The transcription factor Pax6, a member of the Pax family class IV, is a key regulator of multiple developmental processes. These include brain patterning, neuronal specification, migration, maturation, and axonal guidance, all of which are essential for the formation of proper neuronal networks. In the mammalian brain, Pax6 exhibits region-specific expression throughout the entire lifespan. During early embryogenesis, the chromatin remodeling BAF complex cooperates with Pax6 to direct cell differentiation along the neuroectodermal pathway. This partnership regulates the development of neurons…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Covalently closed circular DNA (cccDNA) is a stable episomal form of the hepatitis B virus (HBV) genome that serves as the template for viral transcription and replication and represents a major barrier to HBV cure. Here, we investigated chromatin accessibility patterns of cccDNA in HBV-infected hepatocyte cells at single-molecule resolution. We found that most cccDNA copies exhibited limited accessibility around nucleotides 800-1000, a region overlapping the polymerase open reading frame and the pregenomic RNA transcriptional region. Notably, a small subset of cccDNA showed detectable accessi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cisplatin [cis-diamminedichloroplatinum(II)] is a widely used chemotherapeutic agent that induces cytotoxicity primarily through DNA damage; however, drug resistance severely limits its efficacy. Cisplatin resistance is complex and multifactorial, involving DNA repair via nucleotide excision repair (NER), increased detoxification activities, and overexpression of lysine deacetylases (KDACs), which reduce chromatin accessibility and alter transcriptional regulation. Combining cisplatin with KDAC inhibitors has shown promise, often attributed to increased drug sensitivity through higher chromati…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ATP-dependent chromatin remodeling is essential for replication, transcription, and DNA repair, especially DNA double-strand break (DSB) repair. However, the mechanisms underlying chromatin remodeling remain elusive. Here, we investigated the role of CHRAC17, a component of the chromatin assembly complex (CHRAC), in maintaining genome stability. In response to DSBs, the ISWI-family ATPase complex SNF2H-ACF1 is immediately recruited to DSBs through the H2B-type histone-fold protein CHRAC17, forming CHRAC, which promotes nucleosome assembly and recruits BRCA1 and RAD51 to the DSB site. CHRAC pro…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Chromatin in the cell nucleus adopts a complex three-dimensional (3D) structure shaped by folding and interactions, with chromatin loops serving as fundamental organizational units. Accurate loop prediction is essential for understanding gene regulation and disease mechanisms. However, existing chromatin loop prediction methods still face challenges in noise handling, data imbalance, and multi-omics integration.
RESULTS: In this study, we present CNNKSCEC, a deep learning-based framework for chromatin loop prediction via multi-source feature fusion. The model integrates Hi-C and D…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Biallelic variants in FSIP2 have been associated with multiple morphological abnormalities of the sperm flagella (MMAF) and acrosomal defects. This study aimed to characterize the genetic, sperm phenotypic, and reproductive features of infertile men carrying homozygous FSIP2 variants, with particular attention to sperm nuclear ultrastructure and chromatin condensation.
METHODS: Two infertile men with severe sperm morphological abnormalities were enrolled. Whole-exome sequencing and Sanger sequencing were performed to identify candidate variants. Sperm morphology, FSIP2 expression, ac…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant epigenetic reprogramming together with dysregulated mTOR signaling are hallmarks of cancer, where altered chromatin methylation and nutrient-sensing pathways cooperate to drive tumor progression. S-adenosylmethionine (SAM), the universal methyl donor, is essential for these processes, yet how tumors sustain elevated SAM availability to support oncogenic transmethylation reactions remains poorly defined. Here, using prostate cancer (PCa) as a model system, we identify nicotinamide N-methyltransferase (NNMT) as a critical metabolic-epigenetic regulator and tumor suppressor. Using a pros…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Neonatal necrotizing enterocolitis (NEC) is a severe gastrointestinal disorder with high mortality, characterized by epit … charide, we applied an integrated multi-omics framework to map epithelial injury at transcriptomic, chromatin accessibility, and spatial levels. These included bulk RNA sequencing, single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq), single-nucleus assay for transposase-accessible chromatin sequencing (snATAC-seq), and multiplexed error-robust fluorescence in situ hy …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traditional wound therapies continue to be predominantly exogenous and address extracellular causes of the pathology without addressing the impaired function of cellular pathways that are trapped in the state of constant inflammation. The present review explores a novel putative nutriepigenetic framework, discussing how the honey matrix could act as a proposed modulator of the altered epigenetic landscape in non-healing ulcers. Honey contains a complex mixture of bioactive agents (polyphenols, flavonoids, and plant-derived xenomiRs) that are hypothesized to interact with multiple chromatin con…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oogonial stem cells (OSCs) are a type of reproductive germline stem cell present in the ovaries of adult animals after birth. They have been … e Hippo pathway including YAP1 and TEAD1. Pharmacological inhibition of H3K27me3 reduced repressive chromatin marks, restored Hippo pathway gene expression, and significantly enhanced OSC proliferation. Conversely, YAP1 knockdown attenuated proliferation-associated gene expression. These findings indicate that age-dependent H3K27me3 accumulation suppresses …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steroid hormone receptors are traditionally described through models derived from simplified experimental conditions that do not fully recapitulate the physiological environment. In this review, we propose an integrated physiological framework for understanding steroid receptor function, in which chromatin organization, mechanotransduction, receptor network plasticity, and dynamic nuclear organization are recognized as fundamental components of hormone signaling rather than secondary regulatory layers. We highlight how steroid receptor signaling in breast cancer emerges from the coordinated in…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex molecular mechanisms underlie the heterogeneity of microglia immune functions in neurodegenerative diseases. Here, we report on the … ammatory microglial polarization process. Therefore, distinct configurations of signals, along with chromatin remodeling, orchestrate transcription in microglia to support their immune activities in the context of demyelination.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke constitutes a multifaceted neurological affliction that spans various cellular types. Lack of dynamic chromatin accessibility data after stroke is one of the obstacles to understanding this process. To gain insights into the variations in transcriptional regulation among various cell types subsequent to a stroke, we employed single-nucleus ATAC-seq to curate a chromatin accessibility compendium from the cerebral cortex of mice subjected to middle cerebral artery occlusion/reperfusion (MCAO/R). Tissue samples were collected at various time points including 0, 6, 12, 24 hours, an…
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent advances in high-throughput transcriptomics have revealed extensive gene expression changes during cerebral ischemia. However, the changes in 3-dimensional chromatin architecture and long-range chromatin looping between genes and distal regulatory elements that drive these gene expression changes remain virtually unexplored. In this study, we map the landscape of the dynamic alterations in topologically associating domains and chromatin loops in the ischemic cortex and evaluate their contributions to poststroke transcriptional changes.
METHODS: We used high-throughput chrom…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Temperature fluctuations challenge ectothermic species, particularly tropical fish dependent on external temperatures for physiological regulation. However, the molecular mechanisms through which low-temperature stress impacts immune responses in these species, especially in relation to chromatin accessibility and epigenetic regulation, remain poorly understood. In this study, we investigate chromatin and transcriptional changes in the head kidney and thymus tissues of Nile tilapia (Oreochromis niloticus), a tropical fish of significant economic importance, under cold stress. By analyzing cis-…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin remodelling complexes like the SHPRH (sucrose non-fermenting 2 (SNF2), histone linker, plant homeodomain (PHD), really interesting new gene (RING), and helicase domains) control gene expression via ATPase and nucleosome-E3 ubiquitin ligase activities. The members of SHPRH have been shown to play substantial roles in DNA repair in mammals, while their functions remain largely unknown in plants. In this study, we further investigated a SHPRH member designated as BrCHR39 in Brassica rapa, building on earlier experimental evidence from our laboratory that highlighted its functional signi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report eight children with de novo pathogenic DNA variants in chromatin-related genes: MORC2, CHD7, KANSL1, KMT2D, ZMYND11, HIST1HIE, EP300, and KMT2B. All children experienced infection or vaccine-provoked neuroregression or abrupt-onset neuropsychiatric syndromes. Most had delayed development (n = 6) before the first regression, and four had immune deficiency or autoimmunity (n = 4). At a mean age of 4 years 2 months (range 1-8 years), symptoms included infection-provoked autistic/language regression (n = 6), cognitive decline (n = 3), gait deterioration (n = 3), or abrupt-onset anxiety, …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have reported that chronic lymphocytic leukemia (CLL) shows a de novo chromatin activation pattern compared with normal B cells. Here, we explored whether the level of chromatin activation is related to the clinical behavior of CLL. We identified that, in some regulatory regions, increased de novo chromatin activation is linked to clinical progression, whereas, in other regions, it is associated with an indolent course. We next developed 2 prognostic scores for progressive and indolent disease, respectively, calculated a single score representing the balance between them, and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BPTF, the scaffolding subunit of the nucleosome remodeling factor (NURF) complex, has been implicated in the progression of several malignancies, but its role in prostate cancer (PCa) remains unclear. Here, we demonstrate that BPTF is upregulated in castration-resistant prostate cancer (CRPC) and promotes disease progression. RNA-seq revealed that BPTF primarily enhances the expression of androgen receptor (AR) target genes. ChIP-seq showed that BPTF increases AR binding at promoters, enhancers and super-enhancers. ATAC-seq further demonstrated that BPTF increases chromatin accessibility to fa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CECR2 is a bromodomain-containing epigenetic regulator essential for maintaining chromatin architecture and is implicated in diverse biological processes, including cellular development, spermatogenesis, neurulation, and DNA damage response. Acting as a histone acetyl-lysine reader, CECR2 participates in chromatin remodeling through the formation of tissue-specific complexes with ISWI proteins. With its well-established roles in somatic cell reprogramming, CECR2 has recently emerged as a promising therapeutic target in breast cancer metastasis. In this review, we discuss its origin, structural…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования