probe. This hybridization assay is based on visualizing a biotinylated probe that is hybridized to the target DNA by a streptavidin/alkaline phosphatase system. The time required for performing this assay system is only two days. This assay system could detect a probe which had been hybridized to as little as 1 pg of homologous DNA and did not cross-react with DNA of other human herpes viruses except that of herpes simplex virus type 2 (HSV-2) which s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.