BACKGROUND: Distinguishing malignant pleural effusion (MPE) from benign pleural effusion (BPE) remains clinically challenging because conventional cytology has limited sensitivity. We investigated whether cfDNA methylation profiling of pleural effusion supernatant could provide a non‑invasive diagnostic alternative.
METHODS: Patients with pleural effusion were consecutively and prospectively recruited from Beijing Chest Hospital between November 2022 and March 2024. We conducted genome-wide cfDNA methylation profiling on qualified pleural effusion samples. A mechanistically relevant diagnosti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of oropharyngeal cancer (OPC) driven by human papillomavirus (HPV) is increasing in high-income countries. Recurrent tumors remain a major cause of HPV-OPC mortality, yet reliable biomarkers for post-treatment monitoring are lacking. This study evaluated HPV cell-free DNA (cfDNA) from blood plasma as a monitoring biomarker for the detection of HPV-OPC recurrence. Blood plasma from 59 OPC patients was collected at diagnosis and during follow-up. HPV cfDNA was quantified using a multiplex digital PCR assay targeting HPV16 and seven other high-risk types. Tumor HPV status was confir
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Liquid biopsy technology has received widespread attention in the early diagnosis of cholangiocarcinoma (CCA).
METHODS: We collected bile samples from 48 patients with CCA and 48 patients with gallstones at Shandong Provincial third Hospital. We quantified bile circulating free DNA (cfDNA) of syncytin-1 and SLC7A11, calculated the correlation between syncytin-1 and SLC7A11 expression and clinical parameters by Spearman rank correlation, plotted Receiver Operating Characteristic (ROC) curves, and compared the Area Under Curve (AUC) values to explored early diagnostic utility in patien
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Impact of long-term plasma storage on biomarker analysis is critical for ensuring data reliability. Cell-free DNA (cfDNA) epigenetic markers, including 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), have emerged for disease detection, prognosis, and treatment response. However, the effects of prolonged storage on 5hmC analysis remain unclear. We evaluated the quantity and quality of cfDNA and 5hmC sequencing analyses in 1070 plasma samples stored for up to 14 years from patients with solid tumors and acute myeloid leukemia (AML) and non-cancer individuals. In long-term stored plasma samples, cfDNA yield rema
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallbladder cancer (GBC) frequently mimics gallbladder benign lesions (GBBLs) in radiological images, leading to preoperative misdiagnoses. To address this challenge, we initiated a prospective, multicenter clinical trial (ChicCTR2100049249) and proposed a multimodal, non-invasive diagnostic model to distinguish GBC from GBBLs. A total of 301 patients diagnosed with gallbladder-occupying lesions (GBOLs) from 11 medical centers across 7 provinces in China were enrolled and divided into a discovery cohort and an independent external validation cohort. An artificial intelligence (AI)-based integr
Клиническое исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The identification of noninvasive biomarkers for monitoring liver transplant (LT) recipients is crucial for the early detection of graft dysfunction and rejection. Donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) and microRNAs (miRNAs) have been identified as promising biomarkers for assessing graft integrity. While the levels of dd-cfDNA have been validated for this use in kidney and heart transplantation, there are limited data regarding its potential in liver graft monitoring. Similarly, the expression levels of miRNAs, key regulators of immune responses and liver injury, have potential
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current non-invasive prenatal testing (NIPT) based on cell-free DNA (cfDNA) mainly targets the detection of chromosome aberrations but not dominant single-gene disorders (dSGDs).
AIM: This prospective pilot study aims to evaluate the clinical utility of a plasma cfDNA and targeted next-generation sequencing-based NIPT approach for dSGDs (NIPT-dSGD), with a particular focus on neurodevelopmental disorders (NDDs).
DESIGN: Prospective pilot study.
METHODS: The NIPT-dSGD method targeted 34 genes, including 25 correlated to NDDs and nine correlated to Noonan spectrum, skeletal, crani
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Prenatal single-nucleotide polymorphism (SNP)-based cell-free DNA (cfDNA) screening can identify genome-wide paternal uniparental disomy (GW-UPDpat), including cases with complete hydatidiform mole with a coexisting fetus (CHMCF), those with placental mesenchymal dysplasia (PMD) and those with a mosaic/chimeric GW-UPDpat syndrome. Our objective was to review laboratory data and pregnancy outcome for SNP-based cfDNA screening tests with results compatible with GW-UPDpat and a normal cell line.
METHODS: This was a retrospective study of all cfDNA screening results from a single comme
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, cell-free DNA (cfDNA) has gained attention as a diagnostic and prognostic biomarker for various conditions, including autoimmune and inflammatory skin diseases. However, reports of cfDNA use in patients with systemic sclerosis (SSc) are limited. The purpose of this study was to investigate the clinical significance of cfDNA in patients with SSc and assess the circulating DNA levels of key cytokines associated with SSc fibrosis. Serum samples were obtained from 64 patients with SSc, 9 with very early SSc, and 20 healthy controls (HC). Circulating DNA copies were quantified using dropl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal ischemia/reperfusion (I/R) injury is a common life-threatening condition. Inflammatory dysregulation plays a crucial role in the pathological progression of intestinal I/R injury, indicating that controlling excessive inflammatory responses can be an effective strategy for mitigating I/R injury. Herein, after establishing a correlation between cell-free DNA (cfDNA) levels and postoperative inflammatory factors in samples from patients with intestinal I/R, we tested a cfDNA-scavenging approach for the treatment of intestinal I/R injury. Poly-ε-caprolactone (PCL) microspheres (Micro D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: To explore how early cancers can be detected prior to clinical signs or symptoms, we assessed prospectively collected serial plasma samples from the Atherosclerosis Risk in Communities study, including 26 participants diagnosed with cancer and 26 matched controls. At the index time point, 8 of these 52 participants scored positively with a multicancer early detection test. All eight participants were diagnosed with cancer within 4 months after blood collection. In six of these eight participants, we were able to assess an earlier plasma sample collected 3.1 to 3.5 years prior to cl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive pulmonary aspergillosis (IPA), the most common fungal infection, is associated with high mortality of affected patients. Traditional diagnostic methods exhibit limited sensitivity and specificity, raising big challenges for precise management of the patients. There is thus an urgent need to find out a timely and accurate diagnostic method in clinical practice. In this study, 163 patients suspected with IPA were enrolled. The medical data of the patients were retrieved from hospital information system. The 158 patients with complete data were classified into an IPA group with 122 cases
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgA nephropathy (IgAN) is one of the most prevalent glomerulonephropathies and commonly leads to kidney failure. The recurrence of IgAN following transplantation remains a significant concern. Currently, detecting IgAN recurrence requires a kidney biopsy, highlighting the need for non-invasive biomarkers such as donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) to aid in early detection. This prospective pilot study aims to evaluate dd-cfDNA as a non-invasive biomarker for detecting IgAN recurrence post-kidney transplantation. Specifically, the study seeks to compare %dd-cfDNA levels in transplanted pati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The value of integrating clinical variables, radiomics, and tumor-derived cell-free DNA (cfDNA) for the prediction of survival and response to chemoradiation of patients with resectable esophageal adenocarcinoma is not yet known. Our aim was to investigate if radiomics and cfDNA metrics combined with clinical variables can improve personalized predictions.
METHODS AND MATERIALS: A cohort of 111 patients with resectable esophageal adenocarcinoma from 2 centers treated with neoadjuvant chemoradiation therapy was used for exploratory retrospective analyses. Models combining the clinical
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An improved understanding of the cfDNA fragmentomics has proved it as a promising biomarker in clinical applications. However, biological characteristics of cfDNA in spent embryos culture medium (SECM) remain unsolved obstacles before the application in non-invasive in-vitro embryo selection. In this study, we developed a Tn5 transposase and ligase integrated dual-library construction sequencing strategy (TDual-Seq) and revealed the fragmentomic profile of cfDNA of all sizes in early embryonic development. The detected ratio of long cfDNA (>500 bp) was improved from 4.23 % by traditional NGS t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to evaluate the efficiency of noninvasive prenatal screening (NIPS) technology in screening for microdeletions in the 7q11.23 region.
METHODS: 19,607 pregnant women underwent NIPS in our hospital. Maternal peripheral cell-free foetal DNA (cffDNA) was routinely screened for aneuploidy by cffDNA enrichment and simultaneously analyzed for pathogenic copy number variants (CNVs). The Williams syndrome (WS) 7q11.23 region was targeted in this study. Chromosomal microarray analysis (CMA) was used to verify the screen-positive samples.
RESULTS: The mean concentration of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: While cell-free DNA (cfDNA) screening has emerged as a screening modality for common aneuploidies, further research and several publications over the past decade suggested some correlation between the low concentrations of cfDNA and a number of pregnancy-related complications. The primary goal of this systematic review and meta-analysis was to assess the potential value of low-ff levels in the prediction of subsequent PE/PIH, GDM, SGA/FGR, and PTB. The meta-analysis results aim at summarizing the currently available literature data and determining the clinical relevance of this bioche
Систематический обзорСтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There is significant variability among pathologists in the histopathological interpretation of the endomyocardial biopsy (EMB) for acute cellular rejection (ACR), and assessment of variability in the interpretation of antibody-mediated rejection (AMR) has not been reported. In contemporary practice, the strategy of allograft surveillance with donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) compared to EMB has not been compared with a focus on long-term clinical outcomes beyond acute rejection (AR).
METHODS: The Genomic Research Alliance for Transplantation is a multicenter, prospective coh
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective Testing for the Janus activating kinase 2 (JAK2) V617F mutation is important for diagnosing and treating myeloproliferative neoplasms (MPNs). Recently, urine cell-free DNA (ucfDNA) was reported to be useful for detecting tumor-specific gene mutations in several solid tumors. However, its utility in detecting such mutations in hematological malignancies has not yet been assessed. In this study, we assessed whether or not the JAK2 V617F mutation could be detected in ucfDNA and whether or not its positivity rate in ucfDNA was associated with the JAK2 V617F allele ratio of peripheral blo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circulating cell-free DNA (cfDNA) is a noninvasive substitute to liver biopsy for hepatocellular carcinoma (HCC) molecular profiling. This study aimed to use cfDNA to investigate copy number variation (CNV) in the BCL9 and RPS6KB1 genes and its impact on prognosis in HCC.
METHODS: Real-Time Polymerase Chain Reaction was used to determine the CNV and cfDNA integrity index in 100 HCC patients.
RESULTS: CNV gain in BCL9 and RPS6KB1 genes was detected in 14% and 24% of patients, respectively. Gain in CNV of BCL9 associated with risk of HCC in alcohol drinkers and hepatitis C seroposi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования