Cells are continuously exposed to both endogenous and exogenous sources of genomic stress. To maintain chromosome stability, a variety of mechanisms have evolved to cope with the multitude of genetic abnormalities that can arise over the life of a cell. Still, failures to repair these lesions are the driving force of cancers and other degenerative disorders. DNA double-strand breaks (DSBs) are among the most toxic genetic lesions, inhibiting cell ability to replicate, and are sites of mutations and chromosomal rearrangements. DSB repair is known to proceed via two major mechanisms: homologous
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA and RNA methylations constitute two interconnected regulatory layers of gene expression. Simultaneous detection of DNA 5-methylcytosine (m5C-DNA) and RNA N6-methyladenosine (m6A-RNA) is essential for capturing multilayer epigenetic and epitranscriptomic information while avoiding the interpretative bias that often arises from single-modification measurements. In this study, we report an iontronic sensing method based on an anodic aluminum oxide (AAO) nanochannel, which can detect both m5C-DNA and m6A-RNA. The sensor relies on modulation of the ionic current in the confined AAO nanochannel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The retinoblastoma tumor suppressor (Rb) acts in a conserved pathway that is deregulated in most human cancers. Inactivation of the single Rb-related gene in Caenorhabditis elegans, lin-35, has only limited effects on viability and fertility, yet causes changes in cell-fate and cell-cycle regulation when combined with inactivation of specific other genes. For instance, lin-35 Rb is a synthetic multivulva (synMuv) class B gene, which causes a multivulva phenotype when inactivated simultaneously with a class A or C synMuv gene.
RESULTS: We used the ORFeome RNAi library to identify g
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Secondary structure in the target is a property not usually considered in software applications for design of optimal custom oligonucleotide probes. It is frequently assumed that eliminating self-complementarity, or screening for secondary structure in the probe, is sufficient to avoid interference with hybridization by stable secondary structures in the probe binding site. Prediction and thermodynamic analysis of secondary structure formation in a genome-wide set of transcripts from Brucella suis 1330 demonstrates that the properties of the target molecule have the potential to st
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV), a member of the herpesvirus family, is extremely prevalent worldwide. EBV is a double-stranded DNA virus associated with various malignancies, autoimmune diseases, and lymphomas. Transmission occurs through different means, including saliva and organ transplantation. EBV can produce and secrete vesicles that are critical in intracellular communication and valuable biomarkers in body fluids to diagnose potential diseases. They can also be utilized in targeted therapy. Exosomes are extracellular vesicles (EVs) that play a significant role in several biological processes
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA), which results from the loss of expression of the survival of motor neuron-1 (SMN1) gene, represents the most common genetic cause of pediatric mortality. A duplicate copy (SMN2) is inefficiently spliced, producing a truncated and unstable protein. We describe herein a potent, orally active, small-molecule enhancer of SMN2 splicing that elevates full-length SMN protein and extends survival in a severe SMA mouse model. We demonstrate that the molecular mechanism of action is via stabilization of the transient double-strand RNA structure formed by the SMN2 pre-mRNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It is well established that ecdysteroid hormones play an important role in arthropod development and reproduction, mediated by ecdysteroid receptors. Ticks are obligate hematophagous arthropods and vectors of pathogens. The salivary gland plays an essential role in tick growth and reproduction and in the transmission of pathogens to vertebrate hosts. During tick development, the salivary gland undergoes degeneration triggered by ecdysteroid hormones and activated by apoptosis. However, it is unknown how the ecdysteroid receptor and apoptosis regulate salivary gland degeneration. He
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human malaria parasite infection and its control is a global challenge which is responsible for ~0.65 million deaths every year globally. The emergence of drug resistant malaria parasite is another challenge to fight with malaria. Enormous efforts are being made to identify suitable drug targets in order to develop newer classes of drug. Helicases play crucial roles in DNA metabolism and have been proposed as therapeutic targets for cancer therapy as well as viral and parasitic infections. Genome wide analysis revealed that Plasmodium falciparum possesses UvrD helicase, which is ab
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis isolates from sporadic, drinking water-associated, and intrafamilial human cases together with C. parvum isolates from sporadic cases in livestock were collected in the United Kingdom between 1995 and 1999. The isolates were characterized by analysis of three microsatellite markers (ML1, GP15, and MS5) using PCR amplification. Within C. hominis, four alleles were detected within the GP15 and MS5 loci, and a single type was detected with ML1. C. parvum was more polymorphic; 12 alleles were detected with GP15, 6 were detected with MS5, and 3 wer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistent DNA double-strand breaks (DSBs) in neurons are an early pathological hallmark of neurodegenerative diseases including Alzheimer's disease (AD), with the potential to disrupt genome integrity. We used single-nucleus RNA-seq in human postmortem prefrontal cortex samples and found that excitatory neurons in AD were enriched for somatic mosaic gene fusions. Gene fusions were particularly enriched in excitatory neurons with DNA damage repair and senescence gene signatures. In addition, somatic genome structural variations and gene fusions were enriched in neurons burdened with DSBs in th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stage-specific activator protein (SSAP) is a 43-kDa polypeptide that binds to an enhancer element of the sea urchin late histone H1 gene. This enhancer element mediates the transcriptional activation of the late histone H1 gene in a temporally specific manner at the mid-blastula stage of embryogenesis. We have cloned cDNAs encoding SSAP by using polyclonal antibodies raised against purified SSAP to screen expression libraries. SSAP is unrelated to previously characterized transcription factors; however, it exhibits striking homology to a large family of proteins involved in RNA processing. The
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The yellow fever mosquito, Aedes aegypti, serves as the primary vector for epidemic transmission of yellow fever, dengue, Zika (ZIKV), and chikungunya viruses to humans. Control of Ae. aegypti is currently limited to insecticide applications and larval habitat management; however, to combat growing challenges with insecticide resistance, novel genetic approaches for vector population reduction or transmission interruption are being aggressively pursued. The objectives of this study were to assess the ability of the Ae. aegypti antiviral exogenous-small interfering RNA (exo-siRNA) response to i
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Keeping in view the fact that molecular basis of Burkitt's lymphoma (BL) is poorly understood, we attempted to explore the small interfering RNA (siRNA) mediated c-myc gene regulation using BL-derived EB-3 cell line as archetype cellular model. Such a study revealed that EB-3 cells possess 4-fold higher expression of Dicer gene coupled with 2-fold higher activity of RNA polymerase III than that observed in normal human lymphocytes. siRNAs derived from EB-3 cells had the inherent capacity to suppress c-myc gene expression in normal cells but not in native cells. Based on these findings we have
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is a zoonotic parasitic disease caused by schistosome infection that severely threatens human health. Therapy relies mainly on single drug treatment with praziquantel. Therefore, there is an urgent need to develop alternative medicines. The glutamate neurotransmitter in helminths is involved in many physiological functions by interacting with various cell-surface receptors. However, the roles and detailed regulatory mechanisms of the metabotropic glutamate receptor (mGluR) in the growth and development of Schistosoma japonicum remain poorly understood. In this study, we identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To evaluate the impact of Bmi-1 on cell senescence and metastasis of human gastric cancer cell line BGC823.
METHODS: Two pairs of complementary small hairpin RNA (shRNA) oligonucleotides targeting the Bmi-1 gene were designed, synthesized, annealed and cloned into the pRNAT-U6.2 vector. After DNA sequencing to verify the correct insertion of the shRNA sequences, the recombinant plasmids were transfected into BGC823 cells. The expression of Bmi-1 mRNA and protein was examined by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and Western blotting. The effects of Bmi-1 knockdown o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious bursal disease virus (IBDV), a nonenveloped double-stranded RNA virus of chicken, encodes five proteins. Of these, the RNA-dependent RNA polymerase (VP1) is specified by the smaller genome segment, while the large segment directs synthesis of a nonstructural protein (VP5) and a structural protein precursor from which the capsid proteins pVP2 and VP3 as well as the viral protease VP4 are derived. Using the recently redefined processing sites of the precursor, we have reevaluated the homotypic interactions of the viral proteins using the yeast two-hybrid system. Except for VP1, which
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Outcomes for patients with esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) remain poor, partly due to treatment resistance, particularly to DNA-damaging therapies. Poly(ADP‑ribose) polymerase 1 (PARP1) plays a critical role in repairing single‑strand DNA breaks (SSBs). Unrepaired SSBs can be converted into double‑strand breaks (DSBs) during DNA replication, potentially leading to cell death. Genomic amplification of the distal portion of chromosome 3q (3q26-q29) is a frequent copy‑number alteration in ESCC, which harbors genes encoding several oncoproteins. However, whether long noncodin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Qi River crucian carp (Carassius auratus), a gynogenetic all-female fish, reproduces both unisexually and sexually, but the underlying molecular mechanisms remain unclear. The Wnt/β-catenin pathway influences mammalian ovarian development via cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1 (CYP19A1) activation, however, its role in teleosts is poorly understood. Here, we investigated β-catenin's involvement in gonadal differentiation through histological and molecular analyses. Histological examination with Hematoxylin and Eosin (HE) staining and immunohistochemistry showed that oogonia eme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toll-like receptor 3 (TLR3) is a key component of the innate immune system that recognizes viral double-stranded RNA (dsRNA) as well as endogenous RNA released from necrotic cells. Unlike other TLRs, TLR3 signals exclusively through the TIR-domain-containing adaptor inducing interferon-β (TRIF). This activation triggers downstream cascades that culminate in the translocation of IRF3 and NF-κB, inducing type I and type III interferons (IFNs) alongside interferon-stimulated genes (ISGs) and pro-inflammatory cytokines. These responses are essential for shaping antiviral immunity in hepatitis viru
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dried fruit beetle, Carpophilus hemipterus (Linnaeus, 1758) (Coleoptera: Nitidulidae), is a serious pest of ripened fresh fruit in the orchard and dried fruit in postprocessing storage. Despite the economic impact and widespread distribution of C. hemipterus, there is a lack of functional genomics research seeking to elucidate features of molecular physiology for improved pest management. Here, we report the characterization of the gene named Vermilion in C. hemipterus (ChVer) that encodes for tryptophan 2,3-dioxygenase. The Vermilion is frequently used as a visual marker for genomics approach
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования