Atractylodes lancea rhizomes are used as crude drugs. Essential oil compounds, including atractylodin, hinesol, β-eudesmol, and atractylon, are key determinants of crude drug quality. Conventional breeding of A. lancea is difficult because of its perennial growth. In this study, a chromosome-scale reference genome of A. lancea (4.79 Gb) was generated, and genome-wide association studies (GWAS) and genomic predictions of essential oil compounds were conducted to explore the potential for genome-assisted breeding. Genotyping of 480 lines using double-digest restriction-site-associated DNA-sequen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Highly identical segmental duplications (SDs) account for over 5% of the human genome and are enriched in the short arm of the chromosome 16. These SDs are susceptibility factors for recurrent chromosomal rearrangements mediated by non-allelic homologous recombination (NAHR). Chromosomal microarray analysis (CMA) has been widely used as the first-tier test for individuals with developmental disabilities and/or congenital anomalies and several genomic disorders involving the 16p-arm have been identified with this technique. However, the resolution of CMA and the limitations of short-reads whole
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydia trachomatis (Ct) plasmid has been shown to encode genes essential for infection. We evaluated the population structure of Ct using whole-genome sequence data (WGS). In particular, the relationship between the Ct genome, plasmid and disease was investigated.
RESULTS: WGS data from 157 Ct isolates deposited in the Chlamydiales pubMLST database ( http://pubMLST.org/chlamydiales/ ) were annotated with 902 genes including the core and accessory genome. Plasmid associated genes were annotated and a plasmid MLST scheme was defined allowing plasmid sequence types to be determine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Corynebacterium urealyticum is an opportunistic pathogen that normally lives on skin and mucous membranes in humans. This high Gram-positive bacteria can cause acute or encrusted cystitis, encrusted pyelitis, and pyelonephritis in immunocompromised patients. The bacteria is multi-drug resistant, and knowledge about the genes that contribute to its virulence is very limited. Two complete genome sequences were used in this comparative genomic study: C. urealyticum DSM 7109 and C. urealyticum DSM 7111.
RESULTS: We used comparative genomics strategies to compare the two strains, DSM 7…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Smithella are repeatedly implicated as primary alkane activators in methanogenic hydrocarbon-degrading communities, yet the propionate-oxidizing type species and many relatives cannot activate alkanes, and the genus's diversity and functional differentiation remain poorly resolved. Here, we present genus-scale comparative genomics of Smithella across 108 Smithellaceae metagenome-assembled genomes from three genera. The 74 Smithella genomes resolve into 23 species, 15 of them unnamed. Alkylsuccinate synthase occurs as two paralogous families, A and B. They differ by a third of their residues an…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Pleurotus comprises economically important edible fungi with diverse ecological adaptations, yet the molecular basis of their functional diversity remains unclear. Comparative genomics of three Pleurotus species (Pleurotus ostreatus, Pleurotus citrinopileatus, Pleurotus salmoneostramineus) revealed species-specific gene expansions: reproduction/cell cycle in P. ostreatus, secondary metabolism in P. citrinopileatus, and amino acid/protein metabolism in P. salmoneostramineus. Laccase genes varied markedly in number and sequence, whereas chitin synthases were more conserved. Autophagy-r…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Nasopharyngeal angiofibroma (NA) is generally benign, but recurrent disease and rare malignant transformation remain clinically relevant beyond adolescence. We examined adult clinical presentations, records of malignant transformation, and age-related differences in stage distribution.
METHODS: We retrospectively reviewed 289 surgically treated patients from January 2006 through June 2026. Radkowski stage distributions were compared between patients aged > 30 and ≤30 years using exact tests. Detailed clinical records were reviewed for 16 adults, and whole-genome sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing sustainable genomics capacity in the Global South requires more than technology transfer; it depends on human-centered approaches based on the workflows and existing expertise of laboratory personnel, institutional collaboration, and long-term integration into health systems. Drawing on lessons learned from regional capacity-building initiatives, this article proposes ten simple rules for implementing and sustaining genomics capacity within public health and clinical laboratory settings. These rules emphasize local context, strategic planning, continuous learning, and equitable coll…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed inducible dead Cas12a (dCas12a)-based CRISPR interference/activation (CRISPRi/a) systems for Plasmodium falciparum, expanding the gene regulation toolkit beyond dCas9. Our previous systems fused dCas9 to the catalytic domains of PfSir2a or PfGCN5 under DiCre/loxP regulon, enabling conditional gene regulation but remaining constrained by Cas9's NGG protospacer adjacent motif (PAM) requirement. Unlike dCas9, dCas12a recognizes T-rich PAMs and processes a single transcript into multiple sgRNAs via its RNase activity, allowing multiplexed regulation of one or multiple genes. Functiona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advent of high-throughput technologies has accelerated biomedical research by facilitating the investigation of biological complexity at … tion available within these constraints. Overall, scVAR bridges the gap between transcriptomics and genomics, providing a broadly applicable platform for the integrative characterization of cell states and disease processes.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myeloid leukemia (AML) is a clinically and genetically heterogeneous malignancy characterized by a differentiation block i … SUMMARY: This review summarizes recent advances in phenotypic screening and CRISPR-based functional genomics that have contributed to the discovery of novel differentiation-inducing strategies in AML. High-throughput phenotypic screening approaches using compound libraries, computational tools, and integrative transcriptomic analyses have identified severa …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thermophilic microorganisms, such as those inhabiting hydrothermal environments, play key roles in carbon monoxide (CO) metabolism, thereby influencing global carbon cycling. Members of the genera Thermincola and Carboxydocella are capable of CO oxidation via the water-gas shift reaction, generating H2, but comprise only two and three validly described species, respectively. In this study, we report the isolation of two novel bacterial strains: strain AZ34E, affiliated with Thermincola, and strain AZ29I, affiliated with Carboxydocella. Comparative genomic and phylogenetic analyses revealed tha
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background:Stenotrophomonas maltophilia is an increasingly important multidrug-resistant opportunistic pathogen frequently isolated from cli … Prokka, and compared using average nucleotide identity (ANI), pan-genome analysis, core-genome phylogenomics, and functional annotation. AMR genes, mobile genetic elements (MGEs), and metadata (source, host, and geographic origin) were integrated to assess lineage-specific genomic features and ecological distributions. Results: ANI-based clustering resolve …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chitin is the second most abundant polysaccharide and can serve as a carbon and nitrogen source for microorganisms in various ecosystems, including hypersaline environments. However, chitin metabolism in extremely halophilic archaea of the class Halobacteria has not been systematically analyzed, and the pathways of N-acetylglucosamine (GlcNAc) utilization in these organisms remain poorly understood. In this study, we performed a large-scale comparative genomic analysis of the class Halobacteria to assess prevalence and organization of genes, presumably involved in chitin utilization. Potential
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric neurological disorders comprise a highly heterogeneous group of conditions that together represent a substantial global public hea … al presentations that differ from classical adult neurological phenotypes. Advances in genetics and genomics have fundamentally transformed the understanding, diagnosis, and classification of pediatric neurological diseases. The widespread use of high-throughput sequencing, genome-wide association studies, and integrative bioinformatics approaches has enab …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder (ASD) risk genes converge on synaptic and developmental regulatory biology, but it remains unclear whether fixed risk-gene sets retain the same functional meaning across prenatal and adult cortical contexts. We analyzed predefined ASD risk-gene sets across BrainSpan developmental transcriptomics, three adult cortical bulk cohorts, fetal and adult single-cell resources, composition-aware bulk models, SynGO and Reactome annotations, matched-random controls, correlation-aware gene-set tests, and STRING physical-interaction networks. The broad SFARI gene set showed the str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell transcriptomics is valuable for uncovering individual cell properties, particularly in heterogeneous systems. However, this technique often results in the reanalysis of many well-characterized cells, increasing costs and diluting rare cell populations. To address this, we develop PIP-seq for Rare-cell Enrichment and Sequencing (PURE-seq). PURE-seq allows direct FACS sorting of cells into PIP-seq reactions, minimizing handling and reducing cell loss. PURE-seq reliably sequences ultrarare cells, with 1 hour of sorting capturing tens of target cells at a rarity of 1 in 1,000,000. Leve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic non-communicable diseases (NCDs), including cardiovascular disease, type 2 diabetes, obesity, and metabolic syndrome, account for more than 70% of global mortality and impose a disproportionate burden on low- and middle-income countries. Traditional, population-level dietary guidelines often fail to address population-level dietary guidelines often fail to account for the considerable inter-individual variability in metabolic responses to food. Personalized nutrition (PN), informed by genomics, metabolomics, gut microbiome composition, and behavioral factors, has emerged as an effectiv…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWASs) have uncovered many associations for human complex diseases, but functional dissection of the discovered loci has lagged behind. We present a variant-to-gene (V2G) mapping effort for Alzheimer disease (AD) leveraging the most recent AD GWAS meta-analyses. In this study, we integrated ten brain-relevant genomics datasets-including promoter Capture C, ATAC-seq, and RNA-seq from microglia, neurons, and astrocytes-to fine-map AD GWAS variants and identify effector genes. We then performed a single-cell CRISPRi Perturb-seq screen targeting 74 candidate regula…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования