The detection of viral gene fragments is essential for diagnosing and screening viral infections, managing virus transmission, and controlling epidemics. In this study, we developed an isothermal amplification-bridged DNA switch designed for the sensitive detection of viral gene fragments. Specifically, the binding of the target viral gene fragment to the recognition sequences triggers isothermal amplification, resulting in the production of multiple DNA products. Consequently, a single target gene fragment is transformed into approximately 1250 DNA products, which can subsequently activate th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to develop a method to evaluate the quality of bovine in vitro fertilized (IVF) embryos based on gene expression profiling via whole-transcriptome amplification. The expression of 11 developmentally important genes in individual bovine in vivo-derived (IVD) and IVF embryos were examined. Gene expression profiling was conducted by classifying the expression level of each gene in individual embryos as low, medium, or high. The IVF group had a higher (P < 0.01) proportion of embryos with low expression of SOX2, NANOG, and FGF4. In addition, a correlation analysis between the expr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HER2 (ERBB2) overexpression and/or HER2 gene amplification has been well established in several tumors types and when present HER2 directed therapy may be to be efficacious. While recent findings suggests that HER2 overexpression and HER2 amplification are a relatively common in serous endometrial carcinoma, similar data regarding clear cell endometrial carcinoma (CCC) is difficult to interpret due to issues such as diagnostic criteria, sample type and HER2 interpretation criteria. Our goals were to study HER2 expression and HER2 copy number status in hysterectomy specimens from a large series…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance continues to impede the success of cancer treatments, creating a need for experimental model systems that are broad, yet simple, to allow the identification of mechanisms and novel countermeasures applicable to many cancer types. To address these needs, we investigated a set of engineered mammalian cell lines with synthetic gene circuits integrated into their genome that evolved resistance to Puromycin. We identified DNA amplification as the mechanism underlying drug resistance in 4 out of 6 replicate populations. Triplex-forming oligonucleotide (TFO) treatment combined with Pu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Targeting fibroblast growth factor receptor 1 (FGFR1) is a potential treatment for squamous cell lung cancer (SQCLC). So far, treatment decision in clinical studies is based on gene amplification. However, only a minority of patients have shown durable response. Furthermore, former studies have revealed contrasting results regarding the impact of FGFR1 amplification and expression on patient's prognosis.
AIMS: Here, we analyzed prevalence and correlation of FGFR1 gene amplification and protein expression in human lung cancer and their impact on overall survival. MATERIALS & METHOD…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PCR inhibition is frequent in medical microbiology routine practice and may lead to false-negative results; however there is no consensus on how to detect it. Pathogen-specific and human gene amplifications are widely used to detect PCR inhibition. We aimed at comparing the value of PCR inhibitor detection using these two methods. We analysed Cp shifts (ΔCp) obtained from qPCRs targeting either the albumin gene or the pathogen-specific sequence used in two laboratory-developed microbiological qPCR assays. 3152 samples including various matrixes were included. Pathogen-specific amplification an…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horizontal gene transfer may occur between distantly related bacteria, thus leading to genetic plasticity and in some cases to acquisition of novel resistance traits. Proteus mirabilis is an enterobacterial species responsible for human infections that may express various acquired β-lactam resistance genes, including different classes of carbapenemase genes. Here we report a Proteus mirabilis clinical isolate (strain 1091) displaying resistance to penicillin, including temocillin, together with reduced susceptibility to carbapenems and susceptibility to expanded-spectrum cephalosporins. Using
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic origins of DNA replication are bound by the origin recognition complex (ORC), which scaffolds assembly of a pre-replicative complex (pre-RC) that is then activated to initiate replication. Both pre-RC assembly and activation are strongly influenced by developmental changes to the epigenome, but molecular mechanisms remain incompletely defined. We have been examining the activation of origins responsible for developmental gene amplification in Drosophila. At a specific time in oogenesis, somatic follicle cells transition from genomic replication to a locus-specific replication from s…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is almost invariably associated with an underlying inflammatory state, whose direct contribution to the acquisition of critical genomic changes is unclear. Here we map acquired genomic alterations in human and mouse HCCs induced by defects in hepatocyte biliary transporters, which expose hepatocytes to bile salts and cause chronic inflammation that develops into cancer. In both human and mouse cancer genomes, we find few somatic point mutations with no impairment of cancer genes, but massive gene amplification and rearrangements. This genomic landscape differs fr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Analyzing chromosomal amplifications delivers valuable information for identification of oncogenes. For carcinomas of the oral cavity only few genes have been identified in amplified regions. The aim of this study was to search genes in amplified regions as possible biomarkers and targets for novel therapies.
MATERIAL AND METHODS: DNA from 10 carcinomas of the floor of the oral cavity was examined using a 500K Array GeneChip (Affymetrix 6.0) to detect chromosomal losses, gains or amplifications. Suspicious alterations were validated on tissue microarrays using fluorescence in si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although triple-negative breast cancer (TNBC) with epidermal growth factor receptor (EGFR) expression has been extensively studied, few studies have simultaneously examined EGFR expression and EGFR gene amplification. Here, we examined the correlations of EGFR expression with EGFR gene amplification, EGFR-activating mutations, and the expression of components of the Akt pathway.
METHODS: Tumor tissues were obtained from 84 patients with TNBC. We analyzed the expression of EGFR, phosphorylated Akt (p-Akt), phosphorylated mammalian target of rapamycin (p-mTOR), and other relevant pr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the feasibility and practical value of fluorescence in situ hybridization (FISH) detection of TERC gene amplification in cervical intraepithelial lesions (CIN) and squamous cell carcinoma (SCC).
METHODS: Tissue microarray was constructed to cover 150 cases of various cervical conditions, including 24 cases of normal cervical mucosa, 78 cases of CINs (CINI, 25 cases; CINII, 21 cases and CINIII, 32 cases) and 48 cases of SCC. FISH was used to detect TERC gene amplification.
RESULTS: TERC gene amplification was detected in 8% (2/25) CINI, 47.6% (10/21) CINII, 71.9% (23/32)…
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus is an encapsulated yeast of class Basidiomycetes, etiologic agent of cryptococcosis. Cryptococcosis is one of the most common o … sis. A standardized yeast suspension from different Cryptococcus isolates as template allowed CAP59 gene amplification. This procedure was quick, simple, and inexpensive and required no PCR steps. This is important for taxonomic studies in laboratories with implemented molecular biology tools.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oncogene amplification resulting in aberrant expression, although common in solid tumors, is rare in acute myeloid leukemia (AML) and is mostly associated with amplification of MYC, RUNX1, and MLL genes. Retinoic acid receptor alpha (RARA) and other target sequences at 17p11.2 often represent the amplicons expressed in breast cancer, not in AML. We present a unique case of a 59-year-old female with a history of breast cancer, now presenting with pancytopenia and bilateral infiltration with effusion in nodules of the right upper lobe of the lung. She was diagnosed with AML-M5. Chromosome analys…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To evaluate genomic amplification of the human telomerase RNA gene (TERC) as a supportive approach to cytopathology or histopathology in diagnosis of low-grade and high-grade uterine cervical lesions, 1,033 Chinese women at three medical centers had liquid-based thin-layer cytopathologic examination and TERC detection by fluorescence in situ hybridization (FISH). Human papillomavirus DNA testing, colposcopy with or without biopsy, and histopathologic examination were conducted as needed. In cytopathologic examination, genomic amplification of TERC was found in 30 of 659 (4.6%) normal or benign
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a common disorder caused by degeneration of dopaminergic neurons in the substantia nigra and other brain areas. Mutations in several genes have been associated with both autosomal dominant PD and recessive early onset Parkinsonism (EOP). Genomic rearrangements such as deletions or multiplications of one or more exons represent a common mutational mechanism for most of these genes and are not detectable with routine mutation screening techniques. MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification), is a cheap, simple, rapid, and sensitive tool to detect exon dosa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The authors report on two gonadotropic carcinomas of the adenohypophysis that occurred in a55-year-old man (Case 1) and a 53-year-old woman … tic cells of the second recurrence and in 80% of cells of the dural metastasis. Low-level HER-2/neu gene amplification was evident in the recurrent tumors and metastasis. The sellar and metastatic tumors in Case 2 resembled benign gonadotropic adenoma with oncocytic change; p53 accumulation, HER-2/neu overexpression, and HER-2/neu gene amplification were not present …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have utilized a dihydrofolate reductase (DHFR) probe in combination with selected probes from other positions along the 2q chromosome arm in a two-color fluorescence in situ hybridization analysis of early DHFR gene amplification events in CHO cells. These studies show clearly that the most frequent initiating event is the formation of a giant inverted duplication, resulting from chromosome breakage and terminal fusion or a reverse unequal sister chromatid exchange. The dicentric chromosomes thus formed initiate bridge/breakage/fusion cycles that appear to mediate subsequent amplification s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cytogenetically detectable form of gene amplification, presumably oncogene amplification, double minute chromosomes, has been found in 11 out of 45 specimens (24%) of moderately and poorly differentiated, deeply infiltrating transitional cell carcinoma of the bladder and ureter. None of the 75 low-grade low-stage tumors contained this karyotypic anomaly. It is obvious that double minutes are not a rare and sporadic phenomenon in this type of tumors; additionally there is strong evidence that they are involved in tumor progression, i.e. they are associated with tumor aggressiveness and unfavo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nickel subsulfide (alpha Ni3S2) was administered to male Fischer-344 rats by unilateral intrarenal (i.r.) injection (20 mg per rat) to estab … marker chromosomes, polyploidy, and in one case an homogeneously staining region (HSR). Assays for gene amplification were performed with probes for murine erythropoietin (EPO) gene and H-ras, c-fos, c-myc, and N-myc oncogenes, using deoxyribonucleic acid (DNA) samples isolated from injected kidneys and renal neoplasms, as well as from the contralateral, non-inject …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования