Urinary tract infections (UTIs), particularly cystitis, are among the most common bacterial infections worldwide, with a disproportionate burden on adult female individuals, who often have recurrence. The discovery of the urobiome, a low microbial biomass community in the urinary tract, has transformed our understanding of UTI pathogenesis and infection susceptibility. Experimental and omics approaches provide insights into the taxonomic and functional complexity of the urobiome, highlighting the importance of microbial metabolites, ecological interactions, and host-microbe dynamics. Polymicro
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance is a constant threat to global public health, requiring innovative strategies for therapeutic target identification. Hence, this narrative review discusses the application of structural modeling and artificial intelligence in the functional prediction of proteins encoded by multidrug-resistant bacterial genomes. Tools such as AlphaFold and RoseTTAFold have enabled high-accuracy three-dimensional structure prediction, facilitating the annotation of hypothetical proteins and the identification of conserved domains and catalytic sites. These computational approaches bridg
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An unknown-aged adult female wild boar (Sus scrofa) was brought to Kyungpook National University for postmortem examination. Gross examination revealed gallbladder agenesis. Histologically, the liver was cirrhotic and had intrahepatic cholelithiasis, the choleliths were yellow, brown, gray, and black, and had coffin-lid and pyramidal appearances. Fourier-transform infrared spectroscopy analysis revealed that the components were 80% struvite and 20% calcium oxalate monohydrate. Chronic inflammatory cell infiltration was observed, with hyperplastic hepatocellular nodules characterized by large n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus, a Gram-positive bacterium colonizing nares, skin, and the gastrointestinal tract, frequently invades the skin, soft tissues, and bloodstreams of humans. Even with surgical and antibiotic therapy, bloodstream infections are associated with significant mortality. The secretion of coagulases, proteins that associate with and activate the host hemostatic factor prothrombin, and the bacterial surface display of agglutinins, proteins that bind polymerized fibrin, are key virulence strategies for the pathogenesis of S. aureus bloodstream infections, which culminate in the estab
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein, we report an Escherichia coli-based expression and purification method of recombinant cholera toxin B subunit (CTB). The CTB gene (E. coli codon optimized) is cloned into commercial pET-22b(+) vector using standard molecular biology techniques and the resulting vector is transformed into BL21(DE3) electrocompetent cells. The bacterial cells are grown and induction with isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) results in accumulation of CTB in the culture medium. CTB is purified from the culture medium using a simple two-step chromatography process: immobilized metal affinity chroma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although rare, osteoarticular infections constitute a diagnostic and therapeutic emergency in infants and children. Their incidence has remained stable in the industrialized countries for 20 years. Their evolution has been transformed with the use of antibiotics, mortality has become exceptional and sequelae became rare. Some paediatric specificities of this type of infection are explained by many physiopathological characteristics: bacteriemic inoculation is predominant and corresponds to a particular microbial etiology, the specific vascular and tissue anatomy explains the propensity of arti
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of bacterial resistance to antibiotics poses a significant threat to human health; thus, there is an urgent need for new strategies in understanding the mechanisms of resistance and further fast prediction of it. Deep learning models offer promising solutions through analyzing genetic sequences in the prediction of bacterial resistance patterns. This study develops and validates a transformer-based deep learning model, DNABERT-2-117M, to predict gentamicin resistance in Klebsiella pneumoniae directly from whole-genome sequences. Our central methodological advance investigates the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ethylene glycol (EG) is a widely used industrial chemical with manifold applications and also generated in the degradation of plastics such as polyethylene terephthalate. Rhodococcus jostii RHA1 (RHA1), a potential biocatalytic chassis, grows on EG. Transcriptomic analyses revealed four clusters of genes potentially involved in EG catabolism: the mad locus, predicted to encode mycofactocin-dependent alcohol degradation, including the catabolism of EG to glycolate; two GCL clusters, predicted to encode glycolate and glyoxylate catabolism; and the mft genes, predicted to specify mycofactocin bio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus, a member of the group D streptococci, is normally found in the bovine rumen and human gut. It is an opportunistic pathogen that was recently determined to be a bacterial driver of colorectal cancer, in addition to causing other diseases, such as infective endocarditis, bacteremia, neonatal meningitis, and septicemia. As an emerging pathogen, not much is known about this bacterium, its virulence mechanisms, or its virulence regulatory pathways. Previous studies suggest that S. gallolyticus subsp. gallolyticus uses a ComRS pathway, one of many Stre
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial infections may constitute an important risk factor of developing cancer disease. Molecular mechanisms by which bacteria contribute to cancer are extremely complex and still remain not fully understood. So far, it is generally accepted that Helicobacter pylori infections are associated with induction of gastric adenocarcinoma and MALT lymphoma. Two H. pylori toxins which modulate many cellular functions are VacA and CagA. So far, CagA is the only one known bacterial oncoprotein. However, many other bacteria produce toxins or effector proteins perturbing host cell homeostasis or/and ev
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: One of the main issues facing public health with microbial infections is antibiotic resistance. Nanoparticles (NPs) are among the best alternatives to overcome this issue. Silver nanoparticle (AgNPs) preparations are widely applied to treat multidrug-resistant pathogens. Therefore, there is an urgent need for greater knowledge regarding the effects of improper and excessive use of these medications. The current study describes the consequences of long-term exposure to sub-lethal concentrations of AgNPs on the bacterial sensitivity to NPs and the reflection of this change on the bac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This work aimed to detect the frequency of pathogenic bacteria of zoonotic importance in ducks' dropping, their surrounding environment, and farmworkers in contact with them. Furthermore, the susceptibility pattern of isolated bacteria to antimicrobial drugs and the efficiency of disinfectants (CID 20, Durak® plus, and hydrogen peroxide (H2O2), nano zinc oxide (ZnO NPs), and hydrogen peroxide loaded nano zinc oxide (H2O2/ZnO NPs) composites against isolated bacteria were evaluated.
MATERIALS AND METHODS: A total of 271 samples were collected from duck pens, including 35 fecal dropp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the accuracy of a custom version of the generative pretrained transformer (GPT)-4o large language model (LLM) in identifying PICU admissions with vs. without bacterial pneumonia using clinical notes.
DESIGN: In this retrospective cohort study, the GPT-4o model was provided guidance on our institution's pneumonia diagnosis practices through a custom prompt and instructed to analyze PICU provider notes from the first 2 calendar days of PICU admission to identify bacterial pneumonia diagnoses. Diagnoses from the manually curated Virtual Pediatric Systems (VPS) Registry we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obesity promotes nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). The intestinal microbiota contributes to NAFLD progression through a gut-to-liver pathway that promotes inflammation and fibrosis. Gut microbiota-derived factors can travel to the liver and activate immune responses in liver resident cells to promote inflammation and NAFLD. Little is known about bacterial sensors or immune responses that can protect against NAFLD. We tested whether the bacterial cell wall sensor nucleotide-binding oligomerization domain-containing (NOD)2 protects against diet-induced NAFLD in mice. Whole body deletion
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative antimicrobials require a deep understanding of their action mechanisms by in vitro assays which support science-based field use. This study focuses on the characterization of bactericidal mechanisms of potential antimicrobial compounds, two organic acids and three single essential oil (EO) compounds against swine enteropathogenic bacteria Escherichia coli, Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium, and Clostridium perfringens. Target concentrations of the compounds were evaluated using the inhibitory potential of the vapor phase and bacterial viability after short-ter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterotrophic nitrification-aerobic denitrification (HNAD) characteristics and antibiotic resistance of two bacterial consortia, Marinomonas communis & Halomonas titanicae (MCH) and Marinomonas aquimarina & Halomonas titanicae (MAH), and their single isolates (MC, MA, and H) were determinated in this study. When cultured in sole and mixed N-source media (NH4+-N and/or NO2--N of 10 mg/L), MCH and MAH exhibited greater efficiency and stability of inorganic-N removal than single isolates, and these strains preferred to remove NH4+-N by simultaneous HNAD in mixed N-source media. Meanwhile, 45%-70%
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The genus Vitex (family Verbenaceae), commonly known as the chaste tree, includes large shrubs native to tropical and subtropical regions. Vitex leucoxylon L.f., a species widespread in India, was investigated for its antibacterial potential. Methanol and chloroform extracts from V. leucoxylon leaves were investigated through preliminary phytochemical analysis, and bioactive compounds were identified using Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS), along with Fourier-Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) to characterize functional groups. Antibacterial activity was evaluated us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of the present study was to examine the expression of FOXP3, interleukin (IL)-10, transforming growth factor (TGF)-β1, IL-17A, and T helper 17 (TH17) cells/FOXP3+ regulatory T (Treg) cells balance in the gastric mucosa of children with Helicobacter pylori infection, in relation to the gastric histopathology.
METHODS: Antral mucosal biopsies were obtained from 20 children with H pylori(+) gastritis and 20 age- and sex-matched normal controls. Histopathology was assessed by the updated Sydney classification. Gene expression of FOXP3, IL-10, and TGF-β1 was analyzed by quantita
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nocardia brasiliensis is an intracellular microorganism and the most common etiologic agent of actinomycetoma in the Americas. Several intracellular pathogens induce an immunosuppressive microenvironment through increases in CD4+ Foxp3+ regulatory T cells (Treg), thus downregulating other T-cell subpopulations and assuring survival in the host. In this study, we determined whether N. brasiliensis modulates T-lymphocyte responses and their related cytokine profiles in a murine experimental model. We also examined the relationship between N. brasiliensis immunomodulation and pathogenesis and bac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Onsets of bacterial infections devastate the compromised immune system in AIDS patients. Damaged gut mucosa permits dissemination of bacterial toxins into deeper layers and hyper-activation of the immune system. We previously reported that the unfractionated supernatants of HIV-resistant CD4(+) T cells impeded the NF-κB/DNA binding in macrophages induced by either HIV-1 or LPS. The active component of this soluble material was identified as X-DING-CD4 (extracellular DING from CD4 T cells). We hypothesized that the anti-inflammatory effect of the X-DING-CD4 protein might extend to non-immune ce
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.