Real-time fluorescence resonance energy transfer (FRET) polymerase chain reaction (PCR) supplemented with melting curve analysis is a highly sensitive and fast method offering a high throughput. We report the development of a real-time FRET PCR for molecular detection of Opisthorchis viverrini in human fecal samples. The diagnostic sensitivity, specificity, accuracy, and positive and negative predictive values of this method were 97.5%, 100%, 98.9%, 100%, and 98.2%, respectively. The sensitivity was not significantly different from that of the quantified formalin-ethyl acetate concentration te
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human plague is found in the West Nile region of Uganda and Democratic Republic of the Congo where flea vectors are often found inhabiting homes. We have developed a multiplexed, real-time polymerase chain reaction assay targeting mitochondrial genes that is capable of detecting blood meal sources in fleas collected off-host in East Africa. Laboratory tests showed that the assay is specific for the intended targets and has a detection limit below one picogram of DNA. Testing of wild-caught fleas from the Democratic Republic of Congo suggests that humans are at significant risk from flea-borne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate identification of meningococcal sudden deaths is needed to avoid underestimation of the true incidence of the disease. This study analyzed the usefulness of a real-time polymerase chain reaction (PCR) protocol using MGB (3'-minor groove binder) probes to detect Neisseria meningitidis in formalin-fixed paraffin-embedded tissues from sudden deaths where a meningococcal fulminating infection was suspected. The protocol included detection of meningococcal DNA (ctrA gene), multiplex B/C PCR serogrouping (siaD gene), and rapid confirmation of PCR products by microcapillary electrophoresis.
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Rapid detection of fetal aneuploidy helps inform a mother's choice about the course of her pregnancy. Obtaining results by fluorescent in situ hybridization (FISH) requires more than 24 h, and thus a more rapid method is needed.
METHODS: Conventional G-banding and FISH for chromosome 21 were performed for cultured amniocytes. Genomic DNA was extracted from uncultured amniocytes obtained from 23 patients. TaqMan polymerase chain reaction (PCR) primers were designed to amplify the potassium voltage gated channel gene on chromosome 21q22.12 and the ribosomal phosphoprotein gene on 18q21.1.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We studied the diagnostic yield of a real-time polymerase chain reaction assay in urine samples for the rapid diagnosis of brucella epididymo-orchitis compared to that of conventional microbiological techniques.
MATERIALS AND METHODS: We used an SYBR Green I LightCycler based real-time polymerase chain reaction to retrospectively study 10 urine samples from patients with Brucella epididymo-orchitis. The assay amplifies a 223 bp sequence of a gene that codes for the synthesis of an immunogenetic membrane protein specific for Brucella genus (BCSP31). After amplifying this 223 bp sequen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Group B streptococcal (GBS) infection remains a leading cause of neonatal sepsis. Currently, the management guidelines of neonates born to women with unknown GBS status at delivery are unclear. In this cohort, who undergo at least a 48-hour observation, a rapid method of detection of GBS colonization would allow targeted evaluation and treatment, as well as prevent delayed discharge.
OBJECTIVE: The goal of this research was to evaluate the validity of rapid fluorescent real-time polymerase chain reaction in comparison with standard culture to detect GBS colonization in infants bor
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid, simple, and reliable assays to monitor allogeneic responses are essential for the safe development of novel protocols of tailored immunosuppression. Herein, we describe a real-time polymerase chain reaction method based on interleukin-2 and interferon-gamma mRNA quantification upon stimulation of whole blood with allogeneic T cell-depleted peripheral blood mononuclear cells. The technique requires only small blood volumes and results can be obtained within 48 hours. Data obtained in a liver transplant patient receiving a tolerance induction protocol based on the infusion of donor-type h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adenoviruses are associated with a variety of diseases including upper respiratory tract infections, acute conjunctivitis, cystitis and gastroenteritis. Adenoviruses can also cause fatal disseminated infections in patients undergoing stem cell transplantation. Measurement of adenovirus load in clinical samples from localized adenovirus infections or disseminated adenovirus infections may provide important information for analyzing the pathogenesis of various adenovirus infections. The purpose of the present study was to develop and optimize a highly sensitive real-time polymerase c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fasciola hepatica is the most widely distributed trematode infection in the world. Control efforts may be hindered by the lack of diagnostic capacity especially in remote endemic areas. Polymerase chain reaction (PCR)-based methods offer high sensitivity and specificity but require expensive technology. However, the recombinase polymerase amplification (RPA) is an efficient isothermal method that eliminates the need for a thermal cycler and has a high deployment potential to resource-limited settings. We report on the characterization of RPA and PCR tests to detect Fasciola infection in clinic
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The use of the PCR to aid in the diagnosis of Pneumocystis pneumonia (PcP) has demonstrated excellent clinical performance, as evidenced through various systematic reviews and meta-analyses, yet there are concerns over the interpretation of positive results due to the potential presence of Pneumocystis colonization of the airways. While this can be overcome by applying designated positivity thresholds to PCR testing, the shear number of assays described limits the development of a universal threshold. Commercial assays provide the opportunity to overcome this problem, provided sati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microscopic methods are accepted as the gold standard in the diagnosis of malaria and in the followup of treatment. However, as the microscopical methods require experienced personnel, it is important to confirm the diagnosis with a different method for accurate diagnosis and treatment follow-up. In our study, we aimed to investigate the utility of the use of real time reverse transcriptase polymerase chain reaction (rRT-PCR), as well as microscopic methods for malaria treatment follow-up. In our study, we formed five groups each consisting of five male Balb/c mice. Each mouse was injected int
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two experiments, 1 in vitro and 1 in vivo study, were conducted to analyze probiotic species characteristics and survival in the intestine of broiler birds. The in vitro study characterized the effect of bile salt supplementation and pH on the proliferation of Lactobacillus reuteri, Pediococcus acidilactici, Bifidobacterium animalis, and Enterococcus faecium. L. reuteri and P. acidilactici growth was maximal when the media was supplemented with 1.0% bile salt, whereas B. animalis and E. faecium growth was maximal when the media was supplemented with 0.5% bile salt. Altering the pH between 2.5
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During summer and fall, enterovirus infections are responsible for a considerable proportion of hospitalizations of young infants. We prospectively studied the incidence of enterovirus infections via real-time polymerase chain reaction (PCR) in blood, feces, and cerebrospinal fluid samples from infants <or=60 days old who had received a clinical diagnosis of sepsis. Forty-five patients were included: 19 were admitted to the pediatric wards of 2 general hospitals, and 26 had been hospitalized since birth in the neonatal intensive care unit (NICU) of a tertiary care hospital. None of the NICU pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The family Phenuiviridae, part of the order Hareavirales, includes arboviruses and arthropod-associated viruses, with sandflies, mosquitoes, and ticks as primary vectors. Historically, only sandfly/mosquito-borne phenuiviruses were associated with human diseases, but the emergence of severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) has highlighted the potential of tick-borne phenuiviruses as human pathogens. Recent discoveries of new arthropod-associated viruses, some of which remain unclassified, underscore the need for sensitive detection and differentiation methods, particularly in region
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goals of this study were to monitor the growth kinetics of Salmonella Enteritidis in chicken juice using real-time polymerase chain reaction (PCR) and to evaluate its efficacy by comparing the results with an experimental database. Salmonella Enteritidis was inoculated in chicken juice samples at an initial inoculum of 104 CFU/mL with inoculated samples incubated at six different temperatures (10, 15, 20, 25, 30, and 35°C). Sampling was carried out for 36 h to observe the growth of Salmonella Enteritidis. The total DNA was extracted from the samples, and the copy number of the Salmonella i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeriosis is a foodborne disease caused by Listeria monocytogenes. The aims of this work were to develop and validate an in-house real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) for the detection of L. monocytogenes, and to determine its prevalence in raw ground beef samples from 53 butcheries that also sell ready-to-eat foods. One set of primers and one hydrolysis probe were designed for hly gene detection and then challenged with pure strains. The detection was successful for all L. monocytogenes strains analyzed and negative for all non-L. monocytogenes strains (detection limit, 10 colony fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The set of specific oligonucleotide primers and hybridization testers with the support of TaqMan in real time is proposed to identify and differentiate such human pathogenic orthopoxviruses as smallpox virus, monkey smallpox virus, cowpox virus, variolovaccine. The analytical specificity of the set is determined upon the example of 20 strains of 6 types of human pathogenic orthopoxviruses and made up 100%. The sensibility is established using recombinant plasmids containing orthopoxviruses sequence. The minimal revealed amount of plasmid made up to 20 copies for smallpox and monkey smallpox vi
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymerase chain reaction (PCR) assay has been reported for the diagnosis of cutaneous leishmaniasis (CL). Real-time (RT) PCR offers several advantages over traditional PCR, including faster processing time and decreased risk of contamination. Enhanced portability is another benefit that expands the applicability of the assay. A portable RT-PCR assay was transported from the United States to Guatemala for comparison with traditional diagnostic modalities. With the clinical diagnosis of CL as the gold standard, RT-PCR was positive in 86% (37 of 43) versus 53% (20 of 38) for microscopy and 7
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In metabolic dysfunction-associated fatty liver disease (MAFLD) research, reference genes for qPCR are crucial but often unvalidated.
METHODS: RNA-seq was performed in control and free fatty acid (FFA) treated AML12 cells, and the candidates for reference gene were selected by previous literatures and filtered by dual-index ranking via normalization of coefficient variation and Log2FoldChange in the RNA-seq library. qPCR data was further analyzed via NormFinder, BestKeeper, geNorm, ΔCt and RefFinder to assess reference gene expression stability.
RESULTS: FFA treated cells showed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования