Celiac sprue, also known as gluten-sensitive enteropathy, is a chronic disease suffered by approximately 1% of the world's population. Engineered enzymes have been emerging to treat celiac disease by hydrolyzing the pathogenic peptides of gluten. For example, Kuma010 has been studied experimentally and proved to be a promising gluten hydrolase under gastric conditions. However, the detailed catalytic mechanism and the substrate specificity are still unclear. In this paper, quantum-mechanical/molecular-mechanical (QM/MM) molecular dynamics (MD) and free energy simulations were performed to dete
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitroxyl (HNO) is a species that has been proposed recently to play different roles in nitrosative stress processes. HNO decomposition in aqueous solution leading to N2O is a fast reaction that competes with many biochemical reactions in which HNO may be involved. Since molecular determinants of this reaction are still not fully understood, we present in this work an exhaustive analysis of the mechanism in terms of electronic-structure calculations as well as state of the art hybrid quantum mechanics/molecular mechanics molecular dynamics simulations. We characterized the reaction mechanism an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure, vibrational and (1)H and (13)C NMR spectra of the local anesthetic drug lidocaine were investigated by the B3LYP/6-311G(∗∗) calculations. The molecule was predicted to have the non-planar cis (NCCN∼0°) structures being about 2-6kcal/mol lower in energy than the corresponding trans (NCCN∼180°) forms. The calculated NCCN (9.6°) and CNCC (-132.2°) torsional angles were in a good qualitative agreement with the reported X-ray angles (3.1 and 13.0°, -102.67 and -77.9°, respectively, for H-bonded dimers). The Gibbs energy of solution of lidocaine in formamide, water, dimethylsulfoxide,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two mid-IR transparency compounds, namely, acentric BaHgS2 (BHS) and centric Ba8Hg4S5Se7 (BHSSe), were successfully synthesized by a conventional solid-state reaction method. The space group of BHS is orthorhombic Pmc21 with [HgS4] tetrahedra and isolated dumbbell-shaped [HgS2] units, while BHSSe belongs to the orthorhombic space group Pnma with infinite isolated ∞[HgSe2(S/Se)2](4-) chains. Raman spectra and thermal analysis of the titled materials were measured. In addition, their band gaps are found to be 1.93 (BHS) and 1.98 eV (BHSSe) from the measured diffuse reflectance spectra. Significa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photosynthesis is responsible for the sunlight-powered conversion of carbon dioxide and water into chemical energy in the form of carbohydrates and the release of O2 as a by-product. Although many proteins are involved in photosynthesis, the fascinating machinery of Photosystem II (PSII) is at the heart of this process. This tutorial review describes an emerging technique named protein film photoelectrochemistry (PF-PEC), which allows for the light-dependent activity of PSII adsorbed onto an electrode surface to be studied. The technique is straightforward to use, does not require highly speci
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aminophosphine ligand (2-aminoethyl)diphenylphosphine (edpp) has been coordinated to the W3(μ-S)(μ-S)3 cluster unit to afford trimetallic complex [W3S4Br3(edpp)3](+) (1(+)) in a one-step synthesis process with high yields. Related [W3S4X3(edpp)3](+) clusters (X = F(-), Cl(-), NCS(-); 2(+)-4(+)) have been isolated by treating 1(+) with the corresponding halide or pseudohalide salt. The structure of complexes 1(+) to 4(+) contains an incomplete W3S4 cubane-type cluster unit, and only one of the possible isomers is formed: the one with the phosphorus atoms trans to the capping sulfur and the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of BrHgY compounds (Y = NO2, ClO, BrO, HOO, etc.) are expected to be formed in the Br-initiated oxidation of Hg(0) to Hg(II) in the atmosphere. These BrHgY compounds have not yet been reported in any experiment. This article investigates the potential to use proton-transfer reaction mass spectrometry (PTRMS) to detect these atmospherically important species. We show that reaction of the standard PTRMS reagent (H3O(+)) with BrHgY leads to stable parent (M + 1) ions, BrHgYH(+), for most of these radicals, Y. Rate constants for the proton transfer reaction H3O(+) + BrHgY are computed usi
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study outlines the development of a series of quantitative mechanistic models enabling skin sensitization potency in the LLNA to be predicted for direct acting Michael acceptors. These models utilized several computational descriptors based on knowledge of the Michael addition reaction mechanism. The key descriptor was calculated using density functional theory and modeled the stability of the reaction intermediate. A second descriptor relating to the available surface area at the site of the reaction was also found to be important. Several poorly predicted compounds were identified, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The crystal structures of two novel carborane-sulfamide inhibitors in the complex with human carbonic anhydrase II (hCAII) have been studied using QM/MM calculations. Even though both complexes possess the strongly interacting sulfamide···zinc ion motif, the calculations have revealed the different nature of binding of the carborane parts of the inhibitors. The neutral closo-carborane cage was bound to hCAII mainly via dispersion interactions and formed only very weak dihydrogen bonds. On the contrary, the monoanionic nido cage interacted with the protein mainly via electrostatic interactions.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amine-based diazeniumdiolates (NONOates) have garnered widespread use as nitric oxide (NO) donors, and their potential for nitroxyl (HNO) release has more recently been realized. While NO release rates can vary significantly with the type of amine, half-lives of seconds to days under physiological conditions, there is as yet no way to determine a priori the NO or HNO production rates of a given species, and no discernible trends have manifested other than that secondary amines produce only NO (i.e., no HNO). As a step to understanding these complex systems, here we describe a procedure for mod
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A chiral oxazoline-based organocatalyst has been found to efficiently catalyze asymmetric Strecker reactions of various aromatic and aliphatic N-benzhydrylimines with trimethylsilyl cyanide (TMSCN) as a cyanide source at -20 °C to give α-aminonitriles in high yield (96 %) with excellent chiral induction (up to 98 % ee). DFT calculations have been performed to rationalize the enantioselective formation of the product with the organocatalyst in these reactions. The organocatalyst has been characterized by single-crystal X-ray diffraction analysis, as well as by other analytical methods. This pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular modeling methods are used to estimate the influence of impurity species: water, O(2), and SO(2) in flue gas mixtures present in postcombustion CO(2) capture using a metal organic framework, HKUST-1, as a model sorbent material. Coordinated and uncoordinated water effects on CO(2) capture are analyzed. Increase of CO(2) adsorption is observed for both cases, which can be attributed to the enhanced binding energy between CO(2) and HKUST-1 due to the introduction of a small amount of water. Density functional theory calculations indicate that the binding energy between CO(2) and HKUST-1
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Density functional theory (DFT) calculations were used to study the mechanism for the cleavage reaction of the RNA analogue HpPNP (HpPNP = 2-hydroxypropyl-4-nitrophenyl phosphate) catalyzed by the dinuclear Zn(II) complex of 1,3-bis(1,4,7-triazacyclonon-1-yl)-2-hydroxypropane (Zn(2)(L(2)O)). We present a binding mode in which each terminal phosphoryl oxygen atom binds to one zinc center, respectively, and the nucleophilic 2-hydroxypropyl group coordinates to one of the zinc ions, while the hydroxide from deprotonation of a water molecule coordinates to the other zinc ion. Our calculations foun
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The stability, geometry and electronic structure of the title nanoclusters were compared by using density functional theory (DFT) calculations. Their electrical property analysis showed that the relative magnitude of the HOMO-LUMO gaps (eV) that are average values from the calculated results with five different DFT functionals is as follows: B12N12(7:02)>>Al12N12(4.09)>B12P12(3.80)>Al12P12(3.39). Computing the standard enthalpy and the Gibbs free energy of formation, it was found that the B(12)N(12) structure is thermodynamically stable at 298 K and 1 atmosphere of pressure, while the Al(12)N(
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experimental as well as theoretical studies have been carried out with the aim of elucidating the mechanism of the atom transfer radical addition (ATRA) of styrene and carbon tetrachloride with a Tp(x)Cu(NCMe) complex as the catalyst precursor (Tp(x) = hydrotrispyrazolyl-borate ligand). The studies shown herein demonstrate the effect of different variables in the kinetic behavior. A mechanistic proposal consistent with theoretical and experimental data is presented.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vibrational dynamics of (μ-propanedithiolate)Fe(2)(CO)(4)(CN)(2)(2-), a model compound of the active site of the [FeFe]-hydrogenase enzyme, have been examined via ultrafast 2D-IR spectroscopy. The results indicate that the vibrational coupling between the stretching modes of the CO and CN ligands is small and restricted to certain modes but the slow growth of off-diagonal peaks is assigned to population transfer processes occurring between these modes on timescales of 30-40 ps. Analysis of the dynamics in concert with anharmonic density functional theory simulations shows that the presence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of ab initio calculations are used to determine the C--Hpi and pipi-stacking interactions of aromatic rings coordinated to transition-metal centres. Two model complexes have been employed, namely, ferrocene and chromium benzene tricarbonyl. Benchmark data obtained from extrapolation of MP2 energies to the basis set limit, coupled with CCSD(T) correction, indicate that coordinated aromatic rings are slightly weaker hydrogen-bond acceptors but are significantly stronger hydrogen-bond donors than uncomplexed rings. It is found that pipi stacking to a second benzene is stronger than in th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum chemical calculations are reported to provide new insights on plausible mechanisms leading to the deamidation of asparagine residues in proteins and peptides. Direct hydrolysis to aspartic acid and several succinimide-mediated mechanisms have been described. The catalytic effect of water molecules has been explicitly analyzed. Calculations have been carried out at the density functional level (B3LYP/6-31+G**). Comparisons of free energy profiles show that the most favorable reaction mechanism goes through formation of a succinimide intermediate and involves tautomerization of the aspar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The three square planar complexes [N(n-Bu)(4)](2)[Cr(II)L(2)] x 4 CH(3)CN (S = 2; 1), [N(n-Bu)(4)][Co(III)L(2)] (S = 1; 3), and [N(n-Bu)(4)](2)[Rh(II)L(2)] x 4 CH(3)CN (S = 1/2; 4) have been prepared and structurally characterized by X-ray crystallography (L(2-) represents the 3,6-bis(trimethylsilyl)benzene-1,2-dithiolate(2-)). Aerial oxidation of CH(2)Cl(2) solutions of 1 produced purple crystals of [N(n-Bu)(4)][Cr(V)OL(2)] x 2 CH(2)Cl(2) (S = 1/2; 2), the structure of which has also been determined by X-ray crystallography. The electro- and magnetochemistry of all species has been studied. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphorus is one of the predominant impurities in the Hall-Heroult process for industrial aluminium production. The nature of the dissolved phosphorus species in the Na(3)AlF(6)-AlPO(4) system has been investigated by in situ high-temperature (HT) (19)F, (23)Na, (27)Al, (17)O, and (31)P NMR. The combination of these experiments enables to define the presence of PO(4)(3-), AlF(5)(2-) and (AlF(4)-O-PO(3))(4-) anions in the melt, and then the formation of Al-O-P bonding. Melts solidified at different cooling rates were characterised using various solid-state NMR techniques including multiple qua
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования