Redox enzymes play an essential role in nature and in biotechnological applications such as (photo)biocatalysis and biosensing. Understanding how a protein's sequence and structure tune its redox potential is very valuable for engineering proteins with tailored (photo)redox properties. Since protein redox potential measurements are laborious, reliable redox potential computations present an attractive alternative. However, redox calculations come with their own set of challenges, such as ensuring adequate sampling and accurate force fields. Dealing with charge-changing states introduces additi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enzyme applications in industry are often limited by low stability, poor reusability and challenging recovery. This study presents a sustainable strategy for enhancing enzyme performance by immobilizing porcine pancreatic lipase (PPL) onto Ganoderma lucidum using a hydrophobic deep eutectic solvent (HDES) as a reaction medium to facilitate enzyme immobilization. Among several HDESs tested, menthol:decanoic acid (HDES 1) showed the highest lipase activity (198.38%) and was selected for immobilization. Under optimized conditions (3 h, 40 °C, pH 7.0), the immobilized PPL achieved 212.41% catalyti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Allitol is a rare sugar alcohol with potential as a low-calorie sweetener and food ingredient; however, its biocatalytic production from d-allulose is limited by the thermostability and cofactor efficiency of the ribitol dehydrogenases (RDH).
RESULTS: In this study, the RDH from Klebsiella oxytoca was engineered for enhanced thermostability using consensus-guided mutagenesis targeting non-conserved, non-active-site residues, followed by stepwise combination. The resulting M4 mutant showed markedly improved thermostability, with its melting temperature (Tm) elevated by 19.6 °C rela
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioelectrocatalysis, which couples enzymatic catalytic and electrode reactions, is the basic principle behind enzyme electrochemical biosensors, biofuel cells, and bioelectrosynthesis systems. Electron mediators facilitate the transfer of electrons between electrodes and oxidoreductases during catalytic reactions, so ideally the mediator remains near the electrode for higher catalytic efficiency. Additionally, electrode materials with three-dimensional space at the enzyme volume mesoscale are expected to improve electrode performance (e.g., increased current density and stability). In previous
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein lipoengineering is a promising approach for programming biomolecular assembly and function, yet its use has remained confined to biologically inert lipids. Here, we repurpose the hedgehog autoprocessing domain as a biocatalyst to install the anticancer sterol abiraterone as a noncanonical post-translational modification (ncPTM) on an intrinsically disordered protein scaffold. Artificial abirateronylation produced protein-drug conjugates (PDCs) with significantly enhanced solubility, tunable phase behavior, and dynamic self-association. The conjugates underwent slow hydrolytic release o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophage endolysins are attractive alternatives to antibiotics owing to their rapid action, host specificity, and unlikeliness of resistance development. Here, bioinformatic analysis of Streptococcus suis prophage sequences identified an endolysin, named PlyCYU, containing two putative catalytic domains-an N-terminal amidase_5 and a C-terminal glucosaminidase (Lyz2) domain-with two CW_7 family cell wall binding motifs. PlyCYU exhibited bactericidal activity against Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae, and Streptococcus uberis, with a minimum bactericidal concentration (MB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amine transaminases (ATAs) are pyridoxal-5'-phosphate (PLP)-dependent enzymes that catalyze the transfer of an amino group from an amino donor to an aldehyde and/or ketone. In the past decade, the enzymatic reductive amination of prochiral ketones catalyzed by ATAs has attracted the attention of researchers, and more traditional chemical routes were replaced by enzymatic ones in industrial manufacturing. In the present work, the influence of the presence of an α,β-unsaturated system in a methylketone model substrate was investigated, using a set of five wild-type ATAs, the (R)-selective from A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomineralization is the process by which organisms produce hard inorganic matter from soft tissues with outstanding control of mineral deposition in time and space. For this purpose, organisms deploy a sophisticated "toolkit" that has resulted in significant evolutionary innovations, for which calcium phosphate (CaP) is the biomineral selected for the skeleton of vertebrates. While CaP mineral formation in aqueous media can be investigated by studying thermodynamics and kinetics of phase transitions in supersaturated solutions, biogenic mineralization requires coping with the inherent complex
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human serum albumin (HSA) is a promising drug delivery carrier. Although covalent modification of Cys34 is a well-established method, it is desirable to develop a novel covalent modification method that targets residues other than cysteine to introduce multiple functions into a single HSA molecule. We developed a tyrosine-selective modification of HSA. Three tyrosine selective modification methods, hemin-catalyzed, horseradish peroxidase (HRP)-catalyzed, and laccase-catalyzed reactions were performed, and the modification efficiencies and modification sites of the modified HSAs obtained by the
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptidylprolyl isomerases (PPIases) catalyze cis/trans isomerization of prolines. The PPIase CypA colocalizes with the Parkinson's disease (PD)-associated protein α-synuclein in cells and interacts with α-synuclein oligomers. Herein, we describe atomic insights into the molecular details of the α-synuclein/CypA interaction. NMR spectroscopy shows that CypA catalyzes isomerization of proline 128 in the C-terminal domain of α-synuclein. Strikingly, we reveal a second CypA-binding site formed by the hydrophobic sequence 47 GVVHGVATVA56 , termed PreNAC. The 1.38 Å crystal structure of the CypA/Pre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An important mechanism of resistance to β-lactam antibiotics is via their β-lactamase-catalyzed hydrolysis. Recent work has shown that, in addition to the established hydrolysis products, the reaction of the class D nucleophilic serine β-lactamases (SBLs) with carbapenems also produces β-lactones. We report studies on the factors determining β-lactone formation by class D SBLs. We show that variations in hydrophobic residues at the active site of class D SBLs (i.e. Trp105, Val120, and Leu158, using OXA-48 numbering) impact on the relative levels of β-lactones and hydrolysis products formed. So
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: NAA10 is the catalytic subunit of the major N-terminal acetyltransferase complex NatA which acetylates almost half the human proteome. Over the past decade, many NAA10 missense variants have been reported as causative of genetic disease in humans. Individuals harboring NAA10 variants often display variable degrees of intellectual disability (ID), developmental delay, and cardiac anomalies. Initially, carrier females appeared to be oligo- or asymptomatic with X-inactivation pattern skewed towards the wild type allele. However, recently it has been shown that NAA10 variants can cause
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the tripartite motif family of E3 ubiquitin ligases are characterized by the presence of a conserved N-terminal module composed of a RING domain followed by one or two B-box domains, a coiled-coil and a variable C-terminal region. The RING and B-box are both Zn-binding domains but, while the RING is found in a large number of proteins, the B-box is exclusive to the tripartite motif (TRIM) family members in metazoans. Whereas the RING has been extensively characterized and shown to possess intrinsic E3 ligase catalytic activity, much less is known about the role of the B-box domains.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mixed larvae and pupae of weaver ant (Oecophylla smaragdina) are widely used as an important food ingredient in regions of Thailand. They have high nutritional values and comprise 53% protein and 13% lipid. Peptides derived from food proteins have been shown to possess biological activities.
RESULTS: Peptides derived from pepsin and trypsin digestion of these weaver ant larvae and pupae were purified based on angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitory and antioxidant activities, and their amino acid sequences were identified by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (L
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Closely related penta- and octaheme nitrite reductases catalyze the reduction of nitrite, nitric oxide, and hydroxylamine to ammonium and of sulfite to sulfide. NrfA pentaheme nitrite reductase plays the key role in anaerobic nitrate respiration and the protection of bacterial cells from stresses caused by nitrogen oxides and hydrogen peroxide. Octaheme nitrite reductases from bacteria of the Thioalkalivibrio genus are less studied, and their function in the cell is unknown. In order to estimate the possible role of octaheme nitrite reductases in the cell resistance to oxidative stress, the pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The alpha carbonic anhydrases (α-CAs) are a group of structurally related zinc metalloenzymes that catalyze the reversible hydration of CO2 to HCO3(-). Humans have 15 different α-CAs with numerous physiological roles and expression patterns. Of these, 12 are catalytically active, and abnormal expression and activities are linked with various diseases, including glaucoma and cancer. Hence there is a need for CA isoform specific inhibitors to avoid off-target CA inhibition, but due to the high amino acid conservation of the active site and surrounding regions between each enzyme, this has proven
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The currently known methods of enzymatic β-lactam synthesis, as well as the enzymes and heterogeneous biocatalysts used for this purpose, are presented, and the published reports on advances in the field of enzymatic synthesis of selected antibiotics belonging to the groups of acidic penicillins and acidic cephalosporins are summarized in the present review. The key conditions and parameters of biocatalytic processes, such as the biocatalyst form, concentration of the precursor compounds, solvent type, pH, temperature, etc. are analyzed and compared, and guidelines for further optimization of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work reports a rapid and sensitive organophosphates (OPs) amperometric biosensor based on acetylcholinesterase (AChE) immobilized on CdS-decorated graphene (CdS-G) nanocomposite. The as-prepared biosensor shows high affinity to acetylthiocholine (ATCl) with a Michaelis-Menten constant (K(m)) value of 0.24 mM. A rapid inhibition time (2 min) is obtained due to the integration of the CdS-G nanocomposite. Based on the inhibition of OPs on the enzymatic activity of the immobilized AChE, and used carbaryl as the model compound, the resulting biosensor exhibits excellent performance for OPs det
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new secretory phospholipase A2 (sPLA2) isoform from Bothrops jararacussu venom (BjVIII) has been characterized by causing platelet aggregation, an absent activity in BthTx-I, Prtx-I and PrTx-II sPLA2s. According to our results, BjVIII also enhances insulin release by the pancreatic beta cells. The complete amino acid sequence of the new isoform was determined by Edman degradation and de novo peptide sequencing. These analyses showed a G35K amino acid modification for BjVIII in comparison with BthTx-I, PrTx-I and Prtx-II, a structural difference that has been related to the conflicting biolog
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ionic liquids (ILs) have evolved as a new type of non-aqueous solvents for biocatalysis, mainly due to their unique and tunable physical properties. A number of recent review papers have described a variety of enzymatic reactions conducted in IL solutions, on the other hand, to improve the enzyme's activity and stability in ILs; major methods being explored include the enzyme immobilization (on solid support, sol-gel, etc.), protic ionic liquids used as an additive process. The immobilization of the lipase from Burkholderia cepacia by the sol-gel technique using protic ionic liquids (PIL) as a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования