BACKGROUND: Blood smear examination through traditional optical microscopy is the gold standard for malaria diagnosis. However, it imposes strict requirements for operational staff and its sensitivity cannot perfectly satisfy the needs of clinical requirements. More sensitive and accurate modern technologies should be applied to this field. Digital PCR (dPCR), as an absolute quantification detection method, can serve as an effective tool to facilitate the diagnosis and classification of different malaria species.
OBJECTIVE: We aimed to establish a new multiplex dPCR detection system for four
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex-nested PCR (M-nested PCR) targeting mpt64 (Rv1980c) + IS6110 was designed to detect Mycobacterium tuberculosis (Mtb) DNA within urine (n = 35), endometrial biopsies (n = 22) and menstrual blood (n = 3) of male/female UGTB patients, and results were compared with M-PCR using the same targets. Detection limit of the purified Mtb DNA was found to be 1 fg by M-nested PCR, which was 106 -fold lower than M-PCR. Moreover, sensitivities of 100% and 81·8% were obtained in confirmed (n = 5) and clinically suspected UGTB (n = 55) cases, respectively, by M-nested PCR, with a specificity of 97·
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are several convenient and accurate molecular assays to detect respiratory bacterial infection. The NeoPlex RB-8 detection kit (NeoPlex RB-8) is a new multiplex real-time PCR assay that simultaneously detects Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Haemophilus influenzae, Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis, and Moraxella catarrhalis in a single test. This study compared the clinical concordance of NeoPlex RB-8 with another method, Seeplex PneumoBacter ACE detection assay (Seeplex PB ACE), which simultaneously detects
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral respiratory infections remain a significant cause of morbidity and mortality in pediatric, elderly, and immunocompromised patients. The Panther Fusion respiratory panels consist of 3 separate multiplex assays that test for 1) influenza A, influenza B, and RSV; 2) parainfluenza virus types 1-4; or 3) adenovirus, human metapneumovirus, and rhinovirus. This study evaluated the performance of the Fusion assays for both upper and lower respiratory tract specimens in comparison to routine methods, including viral culture and targeted real-time polymerase chain reaction assays. Following discor
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We expanded our current Centers for Disease Control and Prevention triplexed real-time polymerase chain reaction scheme identifying 11 individual serotypes and 10 serogroups to a quadriplex format identifying 34 individual serotypes and 13 small serogroups, 4 antibiotic resistance determinants, pilus targets, and penicillin susceptibility. Newly developed assays are specific for serotypes/serogroups, are sensitive (10 copies/reaction), and further discriminate larger serogroups into individual serotypes or smaller serogroups.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Worldwide, Listeria monocytogenes is a common foodborne pathogen and serotyping is necessary for traceability and surveillance. Due to high accuracy and speed, PCR is commonly used for serotyping by targeting specific genes, such as lmo1118 and ORF2110 for 1/2c-3c and 4b-4d-4e, respectively. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are single base alterations at specific loci which are associated with various phenomena. In this study, a method was explored to mine specific SNPs from 253 L. monocytogenes genomes with known serotypes by writing Python programming language script. After blasting al
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterococcus spp. are opportunistic pathogens that cause lameness in broiler chickens, resulting in serious economic losses worldwide. Virulence of Enterococcus spp. is associated with several putative virulence genes including fsr, efm, esp, cylA, cad1, ace, gelE, and asa1. In this study, multiplex polymerase chain reaction (PCR) for the simultaneous detection of these virulence genes in Enterococcus spp. was developed, and detection limits for E. faecium, E. faecalis, and E. hirae were 64.0 pg/μL, 320.0 pg/μL, and 1.6 ng/μL DNA, respectively. Among 80 Enterococcus isolates tested, efm and ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The FilmArray® meningitis/encephalitis (ME) panel is a multiplex PCR assay which can detect the most commonly identified pathogens in central nervous system infections. It significantly decreases the time to diagnosis of ME and data has yielded several positive outcomes. However, in part, reports of both false positive and false negative detections have resulted in concerns about adoption.
OBJECTIVES: The aim was to evaluate the ME panel in a diagnostic test accuracy review.
DATA SOURCES: The PubMed and EMBASE databases were systematically searched through May 2019.
STUDY ELIGIB
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: Infectious uveitis is a serious inflammatory condition that often causes grave ocular morbidity including permanent vision los … nd potentially sight-saving. Several groups have recently found experimental success with real-time multiplex polymerase chain reaction (PCR) techniques. Methods: A comprehensive review of the literature was undertaken to further understand the current state of real-time multiplex PCR and its clinical use. Search terms including "real time multiplex PCR", "infectious uveitis", and " …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For lowering prevalence of drug resistance it is necessary to diagnose TB in tuberculosis sputum suspect patients instead of TB-cultured samples which required a long time of culturing. Comparison of the results of drug resistant bacterial genes in both tuberculosis suspect sputum and multi-drug resistant DNA isolates detected by MAS-PCR. In the current study, the genetic mutations linked with INH, RIF as well as EMB drugs were detected by MAS-PCR simultaneously in MDR as well as TB suspect sputum isolates. 175/291 samples belonged to MDR and 116/291 samples belonged to tuberculosis suspect gr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: Polymerase chain reaction (PCR)-based assays are being increasingly used for the diagnosis of orthopedic-related infections. Unfortunately, classical PCR requires imaging devices that are expensive and complex. We previously developed the PCR-lateral flow (PCR-LF) method, which does not require any additional imaging device. In the present study, the objective was to determine whether PCR-LF tests could be used to effectively diagnose orthopedic-related infections. Methods: In this study, we used PCR-LF to diagnose common causes of orthopedic-related infections and compared the res
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid pathogen identification during an acute febrile illness is a critical first step for providing appropriate clinical care and patient isolation. Primary screening using sensitive and specific assays, such as real-time PCR and ELISAs, can rapidly test for known circulating infectious diseases. If the initial testing is negative, potentially due to a lack of developed diagnostic assays or an incomplete understanding of the pathogens circulating within a geographic region, additional testing would be required including highly multiplexed assays and metagenomic next generation sequencing. To
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Improved methods for the detection and characterization of carried Neisseria meningitidis isolates are needed. We evaluated a multiplex PCR algorithm for the detection of a variety of carriage strains in the meningitis belt. To further improve the sensitivity and specificity of the existing PCR assays, primers for gel-based PCR assays (sodC, H, Z) and primers/probe for real-time quantitative PCR (qPCR) assays (porA, cnl, sodC, H, E, Z) were modified or created using Primer Express software. Optimized multiplex PCR assays were tested on 247 well-characterised carriage isolates from six countrie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To investigate the feasibility of multiplex real-time RT-PCR with fluorescent probes in early screening of Ph-like acute lymphoblastic leukemia (ALL) and analyze the clinical feature and prognos. Method: A total of 118 adult B-ALL patients diagnosed between October 2010 and March 2016 were enrolled in this study. Multiplex RT-PCR was used to detect the Ph-like ALL related fusion gene and CRLF2 expression in 58 BCR-ABL and MLL rearrangement negative patients. The clinical features, treatment response and prognosis were analyzed in Ph-like fusion gene positive and/or CRLF2 over-expres
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Establishment of a reliable and rapid diagnosis is of paramount importance in spinal tuberculosis. The available gadgetry of investigations, such as AFB smear, culture of Mycobacterium tuberculosis, and Uniplex PCR, suffers from a lack of adequate sensitivity and/or a lack of rapidity. Therefore, many times a diagnosis is made either very late in the disease process or sometimes empirical therapy has to be started because a definite diagnosis could not be made. All of these are not ideal situations for a clinician. The present study was done with the aim to establish a rapid and re
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: β-thalassaemia is a group of inherited single-gene disorders worldwide. Each ethnic population has its own common mutations. Heterogeneity of β-thalassaemia mutations in multi-ethnic population of Surat, makes molecular diagnosis expensive and time consuming.
METHODS: Specific primers were used to differentiate four common mutations, IVS I-5 (G→C), Codon 41/42 (- TCTT), 619-bp deletion and FS 8/9 (+G), by a simple PCR involving a multiplex amplification refractory mutation system.
RESULTS: Several high prevalence β-Thalassemia trait groups constituted by Muslims, Patels, Sindhis,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) calculated from whole genome sequencing (WGS) are ideally suited to study evolutionary relationships of pathogens and their epidemiology. Mycobacterium caprae infections have been documented frequently in cattle and red deer along the Bavarian and Austrian Alps during the last decade. However, little is still known about the transmission within cattle holdings and possible alterations of the genomes of M. caprae during such events. The aim of this study was to study the molecular epidemiology of bovine tuberculosis (bTB) in selected herds based on isolate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gaucher disease (GD) is caused by the deficient activity of β-glucocerebrosidase due to pathogenic mutations in the GBA1. This gene has a pseudogene (GBAP) with 96% of sequence homology. Recombination (Rec) events in the GBA1 seem to be facilitated by an increased degree of homology and proximity to the GBAP. The objectives of this study were to validate the P338-X1 GBA kit (MRC-Holland) for Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) and to detect larger deletions/duplications present in GBA1 in GD patients from Brazil. Thirty-three unrelated Brazilian GD patients, previously geno
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The aetiological study of infections of the central nervous system has traditionally been performed using bacterial cultures and, more recently, using polymerase chain reaction (PCR) for herpes simplex virus (HSV). Bacterial cultures may not have good performance, especially in the context of patients who have received antibiotics prior to sampling, and a request for HSV only by PCR reduces the information to only one aetiological agent. The aim of this study is to determine the infectious causes of meningitis and encephalitis, using traditional microbiology and molecular biology
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования