BACKGROUND AND PURPOSE: Stroke is the second leading cause of death worldwide and the leading cause of mortality and long-term disability in China, but its underlying risk genes and pathways are far from being comprehensively understood. We here describe the design and methods of whole genome sequencing (WGS) for 10 914 patients with acute ischaemic stroke or transient ischaemic attack from the Third China National Stroke Registry (CNSR-III).
METHODS: Baseline clinical characteristics of the included patients in this study were reported. DNA was extracted from white blood cells of participant
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Many phenotypic variations in the expression of blood group A have been explained by variations in gene structure, but unresolved samples are frequently encountered in the reference laboratory. Among ABO subgroups, A(bantu) has the highest frequency in a specified population. The molecular basis of this phenotype is now described.
MATERIALS AND METHODS: Blood from Black donors phenotyped as A(bantu) was subjected to genomic ABO screening and direct sequencing of polymerase chain reaction (PCR)-amplified ABO exons 1-7 and introns 2-6. Total RNA was extracted and ABO
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Failed surface expression of the complement decay-accelerating factor (DAF) due to mutation of the PIG-A gene is a hallmark of affected paroxysmal nocturnal haemoglobinuria (PNH) blood elements. Previous findings that acute myelogenous leukaemia (AML) blasts evolving in a PNH patient differed from idiopathic AML blasts in that they exhibited DAF negativity suggested that the leukaemic blasts derived from an affected PNH cell. To investigate whether these cells differ from untransformed PNH cells in PIG-A genetic alterations or in DAF mRNA processing, or are distinguishable from conventional AM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In July 2025, a large chikungunya outbreak occurred in southern China, with more than 5000 cases reported within a single month. However, the genomic basis of this urban outbreak remains poorly characterized.
METHODS: A total of 804 CHIKV-positive clinical specimens were collected through routine surveillance and outbreak investigations by the Shenzhen Center for Disease Control and Prevention. Following whole-genome sequencing and quality control, 614 genomes were retained and analyzed in combination with 1105 publicly available CHIKV genomes sampled globally between 1953 and 202
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Karyotype abnormalities are frequent in immortalized continuous cell lines either transformed or derived from primary tumors. Chromosomal rearrangements can cause dramatic changes in gene expression and affect cellular phenotype and behavior during in vitro culture. Structural variations of chromosomes in many continuous mammalian cell lines are well documented, but chromosome aberrations in cell lines from other vertebrate models often remain understudied. The chicken LSCC-HD3 cell line (HD3), generated from erythroid precursors, was used as an avian model for erythroid differenti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococci producing exfoliative toxins are the causative agents of staphylococcal scalded skin syndrome (SSSS). Exfoliative toxin A (ETA) is encoded by eta, which is harbored on a temperate bacteriophage ΦETA. A recent increase in the incidence of SSSS in North America has been observed; yet it is largely unknown whether this is the result of host range expansion of ΦETA or migration and emergence of established lineages. Here, we detail an outbreak investigation of SSSS in a neonatal intensive care unit, for which we applied whole-genome sequencing (WGS) and phylogenetic analysis of Staph
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To maintain prolonged infection of mammals, African trypanosomes have evolved remarkable surface coats and a system of antigenic variation1. Within these coats are receptors for macromolecular nutrients such as transferrin2,3. These must be accessible to their ligands but must not confer susceptibility to immunoglobulin-mediated attack. Trypanosomes have a wide host range and their receptors must also bind ligands from diverse species. To understand how these requirements are achieved, in the context of transferrin uptake, we determined the structure of a Trypanosoma brucei transferrin recepto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The susceptibility single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genome-wide association studies leave some thorny questions, such as prioritization, false positives and unknown pathogenesis. Previous studies suggested that genetic variation may perturb the RNA secondary structure, influence protein recruitment and binding and ultimately affect splicing processes. Therefore, exploring the perturbation of SNPs to structure-function correlations may provide an effective bridge toward understanding the genetic contribution to diseases. Here, aiming to decipher the regulatory mechanism of myo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori, a Gram-negative pathogen associated with ulcers, chronic gastritis, and gastric cancers, has been a resident of the human stomach since early human history [1]. This association has only recently begun to erode with the advent of antibiotics and modern lifestyles, but even today H. pylori colonizes approximately half the world's population. To have remained a successful colonizer of humans during thousands of years of association, populations of H. pylori must have been able to survive and adapt to countless evolutionary challenges within and between hosts. As a species, H
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium abscessus (Mab) is a rapidly growing non-tuberculous mycobacterium that causes opportunistic infections and exhibits extensive intrinsic antibiotic resistance. The proline-glutamate (PE) and proline-proline-glutamate (PPE) protein families are mycobacteria-specific virulence factors implicated in immune modulation, antigenic variation, and persistence. While Mycobacterium tuberculosis (Mtb) harbors approximately 170 PE/PPE members, the repertoire of PE/PPE genes in Mab remains largely uncharacterized. Here, we performed a genome-wide survey of PE/PPE genes in Mab ATCC 19,977 and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duck viral hepatitis (DVH) caused by duck hepatitis A virus (DHAV) is a highly contagious and economically important disease of ducklings worldwide. In many parts of the globe, disease outbreaks are reported in spite of vaccinations, probably due to antigenic diversity among DHAV genotypes. We previously reported the first isolation of DHAV-2 (Genotype-2) from ducklings in Tamil Nadu, India. In this study, we discuss the complete genome sequence of this DHAV-2 isolate (OQ862826). The DHAV-2 genome is 7769 bp long, with a 5'-UTR of 653 bp and a 3'-UTR of 366 bp. Phylogenetic analysis showed clu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MDC1 (Mediator of DNA damage Checkpoint protein 1) functions to facilitate the localization of numerous DNA damage response (DDR) components to DNA double-strand break sites. MDC1 is an integral component in preserving genomic stability and appropriate DDR regulation. There haven't been systematic investigations of MDC1 mutations that induce cancer and genomic instability. Variations in nsSNPs have the potential to modify the protein chemistry and their function. Describing functional SNPs in disease-associated genes presents a significant conundrum for investigators, it is possible to assess
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Significant selection pressure has been exerted on the genomes of human populations exposed to Plasmodium falciparum infection, resulting in the acquisition of mechanisms of resistance against severe malarial disease. Many host genetic factors, including sickle cell trait, have been associated with reduced risk of developing severe malaria, but do not account for all of the observed phenotypic variation. Identification of novel inherited risk factors relies upon high-resolution genome-wide association studies (GWAS). We present findings of a GWAS of severe malaria performed in a Tanzanian popu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Corydalis DC., the largest genus in the family Papaveraceae, comprises > 465 species. Complete plastid genomes (plastomes) of Corydalis show evolutionary changes, including syntenic arrangements, gene losses and duplications, and IR boundary shifts. However, little is known about the evolution of the mitochondrial genome (mitogenome) in Corydalis. Both the organelle genomes and transcriptomes are needed to better understand the relationships between the patterns of evolution in mitochondrial and plastid genomes.
RESULTS: We obtained complete plastid and mitochondrial genomes from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural variation (SV) serves as a fundamental driver of phenotypic diversity and environmental adaptation in plants and animals, significantly influencing key agronomic traits in crops. Common wheat (Triticum aestivum L.), an allohexaploid species, harbors extensive chromosomal SVs and distant hybridization-induced recombination events that provide critical resources for genetic improvement. This study utilizes non-denaturing fluorescence in situ hybridization (ND-FISH) and oligonucleotide multiplex probe-based FISH (ONPM-FISH) to analyze the karyotypes of 153 BC1F4-BC1F6 lines derived fro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The global resurgence of treponematoses, particularly syphilis, poses a growing public health challenge. Despite advances in sequencing technologies, obtaining complete Treponema pallidum genome sequences for epidemiological studies remains challenging due to clinical sampling and methodological constraints. There is, therefore, a need for rapid, cost-effective, and accessible typing methods. Based on the analysis of 121 T. pallidum genomes spanning all three subspecies (TPA, TPE, and TEN) from diverse regions, we selected seven highly variable genes (tp0136, tp0326, tp0548, tp0705
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cryptococcus gattii is a fungal pathogen of humans, causing pulmonary infections in otherwise healthy hosts. To characterize genomic variation among the four major lineages of C. gattii (VGI, -II, -III, and -IV), we generated, annotated, and compared 16 de novo genome assemblies, including the first for the rarely isolated lineages VGIII and VGIV. By identifying syntenic regions across assemblies, we found 15 structural rearrangements, which were almost exclusive to the VGI-III-IV lineages. Using synteny to inform orthology prediction, we identified a core set of 87% of C. gattii g
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Y-chromosome gene copy number variations (CNV) are closely associated with testicular development and male fertility. ZNF280AY, originating from the transposition of the ZNF280A gene, has been identified as a multicopy gene in the male-specific region of the Y chromosome within the Bovidae family. However, the genomic structure of ZNF280AY and its impact on male fertility through CNV remain poorly characterized. Our study revealed that ZNF280AY exhibits pseudogene characteristics in sheep, as evidenced by disrupted coding sequences and the absence of mRNA expression across 7 somatic tissues (h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal inversions play a crucial role in evolution and have been found to regulate epidemiologically significant traits in malaria mosquitoes. However, they have not been characterized in Aedes aegypti, the primary vector of arboviruses, due to the poor structure of its polytene chromosomes. The Hi-C proximity ligation approach was used to identify chromosomal inversions in 25 strains of A. aegypti obtained from its worldwide distribution and in one strain of Aedes mascarensis. The study identified 21 multimegabase polymorphic inversions ranging in size from 5 to 55 Mbp. Inversions were m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fatty liver disease causes huge economic losses in the poultry industry due to its high occurrence and lethality rate. Three-dimensional (3D) chromatin architecture takes part in disease processing by regulating transcriptional reprogramming. The study is carried out to investigate the alterations of hepatic 3D genome and H3K27ac profiling in early fatty liver (FLS) and reveal their effect on hepatic transcriptional reprogramming in laying hens.
RESULTS: Results show that FLS model is constructed with obvious phenotypes including hepatic visible lipid deposition as well as higher
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования