Recent development of DNA markers provides powerful tools for population genetic analyses. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers result from a polymerase chain reaction (PCR)-based DNA fingerprinting technique that can detect multiple restriction fragments in a single polyacrylamide gel, and thus are potentially useful for population genetic studies. Because AFLP markers have to be analysed as dominant loci in order to estimate population genetic diversity and genetic structure parameters, one must assume that dominant (amplified) alleles are identical in state, recessive (unam…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we compared the potential of amplified fragment length polymorphism (AFLP), random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis, restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the gene encoding lipoprotein P146, and the variable number of tandem repeats (VNTR) of the P97 encoding gene, as possible methods for typing an international collection of Mycoplasma hyopneumoniae isolates. All techniques showed a typeability of 100% and high intraspecific diversity. However, the discriminatory power of the different techniques varied considerably. AFLP (>0.99) and PCR-RFLP of the P146 e
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human body decomposition significantly damages DNA, particularly short tandem repeats used in DNA profiling. In degraded samples, mitochondrial DNA (mtDNA) is used for aiding identification, utilizing hard tissues such as bones as DNA sources. However, extracting DNA from these tissues is complex and time-consuming. This study explores soft tissues for mtDNA analysis employing a next-generation sequencing (NGS) panel. A total of 290 samples from 30 autopsy cases were analyzed using an NGS panel targeting the entire mitochondrial genome. Among them, 239 samples were from 25 decomposed bodies wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The first case of canine endocarditis caused by "Bartonella rochalimae" is reported. By PCR-restriction fragment length polymorphism, sequence, and phylogenetic analyses, Bartonella isolates from a dog with endocarditis, 22 gray foxes, and three dogs, described as B. clarridgeiae like, were confirmed to belong to the new species "B. rochalimae," suggesting canids as the natural reservoir.
Клинический случайСравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benzene, a well-known carcinogenic airborne pollutant, poses significant health risks, particularly in industries such as petroleum, shoemaking, and painting. Despite strict regulations, chronic occupational exposure persists, contributing to the onset of acute myeloid leukemia (AML) and other malignancies. Benzene's carcinogenicity stems from its metabolic activation, leading to increased oxidative stress, DNA damage, and cancer transformation. While its toxicity is well-documented, the link between genetic and epigenetic alterations and cancer susceptibility in exposed workers remains undere
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Stroke is the second leading cause of death worldwide and the leading cause of mortality and long-term disability in China, but its underlying risk genes and pathways are far from being comprehensively understood. We here describe the design and methods of whole genome sequencing (WGS) for 10 914 patients with acute ischaemic stroke or transient ischaemic attack from the Third China National Stroke Registry (CNSR-III).
METHODS: Baseline clinical characteristics of the included patients in this study were reported. DNA was extracted from white blood cells of participant
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetics is a rapidly developing field focused on deciphering chemical fingerprints that accumulate on human genomes over time. As the nascent idea of precision medicine expands to encompass epigenetic signatures of diagnostic and prognostic relevance, there is a need for methodologies that provide high-throughput DNA methylation profiling measurements. Here we report a novel quantification methodology for computationally reconstructing site-specific CpG methylation status from next generation sequencing (NGS) data using methyl-sensitive restriction endonucleases (MSRE). An integrated pipel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the prerequisites of making ecological conclusions derived from genetic fingerprints is that bacterial community profiles reflect the live portion of the sample of interest. Propidium monoazide is a membrane-impermeant dye that selectively penetrates cells with compromised membranes, which can be considered dead. Once inside the cells, PMA intercalates into the DNA and can be covalently cross-linked to it, which strongly inhibits PCR amplification. By using PCR after PMA treatment, the analysis of bacterial communities can theoretically be limited to cells with intact cell membranes. Fo
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Primary orbital non-Hodgkin's lymphoma is a mucosa-associated lymphoid tissue (MALT)-type extranodal marginal zone lymphoma. Chronic antigen stimulation is implicated as a causative agent in the development of some mature B-cell proliferations; for example, there are associations involving Helicobacter pylori with gastric or conjunctival MALT lymphoma and Chlamydia psittaci with ocular adnexal lymphoma. We examined the molecular signatures of H pylori and Chlamydia in eight orbital lymphomas.
METHODS: Polymerase chain reaction (PCR) was performed on DNA extracted from microdissected
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid biopsy is a promising, noninvasive approach for cancer detection, but current methods often trade off accuracy, operability, and cost. To address these limitations, we introduce an artificial perception system (APS) for liquid biopsy that combines a structurally defined DNA-carbon nanotube sensor array with machine learning (ML) models. The array produces multichannel fluorescence fingerprints from serum, which are decoded by ML models to classify disease state. In a total of 253 serum samples spanning liver, lung, and ovarian cancers and noncancer controls, the APS achieved mean sensit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two onboard crew members lost their lives in the fatal Makalu Air Cessna Grand Caravan 208B domestic cargo flight crash on May 16, 2018. The Disaster Victim Identification (DVI) procedure comprises external examination, photography, DNA collection, fingerprint collection, postmortem examination, antemortem information collection from the family members, and reconciliation. The major challenge of this operation was dealing with cognitive bias. The antemortem dental information of one of the deceased was revealed to the forensic experts just before the postmortem examination. This influenced the
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To provide materials for the study of the function of ESC42 protein specifically expressed in the human epididymis.
METHODS: The ESC42 gene was amplified from the human epididymis cDNA library by PCR and then cloned into prokaryotic expression vector pGEX-4T-1, expressed and purified by recombinant DNA techniques. The specificity of ESC42 protein was identified by Western blot and MALDI-TOF-MS. The database was searched by Ms-Fit.
RESULTS: The recombinant plasmid expressed a Mr 38 x 10(3) fusion protein in E. coli at a level of 30% of the total protein, and the purity was as high
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene polymorphism of the DNAs extracted from reference strains of L. interrogans in China was characterized by LSSP-PCR primered by G1 or G2, which were a pair of specific primers for L. interrogans. The fingerprinting produced by LSSP-PCR showed that serovar lai, serovar canicola, serovar pyrogens, serovar autumnalis, serovar australis, serovar linhai, serovar wolffi and serovar haemolytic have similar patterns, but serovar hebdomadis, serovar javanica, serovar ballum, serovar pomona, serovar spaidjin, serovar tarassov and serovar manahao I have different profiles. This result agreed with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A representative collection of meningococci was isolated from cases and healthy carriers in The Gambia between 1982 and 1988, during and after an epidemic of meningococcal meningitis. These bacteria were subjected to a clonal analysis. All serogroup A bacteria from both cases and carriers were of one clone (A IV-1). Several unrelated clones were observed among serogroup 29E and serogroup Y carrier strains. The serogroup A strains were uniform for serotype and subtype antigens (serotype 4, subtype P1.7) and antibiotic sensitivity pattern. Occasional strains varied in their lipopolysaccharide (L
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, we cannot provide a conclusive diagnosis for 3% to 5% of people who are confronted with cancer. These patients have cancer of unknown primary (CUP), ie, a metastasized cancer for which the tissue of origin cannot be determined. Studies have shown that the DNA methylation profile is a unique "fingerprint" that can be used to classify tumors. Here we used cell-free reduced representation bisulfite sequencing (cfRRBS), a technique that allows us to identify the methylation profile starting from minimal amounts of highly fragmented DNA, for CUP diagnosis on formalin-fixed paraffin-embed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although only poorly documented, it can be assumed that intensive antibiotic treatments of chronic lung infections in patients with cystic fibrosis (CF) also affect the diversity and metabolic functioning of the gastrointestinal microbiota and potentially lead to a state of dysbiosis. A better knowledge of the differences in gut microbiota composition and stability between patients with CF and healthy subjects could lead to optimization of current antibiotic therapies and/or development of add-on therapies. Using conventional culturing and population fingerprinting by denaturing gradient gel e
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In New Zealand the number of campylobacteriosis notifications increased markedly between 2000 and 2007. Notably, this country's poultry supply is different than that of many developed countries as the fresh and frozen poultry available at retail are exclusively of domestic origin. To examine the possible link between human cases and poultry, a sentinel surveillance site was established to study the molecular epidemiology of Campylobacter jejuni over a 3-year period from 2005 to 2008 using multilocus sequence typing. Studies showed that 60.1 to 81.4% of retail poultry carcasses from the major s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD), pulsed-field gelelectrophoresis (PFGE), and amplified fragment length polymorphism (AFLP) analyses were used to investigate a possible outbreak of Nocardia farcinica. RAPD and PFGE analyses yielded irreproducible and unsatisfactory results, respectively. AFLP analysis seem to be a promising and welcome addition for molecular analysis of Nocardia isolates.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reliable single cell PCR requires nested or heminested PCR and careful optimization of conditions. This report describes the successful use of nested PCR for gender identification and reverse paternity testing in a forensic case where the only available materials consisted of charred human remains and a minute quantity of blood that were unsuitable for standard PCR. Use of nested PCR allowed the blood and burned tissue to be identified as human female. Analysis of two PCR length polymorphisms (AMPFLP) was successful on the blood sample and reverse paternity testing yielded a 98% probability th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex detection of metal ions is often challenged by their similar charge states and ionic radii, which interfere with for simultaneous analysis and cause the low selectivity of conventional lock-and-key recognition elements. Herein, a label-free and intelligent fluorometric array has been developed for simultaneously probing multiplexed metal ions by utilizing the conformational diversity of DNA structures, including G-triplex, G-quadruplex, and dimeric G-quadruplex DNA. The sensing mechanism relies on thioflavin T intercalation, which converts metal-binding-induced DNA conformational cha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.