Blood， which forms part of the systemic circulatory system， contains proteins from various tissues and organs. Hence， blood samples are idea … s is highly valuable during biomarker and drug-target development. However， efficiently enriching N-glycopeptides in biological samples before detection by mass spectrometry （MS） is difficult. This is because the highly abundant unmodified peptides result in signal suppression. Consequently， achieving deep N-glycoproteomic coverage is a key challenge， particula …
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance is a global crisis that stems from the use of antibiotics as an essential part of modern medicine. Understanding how a … de resistance to lincosamides and tylosin, respectively. We found that bmrCD promotes resistance to glycopeptides, including phleomycin and bleomycin. Promoter fusions to luciferase were used to follow expression of bmrCD, vmlR, and tlrB. Subinhibitory chloramphenicol exposure induces sliding motility of B. subtilis, wherein the three antibiotic resistance func …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to provide compelling evidence of anti-staphylococcal beta-lactam use for methicillin-susceptible Staphylococcus a … s based on the definitive therapy used: beta-lactams (n=203), including nafcillin or cefazolin; and glycopeptides (n=156), including vancomycin or teicoplanin. In the IPTW analysis, glycopeptides were associated with significantly increased odds of 28-day mortality (adjusted odds ratio, 3.37; 95% confidence interval, 1.71-6.61; p<0.001). The rate of primary out …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycopeptide enrichment is an essential prerequisite in mass spectrometry (MS)-based protein glycosylation studies, due to the low abundance of glycosylated peptides and the high complexity of biological samples, which contain substantial interference from non-glycosylated metabolites. Current enrichment strategies commonly exploit the polar interactions between glycans and hydrophilic solid-phase materials. Building on existing magnetic-core particles, we developed a series of novel magnetic materials with surfaces functionalized with dextran and amide groups. The magnetic core, composed of p
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The glycopeptide antibiotics (GPAs) remain clinical antibiotics used against drug-resistant Gram-positive infections. The discovery of GPAs continues, with new type IIa and V GPAs, the kineomicins, the rimomycins, and corbomycin, being recently identified. Despite this larger repertoire of GPA scaffolds and crosslinking types, limitations remain with the in vitro exploration of the cytochrome P450 enzymes that install the essential crosslinks between the aromatic side chain residues of GPAs. While the chemoenzymatic synthesis of the more hydrophilic type I GPAs like vancomycin has aided our un
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A member of a new family of glycopeptides, named saarvienin A, was isolated from a rare actinomycete Amycolatopsis sp. YIM10. Extensive NMR and MS analyses revealed a halogenated peptide core comprising four amino acids cyclized via a ureido linkage with an exocyclic 2-hydroxy-3-(4-hydroxyphenyl)propyl residue connected to a five-sugar/aminosugar chain. Two of the three aminosugars constitute the N-methylated and N,O-dimethylated derivatives of eremosamine (4-epi-vancosamine) that have not been reported in any natural product. Saarvienin A exhibits potent activity against a range of Gram-posit…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease and amyotrophic lateral sclerosis are characterized by progressive neuronal loss and the accumulation of misfolded proteins including amyloid proteins. Current therapeutic options include the use of antibodies for these proteins, but novel chemical strategies need to be developed. The disaccharide trehalose has been widely reported to prevent misfolding and aggregation of proteins, and we therefore investigated the conjugation of this moiety to biocompatible peptide amphiphiles (TPAs) known to undergo supramolecular polymerization. Using X
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glycopeptide antibiotic vancomycin is a bactericidal antibiotic available for the infection to Staphylococcus aureus (SA), however, SA has a strong adaptive capacity and thereby acquires resistance to vancomycin. This study aims to illuminate the possible molecular mechanism of vancomycin resistance of SA based on the 16S rRNA sequencing data and microarray profiling data.
METHODS: 16S rRNA sequencing data of control samples and urinary tract infection samples were retrieved from the EMBL-EBI (European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute) database. Cor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza is caused by a respiratory virus and has a major global impact on human health. Influenza A viruses in particular are highly pathogenic to humans and have caused multiple pandemics. An important consequence of infection is viral pneumonia, and with serious complications of excessive inflammation and tissue damage. Therefore, simultaneously reducing direct damage caused by virus infection and relieving indirect damage caused by excessive inflammation would be an effective treatment strategy. Lycium barbarum glycopeptide (LbGp) is a mixture of five highly branched polysaccharide-protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the era of antimicrobial resistance, the use of nanoconjugated antibiotics is regarded as a promising approach for preventing and fightin … istance spread in the commensal microbiota. Here, we prepared nanoformulations of the 'last-resort' glycopeptides teicoplanin and vancomycin by conjugating them to IONPs via surface functionalization with (3-aminopropyl) triethoxysilane (APTES). These superparamagnetic NP-TEICO and NP-VANCO were chemically stable and NP-TEICO (better than NP-VANCO) conserved th …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vancomycin (VAN) minimum inhibitory concentrations (MICs) at the upper end of the susceptible range for Staphylococcus aureus (S. aureus), as measured by the Etest method, have been associated with poor clinical outcomes of S. aureus bloodstream infections, as has the isolate's genetic background. Here, we assessed the impact of VAN MICs, as determined by a broth microdilution method (BMD) that incorporates incremental VAN concentrations between the conventional log2 dilutions, isolate susceptibility to killing by human phagocytes, acting as a surrogate marker for bacterial cell wall thickness
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-translational modifications of proteins can have a major role in disease initiation and progression. Incredible efforts have recently b … (WT) and transverse aortic constriction (TAC) mouse models were analyzed. We identified 291 unique glycopeptides from 195 glycoproteins; the comparative studies between WT and TAC mice indicate the overexpression of extracellular proteins for heart matrix remodeling and the down-regulation of proteins associated with energy metabolism in cardiac hypertrophy. T …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel and convenient strategy for iodine labeled glycopeptide molecular probe and purification was developed. The fluorine rich bi-functional coupling agent, 4-tris(2-perfluorohexylethyl)stannylbenzoate succinimidyl ester, was successfully synthesized via 5 steps starting from the fluorous Grignard reagent. It was purified by a simple and fast isolation using perfluorinated hexanes (FC-72). The "cold" iodine labeled yield for the coupling agent was as high as 92% within 15 min. The iodine-labeled product was only in organic fractions as we expected. It was shown that there was only one major
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A laboratory model of renal osteodystrophy was developed in rats by a single injection of glycopeptide isolated from renal cortical tissues of rats according to the method used by Shibata et al. to induce glomerulonephritis. Approximately 60-70 days after injection, severe proteinuria appeared and continued for at least 170 days at a rate of more than 1 g/day. Morphological changes in the kidney were typical of chronic glomerulonephritis. The plasma calcium concentration was lowered transiently by the 96th day after injection, but was restored to the normal range thereafter. Plasma parathyroid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N- and O-glycosylation are structurally diverse post-translational modifications that affect a range of biological functions. Glycoproteomics faces substantial challenges, particularly in the analysis of O-glycans due to their diversity compared to that of N-glycans. In addition, tandem mass spectrometry data patterns exhibit variability between different fragmentation methods. Existing de novo algorithms often lack sensitivity and are limited to sceHCD fragmentation, restricting their practical application. To address these limitations, we introduce DeepGlycan, a deep-learning-based method fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current analytical techniques are limited in their ability to interrogate the mechanistic relationship between aberrant mucin glycosylation and malignancy. Herein, we describe a method for mapping specific mucin glycoforms in diseased tissue, enabling correlation of the tumor glycan profile with malignant features. Following on-tissue digestion with mucinase StcE, matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) deduces the spatial distribution of mucinous O-glycopeptides that are subsequently identified using liquid chromatography coupled to mass spectrometry …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Antibiotic resistance presents an urgent global crisis, exacerbated by antibiotic overuse. Understanding the regulation of resis … trations of respective antibiotics. We discovered that BmrCD confers resistance to the DNA-damaging glycopeptides, phleomycin and bleomycin, revealing that resistance arising from stalled ribosomes extends beyond drugs that target translation.
IMPORTANCE: Antibiotics are a natural component of bacterial communities that are vital to modern medicine and combati …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glycoproteins are critical in various biological processes and attract lots of attention of researchers. It still remains a challenge to detect glycopeptides by mass spectrometry because of their low abundance with heterogeneity and lability, as well as signal suppression by non-glycopeptides. The boronate affinity-based enrichment is an effective solution for detecting cis-diols-containing compounds including glycopeptides in complex matrices. However, there has not been any report about absolute quantitation of boron in the absorbent materials for glycopeptides, which obstructed …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: There are no blood biomarkers to detect early-stage oral cavity squamous cell carcinoma (OSCC) prior to clinical signs. Most OSCC incidence is associated with significant morbidity and poor survival. The authors aimed to use mass-spectrometry (MS) technology to find specific N-glycopeptides potentially serving as serum biomarkers for preclinical OSCC screening.
EXPERIMENTAL DESIGN: Serum samples from 14 patients treated for OSCC (stage I or stage IV) with 12 age- and sex-matched controls are collected. Quantitative label-free N-glycoproteomics is performed, with MS/MS analysis of the…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования