Junctional regions of rearranged T-cell-receptor-gamma (TCR) and immunoglobulin heavy-chain (IgH) genes represent an idiotypic DNA sequence for an individual lymphocytic cell, and any clone or clonal disease developing from this cell. In this study, a novel methodology for detection and characterization of clone specific DNA sequences in patients with acute lymphocytic leukemia (ALL) was developed. Junctional regions of rearranged TCR-gamma IgH genes in specimens of bone marrow aspirates of patients with ALL (precursor-B-ALL ten, T-ALL two, null-ALL one; ALL not classified one), of a patient w
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DHODH (dihydroorotate dehydrogenase (quinone)) has been demonstrated as a critical regulator of programmed cell death, yet its role in macroautophagy/autophagy remains poorly defined. Flaviviridae pose a significant threat to global public health, and their replication is closely associated with autophagy. Building upon our previous findings that DHODH was a broad-spectrum target for Flaviviridae and a key regulator of Pestiviruses replication, this study employed RNA-seq screening coupled with functional validation to demonstrate that DHODH affected Pestiviruses replication by regulating mito
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression profiling (GEP) of primary leukaemic cells (PLC) from 157 paediatric B-lineage acute lymphoblastic leukaemia (ALL) patients, including a direct comparison of matched pair initial diagnosis versus first relapse leukaemic specimens, provided previously unknown evidence that relapse clones are characterized by significantly higher expression levels of a CD22 exon 12 deletion (CD22ΔE12)-associated signature transcriptome than the PLC from newly diagnosed patients. In agreement with and validating these GEP results, reverse transcription polymerase chain reaction and Western blot an
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Inositol is an essential nutrient and a precursor of phosphorylated metabolites that play important roles in cell physiology. Here we characterize the impact of intracellular inositol deficiency, taking advantage of fission yeast Schizosaccharomyces pombe, an obligate inositol auxotroph, as a model system. We find that cells deprived of inositol ceased growth after two or three rounds of division, with genome content indicative of a G2 arrest. Inositol starvation elicited (i) widespread changes in the expression of genes involved in lipid metabolism and inositol polyphosphate dynam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric intestinal metaplasia (GIM), particularly the incomplete subtype (Inc IM), is strongly associated with increased gastric cancer (GC) risk. However, its role as a true precursor lesion remains uncertain.
OBJECTIVE: We aimed to delineate the molecular identity, differentiation potential and oncogenic relevance of Inc IM.
METHODS: Spatial transcriptomics using a custom lineage-enriched panel was applied to profile GIM and GC tissues. Subtype-specific GIM organoid models were developed for DNA methylation and chromatin accessibility profiling. Single-cell RNA sequencing was p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are associated with amyloid-β (Aβ) dysmetabolism, a pivotal factor in the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD). This study unveiled a novel miRNA, microRNA-32533 (miR-32533), featuring a distinctive base sequence identified through RNA sequencing of the APPswe/PSEN1dE9 (APP/PS1) mouse brain. Its role and underlying mechanisms were subsequently explored. Bioinformatics and confirmatory experiments revealed that miR-32533 had a novel 23-base sequence with minimal coding potential, functioning within the Drosha ribonuclease III (Drosha)/Dicer 1, ribonuclease III (Dicer)-dep
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: In response to injury, pancreatic acinar cells undergo acinar-to-ductal metaplasia (ADM), marked by loss of acinar identity and acquisition of ductal features. Although ADM can resolve to support tissue repair, it may also persist and serve as a precursor to pancreatic cancer. Whether diverse pancreatic stressors drive a shared or context-specific ADM program remains unclear. We sought to comprehensively define metaplastic responses to clinically relevant exocrine pancreas diseases known to increase cancer risk.
METHODS: We profiled ADM and the surrounding microenvironment
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In somatic tissue differentiation, chromatin accessibility changes govern priming and precursor commitment towards cellular fates1-3. Therefore, somatic mutations are likely to alter chromatin accessibility patterns, as they disrupt differentiation topologies leading to abnormal clonal outgrowth. However, defining the impact of somatic mutations on the epigenome in human samples is challenging due to admixed mutated and wild-type cells. Here, to chart how somatic mutations disrupt epigenetic landscapes in human clonal outgrowths, we developed genotyping of targeted loci with single-cell chroma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ductal carcinoma in situ (DCIS) of the breast is a non-obligate precursor of Invasive Ductal Carcinoma (IDC) and thus the identification of features that may predict DCIS progression would be of potential clinical value. Experimental mouse models can be used to address this challenge by studying DCIS-to-IDC biology. Here we utilize single cell RNA sequencing (scRNAseq) on the C3Tag genetically engineered mouse model that forms DCIS-like precursor lesions and for which many lesions progress into end-stage basal-like molecular subtype IDC. We also perform bulk RNAseq analysis on 10 human synchro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Children with Down syndrome (constitutive trisomy 21) that develop acute lymphoblastic leukemia (DS-ALL) have a 3-fold increased likelihood of treatment-related mortality coupled with a higher cumulative incidence of relapse, compared with other children with B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). This highlights the lack of suitable treatment for Down syndrome children with B-ALL.
