Small RNAs (sRNAs) in bacteria have emerged as key players in transcriptional and post-transcriptional regulation of gene expression. Here, we present a statistical analysis of different sequence- and structure-related features of bacterial sRNAs to identify the descriptors that could discriminate sRNAs from other bacterial RNAs. We investigated a comprehensive and heterogeneous collection of 816 sRNAs, identified by northern blotting across 33 bacterial species and compared their various features with other classes of bacterial RNAs, such as tRNAs, rRNAs and mRNAs. We observed that sRNAs diff
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In China, there is a high prevalence of antibiotic-resistant Helicobacter pylori infections in the population. The aim of the study was to assess a new ARMS-PCR test for detection of H. pylori clarithromycin resistance (CR) and quinolone resistance (QR) mutations and evaluate the spectrum of antibiotic resistance in patients from three Chinese provinces. Sanger sequencing and multiplex ARMS-PCR were used to detect H. pylori CR and QR bacteria in gastric biopsy samples. Among the 1,182 patients enrolled with gastritis, 643 (54.4%) were positive for H. pylori. Of these, 371 (57.7%) had antibioti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance is a major threat to modern society and healthcare, as it severely compromises the efficacy of standard antibiotic treatments. To meet the ever-increasing demand for novel antimicrobial drugs, it is crucial to develop new strategies for screening antimicrobial compounds and improve existing high-throughput techniques. Reporter systems that employ specific genetic markers are powerful tools not only for detecting antimicrobial activity of the substance being studied, but also for identifying the potential mechanism of its action. Among other metabolic pathways, RNA bios
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Group A Streptococcus (GAS) is a Gram-positive human pathogen that causes a variety of diseases ranging from pharyngitis to life-threatening streptococcal toxic shock syndrome. Recently, several global gene expression analyses have yielded extensive new information regarding the regulation of genes encoding known and putative virulence factors in GAS. A microarray analysis found that transcription of the GAS gene M5005_Spy_1343 was significantly increased in response to interaction with human polymorphonuclear leukocytes. M5005_Spy_1343 is predicted to encode a member of the LysR family of tra
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylmercury is an environmental toxicant that biomagnifies and causes severe neurological degeneration in animals. It is produced by bacteria in soils and sediments that have been contaminated with mercury. To explore the potential of plants to extract and detoxify this chemical, we engineered a model plant, Arabidopsis thaliana, to express a modified bacterial gene, merBpe, encoding organomercurial lyase (MerB) under control of a plant promoter. MerB catalyzes the protonolysis of the carbon---mercury bond, removing the organic ligand and releasing Hg(II), a less mobile mercury species. Tran
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fumarase C was strongly induced by paraquat in a parental strain of Escherichia coli but was not induced in a strain lacking the soxRS response. Moreover, a strain that constitutively expresses the soxRS regulon contained more fumarase C than did the parental strain. The Mn-containing superoxide dismutase and glucose-6-phosphate dehydrogenase, members of the soxRS regulon, were similarly induced by paraquat. Mutational defects in glucose-6-phosphate dehydrogenase increased the induction of fumarase C by paraquat. For Mn-containing superoxide dismutase, responsiveness to paraquat was also enhan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gene (ermA) coding for a presumed erythromycin-resistance (ErR) determinant from an Er-producing Arthrobacter sp. strain (NRRLB3381) was isolated from a gene bank in phage vector lambda 2001 by probing with a Streptomyces ErR gene. Strongly hybridizing fragments were subcloned and the appropriate segments sequenced. The ermA gene is 76 mol% G + C in content and specifies a protein of 340 aa with an Mr of 37454. S1 nuclease mapping and primer extension identified the putative promoter, which resembles the consensus sequence of Escherichia coli promoters particularly in the -10 region. A poten
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria adhesin A (NadA) is present on the meningococcal surface and contributes to adhesion to and invasion of human cells. NadA is also one of three recombinant antigens in the recently-approved Bexsero vaccine, which protects against serogroup B meningococcus. The amount of NadA on the bacterial surface is of direct relevance in the constant battle of host-pathogen interactions: it influences the ability of the pathogen to engage human cell surface-exposed receptors and, conversely, the bacterial susceptibility to the antibody-mediated immune response. It is therefore important to underst
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Zinc is widely present in the oral microenvironment and can influence the growth of oral bacteria. ZccR is a MerR-type transcriptional regulator that controls zinc efflux in Streptococcus mutans (S. mutans), but its role in biofilm virulence and interspecies competition with oral commensals remains unclear. This study aimed to investigate the role of ZccR in the formation of single-species biofilms of S. mutans and dual-species biofilms with oral commensal streptococci, and its underlying regulatory mechanisms.
METHODS: We constructed an in-frame zccR knockout mutant of S. mutans.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, our group showed that the dental pathogen Streptococcus mutans is inherently more tolerant to high zinc stress than other streptococci, a phenotype associated with the presence of a P-type ATPase exporter named ZccE, virtually unique to S. mutans. In addition to zccE, a previous transcriptome analysis revealed that S. mutans upregulates genes involved in glutathione uptake during initial exposure to zinc stress. Glutathione, a major supplier of organic sulphur that also plays key roles in antioxidant defence and xenobiotic detoxification, forms coordination complexes with a variety o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Obligate intracellular pathogenic bacteria belonging to the order Rickettsiales include several important emerging pathogens causing major health and economic impact to humans, companion animals, and agricultural animals. Despite some recent progress, the lack of well-established genetic manipulation methods for diverse research applications remains a challenge. We recently reported the establishment of targeted mutagenesis to disrupt genes in Ehrlichia and Anaplasma species. Many essential genes of the obligate pathogens, such as Ehrlichia chaffeensis, are likely refractory to tar
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusobacterium nucleatum subsp. animalis (FNA) plays a prominent role in oral microbial ecology and is increasingly implicated in systemic diseases such as colorectal cancer. However, its genetic intractability has significantly hindered functional studies to understand its pathogenic mechanisms. To address this challenge, we developed a conditional plasmid system that enables efficient, markerless gene deletion in FNA strains. This system features inducible control of plasmid replication via a theophylline-responsive riboswitch regulating repA, and counterselection via the MazF toxin under the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella biofilms are mainly formed by cellulose and curli fimbriae under the control of CsgD. Biofilm regulation also involves small RNAs and LuxS-mediated AI-2 quorum sensing. This study aimed to investigate the relationship between CsgD and quorum-sensing regulation in Salmonella Typhimurium. By modulating csgD expression, the impact on the expression levels of MicA, CsrB, CsrC, and RyeE sRNAs-sRNAs implicated in QS-linked regulatory pathways-was assessed. Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) analyses demonstrated that the expression of these sRNAs was increased following perturbation of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis is an obligate intracellular bacterium of major clinical significance. While untreated sexually transmitted infections can result in pelvic inflammatory disease and infertility, ocular infections can cause the blinding disease trachoma. During infection of host cells, C. trachomatis transitions between the non-replicative, infectious elementary body (EB) and the replicative, non-infectious reticulate body (RB). ObgE is a GTPase that can promote morphological differentiation in some bacteria. In C. trachomatis, obgE is maximally expressed from 16 to 24hpi, a timeframe that
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pneumoniae (pneumococcus) causes multiple infectious diseases. The pneumococcal competence system facilitates genetic transformation, spreads antibiotic resistance, and contributes to virulence. DNA-processing protein A (DprA) regulates the exit of pneumococcus from the competent state. Previously, we have shown that DprA is important in both bacteremia and pneumonia infections. Here, we examined the mechanisms of virulence attenuation in a ΔdprA mutant. Compared to the parental wild-type D39, the ΔdprA mutant enters the competent state when exposed to lower concentrations of the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nitrogen phosphotransferase system (PTSNtr) is a regulatory cascade present in many bacteria, where it controls different functions. This system is usually composed of three basic components: enzyme INtr (EINtr), NPr, and EIIANtr (encoded by the ptsP, ptsO, and ptsN genes, respectively). In Legionella pneumophila, as well as in many other Legionella species, the EIIANtr component is missing. However, we found that deletion mutations in both ptsP and ptsO are partially attenuated for intracellular growth. Furthermore, these two PTSNtr components were found to be required for maximal express
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The search for novel immunogenic polypeptides to improve the accuracy and reliability of serologic diagnostic methods for Burkholderia pseudomallei infection is ongoing. We employed a rapid and efficient approach to identify such polypeptides with sera from melioidosis patients using a small insert genomic expression library created from clinically confirmed local virulent isolates of B. pseudomallei. After 2 rounds of immunoscreening, 6 sero-positive clones expressing immunogenic peptides were sequenced and their identities were: benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit, a putative 200 kDa antig
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The phosphorus compounds serve as major building blocks of many biomolecules, and have important roles in signal transduction. The phosphate is involved in many biochemical reactions by the transfer of phosphoryl groups. All living cells sophisticatedly regulate the phosphate uptake, and survive even under phosphate-limiting condition, and thus phosphate metabolism is closely related to the diverse metabolism including energy and central carbon metabolism. In particular, phosphorylation may play important roles in the metabolic regulation at acidic condition and nitrogen limiting c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae, the causative agent of cholera and a natural inhabitant of aquatic environments, regulates numerous behaviors using a quorum-sensing (QS) system conserved among many members of the marine genus Vibrio. The Vibrio QS response is mediated by two extracellular autoinducer (AI) molecules: CAI-I, which is produced only by Vibrios, and AI-2, which is produced by many bacteria. In marine biofilms on chitinous surfaces, QS-proficient V. cholerae become naturally competent to take up extracellular DNA. Because the direct role of AIs in this environmental behavior had not been determine
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biodegradation of TCE was studied in a laboratory scale biofilter packed with wood charcoal and inoculated with mixed culture of methanotrophs isolated from local soil. The removal efficiency was found to be higher than 90% up to an inlet load of 5.1g/m(3)h. The maximum elimination capacity was 6.7g/m(3)h at an inlet loading rate of 11.3g/m(3)h. The reaction constants EC(max,)K(s) and K(i) calculated from the experimental results are also presented. The biodegradation process is found to be inhibited at higher TCE concentration. The carbon dioxide production rate has been found to be a lin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования