The pathogenesis of splenic marginal zone lymphoma (SMZL) remains largely unknown. Recent high-throughput sequencing studies have identified recurrent mutations in key pathways, most notably NOTCH2 mutations in >25% of patients. These studies are based on small, heterogeneous discovery cohorts, and therefore only captured a fraction of the lesions present in the SMZL genome. To identify further novel pathogenic mutations within related biochemical pathways, we applied whole exome sequencing (WES) and copy number (CN) analysis to a biologically and clinically homogeneous cohort of seven SMZL pa…
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric adenocarcinoma is a rare diagnosis in childhood. A 14-year-old male patient presented with metastatic gastric adenocarcinoma, and a strong family history of colon cancer. Clinical sequencing of CDH1 and APC were negative. Whole exome sequencing was therefore applied to capture the majority of protein-coding regions for the identification of single-nucleotide variants, small insertion/deletions, and copy number abnormalities in the patient's germline as well as primary tumor.
MATERIALS AND METHODS: DNA was extracted from the patient's blood, primary tumor, and the unaffecte…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fatty acid hydroxylase-associated neurodegeneration due to fatty acid 2-hydroxylase deficiency presents with a wide range of phenotypes including spastic paraplegia, leukodystrophy, and/or brain iron deposition. All previously described families with this disorder were consanguineous, with homozygous mutations in the probands. We describe a 10-year-old male, from a non-consanguineous family, with progressive spastic paraplegia, dystonia, ataxia, and cognitive decline associated with a sural axonal neuropathy. The use of high-throughput sequencing techniques combined with SNP array analyses rev
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Genodermatoses are a group of monogenic inherited skin disorders characterized by marked genetic heterogeneity. Although the phenotype of many genodermatoses is readily recognizable on clinical examination, it is often insufficient to establish the precise molecular genetic etiology. Currently, the use of whole exome sequencing in pediatric dermatology is considered preferable because of its accessibility and higher diagnostic accuracy compared with targeted sequencing approaches.
METHODS: Singleton whole exome sequencing was performed in 18 children (10 boys and 8 girls) aged 1…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To systematically characterize the genetic landscape of dystonia in a Mainland Chinese cohort, where over 60% of patients currently lack a molecular diagnosis due to limited large-scale genomic studies.
METHODS: Whole-exome sequencing (WES) was performed in a cohort of 147 clinically diagnosed dystonia patients, with variants prioritized by population frequency, CADD/REVEL scores, and ACMG criteria; repeat expansion screening was also conducted to evaluate potential repeat-expansion phenocopies.
RESULTS: The overall diagnostic yield was 33.3%, with significantly higher rates in general…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we developed and deployed the blended genome exome (BGE) method, a DNA library approach that generates low-pass whole-genome (1-4× mean depth) and deep whole-exome (30-40× mean depth) data in a single sequencing run. BGE is cost-effective, empowers most genomic discoveries possible with deep whole-genome sequencing and captures global common single-nucleotide polymorphism diversity. We applied BGE to sequence >53,000 samples from the PUMAS Project (Populations Underrepresented in Mental Illness Associations Studies), including African, African American and Latin American populations. Impu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Investigating the genetic basis of adaptation to environmental stresses, such as hypoxia, can enhance our understanding of human biology and resilience. High-altitude adaptation provides a valuable model for studying the genetic mechanisms of the hypoxic response. Indeed, most known loci associated with hypoxic adaptation have been identified in indigenous mountain populations; however, research on elite climbers remains limited. In our previous study, we conducted exome sequencing of experienced mountaineers and identified two pathogenic variants in the RTEL1 and COL6A1 genes, bot…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The expanding use of whole genome sequencing (WGS) and whole exome sequencing (WES) underscores the need to better understand the psychosocial impact of receiving a broader range of potential results than those generated by other types of genetic testing. This systematic review aimed to provide a comprehensive assessment of the psychosocial impact of WGS and WES testing in adult populations. An electronic literature search was conducted to identify studies published up to July 2025. Quantitative and qualitative studies involving adult population, published in English, and examining the psychos…
СтатьяСистематический обзорОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Fetal intracranial hemorrhage (FICH) is a rare and potentially deleterious condition. Fetal alloimmune thrombocytopenia and pathogenic variations in COL4A1/A2 genes are well-recognized causes of FICH. However, pathogenic COL4A1/A2 variations are identified in only 20% of fetuses referred for FICH after excluding other known causes, leaving the majority unexplained and making genetic counseling difficult. Our main aim was to identify novel genes associated with FICH.
METHOD: Exome sequencing was performed on 113 unrelated fetuses (35 trios, 3 families and 75 probands) after negative…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The routine recommendation for detecting monogenic disease in fetuses with increased nuchal translucency remains controversial. This study aimed to evaluate the clinical significance and optimal strategy of whole-exome sequencing in fetuses with increased nuchal translucency.
STUDY DESIGN: This retrospective study included pregnancies that underwent amniocentesis due to advanced maternal age, positive screening results, or abnormal ultrasound findings between January 2018 and December 2019. Chromosomal abnormalities were diagnosed using chromosome microarray analysis. Whole-exome s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Exome sequencing (ES) and genome sequencing (GS) can improve rare disease diagnosis but are not routinely available in many jurisdictions. To inform implementation, we report on a randomized implementation effectiveness trial comparing ES and GS.
METHODS: Eligible trios were randomized to receive ES or GS in the same clinically accredited laboratory. Patient-level data on diagnostic utility and turnaround times were collected. Outcomes were compared statistically between clinically important subgroups.
RESULTS: Of 1048 patients, 68.5% had syndromic intellectual disability/developmen…
СтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bardet-Biedl syndrome (BBS, OMIM 209900) is a rare autosomal recessive disorder characterized by a broad spectrum of clinical features inclu … s with clinically diagnosed BBS were included in this study. Following informed consent, we applied exome sequencing (ES) to the proband and their parents. We next performed Sanger sequencing to validate the identified variants. ES successfully detected four known variants: two in the BBS9 gene, c.2014C > T (p.Gln672Ter) and c.1789 + 1 G > A, one varian …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Combining RNA sequencing (RNA-seq) with whole exome sequencing (WES) from a single tumor sample can substantially improve the detection of clinically relevant alterations in cancer. However, routine clinical adoption of this integrated approach remains limited, especially for RNA-seq, due to the absence of standardized validation frameworks.
METHODS: We developed and validated an assay that integrates RNA-seq and WES for evaluating gene expression, gene fusions, tumor microenvironment signatures, somatic single nucleotide variants (SNVs), insertions/deletions (INDELs), and copy nu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aims to explore the genetic anomalies (excluding aneuploidy) associated with Müllerian duct anomalies (MDA). This project is part of a large uterine transplantation (UTx) program, where women with MRKH (Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser) syndrome are the primary candidates. The potential of the hereditary nature of MDA was evaluated to facilitate appropriate genetic counseling when applicable.
METHODS: We used chromosome microarray analysis (CMA) and exome sequencing (ES) to identify genetic variations that may contribute to the phenotype of MDA. A comprehensive description o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyslexia is a specific difficulty in learning to read that affects 5-10% of school-aged children and is strongly influenced by genetic factors. While previous studies have identified common genetic variants associated with dyslexia, the role of rare variants has only recently begun to emerge from pedigree studies and has yet to be systematically tested in larger cohorts. Here, we present a whole-exome sequencing (WES) study of 53 individuals with dyslexia, followed by an analysis in 38 cases with reading difficulties and 82 controls assessed with reading measures. Of the 22 genes that had high…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To determine pathogenic variants linked to Familial Hypercholesterolemia (FH) among a southern Tunisian family using Whole Exome Sequencing (WES).
METHODS: Genomic DNA was extracted from whole blood among the index case as well as other affected and unaffected family members. Then, WES was performed only in the proband. The pathogenicity of genetic variation was assessed in a set of 13 genes reported as associated with FH using combined filtering and bioinformatics prediction tools. Finally, sanger sequencing was done to verify the probands' likely pathogenic predicted mutations and to c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since panel genetic testing has become widely available, national guidelines recommend that individuals who previously underwent BRCA1/2-only testing should undergo updated testing to include other hereditary breast and ovarian cancer predisposition genes. Our study assessed the yield of additional hereditary cancer predisposition testing in patients who previously underwent negative BRCA1/2 testing. Additionally, our study included a small pilot to evaluate whole exome sequencing in patients with a strong family history. Patients enrolled in a registry study who previously underwent negative …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is the second most common primary hepatic malignancy after hepatocellular carcinoma, with poor prognosis and limited treatment options. The genomic features of ICC in Chinese patients remain largely unknown. In this study, we perform deep whole-exome sequencing of 204 Chinese primary ICCs and characterize genomic alterations and clonal evolution, and reveal their associations with patient outcomes. We identify six mutational signatures, including Signatures A and F, which are highly similar to previously described signatures linked to aristolochic acid and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the inevitable shift in medical practice towards a deeper understanding of disease etiology and progression through multigenic analy … S) data. Herein, a retrospective study was performed to assess the diagnostic value of the clinical exome in 32 probands with specific phenotypic characteristics (patients with autoinflammation and immunological dysregulation, N = 20; patients diagnosed with Hemolytic uremic syndrome N = 9; and patients with Waldenström macroglobulinemia, N = 3). A gene …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования