Synovial fluid is a potential source of novel biomarkers for many arthritic disorders involving joint inflammation, including juvenile idiopathic arthritis. We first compared the distinctive protein 'fingerprints' of local inflammation in synovial fluid with systemic profiles within matched plasma samples. The synovial fluid proteome at the time of joint inflammation was then evaluated across clinical subgroups to identify early disease associated proteins. We measured the synovial fluid and plasma proteomes using the two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis approach. Image
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
What are the current approaches in brain proteomics? Can we combine different, but complementary study designs to obtain better results concerning brain diseases? What are the neuro-hotspots, especially in Korea? These were some of the questions the participants of the 8(th) HUPO Brain Proteome Project Workshop tried to answer prior to the 6(th) HUPO World Congress in Seoul, Korea. Around 100 scientists came together during the afternoon of 7 October, 2007, to discuss and to catch up on the latest results and strategies concerning Huntington's disease, glioblastoma and standardization.
Conference ProceedingsПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer remains a major clinical challenge because of its molecular heterogeneity, therapeutic resistance, and disease recurrence. Melittin, the principal bioactive peptide of honeybee venom, exhibits antitumor activity in multiple experimental models; however, its early proteome-wide effects in breast cancer cells remain incompletely characterized. In this study, E0771 murine mammary carcinoma cells were exposed to melittin for 15 min. Colony formation and CCK-8 assays using 0-8 μg/mL melittin showed concentration-dependent reductions in clonogenic capacity and cell viability. For DIA-b
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chinese hamster ovary (CHO) cells, widely utilised in biopharmaceutical production, experience various stressors during cell culture that can affect protein expression and folding, particularly within the endoplasmic reticulum (ER). Mild hypothermia is widely employed in CHO cell bioproduction to improve recombinant protein yield and quality; however, its impact on ER-associated pathways, particularly those governing protein folding and stress responses, remains insufficiently characterised. Mass spectrometry-based proteomics allows for the identification and relative quantification of protein…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymyalgia rheumatica (PMR) is an inflammatory disorder of unknown etiology, sharing symptoms with giant cell arthritis (GCA) and rheumatoid arthritis (RA). The pathogenic inflammatory roots are still not well understood, and there is a lack of extensive biomarker studies to explain the disease debut and post-acute phase. This study aimed to deeply analyze the serum proteome and inflammatory response of PMR patients before and after glucocorticoid treatment. We included treatment-naïve PMR patients, collecting samples before and after 3 months of treatment. For comparison, disease-modifying a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To explore whether unilateral relapse of Bechet's disease-associated uveitis (BDU) causes differences in the tear proteome between the diseased and the contralateral quiescent eye and potential tear biomarkers for uveitis recurrence and disease monitoring.
METHOD: To minimize interindividual variations, bilateral tear samples were collected from the same patient (n = 15) with unilateral relapse of BDU. A data-independent acquisition (DIA) strategy was used to identify proteins that differed between active and quiescent eyes.
RESULTS: A total of 1,797 confident proteins were identifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia is a chronic and incurable neuropsychiatric disorder that affects about one percent of the world population. The proteomic cha … is a joint effort of the Chr 15 C-HPP team and the Human Brain Proteome Project of B/D-HPP. All MS proteomics data are deposited in the ProteomeXchange Repository under PXD006798.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia (SCZ) is a severe mental disorder where diagnosis remains subjective, and treatment efficacy is limited by high heterogeneity, particularly for negative and cognitive symptoms. There is an urgent need for objective molecular biomarkers, especially for early diagnosis and for identifying individuals at clinical high risk (CHR) for psychosis. This review analyzes blood proteomic studies in SCZ, CHR states, and related disorders (2019-2025), categorizing them into mass-spectrometry (MS)-based approaches (panoramic and targeted) and affinity-based methods (Olink, SOMAscan). It synthe
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tissue proteomics will help discover the molecular pathophysiology of bone diseases. So far, most human studies have been performed on serum/plasma samples. We present an initial pilot proteomics analysis comparing three clinically important anatomical femur sites (caput, collum, and trochanter). The specimens were obtained from osteoarthritic patients undergoing hip replacement surgery and represented predominantly cortical bone from collum and mostly trabecular bone from caput, together with a mixture from trochanter. The bone and the corresponding serum samples were analyzed by high-through…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell proteomics (SCP) platforms are widely sought-after biomedical tools to complement existing omics technologies. Here, we present MiProChip, a microfluidic platform that integrates cell capture, lysis, protein digestion, tandem mass tag (TMT) labeling, on-chip pooling, and desalting a streamlined workflow for multiplexed SCP profiling. We optimized a chip-compatible TMT multiplexing protocol with a carrier-boosting strategy, enabling high-throughput operation and deep proteome coverage. MiProChip was designed to effectively reduce the mass spectrometry (MS) operation time, minimize a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the most common psychiatric complication following stroke, post-stroke depression (PSD) lacks effective biomarkers for diagnosis. This study aims to identify potential biomarkers for PSD through proteomics analysis of plasma exosomes.
METHODS: Patients with acute ischemic stroke were grouped according to the Hamilton Depression Rating Scale (HAMD). Exosomes were isolated and purified from plasma samples using size exclusion filtration combined with ultracentrifugation. Differentially expressed proteins (DEPs) were screened and subjected to functional analysis and identification…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programmed death-ligand 1 (PD-L1) is a key mediator of tumor immune evasion, but the protein networks governing its post-translational regulation remain incompletely understood. Here, we used PhastID-based proximity labeling to map the PD-L1 proximal proteome and integrated these data with pan-cancer proteomics and immunohistochemical analysis of clinical tumor samples. We found that C-terminal-proximal proteins were enriched in protein degradation, ER-associated quality control, and immune-related pathways, whereas N-terminal-proximal proteins were mainly associated with protein localization …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) evolves through precursors, yet the protein programs governing early progression remain poorly defined. We applied Deep Visual Proteomics (DVP)-integrating computational pathology, laser microdissection, and mass spectrometry (MS)-to profile normal ducts, acinar-to-ductal metaplasia (ADM), low-grade (LG) and high-grade (HG) pancreatic intraepithelial neoplasia (PanIN), and invasive carcinoma from organ donors and patients with PDAC. Quantifying 9,181 proteins from ∼100 cells per region, we uncovered a molecular field effect in histologically …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Reliable biomarkers for the diagnosis of chronic pancreatitis (CP) and pancreatic fibrosis severity are lacking, hindering effective treatment and management. Histologic fibrosis is a hallmark of late-stage CP, but noninvasive methods to evaluate fibrosis progression are limited. We used urine proteomics to discover biomarkers that identify patients with CP and predict fibrosis severity.
METHODS: We performed a cross-sectional study of 130 total subjects (CP n = 50) selected based on clinical criteria in a tertiary care setting. Urine proteomics samples were quantified using dat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial proteomics studies the protein localization patterns within tissues, providing new insights into cellular ecosystems and disease mechanisms. One critical challenge is its restricted spatial resolution, where each measured spot contains mixtures of cells, obscuring cell-type-specific proteomic signatures. Here, we propose spatial digital cytometry (Spatial-DC), a graph-enhanced transfer learning framework that computationally profiles single-cell-type-resolved signatures from spatial proteomics. Comprehensive benchmarking demonstrates that Spatial-DC outperforms eight state-of-the-art t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A recent clinical study tested the effects of two different monoclonal antibodies (mAbs) (siltuximab, anti-IL6; tocilizumab, anti-IL6R) on the fate and function of T-cells in people with type 1 diabetes. While both mAbs affect the response of T-cells to stimulation, they have very different, sometimes opposing mechanisms. Here, we use mass-spectrometry based proteomics to analyze longitudinal serum samples (baseline and two weeks post-treatment) from 20 clinical trial participants to examine the effects of siltuximab and tocilizumab on extracellular vesicles. To accomplish this, serum samples …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a pilot, single-subject longitudinal analysis of plasma antibodies and proteome dynamics across 310 days spanning COVID-19 vaccination and subsequent SARS-CoV-2 infection. Serial plasma samples were analyzed by DIA-LC-MS/MS, identifying 1502 proteins. Comparative analyses across key intervals (pre-vaccination, post-dose 1, post-dose 2, and post-infection) showed minimal proteomic shifts after vaccination but distinct, coordinated expression changes after SARS-CoV-2 infection.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fanconi anemia (FA) is a genome instability syndrome caused by defects in the FANC/BRCA DNA repair pathway, yet its broad clinical heterogeneity suggests functions beyond DNA repair. Using an integrative interactomics strategy combining endogenous co-immunoprecipitation, proximity-dependent labeling, in silico network integration, and functional analyses, we construct an interaction score-based multilayered FANCA protein-protein interaction landscape. Beyond its association with the FANCcore complex and DNA repair machineries, FANCA engages with proteins involved in chromatin remodeling, RNA m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical evidence supports a link between obstructive sleep apnea (OSA) and periodontitis. However, whether OSA exerts a causal effect on periodontitis and the underlying protein biomarkers remains unclear. This study aimed to investigate their causal relationship and to identify salivary protein markers involved in the shared pathogenesis. First, a bidirectional two-sample Mendelian randomization (MR) analysis using genome-wide association study (GWAS) statistics was conducted to evaluate the causal relationship. Second, data-independent acquisition (DIA)-based salivary proteomics was applied…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Only subset of patients with Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) benefit from immunotherapy and this is partly due to limited unde … the NSCLC immune landscape, creating distinct immunosuppressive and immune-excluded niches. Spatial proteomics reveals prognostic immune architectures that may guide mutation-directed immunotherapy strategies.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования