Administration of a compound can induce drug-metabolizing enzymes (DMEs) in the liver. DME induction can affect various parameters in toxico … ect and quantify multiple proteins simultaneously per assay. Studies have shown that formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples, which are routinely collected in toxicology studies, can be used for LC/MS-based protein analysis. To validate the utility of LC/MS using FFPE samples for quantitative evaluation of DME induction, we treated rats with a DME …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic analysis on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue specimens has become a mainstream method, from conventional direct sequencing to comprehensive analysis using next-generation sequencing (NGS). In this study, we evaluated the quality of DNA and RNA extracted from FFPE sections, derived from surgical specimens of different tumor types. Electrophoresis was performed using a 4200 TapeStation to evaluate DNA and RNA fragmentation. DNA Ct values were higher and significantly increased over a period of 4 years compared with those from cell lines or frozen tissues. The RNA integrity …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic echinococcosis (CE) is a worldwide zoonotic disease caused by the larval stage of Echinococcus granulosus. We investigated the presence of E. granulosus-specific DNA in the serum of CE patients by detecting the cytochrome c oxidase I (cox1) and NADH dehydrogenase subunit I (nad1) mitochondrial genes. Serum and formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) cyst tissue samples of 80 CE patients were analyzed. The extracted DNA of samples was submitted to PCR amplification of cox1 and nad1 genes, and products were sequenced and genotyped. Nineteen (23.8%; 95% CI 15.8-34.1) serum and 78 (97.5%; 9…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The transition from ductal carcinoma in situ (DCIS) to invasive breast carcinoma (IBC) is an important step during breast carcinogenesis. Understanding its molecular changes may help to identify high-risk DCIS that progress to IBC. Here, we describe a transcriptomic profiling analysis of matched formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) DCIS and IBC components of individual breast tumours, containing both tumour compartments. The study was performed to validate progression-associated transcripts detected in an earlier gene profiling project using fresh frozen breast cancer tissue…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease is a chronic inflammation of the small intestine with villous atrophy that can become refractory to a gluten-free diet. Two c … TRG PCR (N2T) in 73 samples, including 67 cryopreserved intestine tissues. Thirteen formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples were also analyzed retrospectively. The ECN PCR had comparable efficiency to detect major clonal rearrangements in highly infiltrated tissues from T-cell lymphoproliferative disorders and type II refractory celiac disease and …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a retrospective multicenter study, 102 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue specimens with histopathology results were tested. Two 4- to 5-μm FFPE tissue sections from each specimen were digested with proteinase K, followed by automated nucleic acid extraction. Multiple real-time quantitative PCR (qPCR) assays targeting the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of ribosomal DNA, using fluorescently labeled primers, was performed to identify clinically important genera and species of Aspergillus, Fusarium, Scedosporium, and the Mucormycetes The molecular identification was co…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Northern spread of sandflies and Leishmania spp. has been observed in Europe. Diagnosis can be difficult owing to the various clinical manifestations. Species identification is important for patient management and therapy. Molecular diagnostics is increasingly used for pan-Leishmania detection but species identification remains challenging in formalin-fixed material.
OBJECTIVES: To apply cytochrome b (cytb) polymerase chain reaction (PCR) and sequencing for identification of Leishmania species on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) skin biopsies; and to identify species-speci…
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal translocations of t(2;13)(q35;q14) and t(1;13)(p36;q14), resulting in PAX3-FOXO1 (FKHR) and PAX7-FOXO1 (FKHR) gene fusions, have been found to be specific molecular markers for alveolar rhabdomyosarcomas (ARMS) and can be identified in approximately 80% cases. As the prognosis of ARMS is worse than that of embryonal rhabdomyosarcomas (ERMS), it is important to accurately distinguish between these 2 subtypes. This distinction may be difficult on the basis of morphology alone. To detect the genetic alterations, reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) or dual-color du
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defining type-specific human papillomavirus (HPV) infections within cervical tissues is important for understanding the pathogenesis of cervical neoplasia and assessing the effectiveness of prophylactic vaccines with limited type-specific spectra. We compared HPV DNA-testing results from 146 matched exfoliated-cell and formalin-fixed-tissue specimens collected by cervicovaginal lavage (CVL) within 90 days of each other from women with histologically confirmed cervical intraepithelial lesions (CIN). The CVL specimens were HPV typed using a MY09/11 L1 consensus primer PCR method followed by dot
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The definitive diagnosis of the CJD (Creutzfeldt-Jakob disease; very rare neurodegenerative disorder) can be established only on the basis of post-mortem examination of the central nervous system tissue. Formaldehyde-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples may thus constitute the only material available for molecular pathology analyses. We performed post-mortem analysis of the coding region of the prion-protein gene (PRNP)-sequence variations in two definite CJD cases suggestive of genetic form. Only FFPE tissues were available for molecular analyses. The PRNP gene open reading frame was…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the feasibility of detecting cyclin D1 mRNA in paraffin-embedded tissues by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) and competitive RT-PCR and its diagnostic and differential diagnostic significance for mantle cell lymphoma (MCL).
METHODS: Paraffin-embedded samples of 36 cases of MCL, 71 cases of other small B-cell lymphomas and 20 cases of lymphoid reactive hyperplasia as control group were retrieved from archival materials. Cyclin D1 protein and its mRNA was detected by EnVision and RT-PCR and competitive RT-PCR in all samples. House-keeping gene P…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A method was developed for detection of influenza genes in formalin-fixed brains of mice that had been experimentally infected with influenza A/NWS/33 (H1N1) virus. Using this technique, messenger ribonucleic acid (mRNA) of the beta-actin gene was detected in eight clinical brain samples from the 1916-1920 outbreak of encephalitis lethargica, showing preservation of particular mRNAs. However, we did not detect influenza nucleotide sequences of M, NP, and NS genes from these same samples. We conclude either that influenza was not the causative agent of encephalitis lethargica or, possibly, that
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The estrogen- (ER) and progesterone receptors (PR) of 27 pre- and 33 postmenopausal primary breast carcinomas with 320 axillary lymphonodal metastases were investigated in formalin-fixed paraffin-embedded tissue.
MATERIAL AND METHODS: Special interest was devoted to the comparison of the receptor equipment between the axillary lymphonodal metastases and the appertained primary carcinoma. ER-antibody D5 and PR-antibody NCL-PGR were used for investigation.
RESULTS: ER-positive carcinomas of premenopausal women and ER-respectively PR-positive carcinomas of postmenopausal women corres…
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex polymerase chain reaction (PCR)-liquid hybridization assay detecting a minimum 10 fg of cytomegaloviral (CMV) DNA has been developed. This assay successfully detected viral nucleic acids in 25/26 (96.2%) routinely embedded allograft liver biopsies with CMV hepatitis. No CMV DNA was detected in 15 native and 12 donor liver tissues sampled at the time of liver transplantation. These results indicate that archived formalin-fixed, paraffin-embedded liver tissues obtained from patients with significant liver disease can be successfully analyzed for CMV by PCR, retrospectively. Failure t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlorinated paraffins (CPs) are recognized as a novel class of persistent organic pollutants (POPs) and are categorized into short- (SCCPs, C10-13), medium- (MCCPs, C14-17), and long- (LCCPs, C≥18) chain CPs considering the carbon-chain length. Among them, SCCPs possess lower molecular weights, higher vapor pressures, and greater water solubilities compared to their longer-chain counterparts (MCCPs and LCCPs), which promote their environmental release. Consequently, SCCPs were designated as POPs of concern under the Stockholm Convention in 2017. This review concludes the recent research progre…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syphilis remains one of the most prevalent sexually transmitted infections. Serology is the diagnostic gold standard, but skin biopsies aid in ambiguous cases. Treponemas can be detected in tissue by immunohistochemistry (IHC) and polymerase chain reaction (PCR); however, their comparative performance across disease stages has not been extensively studied. This retrospective study of 48 formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) skin biopsies from syphilis cases compared Treponema pallidum IHC and PCR. Of 48 biopsies, 42 (88%) were positive by T. pallidum-specific PCR, whereas IHC identified 45 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short-chain chlorinated paraffins (SCCPs) are persistent organic pollutants that pose ecological risks to marine ecosystems. Their impacts on bacterial communities and environmental fate remain poorly understood. In this study, SCCP exposure significantly altered sediment bacterial diversity and composition, enriching key genera such as Halomonas, Pseudomonas, and Marinobacter. Six SCCP-degrading strains from these genera were isolated. Whole-genome and transcriptomic analyses identified key functional genes involved in 1,2,5,6,9,10-hexachlorodecane degradation, including oxidative stress resp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Personalized medicine and accurate quantification of tumor and biomarker expression have become the cornerstone of cancer diagno … areas, and 54 (79%) had similar tumor percentages.
CONCLUSION: WSIs of aged H&E slides and stained paraffin block re-cuts produce different tumor quantification compared to those of original scanned sslides most likely due to pre-analytical factors. The difference in tumor area detected between original and rescanned WSIs trended upward in the period betw …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования