BACKGROUND: Schistosomiasis is a major parasitic disease affecting over 200 million people in the developing world with a further 400 million people at risk of infection. The aim of this study was to identify a single antigen from adult Schistosoma haematobium worms and subsequently use this antigen to study the development of schistosome-acquired immunity in a human population.
METHODS: The full-length cDNA sequence of a S. haematobium protein, a putative orthologue of the S. mansoni tegumental antigen Sm13, was obtained from a cDNA library of adult S. haematobium worms and named Sh13 follow
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Red blood cell (RBC) protein 4.2 deficiency is often associated with a moderate nonimmune hemolytic anemia, splenomegaly, and osmotically fragile RBCs resembling, but not identical to, hereditary spherocytosis (HS). In the Japanese type of protein 4.2 deficiency (protein 4.2Nippon), the anemia is associated with a point mutation in the protein 4.2 cDNA. In this report, we describe a patient with moderate and apparently episodic nonimmune hemolytic anemia with splenomegaly, spherocytosis, osmotically fragile RBCs, reduced whole cell deformability, and abnormally dense cells. Sodium dodecyl sulf
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small acid-soluble proteins (SASPs) are located in the core region of Bacillus spores and have been previously demonstrated as reliable biomarkers for differentiating Bacillus anthracis and Bacillus cereus. Using MS and MS-MS analysis of SASPs further phylogenetic correlations among B. anthracis and B. cereus strains are described here. ESI was demonstrated to be a more comprehensive method, allowing for the analysis of intact proteins in both MS and MS-MS mode, thus providing molecular weight (MW) and sequence information in a single analysis, and requiring almost no sample preparation. MALDI
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: This study reports an initial analysis of an EBV-infected B cell line (TCC36B), established from an urothelial carcinoma (UC) lesion of the renal pelvis.
MATERIALS AND METHODS: Cytofluorometric and G-banding analyses were performed for phenotyping and cytogenetics. PCR was used to detect EBV DNA, and sequence analysis to investigate mutations and deletions of the latent membrane protein (LMP)-1 gene of EBV.
RESULTS: TCC36B cells proliferated in vitro and showed positivity for surface CD19, CD20, HLA-DR and IgG(λ), indicating that they belong to B-cells. Cytogenetic analysis showe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying recurrent changes in biological sequences is important to multiple aspects of biological research-from understanding the molecular basis of convergent phenotypes, to pinpointing the causative sequence changes that give rise to antibiotic resistance and disease. Here, we present RECUR, a method for identifying recurrent amino acid substitutions from multiple sequence alignments that is fast, easy to use, and scalable to thousands of sequences. We demonstrate that RECUR's recurrence detection achieves 100% accuracy on simulated data with known evolutionary histories. We further show
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Birnaviridae have a wide host range and can infect a variety of fish, causing significant economic losses to the aquaculture industry. Herein, we analyzed the amino acid sequence conservation and antigenic epitope distribution of the VP2 protein to evaluate its suitability as a vaccine antigen, and subsequently developed a full-length VP2-based DNA vaccine to prevent the virus. In detail, bioinformatics analyses revealed that VP2 is highly conserved and contains abundant predicted B-cell and T-cell epitopes. Variation analysis of the VP2 amino acid sequence showed that the homology of VP2 prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most of somatic mutations in cancer occur outside of gene coding regions. These mutations may disrupt the gene regulation by affecting protein-DNA interaction. A study of these disruptions is important in understanding tumorigenesis. However, current computational tools process DNA sequence variants individually, when predicting the effect on protein-DNA binding. Thus, it is a daunting task to identify functional regulatory disturbances among thousands of mutations in a patient. Previously, we have reported and validated a pipeline for identifying functional non-coding somatic mutations in can
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Были изучены штаммы кори от двух случаев склерозного панэнцефалита (SSPE), диагностированных в 1977 году (деформация легких) и в 2007 году (трясение подопытных). Филогенетический анализ, основанный на С-терминальной части нуклеопротеина и всего гена H, показал, что штамм Hoedts, циркулирующий во Франции предположительно в 1980-х годах, принадлежал генотипу C2. Однако штамм Лейна, который предположительно распространился в период с 1940-х по 1960-е годы, не может быть присвоен каким-либо известным генотипам кори. Анализ последовательности штамма Лейна показал, что он возник из вируса кори, кото
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A congenital cataract present in guinea pigs provided a unique opportunity to study a hereditary lens disease at the molecular level. zeta-Crystallin, one of the most abundant guinea pig lens proteins, was found to be altered in the lens of cataractous animals. Several zeta-crystallin cDNA clones were isolated from a cataractous lens library and found to contain a 102-bp deletion towards the 3' end of the coding region. This deletion does not interfere with the reading frame but results in a protein 34 amino acids shorter. Sequence analysis of a normal genomic zeta-crystallin clone revealed th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thirty-three esophageal tumors were analyzed by immunohistochemistry for P53 nuclear protein accumulation, and the results were compared to p53 gene mutations by PCR-direct sequence analysis. A highly significant correlation between the presence of p53 mutations and p53 nuclear protein accumulation was found. Of 33 tumors, 23 (69.7%) that demonstrated P53 protein expression 12(36%) had p53 mutations. Of 12 tumors with p53 mutations, 9 tumors showed P53 intensive nuclear reactivity. The results reported here are consistent with the idea that p53 mutations may be an important biological event in
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein 4.1 is a major component of the junctional complex at the red cell skeleton. Genomic studies have recently evidenced that the encoding gene (EL1 locus) is present in a single copy per haploid genome. Several RFLPs have already been characterized within intron sequences. Here, we describe the first RFLP found within the coding sequence. This polymorphism (C or T at position 2723, in exon 21) does not affect the amino acid sequence (Thr-->Thr). It can be detected by either Dde I restriction digestion of an appropriate PCR product, or simply by SSCP These findings should facilitate analys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two novel genes encoding the serine proteinases, subtilisin (AaSP1) and trypsin (AaSP2), from Aphanomyces astaci were identified. Based on the amino acidconsensus sequences around the catalytic triad of these serine proteinases, degenerated oligonucleotides were designed for isolation of serine proteinase genes from a genomic DNA library. The AaSP1 gene encodes a full-length protein of 515 amino acids as a large precursor of 56 kDa. After cleavage of a predicted leader sequence of 18 residues and a prepeptide of 133 amino acids, the mature enzyme of 364 amino acids is generated with a calculat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasmas are cell wall-less bacteria that evolved by drastic reduction of the genome size. Complete genome analysis of Mycoplasma pneumoniae revealed the presence of numerous copies of four distinct large M. pneumoniae repetitive elements (RepMPs). One copy each of RepMP2/3, RepMP4, and RepMP5 are localized within the P1 operon (MPN140 to MPN142 loci), and their involvement in sequence variation in adhesin P1 and adherence-related protein B/C has been documented. Here we analyzed a clinical strain of M. pneumoniae designated S1 isolated from a 1993 outbreak of respiratory infections in San
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antileukoproteinase (ALP) is a low mol wt mucosal secretory protein which, in human tissues, inhibits the activities of the neutral serine lysosomal proteinases elastase and cathepsin-G. In this study a number of recombinant cDNA clones corresponding to porcine ALP (pALP) were isolated from a cDNA library prepared from porcine endometrial poly(A)+ RNAs. The combined nucleotide sequences of the cDNA clones, representing the entire pALP mRNA sequence, are approximately 600 nucleotides long and encode a protein of 114 amino acids. The deduced amino acid sequence of pALP is 68% similar in primary
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transferrins play a major role in iron homeostasis and metabolism. In vertebrates, these proteins are synthesised in the liver and dispersed within the organism by the bloodstream. In oviparous vertebrates additional expression is observed in the oviduct and the synthesised protein is deposited in egg white as ovotransferrin. Most research on ovotransferrin has been performed on the chicken protein. There is a limited amount of information on other bird transferrins, and until our previous paper on red-eared turtle protein there was no data on the isolation, sequencing and biochemical properti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidium spp. are important diarrhea-associated pathogens in humans and livestock. Among the known species, Cryptosporidium xiaoi, which causes cryptosporidiosis in sheep and goats, was previously recognized as a genotype of the bovine-specific Cryptosporidium bovis based on their high sequence identity in the ssrRNA gene. However, the lack of genomic data has limited characterization of the genetic differences between the two closely related species. In this study, we sequenced the genomes of two C. xiaoi isolates and performed comparative genomic analysis to identify the sequence uniq
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sequencing of endopeptidase-generated peptides from the peripheral binding site (PBS) for benzodiazepines, purified from a Chinese hamster ovary (CHO) cell line, produced internal sequence information, and confirmed and extended the NH2-terminal PBS sequence that we previously reported. Since the sequences were highly similar to the corresponding rat PBS sequences, we investigated whether they were also conserved in human PBS. Scatchard analysis of [3H]PK11195 (a derivative of isoquinoline carboxamide) binding and photoaffinity labeling with [3H]PK14105 (a nitrophenyl derivative of PK11195
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic is the most widespread environmental toxin. Substantial amounts of pentavalent organoarsenicals have been used as herbicides, such as monosodium methylarsonic acid (MSMA), and as growth enhancers for animal husbandry, such as roxarsone (4-hydroxy-3-nitrophenylarsonic acid) [Rox(V)]. These undergo environmental degradation to more toxic inorganic arsenite [As(III)]. We previously demonstrated a two-step pathway of degradation of MSMA to As(III) by microbial communities involving sequential reduction to methylarsonous acid [MAs(III)] by one bacterial species and demethylation from MAs(II
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel peptidyl-lys metalloendopeptidase (Tc-LysN) from Tramates coccinea was recombinantly expressed in Komagataella phaffii using the native pro-protein sequence. The peptidase was secreted into the culture broth as zymogen (~38 kDa) and mature enzyme (~19.8 kDa) simultaneously. The mature Tc-LysN was purified to homogeneity with a single step anion-exchange chromatography at pH 7.2. N-terminal sequencing using TMTpro Zero and mass spectrometry of the mature Tc-LysN indicated that the pro-peptide was cleaved between the amino acid positions 184 and 185 at the Kex2 cleavage site present in t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The synthesis of extracellular enzymes and extracellular polysaccharide (EPS) in Xanthomonas campestris pathovar campestris (Xcc) is subject to co-ordinate regulation by a cluster of genes called rpf (for regulation of pathogenicity factors). These genes are located within a 21.9 kb region of the chromosome isolated as the cosmid clone pIJ3020. The genes in the left-hand section of this region of the chromosome have previously been characterized. This paper reports on the genes in the right-hand section and on the phenotypes of mutants with transposon insertions in these genes. Sequence analys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.