EXPERIMENTAL DESIGN: To facilitate the translation of new therapeutic agents into clinical trials, we built the first preclinical cohort of patient-derived xenograft (PDX) models of DS-ALL, comprehen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viroporins are small transmembrane proteins with ion channel activities modulating properties of intracellular membranes that have diverse proviral functions. Hepatitis C virus (HCV) encodes a viroporin, p7, acting during assembly, envelopment and secretion of viral particles (VP). HCV p7 is released from the viral polyprotein through cleavage at E2-p7 and p7-NS2 junctions by signal peptidase, but also exists as an E2p7 precursor, of poorly defined properties. Here, we found that ectopic p7 expression in HCVcc-infected cells reduced secretion of particle-associated E2 glycoproteins. Using bioc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease is the most common cause of progressive intellectual failure in aged humans. The filamentous brain lesions which define the disease occur within neurons (neurofibrillary tangles), in extracellular cerebral deposits (amyloid plaques) and in meningocerebral blood vessels (amyloid angiopathy). They are found in lesser numbers in the brains of virtually all old humans. A protein with a relative molecular mass (Mr) of approximately 4,000, designated amyloid beta-protein or amyloid A4 protein, is the subunit of the vascular and plaque amyloid filaments in individuals with Alzheim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusions transcripts have been proven to be strong drivers for neoplasia-associated mutations, although their incidence in T-cell lymphoblastic lymphoma needs to be determined yet. Using RNA-Seq we have selected 55 fusion transcripts identified by at least two of three detection methods in the same tumour. We confirmed the existence of 24 predicted novel fusions that had not been described in cancer or normal tissues yet, indicating the accuracy of the prediction. Of note, one of them involves the proto oncogene TAL1. Other confirmed fusions could explain the overexpression of driver genes such
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Long noncoding RNAs serve critical regulatory functions highly specific for a tissue and its developmental stage. Antisense long ncRNA (AS-lncRNA) methylation changes in acute lymphoblastic leukemia (ALL) versus normal pre-B-cell lymphoblasts were evaluated to identify potential differential methylation in this group of genes.
MATERIALS & METHODS: The methylome of ALL and normal lymphoblasts was examined by the methylated CpG island recovery assay followed by NGS.
CONCLUSION: The potential effect of trans regulation by AS-lncRNA through DNA/RNA binding is significant as sequence alignme
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the imatinib based therapy of chronic myeloid leukemia (CML) represents a triumph of medicine, not all patients with CML benefit from this drug due to the development of resistance and intolerance. The interruption of imatinib treatment is often followed by clinical relapse, suggesting a failure in the killing of residual leukaemic stem cells. There is need to identify alternative selective molecular targets for this disease and develop more effective therapeutic approaches. Alternative pre-mRNA splicing (AS) is an epigenetic process that greatly diversifies the repertoire of the tran
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two single-nucleotide substitutions in PKLR constituted the molecular basis underlying pyruvate kinase (PK) deficiency in a patient with severe haemolytic anaemia. One novel mutation, IVS5+1G>A, abolished the intron 5 donor splice site. The other mutation, c.1436G>A, altered the intron 10 donor splice site consensus sequence and, moreover, encoded an R479H substitution. We studied the effects on PKLR pre-mRNA processing, using ex vivo-produced nucleated erythroid cells from the patient. Abolition of the intron 5 splice site initiated two events in the majority of transcripts: skipping of exon
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation hotspots have been a staple of mutation spectra since the introduction of fine structure mutation mapping almost 40 years ago. It has been well established that sequence context is an important determinant of mutational activity at mutagen induced hotspots and coldspots. However, our understanding of the sequence effectors of base substitution hotspots is quite limited. This is because manipulation of the sequence about a hotspot site in a marker gene is restricted by the need to maintain a functional marker. In this work, we describe a generalizable system for studying sequence conte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RFB virus is an ecotropic C-type retrovirus isolated from CF-1 mice, in which it is associated with induction of osteomas. Sequence analysis of the RFB provirus revealed no evidence for presence of an oncogene or a recombined env gene. RFB virus is a member of the murine leukemia virus (MuLV) group (RFB MuLV), sharing 97% nucleotide identity with the endogenous ecotropic provirus of AKR mice (Akv). Like Akv, expression of RFB MuLV mRNAs is inducible by dexamethasone treatment, indicating that FRB MuLV also shares transcriptional control signals with Akv. We assessed the pathogenic potential of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Androgen-dependent sexual differences in the granular convoluted tubules of mouse and rat submandibular glands (SMG) have been extensively reported. We studied two major androgen-dependent mRNAs of the rat SMG encoding proteins named SMR1 and SMR2. To determine which cell type in the SMG is responsible for synthesis of these mRNAs, we performed in situ hybridization with digoxigenin-labeled RNA probes coupled with alkaline phosphatase detection. We show that SMR1 and SMR2 mRNAs are synthesized in the acinar cells of the SMG. A clear difference in SMR1 and SMR2 mRNA levels in male and female is
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The precursor to corticotropin and beta-endorphin was synthesized in a reticulocyte cell-free system under the direction of mRNA from mouse AtT-20 pituitary tumor cells in the presence of [3H]proline, [3H]phenylalanine, [3H]leucine, [3H]valine, [3H]isoleucine or [35S]methionine. Automatic Edman degradation of the radioactive cell-free product showed the following N-terminal sequence: Pro-1, Met-2, Leu-11, Leu-12, Leu-13, Leu-15, Leu-16, Leu-17, Ile-21 and Val-23. The corticotropin-endorphin precursor was also labeled in AtT-20 cells with [3H]valine, [3H]leucine, [3H]tryptophan, [3H]serine, [35
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования