Hereditary spastic paraplegia (HSP) is a clinically and genetically heterogeneous group of disorders characterized by insidiously progressive spastic weakness in the legs. Genetic loci for autosomal dominant HSP exist on chromosomes 2p, 14q, and 15q. These loci are excluded in 45% of autosomal dominant HSP kindreds, indicating the presence of additional loci for autosomal dominant HSP. We analyzed a Caucasian kindred with autosomal dominant HSP and identified tight linkage between the disorder and microsatellite markers on chromosome 8q (maximum two-point LOD score 5.51 at recombination fracti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia-telangiectasia (A-T) is a pleiotropic inherited disease characterized by neurodegeneration, cancer, immunodeficiencies, radiation sensitivity, and genetic instability. Although A-T homozygotes are rare, the A-T gene may play a role in sporadic breast cancer and leukemia. ATM, the gene responsible for A-T, is homologous to several cell cycle checkpoint genes from other organisms. ATM is thought to play a crucial role in a signal transduction network that modulates cell cycle checkpoints, genetic recombination, apoptosis, and other cellular responses to DNA damage. New insights into the p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meckel syndrome (MKS) is a rare autosomal recessive lethal condition of unknown origin, characterized by (i) an occipital meningo-encephalocele with (ii) enlarged kidneys, with multicystic dysplasia and fibrotic changes in the portal area of the liver and with ductal proliferation, and (iii) postaxial polydactyly. A gene responsible for MKS in Finland has been mapped to chromosome 17q21-q24. Studying a subset of Middle Eastern and northern African MKS families, we have recently excluded the chromosome 17 region and have suggested a genetic heterogeneity. In the present study, we report on the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scrub typhus is a notable zoonosis, yet natural host-associated pathogen prevalence and genotypic diversity remain underexplored. A total of 261 small mammals comprising rodents and shrews captured in Uttar Pradesh, India, were screened for Orientia tsutsugamushi (OT) using nested PCR. The sample included Rattus rattus (n = 28), Rattus norvegicus (n = 42), Rattus tanezumi (n = 42), Bandicota bengalensis (n = 10), Mus musculus (n = 15), and Suncus murinus (n = 124). The overall molecular prevalence was 11.9% (95% CI: 8.2-16.4) with detection rates of 13.1% in rodents and 12.1% in shrews. Preval
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: SXT is an integrating conjugative element (ICE) originally isolated from Vibrio cholerae, the bacterial pathogen that causes cholera. It houses multiple antibiotic and heavy metal resistance genes on its ca. 100 kb circular double stranded DNA (dsDNA) genome, and functions as an effective vehicle for the horizontal transfer of resistance genes within susceptible bacterial populations. Here, we characterize the activities of an alkaline exonuclease (S066, SXT-Exo) and single strand annealing protein (S065, SXT-Bet) encoded on the SXT genetic element, which share significant sequence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gonorrhea is a major sexually transmitted disease (STD) in many countries worldwide. The emergence of fluoroquinolone resistance has complicated efforts to control and treat this disease. We report the first study of the evolutionary processes acting on transmission dynamics of a resistant gonococcal population from Shanghai, China. We compare these findings with our previous study of the evolution of a fluoroquinolone sensitive gonococcal population from Baltimore, MD.
METHODS: Ninety six gonococcal samples were collected from male patients in Shanghai, China. All samples were fl
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The zoonotic pathogen Toxoplasma gondii exhibits a diverse global population structure, with a few dominant lineages primarily in the Northern Hemisphere. However, reliance on low-resolution, restriction-based genotyping methods has created a "resolution ceiling," potentially masking hidden genetic diversity and complex transmission dynamics.
METHODS: In this study, we combined conventional PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) screening with high-resolution Sanger sequencing targeting 16 genetic markers to unravel the fine-scale epidemiology of 96 T. gondii DNA samp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Geographic isolation, natural selection, and demographic history interact to shape genomic divergence, yet their combined effects in island endemics remain poorly understood. We investigated the continental Euptelea pleiosperma and the island endemic E. polyandra using whole-genome resequencing of 119 and 50 individuals, respectively, providing a direct comparison of evolutionary outcomes under contrasting demographic and environmental contexts. The two species diverged in the Late Miocene (~6.4 Ma), broadly coinciding with the separation of the Japanese Archipelago. Genome-wide divergence exh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus-A (CV-A) is a causative agent of Hand Foot Mouth Disease (HFMD) worldwide. It belongs to the Human Enterovirus genus of the family Picornaviridae. The genomics data availability of CV-A samples, isolated from human host across different continental regions, provide an excellent opportunity to study its genetic composition, diversity, and evolutionary events. The complete genome sequences of 424 CV-A isolates were analyzed through a model-based population genetic approach implemented in the STRUCTURE program. Twelve genetically distinct sub-populations were identified for CV-A is
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sexual reproduction shuffles genetic variation, potentially enhancing the evolutionary response to environmental change. Many asexual organisms respond to stress by generating facultative sexual reproduction, presumably as a means of escaping the trap of low genetic diversity. Self-fertilizing organisms are subject to similar genetic limitations: the consistent loss of genetic diversity within lineages restricts the production of variation through recombination. Selfing organisms may therefore benefit from a similar shift in mating strategy during periods of stress. We determined the effects o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wheat yellow rust, caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici (PST), is one of the most important wind-borne diseases in all wheat-growing regions, and its occurrence can lead to devastating yield losses in wheat. In China, the wheat fields in Gansu act as an inoculum reservoir during summer periods and provide PST spores for wheat in the fall. The wheat fields in Qinghai provide large amounts of oversummering inocula. The exchange and migration of spores between the two regions are essential to ensure the persistence of PST. To confirm this relationship, we studied the genetic diversity, s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination deficiency (HRD) resulting from inactivation of BRCA1/2 genes promotes chromosomal instability and renders tumor cells susceptible to platinum derivatives and PARP inhibitors (PARPi). The contribution of alterations in other homologous recombination repair (HRR) genes to HRD remains understudied. This investigation aimed to analyze the spectrum of mutations in 34 HRR genes in prostate carcinomas (PCs) and study the relationship between HRR status and HRD. HRR mutations and HRD scores were examined by NGS in 1131 and 680 PCs, respectively. Pathogenic or likely pathogeni
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Norovirus (NoV) is the leading pathogen responsible for global acute gastroenteritis (AGE) outbreaks and sporadic cases. NoV evolves through gene mutation and recombination, leading to the emergence of new strains capable of causing global epidemics. This study aimed to learn the epidemiological characteristics of 39 GI.6[P11] NoV outbreaks in Beijing, China, from 2016 to 2019 and to analyze the genetic diversity and phylogenetic process of GI.6[P11] strains. The Bayesian phylogenetic analysis of partial VP1 and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) genes showed that GI.6[P11] strains were clust
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
EV-A120 is a recently identified serotype of the enterovirus A species. Only one full-length genomic sequence is currently available in GenBank, and very few studies have been conducted on EV-A120 globally. Thus, additional information and research on EV-A120 are needed to explore its genetic characteristics, phylogeny, and relationship with enteroviral disease. In this study, we report the phylogenetic characteristics of a EV-A120 strain (Q0082/XZ/CHN/2000) from Tibet, China. The amino acid sequence similarity and nucleotide sequence similarity of the full-length genomic sequence of this EV-A
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system induces site-specific double-strand breaks, which stimulate cellular DNA repair through either the homologous recombination or non-homologous end-joining pathways. The non-homologous end-joining pathway, which is activated more frequently than homologous recombination, is prone to introducing small insertions and/or deletions at the double-strand break site, leading to changes in the reading frame. We hypothesized that the non-homologous end-joining pathway is applicable to genetic diseases caused by a frameshif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposases are ubiquitous mobile genetic elements responsible for genome development, driving rearrangements, such as insertions, deletions and translocations. Across species evolution, some transposases are tamed by their host and are made part of complex cellular systems. The proliferation of retroviruses is also dependent on transposase related enzymes termed integrases. Recombination‑activating gene protein (RAG)1 and metnase are just two examples of transposase domestication and together with retroviral integrases (INs), they belong to the DDE polynucleotidyl transferases superfamily. T
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-Wide Association Studies (GWAS) in microbial organisms have the potential to vastly improve the way we understand, manage, and treat infectious diseases. Yet, microbial GWAS methods established thus far remain insufficiently able to capitalise on the growing wealth of bacterial and viral genetic sequence data. Facing clonal population structure and homologous recombination, existing GWAS methods struggle to achieve both the precision necessary to reject spurious findings and the power required to detect associations in microbes. In this paper, we introduce a novel phylogenetic approach
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molluscum contagiosum virus (MCV) is the sole member of the Molluscipoxvirus genus and the causative agent of molluscum contagiosum (MC), a common skin disease. Although it is an important and frequent human pathogen, its genetic landscape and evolutionary history remain largely unknown. In this study, ten novel complete MCV genome sequences of the two most common MCV genotypes were determined (five MCV1 and five MCV2 sequences) and analyzed together with all MCV complete genomes previously deposited in freely accessible sequence repositories (four MCV1 and a single MCV2). In comparison to MCV
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A2 (CV-A2) has been frequently detected and commonly associated with hand, foot, and mouth disease (HFMD) in China since 2008. However, limited sequences of CV-A2 are currently available. As a result, we have been focusing on the genetic characteristics of CV-A2 in the mainland of China during 2008-2015 based on national HFMD surveillance. In this study, 20 CV-A2 strains were isolated and phylogenetic analyses of the VP1 sequences were performed. Full-length genome sequences of two representative CV-A2 isolates were acquired and similarity plot and bootscanning analyses were per
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activation-induced deaminase (AID), a member of the AID/apolipoprotein B mRNA-editing enzyme-catalytic (APOBEC) family, deaminates DNA cytidines into uridines and is the major trans-acting player of immunoglobulin (Ig) genes' diversification in mature B lymphocytes. It allows multiple antigen-driven Ig modifications through gene conversion and/or somatic hypermutation of variable region genes and also permits to switch from IgM expression to other antibody classes after class switch recombination, or to stop Ig expression after locus suicide recombination. AID is expressed at high levels into
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.